HIST2H2BE - HIST2H2BE

H2BC21
Доступные конструкции
PDB	Human UniProt search: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4NFT
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC21, GL105, H2B, H2B.1, H2BFQ, H2BGL105, H2BQ, гистоновый кластер 2, H2be, гистоновый кластер 2 Член семейства H2B e, кластерный гистон 21 H2B, HIST2H2BE, H2BE
Внешние идентификаторы	OMIM: 601831 ГомолоГен: 128426 Генные карты: H2BC21
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	149,886,652 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность гетеродимеризации белков; • Связывание ДНК;
Сотовый компонент	• хромосома; • внеклеточная экзосома; • нуклеоплазма; • нуклеосома; • ядро клетки; • внеклеточный; • цитозоль;
Биологический процесс	• сборка нуклеосом; • врожденный иммунный ответ слизистой оболочки; • защитный ответ на бактерию; • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8349
	н / д
	ENSG00000184678
	н / д
	Q16778
	н / д
	NM_003528
	н / д
	NP_003519
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Гистон H2B типа 2-E это белок что у людей кодируется HIST2H2BE ген.^[3]^[4]^[5]

Гистоны - это основные ядерные белки, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которого примерно 146 п.н. ДНК обернуты в повторяющиеся единицы, называемые нуклеосомами. Линкерный гистон, H1, взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и функционирует в уплотнении хроматина в структуры более высокого порядка. Этот ген кодирует член семейства гистонов H2B и генерирует два транскрипта за счет использования консервативного мотива терминации стебель-петля и мотива присоединения полиА.^[5]

Рак

Было обнаружено, что ген HIST2H2BE постепенно подавляется в Вирус папилломы человека -положительный опухолевые кератиноциты происходит из шейки матки предопухолевые поражения на разных уровнях злокачественности.^[6] По этой причине этот ген, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером шейки матки. предопухолевые поражения прогрессия.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184678 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Collart D, Romain PL, Huebner K, Pockwinse S, Pilapil S, Cannizzaro LA, Lian JB, Croce CM, Stein JL, Stein GS (январь 1993 г.). «Вариантный ген гистона H2B.1 человека, расположенный на хромосоме 1, использует альтернативный процессинг 3'-конца». J Cell Biochem. 50 (4): 374–85. Дои:10.1002 / jcb.240500406. PMID 1469070.
^ Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^а ^б "Энтрез Ген: HIST2H2BE гистоновый кластер 2, H2be".
^ ^а ^б Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID 25205602.

дальнейшее чтение

Колларт Д., Рэмси-Юинг А., Бортелл Р. и др. (1991). «Выделение и характеристика кДНК гена гистона H2B человека, который реципрокно экспрессируется по отношению к зависимым от репликации генам гистона H2B во время дифференцировки клеток HL60». Биохимия. 30 (6): 1610–7. Дои:10.1021 / bi00220a024. PMID 1993178.
Джексон С., Брукс В., Джексон В. (1994). «Динамика взаимодействия гистонов H2A, H2B и H3, H4 с ДНК, подвергнутой торсионному стрессу». Биохимия. 33 (18): 5392–403. Дои:10.1021 / bi00184a006. PMID 8180162.
Frohm M, Gunne H, Bergman AC и др. (1996). «Биохимический и антибактериальный анализ жидкости из ран и волдырей человека». Евро. J. Biochem. 237 (1): 86–92. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0086n.x. PMID 8620898.
Родригес П., Манро Д., Правитт Д. и др. (1997). «Функциональная характеристика белка-2 сборки нуклеосомы человека (NAP1L4) предполагает его роль в качестве шаперона гистонов». Геномика. 44 (3): 253–65. Дои:10.1006 / geno.1997.4868. PMID 9325046.
Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК 110633. PMID 9566873.
Чжан Ю., Сунь З. В., Иратни Р. и др. (1998). «SAP30, новый белок, консервативный для человека и дрожжей, является компонентом гистондеацетилазного комплекса». Мол. Ячейка. 1 (7): 1021–31. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.
Лорейн С., Куиви Дж. П., Монье-Гавел Ф. и др. (1998). «Ядровые гистоны и HIRIP3, новый белок, связывающий гистоны, напрямую взаимодействуют с белком-повторов WD HIRA». Мол. Cell. Биол. 18 (9): 5546–56. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5546. ЧВК 109139. PMID 9710638.
Хан И.Ю., Валлин Р., Гупта Р.С., Каммер Г.М. (1998). «Катализируемое протеинкиназой А фосфорилирование шаперона белка теплового шока 60 регулирует его прикрепление к гистону 2B в плазматической мембране Т-лимфоцитов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (18): 10425–30. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10425. ЧВК 27910. PMID 9724719.
Беккер В., Вебер Ю., Ветцель К. и др. (1998). «Характеристики последовательности, субклеточная локализация и субстратная специфичность DYRK-родственных киназ, нового семейства протеинкиназ с двойной специфичностью». J. Biol. Chem. 273 (40): 25893–902. Дои:10.1074 / jbc.273.40.25893. PMID 9748265.
Аллен М.П., Зенг С., Шнайдер К. и др. (1999). «Передача сигналов специфичного для остановки роста гена 6 (Gas6) / киназы, связанной с адгезией (Ark), способствует выживанию нейронов гонадотропин-рилизинг-гормона посредством внеклеточной киназы, регулируемой сигналом (ERK), и Akt». Мол. Эндокринол. 13 (2): 191–201. Дои:10.1210 / me.13.2.191. PMID 9973250.
Пиредда Л., Фаррас М.Г., Ло Белло М. и др. (1999). «Идентификация« тканевых »белков, связывающих трансглутаминазу, в нервных клетках, подверженных апоптозу». FASEB J. 13 (2): 355–64. Дои:10.1096 / fasebj.13.2.355. PMID 9973324.
Carrier F, Georgel PT, Pourquier P и др. (1999). «Gadd45, белок стресса, реагирующий на р53, изменяет доступность ДНК на поврежденном хроматине». Мол. Cell. Биол. 19 (3): 1673–85. Дои:10.1128 / MCB.19.3.1673. ЧВК 83961. PMID 10022855.
Кавасаки Х., Шильц Л., Чиу Р. и др. (2000). «ATF-2 обладает внутренней гистонацетилтрансферазной активностью, которая модулируется фосфорилированием». Природа. 405 (6783): 195–200. Дои:10.1038/35012097. PMID 10821277.
Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Бааке M, Doenecke D, Albig W (2001). «Характеристика сигналов ядерной локализации четырех гистонов ядра человека». J. Cell. Биохим. 81 (2): 333–46. Дои:10.1002 / 1097-4644 (20010501) 81: 2 <333 :: AID-JCB1048> 3.0.CO; 2-D. PMID 11241673.
Чедвик Б. П., Уиллард Х. Ф. (2001). «Новый белок хроматина, отдаленно связанный с гистоном H2a, в значительной степени исключен из неактивной Х-хромосомы». J. Cell Biol. 152 (2): 375–84. Дои:10.1083 / jcb.152.2.375. ЧВК 2199617. PMID 11266453.
Freire J, Covelo G, Sarandeses C и др. (2001). «Идентификация ядерных импортных и регуляторных белков клеточного цикла, которые связываются с протимозином альфа». Biochem. Cell Biol. 79 (2): 123–31. Дои:10.1139 / bcb-79-2-123. PMID 11310559.
Nemergut ME, Mizzen CA, Stukenberg T, et al. (2001). «Докинг хроматина и повышение обменной активности RCC1 гистонами H2A и H2B». Наука. 292 (5521): 1540–3. Дои:10.1126 / science.292.5521.1540. PMID 11375490.
Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q16778 (Гистон H2B типа 2-E) в PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184678 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1469070-3] Collart D, Romain PL, Huebner K, Pockwinse S, Pilapil S, Cannizzaro LA, Lian JB, Croce CM, Stein JL, Stein GS (январь 1993 г.). «Вариантный ген гистона H2B.1 человека, расположенный на хромосоме 1, использует альтернативный процессинг 3'-конца». J Cell Biochem. 50 (4): 374–85. Дои:10.1002 / jcb.240500406. PMID 1469070.

[pmid12408966-4] Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-5] а ^б "Энтрез Ген: HIST2H2BE гистоновый кластер 2, H2be".

[Rotondo_2015-6] а ^б Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID 25205602.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]