Гиперчувствительный сайт - Hypersensitive site

Сайты гиперчувствительности к ДНКазе I внутри хроматина[1]

В генетика а гиперчувствительный сайт это короткая область хроматин и обнаруживается по его сверхчувствительности к расщеплению ДНКаза I и другие различные нуклеазы (ДНКаза II и микрококковые нуклеазы ). В гиперчувствительном сайте нуклеосомная структура менее уплотнена, что увеличивает доступность ДНК для связывания белками, такими как факторы транскрипции и DNase I. Эти сайты объясняют многие унаследованные тенденции.[2]

Место расположения

Сайты гиперчувствительности обнаруживаются на каждом активном гене, и многие из этих генов часто имеют более одного сайта гиперчувствительности. Чаще всего гиперчувствительные сайты обнаруживаются только в хроматине клеток, в которых экспрессируется связанный ген, и не возникают, когда ген неактивен.

В транскрибируемой ДНК 5'-гиперчувствительные сайты появляются до начала транскрипции, и последовательности ДНК внутри гиперчувствительных сайтов необходимы для экспрессия гена. Примечание: гиперчувствительные участки предшествуют активным промоутеры.

Гиперчувствительные сайты образуются в результате связывания факторы транскрипции это вытесняет октамеры гистонов.

Их также можно найти с помощью косвенной маркировки концов. Фрагмент ДНК разрезают один раз в гиперчувствительном сайте с помощью ДНКаза и на другом сайте с рестрикционный фермент. Затем измеряется расстояние от известного сайта рестрикции до разреза ДНКазы, чтобы определить местоположение.

Рекомендации

  1. ^ Wang, YM; Чжоу, П; Wang, LY; Ли, ZH; Zhang, YN; Чжан, YX (2012). «Корреляция между распределением гиперчувствительных сайтов ДНКазы I и экспрессией генов в клетках HeLa S3». PLOS ONE. 7 (8): e42414. Bibcode:2012PLoSO ... 742414W. Дои:10.1371 / journal.pone.0042414. ЧВК  3416863. PMID  22900019.
  2. ^ Пенниси, Элизабет (7 сентября 2012 г.). «Проект ENCODE пишет хвалебную речь мусорной ДНК». Наука. 337 (6099): 1159–1161. Bibcode:2012Научный ... 337.1159П. Дои:10.1126 / science.337.6099.1159. PMID  22955811.