Список программного обеспечения для молекулярного моделирования методом Монте-Карло - Википедия - List of software for Monte Carlo molecular modeling

Это список компьютерных программ, использующих Методы Монте-Карло за молекулярное моделирование.

Морское ушко _{классический гибридный MC}
БОСС _{классический}
Кассандра _{классический}^[1]
CP2K
ПРАЗДНИК _{классический}^[2]
GOMC _{классический}^[3]
Макромодель _{классический}
Студия материалов _{классический}
РАСПА _{классический}^[4]
QMCPACK _квант^[5]
Спартанский _{классический}
Тинкер _{классический}

Смотрите также

Рекомендации

^ Shah, Jindal K .; Марин-Римольди, Элисео; Маллен, Райан Готчи; Кин, Брайан П .; Хан, Сандип; Палуч, Эндрю С .; Рай, Нирадж; Romanielo, Lucienne L .; Рош, Томас У .; Ю, Брайан; Мэджинн, Эдвард Дж. (15 июля 2017 г.). «Cassandra: пакет Монте-Карло с открытым исходным кодом для молекулярного моделирования». Журнал вычислительной химии. 38 (19): 1727–1739. Дои:10.1002 / jcc.24807. PMID 28436594.
^ Хэтч, Гарольд; Махински, Натан; Шен, Винсент (1 марта 2018 г.). "FEASST: Набор инструментов для моделирования свободной энергии и расширенного отбора проб". Журнал исследований Национального института стандартов и технологий. 123. Дои:10.6028 / jres.123.004.
^ Неджахи, Юнес; Соруш Бархаги, Мохаммед; Мик, Джейсон; Джекман, Брок; Рушайдат, Камель; Ли, Юаньчжэ; Швиберт, Лорен; Потофф, Джеффри (28 ноября 2018 г.). «GOMC: Монте-Карло, оптимизированный для графического процессора для моделирования фазовых равновесий и физических свойств сложных жидкостей». Программное обеспечениеX. 9: 20–27. Дои:10.1016 / j.softx.2018.11.005.
^ Дуббелдам, Дэвид; Калеро, София; Эллис, Дональд Э .; Снурр, Рэндалл К. (26 февраля 2015 г.). «RASPA: программа для молекулярного моделирования адсорбции и диффузии в гибких нанопористых материалах». Молекулярное моделирование. 42 (2): 81–101. Дои:10.1080/08927022.2015.1010082.
^ Kim, J .; и другие. (QMCPACK) (27 марта 2018 г.). «QMCPACK: пакет ab initio квантового Монте-Карло с открытым исходным кодом для электронной структуры атомов, молекул и твердых тел». Журнал физики: конденсированное вещество. В прессе (19): 195901. arXiv:1802.06922. Bibcode:2018JPCM ... 30s5901K. Дои:10.1088 / 1361-648X / aab9c3. PMID 29582782.

[1] Shah, Jindal K .; Марин-Римольди, Элисео; Маллен, Райан Готчи; Кин, Брайан П .; Хан, Сандип; Палуч, Эндрю С .; Рай, Нирадж; Romanielo, Lucienne L .; Рош, Томас У .; Ю, Брайан; Мэджинн, Эдвард Дж. (15 июля 2017 г.). «Cassandra: пакет Монте-Карло с открытым исходным кодом для молекулярного моделирования». Журнал вычислительной химии. 38 (19): 1727–1739. Дои:10.1002 / jcc.24807. PMID 28436594.

[2] Хэтч, Гарольд; Махински, Натан; Шен, Винсент (1 марта 2018 г.). "FEASST: Набор инструментов для моделирования свободной энергии и расширенного отбора проб". Журнал исследований Национального института стандартов и технологий. 123. Дои:10.6028 / jres.123.004.

[3] Неджахи, Юнес; Соруш Бархаги, Мохаммед; Мик, Джейсон; Джекман, Брок; Рушайдат, Камель; Ли, Юаньчжэ; Швиберт, Лорен; Потофф, Джеффри (28 ноября 2018 г.). «GOMC: Монте-Карло, оптимизированный для графического процессора для моделирования фазовых равновесий и физических свойств сложных жидкостей». Программное обеспечениеX. 9: 20–27. Дои:10.1016 / j.softx.2018.11.005.

[4] Дуббелдам, Дэвид; Калеро, София; Эллис, Дональд Э .; Снурр, Рэндалл К. (26 февраля 2015 г.). «RASPA: программа для молекулярного моделирования адсорбции и диффузии в гибких нанопористых материалах». Молекулярное моделирование. 42 (2): 81–101. Дои:10.1080/08927022.2015.1010082.

[5] Kim, J .; и другие. (QMCPACK) (27 марта 2018 г.). «QMCPACK: пакет ab initio квантового Монте-Карло с открытым исходным кодом для электронной структуры атомов, молекул и твердых тел». Журнал физики: конденсированное вещество. В прессе (19): 195901. arXiv:1802.06922. Bibcode:2018JPCM ... 30s5901K. Дои:10.1088 / 1361-648X / aab9c3. PMID 29582782.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]