Knome - Википедия - Knome

Knome, Inc.
Частный
ПромышленностьИнформационные технологии
СудьбаПриобретена Tute Genomics, Inc. в 2015 году (которая позже станет дочерней компанией PierianDX, Inc. в 2016 году)
Основан2007
Штаб-квартира
Кембридж, Массачусетс
,
Соединенные Штаты
Ключевые люди
  • Доктор Джордж Черч (основатель и главный научный советник)
  • Хорхе Конде (основатель)
  • Сундар Субраманиам (основатель и председатель)


УслугиИнтерпретация генома человека
Интернет сайтwww.knome.com

Knome, Inc. была компанией по интерпретации генома человека, базирующейся в Кембридже, штат Массачусетс. С момента своего запуска в 2007 году единственное внимание Knome было сосредоточено на улучшении жизни за счет применения научных идей, полученных из интерпретация генома человека. Их продукты и услуги помогают их клиентам идентифицировать и классифицировать варианты, гены и наборы генов, которые могут определять или лежать в основе конкретного заболевания, опухоли или реакции на лекарства. Среди клиентов - академические, фармацевтические и медицинские исследователи. В 2015 г. Tute Genomics.[1]

Технологии

Knome разработал запатентованные технологии, которые автоматизируют многие ручные задачи, связанные с интерпретацией полных геномов человека. Эти технологии предназначены для решения информатика и узкие места в рабочем процессе, которые обычно мешают интерпретации всего генома. Основная технология компании, kGAP, была разработана в 2009 году и служит основой для ряда продуктов и услуг Knome, включая платформу knoSYS®.

Продукты и услуги

Для академических, фармацевтических и медицинских исследователей Knome предлагает:

Платформа knoSYS®
Предоставляет лабораториям масштабируемую информационную систему промышленного уровня для анализа, аннотации и интерпретации данных о последовательностях следующего гена человека (геном, экзом, целевой ген).[2]
knomeDISCOVERY
Исследовательские услуги включают кураторство в рамках проекта, сложную информатику и углубленную интерпретацию, выполняемую командой опытных генетиков Кнома.[3]

График

2007
Knome был соучредителем Джордж М. Черч на основе признания того, что быстро падающая цена секвенирования всего генома создаст значительную рыночную потребность в технологиях и услугах интерпретации всего генома.
2008
Кном интерпретировал геном третьего названного человека, подлежащего секвенированию - Дэн Сточеску.[4] (кто следил Джеймс Уотсон и Крейг Вентер ).
2009
Knome запустил kGAP, a облако -основан информатика двигатель.
2010
Кном успешно помогал исследователям в Университет Британской Колумбии выявить шестой известный наследственный дефект гена, вызывающий Болезнь Паркинсона.[5]
2011
Выпущен kGAP 2.0.
2012
Knome был выбран в качестве технологического партнера Школа медицины Джона Хопкинса проанализировать 1000 геномов для изучения астмы.[6]
2014
kGAP интегрирован в платформу knoSYS как v3.0.
2015
Knome приобретен Tute Genomics (которая позже становится дочерней компанией PierianDX в 2016 году).[7]

В прессе

Нью-Йорк Таймс
В феврале 2013 г. Нью-Йорк Таймс представил knoSYS: «прибыл мощный компьютер с программным обеспечением для конфиденциальной интерпретации последовательностей в стенах лаборатории».[8]
НОВАЯ ЗВЕЗДА
В марте 2012 года Кном появился в специальном выпуске сериала НОВАЯ ЗВЕЗДА, «Взломать ваш генетический код». В шоу Кном помог описать, как интерпретация генома человека помогает разгадывать медицинские загадки и революционизировать личное здравоохранение.[9]
Лица Америки
В сентябре 2011 года Кном снялся в четырехсерийном фильме. PBS серии Лица Америки с Генри Луи Гейтс младший В сериале рассказывается о Гарвардском ученом Генри Луи Гейтсе-младшем, который использовал передовые генетические инструменты для изучения истории предков 12 известных американцев, раскрывая уникальные истории иммиграции, которые проливают свет на американский опыт. В программе ученые Кнома осветили поразительную «мозаику» происхождения в геномах профессора Гейтса и его отца, прослеживая их происхождение в Африке, Европе и за ее пределами. Сравнивая два генома друг с другом, они выявили общее генетическое наследие отца и сына, включая аспекты их рисков и сильных сторон для здоровья. Кроме того, документально зафиксировав части своих геномов, которые не были общими для двух мужчин, анализ Кнома позволил получить представление о геноме покойной матери профессора Гейтса.[10]
Оззи Осборн
В 2010 году Knome классно интерпретировал геномы Оззи и Шэрон Осборн. Исследование выявило заметные различия в генах Оззи, которые были связаны с реакцией на наркотики и алкоголь, что пролило свет на то, как знаменитый упорный рокер пережил десятилетия злоупотребления наркотиками. Несколько крупных новостных агентств, включая CNN[11][12] и ABC[13] подобрал рассказ.

Рекомендации

  1. ^ Knome захватить
  2. ^ «Система информатики и геномной интерпретации - knoSYS®». Knome. Архивировано из оригинал на 2014-04-09. Получено 2014-08-01.
  3. ^ "Услуги по исследованию генома человека - knomeDISCOVERY". Knome. Архивировано из оригинал на 2014-04-03. Получено 2014-08-01.
  4. ^ https://www.nytimes.com/2008/03/04/health/research/04geno.html
  5. ^ «Knome помогает канадской команде идентифицировать ген болезни Паркинсона». bio-itworld.com.
  6. ^ «Джонс Хопкинс использует Knome для анализа данных для исследования генома 1K». GenomeWeb.
  7. ^ «Через несколько дней после отмены краудфандинговой кампании Tute принимает заявку на выкуп PierianDx | FierceBiotech». www.fiercebiotech.com. Получено 2018-12-25.
  8. ^ https://www.nytimes.com/2013/02/03/business/knomes-new-machine-to-aid-labs-in-genomic-analysis.html
  9. ^ "NOVA - Взломать ваш генетический код". pbs.org.
  10. ^ ""Faces of America: Know Thyself "кредиты - Faces of America - PBS". Лица Америки.
  11. ^ «Оззи и Шэрон Осборн: кто здоровее?». cnn.com.
  12. ^ "День ДНК: знакомьтесь с генетиком Осборнов". cnn.com.
  13. ^ ABC News. "Генетические мутации усложняют жизнь Оззи Осборну - ABC News". ABC News.

внешняя ссылка