Вирус Купе - Kupe virus
Ортонаировирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Учебный класс: | Ellioviricetes |
Заказ: | Буньявиралес |
Семья: | Nairoviridae |
Род: | Ортонаировирус |
Напряжение | |
Вирус Купе |
Вирус Купе вирус в роду Ортонаировирус, порядок Буньявиралес.
Таксономия
Вирус Ганджама относится к серогруппе Найробийской болезни овец.
История
Вирус был выделен из пула клещи (Гемма амблиоммы и Rhipicephalus pulchellus ) собраны из шкур крупного рогатого скота в Найроби, Кения, в октябре 1999 г.[1] Слово «купе» - это Кисуахили для галочки.
Геном
Геном состоит из одной цепи отрицательной смысловой РНК, состоящей из трех частей - малой (S), средней (M0 и большой (L)).
РНК L сегмента составляет 12330 нуклеотиды (nt) в длину и кодирует одну открытую рамку считывания (ORF) из 4050 аминокислот. Есть некодирующие области: 5'-область 40 нуклеотидов и 3'-область 137 нуклеотидов. Эта открытая рамка считывания кодирует несколько модулей, включая РНК-зависимую РНК-полимеразу. Вероятно, он посттрансляционно расщепляется на несколько белков, но это еще предстоит показать.
РНК сегмента M имеет длину 4818 нуклеотидов и содержит одну открытую рамку считывания, фланкированную 5'- и 3'-некодирующими областями из 47 и 121 нуклеотидов соответственно. ORF кодирует белок из 1549 аминокислот с 8 потенциальными сайтами для N-связанного гликозилирования. Он содержит уникальный потенциальный сайт N-gly в областях гликопротеинов Gn и Gc в аминокислотах 612 и 1514 соответственно.
S-сегмент состоит из 1694 нуклеотидов и кодирует ORF из 483 аминокислот. 5 'и 3' некодирующие области имеют длину 49 нт и 193 нт соответственно.
Рекомендации
- ^ Sang R, Onyango C, Gachoya J, Mabinda E, Konongoi S, Ofula V, Dunster L, Okoth F, Coldren R, Tesh R, da Rossa AT, Finkbeiner S, Wang D, Crabtree M, Miller B (2006) Tickborne arbovirus наблюдение за товарным скотом, Найроби, Кения. Emerg Infect Dis. Июль 2006; 12 (7): 1074-1080