Международная лаборатория мозга - International Brain Laboratory
В Международная лаборатория мозга (IBL) - это совместная исследовательская группа, целью которой является разработка первой глобальной модели принятия решений на мышах.[1][2] На первом этапе члены IBL регистрируют 100 000 нейронов практически во всех структурах мозга мышей, выполняя одно и то же решение. IBL был официально запущен в сентябре 2017 года.[3][4] благодаря гранту в размере 10 миллионов долларов от Фонд Саймонса и грант в размере 10 миллионов фунтов стерлингов от Wellcome Trust.
Первыми важными научными вехами проекта стали разработка архитектуры данных с открытым исходным кодом для крупномасштабного сотрудничества в области нейробиологии.[5] и воспроизведение поведения во всех экспериментальных лабораториях.[6] В конце 2019 года IBL опубликовала поведенческие данные, содержащие около 3 миллионов вариантов выбора мыши.[6] Следующая веха включает в себя составление общей карты активности. Эта карта деятельности получена с Нейропиксели зонды, позволяющие регистрировать до 300-1000 нейронов одновременно.[7] На втором этапе будут использоваться другие технологии записи, такие как визуализация кальция. Затем эти данные будут проанализированы и интегрированы для создания модели принятия решений в масштабах всего мозга.
Источник
IBL была основана в 2016 году Закари Майнен (Центр Неизвестного Шампалимо), Майкл Хауссер (Университетский колледж Лондона ), и Александр Пуже (Женевский университет ). Эти ученые утверждали в статье, опубликованной в том же году.[8] что, учитывая сложность вопросов нейробиологии и масштаб технических проблем, кажется маловероятным, что исследования, проведенные отдельными лабораториями, будут достаточными для понимания того, как работает мозг. Вдохновленные выдающимся успехом крупномасштабного сотрудничества в области физики, такого как CERN или LIGO, они предложили создать подобное целенаправленное сотрудничество в области нейробиологии на основе нескольких основных принципов:
- Общая амбициозная, но реалистичная цель (например, модель принятия решений в масштабах всего мозга у одного вида),
- Тесная координация между теоретиками и экспериментаторами.
- Стандартизация поведенческих задач, оборудования и анализа данных для обеспечения воспроизводимость и позволяя объединять данные,
- Открытый доступ к данным и ресурсам внутри и вне сотрудничества, а также
- Относительно плоская иерархия и совместный процесс принятия решений.
Эти принципы лежат в основе сотрудничества IBL.[1]
Членство
К Майнену, Хауссеру и Пуже в 2016 году присоединились
- Ларри Эбботт (Колумбийский университет)
- Дора Ангелаки (Нью-Йоркский университет)
- Маттео Карандини (Университетский колледж Лондона )
- Энн Черчленд (Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе)
- Ян Дань (Калифорнийский университет в Беркли)
- Питер Даян (Институт Макса Планка Тюбинген)
- Софи Денев (Ecole Normale Superieure )
- Ила Фите (Массачусетский Институт Технологий)
- Сурья Гангули (Стэндфордский Университет)
- Кеннет Харрис (Университетский колледж Лондона )
- Питер Лэтэм (Университетский колледж Лондона )
- Соня Хофер (Университетский колледж Лондона )
- Том миссис-Флогель (Университетский колледж Лондона )
- Лиам Панински (Колумбийский университет)
- Джонатан Пиллоу (Принстонский университет)
- Илана Виттен (Университет Принстона)
- Тони Задор (Лаборатория Колд-Спринг-Харбор)
Дэвид Танк и Карлос Броуди (оба из Принстонского университета) присоединились к нам в 2016 году, но вышли из них в 2017 году из-за конфликта интересов. Ник Стейнмец (Вашингтонский университет ) присоединилась в 2019 году, а Татьяна Энгель (Лаборатория Колд-Спринг-Харбор ) в 2020 году.
Рекомендации
- ^ а б Эбботт, Ларри Ф .; Angelaki, Dora E .; Карандини, Маттео; Черчленд, Энн К .; Дэн, Ян; Даян, Питер; Денев, Софи; Фите, Ила; Гангули, Сурья; Харрис, Кеннет Д.; Хойссер, Майкл (2017). «Международная лаборатория системной и вычислительной нейробиологии». Нейрон. 96 (6): 1213–1218. Дои:10.1016 / j.neuron.2017.12.013. ЧВК 5752703. PMID 29268092.
- ^ Фогт, Нина (06.01.2020). «Совместная неврология». Методы природы. 17 (1): 22–22. Дои:10.1038 / s41592-019-0706-2. ISSN 1548-7105.
- ^ Пример, Ян (2017-09-19). «Амбициозный проект нейробиологии по изучению того, как мозг принимает решения». Хранитель. ISSN 0261-3077. Получено 2020-01-31.
- ^ Эбботт, Элисон (2017-09-21). «Исследователи объединяются в поисках« стандартной модели »мозга». Новости природы. 549 (7672): 319–320. Bibcode:2017Натура.549..319A. Дои:10.1038 / 549319a. PMID 28933448.
- ^ Бонакки, Никколо; Шапюи, Гаэль; Черчленд, Энн; Харрис, Кеннет Д.; Хантер, Макс; Россант, Сирилл; Сасаки, Махо; Шэнь, Шань; Steinmetz, Nicholas A .; Уокер, Эдгар Ю.; Зима, Оливье; Уэллс, Майлз (2020). «Архитектура данных и визуализация для крупномасштабного сотрудничества в области нейробиологии». bioRxiv: 827873. Дои:10.1101/827873.
- ^ а б Международная лаборатория мозга (2020). «Стандартизированный и воспроизводимый метод измерения принятия решений у мышей». bioRxiv. Дои:10.1101/2020.01.17.909838.
- ^ "Дома". Нейропиксели. Получено 2020-04-26.
- ^ Майнен, Захари Ф .; Häusser, Михаэль; Пуже, Александр (2016). "Лучший способ взломать мозг". Природа. 539 (7628): 159–161. Bibcode:2016Натура.539..159М. Дои:10.1038 / 539159a. ISSN 0028-0836. PMID 27830818.