Жадомицин - Википедия - Jadomycin

Жадомицин B
Жадомицин Б.png
Имена
Другие имена
Жадомицин L-изолейцин
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭБИ
ЧЭМБЛ
ChemSpider
КЕГГ
Характеристики
C30ЧАС31NО9
Молярная масса549.576 г · моль−1
ВнешностьТвердый темно-красно-фиолетовый
РастворимостьРастворим в различных органических растворителях[нечеткий ]
Если не указано иное, данные для материалов приводятся в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы

А жадомицин это натуральный продукт произведено Streptomyces venezuelae ISP5230 (ATCC10712[1]), организм, который наиболее известен как вырабатывающий антибиотик хлорамфеникол. Название «жадомицин» применяется к семейству родственных ангуциклинов, которые отличаются кольцом E (обычно кольцом оксоазолона), которое происходит от аминокислоты. Включение аминокислоты, которая образует E-кольцо, представляет собой скорее химическую реакцию, чем ферментативную, что редко встречается в биосинтезе. Таким образом, было обнаружено множество джадомицинов, включающих различные аминокислоты. Жадомицин А был первым выделенным соединением этого семейства, и он составляет ангуциловую основу с L-изолейцин включены в E-кольцо.[2] Родственный аналог, жадомицин B, модифицируется путем гликозилирования 2,6-дидезоксисахаром, L-дигитоксоза.[3] Джадомицины обладают цитотоксическими и антибактериальными свойствами.

Биосинтез

Кластер биосинтетических генов жадомицина хорошо охарактеризован. Биосинтез жадомицина включает тип II поликетидсинтаза (T2Pks) сборка для создания компонента ангуциклина,[4] и путь дидезоксисахара для генерирования сахарного донора NDP-L-дигитоксозы.[5] Исследования показали, что JadG, FAD-зависимый оксигеназа в кольцевом расщеплении, необходимом для включения аминокислот.[6] JadS, гликозилтрансфераза , который переносит L-дигитоксозу, показал свою гибкость по отношению к донору сахара.[7][8][9]

Аналоги на основе модификации E-ring

Жадомицин аналоги были получены через культуру S. venezuelae в присутствии одной аминокислоты. Разнообразие жадомицинов включает в себя те, которые содержат встречающиеся в природе аминокислоты,[10] непротеиногенные аминокислоты,[11][12] и синтетические аминокислоты с ручками для дальнейшей химической модификации.[13][14]

Рекомендации

  1. ^ «Streptomyces venezuelae Ehrlich et al. ATCC ® 10712 ™». www.atcc.org. Получено 2017-05-31.
  2. ^ Айер, Стивен У .; Макиннес, А. Гэвин; Тибо, Пьер; Уолтер, Джон А .; Дулл, Дженис Л .; Парнелл, Трейси; Вининг, Лео К. (1991-10-28). «Жадомицин, новый антибиотик типа 8H-бенз [b] оксазоло [3,2-f] фенантридин из Streptomyces venezuelae ISP5230». Буквы Тетраэдра. 32 (44): 6301–6304. Дои:10.1016 / 0040-4039 (91) 80152-В.
  3. ^ ДУЛЛ, ДЖАНИС Л .; АЙЕР, Стивен У .; СИНГХ, АМРИТ К .; ТИБО, ПЬЕР (1993-05-25). «Производство нового поликетидного антибиотика, жадомицина B, Streptomyces venezuelae после теплового шока». Журнал антибиотиков. 46 (5): 869–871. Дои:10.7164 / антибиотики. 46.869. ISSN  0021-8820. PMID  8514643.
  4. ^ Хан, Лей; Ян, Кэцянь; Рамалингам, Эсвар; Мошер, Рой Х .; Вининг, Лео С. (1994). «Клонирование и характеристика генов поликетидсинтазы для биосинтеза жадомицина B у Streptomyces venezuelae ISP5230». Микробиология. 140 (12): 3379–3389. Дои:10.1099/13500872-140-12-3379. PMID  7881555.
  5. ^ Ван, Лиру; Белый, Роберт Л .; Вининг, Лео С. (2002). «Биосинтез дидезоксисахарного компонента жадомицина B: гены в jad-кластере Streptomyces venezuelae ISP5230 для сборки l-дигитоксозы и передачи на ангуциклин агликон». Микробиология. 148 (4): 1091–1103. Дои:10.1099/00221287-148-4-1091. PMID  11932454.
  6. ^ Тибревал, Нидхи; Пахари, Паллаб; Ван, Гоцзюнь; Kharel, Madan K .; Моррис, Калеб; Дауни, Тереза; Хоу, Янпэн; Bugni, Tim S .; Рор, Юрген (2012). «Реакция расщепления связи Байера-Виллигера С-С в биосинтезе гилвокарцина и жадомицина». Журнал Американского химического общества. 134 (44): 18181–18184. Дои:10.1021 / ja3081154. ЧВК  3498853. PMID  23102024.
  7. ^ Джейкман, Дэвид Л .; Борисов, Чарльз Н .; Грэм, Кэти Л.; Timmons, Shannon C .; Reid, Taryn R .; Сивицки, Рэй Т. (29 августа 2006 г.). «Гибкость субстрата 2,6-дидезоксигликозилтрансферазы». Химические коммуникации. 0 (35): 3738–3740. Дои:10.1039 / B608847C. ISSN  1364-548X. PMID  17047829.
  8. ^ Забудьте, S.M .; На, Чонгук; McCormick, N.E .; Джейкман, Д. Л. (28 марта 2017 г.). «Биосинтетическая делеция гена 4,6-дегидратазы: выделение глюкозилированного природного продукта жадомицина дает представление о субстратной специфичности гликозилтрансферазы JadS». Органическая и биомолекулярная химия. 15 (13): 2725–2729. Дои:10.1039 / C7OB00259A. ISSN  1477-0539. PMID  28291274.
  9. ^ Ли, Лиюань; Пан, Гохуэй; Чжу, Сифэнь; Фань, Кэцян; Гао, Вубин; Ай, Гоминь; Рен, Цзиньвэй; Ши, Минксин; Олано, Карлос (20 апреля 2017 г.). «Разработанные аналоги жадомицина с измененными сахарными фрагментами, раскрывающие JadS в качестве субстрата гибкой O-гликозилтрансферазы». Прикладная микробиология и биотехнология. 101 (13): 5291–5300. Дои:10.1007 / s00253-017-8256-y. ISSN  0175-7598. PMID  28429060. S2CID  11777539.
  10. ^ Джейкман, Дэвид Л .; Фаррелл, Весна; Янг, Венди; Дусе, Рене Дж .; Тиммонс, Шеннон С. (2005-03-01). «Новые жадомицины: включение неприродных и натуральных аминокислот». Письма по биоорганической и медицинской химии. 15 (5): 1447–1449. Дои:10.1016 / j.bmcl.2004.12.082. PMID  15713404.
  11. ^ Джейкман, Дэвид Л .; Грэм, Кэти Л.; Рид, Тарин Р. (01.12.2005). «Новые и расширенные жадомицины, содержащие непротеогенные аминокислоты». Письма по биоорганической и медицинской химии. 15 (23): 5280–5283. Дои:10.1016 / j.bmcl.2005.08.047. PMID  16185863.
  12. ^ Забудьте, Стефани М .; Робертсон, Эндрю В .; Овери, Дэвид П .; Керр, Рассел Дж .; Джейкман, Дэвид Л. (18 мая 2017 г.). «Биосинтетические конгенеры фурана и лактама жадомицина, выделенные из Streptomyces venezuelae ISP5230, культивированные с Nε-трифторацетил-1-лизином». Журнал натуральных продуктов. 80 (6): 1860–1866. Дои:10.1021 / acs.jnatprod.7b00152. ISSN  0163-3864. PMID  28520425.
  13. ^ Dupuis, Stephanie N .; Робертсон, Эндрю В .; Вейнот, Томас; Монро, Сьюзан М. А .; Дуглас, Сьюзан Э .; Сивицкий, Рэй Т .; Горальски, Керри Б .; McFarland, Sherri A .; Джейкман, Дэвид Л. (2012-04-02). «Синтетическая диверсификация натуральных продуктов: полусинтез и оценка триазольных жадомицинов». Химическая наука. 3 (5): 1640. Дои:10.1039 / C2SC00663D. ISSN  2041-6539.
  14. ^ Робертсон, Эндрю В .; Мартинес-Фарина, Камило Ф .; Смитен, Дебора А .; Инь, Хуэйминь; Монро, Сьюзен; Томпсон, Элисон; McFarland, Sherri A .; Сивицкий, Раймонд Т .; Джейкман, Дэвид Л. (2015). "Восьмичленные кольцевые джадомицины: значение для неферментативного биосинтеза натуральных продуктов". Журнал Американского химического общества. 137 (9): 3271–3275. Дои:10.1021 / ja5114672. PMID  25692677.