Интегрон - Integron

Интегроны представляют собой генетические механизмы, которые позволяют бактериям быстро адаптироваться и развиваться за счет накопления и экспрессии новых генов.[1] Эти гены встроены в определенную генетическую структуру, называемую генная кассета (термин, который в последнее время заменяется на интегронную кассету), которая обычно несет одну без промотора открытая рамка чтения (ORF) вместе с сайтом рекомбинации (attC). Кассеты Integron встроены в attI сайт платформы Integron сайт-специфическая рекомбинация реакции, опосредованные интегразой.

Открытие

Интегроны были первоначально обнаружены на конъюгативных плазмидах благодаря их роли в устойчивости к антибиотикам.[2] В самом деле, эти мобильные интегроны, как они теперь известны, могут нести множество кассет, содержащих гены, почти исключительно связанные с устойчивостью к антибиотикам. Дальнейшие исследования пришли к выводу, что интегроны являются хромосомными элементами, и что их мобилизация на плазмиды была стимулирована транспозонами и выбрана путем интенсивного использования антибиотиков. Функция большинства кассет, обнаруженных в хромосомных интегронах, остается неизвестной.

Структура

Интегрон минимально состоит из:[3][4]

  • ген, кодирующий сайт-специфичный рекомбиназа: intI, принадлежащий к интегрировать семья
  • проксимальный рекомбинация сайт: attI, что распознается интегразой[5] и в какие генные кассеты могут быть вставлены
  • промоутер: ПК, который управляет транскрипцией кассетно-кодируемых генов

Кассеты генов

Основная статья: Кассета гена

Кроме того, интегрон обычно содержит одну или несколько кассет генов, которые были включены в него. Кассеты генов могут кодировать гены для устойчивость к антибиотикам, хотя большинство генов в интегронах не охарактеризованы. An attC последовательность (также называемая 59-be) - это повторение, которое образует боковые стороны кассет и позволяет интегрировать кассеты в attI участка, иссечены и проходят горизонтальный перенос генов.

Вхождение

Интегроны можно найти в составе мобильные генетические элементы Такие как плазмиды и транспозоны. Интегроны также можно найти в хромосомы.

Терминология

Период, термин супер-интегрон был впервые применен в 1998 году (но без определения) к интегрону с длинным массивом кассет на маленькой хромосоме Холерный вибрион.[6][7] С тех пор этот термин использовался для интегронов с различной длиной массива кассет или для интегронов на бактериальных хромосомах (по сравнению, например, с плазмидами). Использование термина «супер-интегрон» сейчас не рекомендуется, поскольку его значение неясно.[6]

Рекомендации

  1. ^ Антонио Эскудеро, Хосе; Мазель, Дидье; Нивина, Александра; Лут, Селин (2015). "ASMscience | Интегрон: Адаптация по запросу". Микробиологический спектр. 3. Дои:10.1128 / microbiolspec.mdna3-0019-2014.
  2. ^ Мазель (2006). «Интегроны: агенты бактериальной эволюции». Обзоры природы Микробиология. 4 (8): 608–620. Дои:10.1038 / nrmicro1462.
  3. ^ Ковалевская, Н. П. (2002). «Мобильные генные кассеты и интегроны». Молекулярная биология. 36 (2): 196–201. Дои:10.1023 / А: 1015361704475.
  4. ^ Холл Р., Коллис С., Ким М., Партридж С., Реккья Г., Стоукс Г. (1999) Кассеты и интегроны мобильных генов в процессе эволюции.
  5. ^ Холл, РМ; Коллис, CM (1995). «Мобильные генные кассеты и интегроны: захват и распространение генов посредством сайт-специфической рекомбинации». Молекулярная микробиология. 15 (4): 593–600. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1995.tb02368.x. PMID  7783631.
  6. ^ а б Холл, Р. М .; Стокс, HW (2004). «Интегроны или суперинтегроны?». Микробиология. 150 (Чт 1): 3–4. Дои:10.1099 / мик. 0.26854-0. PMID  14702391.
  7. ^ Mazel, D .; Дичинко, Б; Webb, VA; Дэвис, Дж (1998). «Отличительный класс Integron в геноме Vibrio cholerae». Наука. 280 (5363): 605–8. Дои:10.1126 / science.280.5363.605. PMID  9554855.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • IntegronFinder - Инструмент для обнаружения интегронов в бактериальных геномах
  • ИНТЕГРАЛ - База данных Integron