Хироки Уэда - Hiroki Ueda

Доктор Философии

Хироки Уэда
Родился1975
Фукуока, Япония
Альма-матерТокийский университет
Научная карьера
ПоляБиология
УчрежденияТокийский университет
Центр количественной биологии RIKEN
Киотский университет
Осакский университет
Университет Тохоку

Хироки Р. Уэда (上 田 泰 己, Уэда Хироки) японский профессор биология на Токийский университет и Центр количественной биологии RIKEN. Он известен своими исследованиями циркадные часы.

Карьера

Хироки Р. Уэда родился в Фукуока, Япония в 1975 году. Окончил лечебный факультет, Токийский университет в 2000 году и защитил докторскую диссертацию в 2004 году в том же университете.[1] Он был назначен руководителем группы в RIKEN Центр для Биология развития (CDB) с 2003 года, а в 2009 году был назначен руководителем проекта в RIKEN CDB.[2] и быть директором группы в Центре количественной биологии RIKEN (QBiC) в 2011 году. В 2013 году он стал профессором Высшей школы медицины Токийского университета.[3] В настоящее время он назначен руководителем группы RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), аффилированным профессором в Высшей школе информационных наук и технологий и главный следователь в IRCN (Международный исследовательский центр нейроинтеллекта) Токийского университета, приглашенный профессор в Осакский университет, и приглашенный профессор в Университеты Токусима.

Исследование

Он имеет опыт в системной биологии и специализируется на хронобиологии, исследуя циркадные часы млекопитающих и циклы сна / бодрствования. Он определил базовую структуру транскрипционного контура циркадных часов млекопитающих и идентифицировал множественные отсроченные мотивы отрицательной обратной связи.[4][5][6][7] Он также сосредоточился на давних и нерешенных вопросах хронобиологии и обнаружил, что сингулярность поведения (то есть временная остановка циркадных часов) вызвана десинхронизацией нескольких клеточных циркадных осцилляторов.[8] и что нечувствительные к температуре биохимические реакции лежат в основе температурной компенсации циркадных часов млекопитающих.[9][10] Он также изобрел методы молекулярного расписания, чтобы определять циркадное время тела, измеряя информацию о снимках циркадных часов.[11][12][13][14] Для циклов сна / бодрствования он обнаружил, что Са2 + и CaMKII-зависимые пути гиперполяризации лежат в основе гомеостаза сна,[15][16][17][18][19] и что мускариновые рецепторы M1 и M3 как важные гены для быстрого сна.[20] Чтобы ускорить эти исследования, он также изобрел методы очистки и визуализации всего мозга и всего тела, названные CUBIC,[21][22][23][24][25][26][27][28][29] а также генетика млекопитающих следующего поколения[30] такие как Triple-CRISPR,[16] ES-мыши[31][32] и методы НДС[16] для одноэтапного производства и анализа мышей KO и KI без скрещивания.[24][26]

Награды

Он получил награды, в том числе Tokyo Techno Forum 21, Золотую медаль (Tokyo Techno Forum 21, 2005), Young Investigator Awards (MEXT, 2006) и IBM Science Award (IBM, 2009), награды за продвижение молодых исследователей (Японское общество хронобиологии, 2007). Он также получил премию Цукахара (Brain Science Foundation, 2012), Japan Innovator Awards (Деловые публикации Nikkei Inc. 2004), Премия Тейичи Ямазаки (Фонд содействия материаловедению и технологиям Японии, 2015 г.), «Новатор года» (2017 г.) и Премия Ичимура в области науки за выдающиеся достижения (Фонд новых технологий Ичимура, 2018 г.).

использованная литература

  1. ^ "Хироки Уэда". Нейроинформатика. Получено 2017-10-28.
  2. ^ "Хироки Уэда". Узел. Компания биологов. Получено 2017-10-28.
  3. ^ «Серия семинаров CSCB:« К системам на уровне организмов и синтетической биологии ». Доктор Хироки Уэда». Получено 2017-10-28.
  4. ^ Уэда; и другие. (2002-08-01). «Элемент ответа фактора транскрипции для экспрессии генов в течение циркадной ночи». Природа. 418 (6897): 534–539. Дои:10.1038 / природа00906. ISSN  0028-0836. PMID  12152080. S2CID  4406987.
  5. ^ Уэда; и другие. (Февраль 2005 г.). «Идентификация на системном уровне транскрипционных схем, лежащих в основе циркадных часов млекопитающих». Природа Генетика. 37 (2): 187–192. Дои:10,1038 / ng1504. ISSN  1061-4036. PMID  15665827. S2CID  18112337.
  6. ^ Укаи-Таденума; и другие. (Октябрь 2008 г.). «Доказательство синтеза логики транскрипции циркадных часов млекопитающих». Природа клеточной биологии. 10 (10): 1154–1163. Дои:10,1038 / ncb1775. ISSN  1476-4679. PMID  18806789. S2CID  9528397.
  7. ^ Укаи-Таденума; и другие. (2011-01-21). «Задержка подавления обратной связи криптохромом 1 необходима для работы циркадных часов» (PDF). Ячейка. 144 (2): 268–281. Дои:10.1016 / j.cell.2010.12.019. ISSN  1097-4172. PMID  21236481. S2CID  8159963.
  8. ^ Укай; и другие. (Ноябрь 2007 г.). «Меланопсин-зависимое фотопертурбация обнаруживает десинхронизацию, лежащую в основе сингулярности циркадных часов млекопитающих». Природа клеточной биологии. 9 (11): 1327–1334. Дои:10.1038 / ncb1653. ISSN  1465-7392. PMID  17952058. S2CID  12385169.
  9. ^ Исодзима; и другие. (2009-09-15). «CKIepsilon / дельта-зависимое фосфорилирование - это нечувствительный к температуре, определяющий период процесс в циркадных часах млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (37): 15744–15749. Дои:10.1073 / pnas.0908733106. ISSN  1091-6490. ЧВК  2736905. PMID  19805222.
  10. ^ Шинохара; и другие. (2017-09-07). «Чувствительный к температуре субстрат и связывание продукта лежат в основе температурно-компенсированного фосфорилирования в часах». Молекулярная клетка. 67 (5): 783–798.e20. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.08.009. ISSN  1097-4164. PMID  28886336.
  11. ^ Уэда; и другие. (2004-08-03). «Методы молекулярного расписания для обнаружения нарушений ритма и времени тела на основе профилей экспрессии в единой временной точке по всему геному». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (31): 11227–11232. Дои:10.1073 / pnas.0401882101. ISSN  0027-8424. ЧВК  509173. PMID  15273285.
  12. ^ Минами; и другие. (2009-06-16). «Измерение внутреннего времени организма метаболомикой крови». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (24): 9890–9895. Дои:10.1073 / pnas.0900617106. ISSN  1091-6490. ЧВК  2689311. PMID  19487679.
  13. ^ Касукава; и другие. (2012-09-11). «График метаболитов в крови человека указывает внутреннее время организма». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (37): 15036–15041. Дои:10.1073 / pnas.1207768109. ISSN  1091-6490. ЧВК  3443163. PMID  22927403.
  14. ^ Наруми; и другие. (2016-06-14). «Абсолютное количественное определение на основе масс-спектрометрии показывает ритмические вариации белков циркадных часов мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (24): E3461–3467. Дои:10.1073 / pnas.1603799113. ISSN  1091-6490. ЧВК  4914154. PMID  27247408.
  15. ^ Тацуки; и другие. (2016-04-06). «Участие Ca (2 +) - зависимой гиперполяризации в продолжительности сна у млекопитающих». Нейрон. 90 (1): 70–85. Дои:10.1016 / j.neuron.2016.02.032. ISSN  1097-4199. PMID  26996081.
  16. ^ а б c Сунагава; и другие. (26.01.2016). «Обратная генетика млекопитающих без скрещивания выявляет Nr3a как ген с коротким сном». Отчеты по ячейкам. 14 (3): 662–677. Дои:10.1016 / j.celrep.2015.12.052. ISSN  2211-1247. PMID  26774482.
  17. ^ Тацуки; и другие. (Май 2017). «Са2 + -зависимая гипотеза гиперполяризации сна млекопитающих». Нейробиологические исследования. 118: 48–55. Дои:10.1016 / j.neures.2017.03.012. ISSN  1872-8111. PMID  28433628. S2CID  4242696.
  18. ^ Ода; и другие. (Июнь 2017). «Быстрые и медленные Ca2 + -зависимые механизмы гиперполяризации связывают мембранный потенциал и гомеостаз сна». Текущее мнение в нейробиологии. 44: 212–221. Дои:10.1016 / j.conb.2017.05.007. ISSN  1873-6882. PMID  28575719. S2CID  2089309.
  19. ^ Ши; и другие. (Январь 2018). «Са2 + -зависимые пути гиперполяризации в гомеостазе сна и психических расстройствах». BioEssays. 40 (1): 1700105. Дои:10.1002 / bies.201700105. ISSN  1521-1878. PMID  29205420.
  20. ^ Нива; и другие. (2018-08-28). «Мускариновые рецепторы ацетилхолина Chrm1 и Chrm3 необходимы для быстрого сна». Отчеты по ячейкам. 24 (9): 2231–2247.e7. Дои:10.1016 / j.celrep.2018.07.082. ISSN  2211-1247. PMID  30157420.
  21. ^ Сусаки; и другие. (2014-04-24). «Визуализация всего мозга с разрешением одной клетки с использованием химических коктейлей и компьютерного анализа». Ячейка. 157 (3): 726–739. Дои:10.1016 / j.cell.2014.03.042. ISSN  1097-4172. PMID  24746791.
  22. ^ Тайнака; и другие. (2014-11-06). «Визуализация всего тела с одноклеточным разрешением путем обесцвечивания тканей». Ячейка. 159 (4): 911–924. Дои:10.1016 / j.cell.2014.10.034. ISSN  1097-4172. PMID  25417165.
  23. ^ Сусаки; и другие. (Ноябрь 2015 г.). «Расширенные протоколы CUBIC для очистки всего мозга и всего тела и визуализации» (PDF). Протоколы природы. 10 (11): 1709–1727. Дои:10.1038 / nprot.2015.085. ISSN  1750-2799. PMID  26448360. S2CID  205466332.
  24. ^ а б Сусаки; и другие. (21.01.2016). "Очистка всего тела и всего органа и методы визуализации с разрешением отдельных клеток: к системной биологии на уровне организма у млекопитающих". Клеточная химическая биология. 23 (1): 137–157. Дои:10.1016 / j.chembiol.2015.11.009. ISSN  2451-9448. PMID  26933741.
  25. ^ Тайнака; и другие. (2016-10-06). "Химические принципы в протоколах очистки и окрашивания тканей для профилирования клеток всего тела". Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 32: 713–741. Дои:10.1146 / annurev-cellbio-111315-125001. ISSN  1530-8995. PMID  27298088. S2CID  16012176.
  26. ^ а б Кубота; и другие. (2017-07-05). «Профилирование всего тела метастазов рака с разрешением отдельных клеток». Отчеты по ячейкам. 20 (1): 236–250. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.06.010. ISSN  2211-1247. PMID  28683317.
  27. ^ Нодзима; и другие. (2017-08-24). «КУБИЧЕСКАЯ патология: трехмерная визуализация для патологической диагностики». Научные отчеты. 7 (1): 9269. Дои:10.1038 / s41598-017-09117-0. ISSN  2045-2322. ЧВК  5571108. PMID  28839164.
  28. ^ Мураками; и другие. (Апрель 2018). «Трехмерный атлас всего мозга с разрешением одной клетки с использованием расширяющей микроскопии CUBIC-X и очистки тканей». Природа Неврология. 21 (4): 625–637. Дои:10.1038 / s41593-018-0109-1. ISSN  1546-1726. PMID  29507408. S2CID  4381325.
  29. ^ Тайнака; и другие. (21.08.2018). «Химический ландшафт для очистки тканей на основе гидрофильных реагентов». Отчеты по ячейкам. 24 (8): 2196–2210.e9. Дои:10.1016 / j.celrep.2018.07.056. ISSN  2211-1247. PMID  30134179.
  30. ^ Сусаки; и другие. (2017). «Следующее поколение генетики млекопитающих в направлении системной биологии на уровне организма». NPJ Системная биология и приложения. 3: 15. Дои:10.1038 / s41540-017-0015-2. ISSN  2056-7189. ЧВК  5459797. PMID  28649442.
  31. ^ Ода; и другие. (2017-01-05). «Нокаут-спасательная мышь, полученная из эмбриональных стволовых клеток, демонстрирует контроль циркадного периода по качеству и количеству CRY1». Молекулярная клетка. 65 (1): 176–190. Дои:10.1016 / j.molcel.2016.11.022. ISSN  1097-4164. PMID  28017587.
  32. ^ Укай; и другие. (Декабрь 2017 г.). «Производство нокаутных мышей в одном поколении из эмбриональных стволовых клеток». Протоколы природы. 12 (12): 2513–2530. Дои:10.1038 / nprot.2017.110. ISSN  1750-2799. PMID  29189772.

внешние ссылки