Контрольный регион мтДНК - Википедия - mtDNA control region

Вторичная структура контрольной области митохондриальной ДНК A
MtDNA control SS.png
Консенсус вторичная структура для всех гаплотипы контрольной области мтДНК.
Идентификаторы
СимволмтДНК ssA
РфамRF01853
Прочие данные
РНК типАнтисмысловая РНК
Домен (ы)Млекопитающие
PDB структурыPDBe

Расположение контрольной области (CR) в митохондриальном геноме человека (серый прямоугольник) с тремя гипервариабельными участками (HV: зеленые прямоугольники).

В контрольная область мтДНК это область митохондриальный геном который некодирующая ДНК. Эта область контролирует синтез РНК и ДНК.[1] Это самый полиморфный область генома мтДНК человека,[2] с полиморфизмом, сосредоточенным в гипервариабельные области. Среднее нуклеотидное разнообразие в этих регионах 1,7%.[3] Несмотря на эту изменчивость, РНК транскрипт из этого региона имеет консервативный вторичная структура (на фото), который оказался ниже селективное давление.[4]

Контрольная область мтДНК содержит начало репликации одной нити, и происхождение транскрипция для обеих прядей.[5] Также есть открытая рамка чтения думал кодировать на 7 секунд рибосомная РНК в люди но не у мышей или коров, где это было удалено.[6]

Отличие от D-петли

Контрольный регион и мтДНК D-петля иногда используются в литературе как синонимы;[3] в частности, контрольная область включает D-петлю вместе с прилегающей транскрипционной промоутерские регионы. По этой причине область управления также известна акроним DLP, что означает D-Lуп и связанный промотеры.[7]

Исследование выносливости

контрольная область мтДНК гаплотипы были связаны с выносливость способность у людей.[8] Исследование 2002 г. последовательный контрольной области 55 субъектов и сравнили их гаплотип с увеличением VO2 Максимум через восемь недель Программа обучения. Они обнаружили, что разные гаплотипы были существенно связано с выносливостью испытуемых. Было высказано предположение, что это произошло потому, что контрольная область влияет на репликацию и транскрипцию в митохондриях.[4][8]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Структура митохондриального генома Центр изучения ДНК, Лаборатория Колд-Спринг-Харбор
  2. ^ Stoneking M, Hedgecock D, Higuchi RG, Vigilant L, Erlich HA (февраль 1991 г.). «Популяционная вариация последовательностей контрольной области мтДНК человека, обнаруженная ферментативной амплификацией и последовательностью-специфическими олигонуклеотидными зондами». Являюсь. J. Hum. Genet. 48 (2): 370–82. ЧВК  1683035. PMID  1990843.
  3. ^ а б Aquadro CF, Greenberg BD (февраль 1983 г.). "Изменения и эволюция митохондриальной ДНК человека: анализ нуклеотидных последовательностей семи человек". Генетика. 103 (2): 287–312. ЧВК  1219980. PMID  6299878. Получено 2010-07-29.
  4. ^ а б Перейра Ф., Соареш П., Карнейро Дж. И др. (Декабрь 2008 г.). «Доказательства переменного селективного давления на большую вторичную структуру контрольной области митохондриальной ДНК человека». Мол. Биол. Evol. 25 (12): 2759–70. Дои:10.1093 / молбев / msn225. PMID  18845547. Получено 2010-07-28.
  5. ^ Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г. и др. (Апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа. 290 (5806): 457–65. Дои:10.1038 / 290457a0. PMID  7219534.
  6. ^ Охала Д., Монтойя Дж., Аттарди Дж. (Апрель 1981 г.). «Модель пунктуации тРНК процессинга РНК в митохондриях человека». Природа. 290 (5806): 470–4. Дои:10.1038 / 290470a0. PMID  7219536.
  7. ^ Митикава Ю., Маццучелли Ф., Брезолин Н., Скарлато Дж., Аттарди Дж. (Октябрь 1999 г.). «Зависимое от старения большое накопление точечных мутаций в контрольной области мтДНК человека для репликации». Наука. 286 (5440): 774–9. Дои:10.1126 / science.286.5440.774. PMID  10531063.
  8. ^ а б Мураками Х., Ота А., Симодзё Х., Окада М., Аджисака Р., Куно С. (июнь 2002 г.). «Полиморфизм в контрольной области мтДНК связан с индивидуальными различиями в выносливости или обучаемости». Jpn. J. Physiol. 52 (3): 247–56. Дои:10.2170 / jjphysiol.52.247. PMID  12230801.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка