Мультилокусный генотип - Multilocus genotype

А мультилокусный генотип это сочетание аллели найдено в двух или более места у одного человека.

Например, в диплоид вида, если их два SNP локусы и первый локус имеет аллели A и G, в то время как второй локус имеет аллели T и C, мультилокусный генотип может быть представлен как {A / G, T / C}. Если геном не гаплоидный, то мультилокусный генотип не обязательно определяет, какие аллели одновременно встречаются на хромосомах. В этом примере, если два локуса расположены на одной хромосоме, возможны следующие варианты: {A-T, G-C} или {A-C, G-T}. Где A-T представляет собой гаплотип с аллелями A и T вместе на одной хромосоме и G и C вместе на другой. Если гаплотипы определены, мультилокусный генотип называется поэтапным генотипом, в противном случае он называется нефазированным. Некоторые авторы[1][2] предполагают, что термин мультилокусный генотип следует применять только к поэтапным мультилокусным данным, в то время как другие[3] примените его также к нефазированным мультилокусным данным. Комбинация аллелей в двух или более локусах на одной хромосоме составляет гаплотип, а два гаплотипа у диплоидного индивида составляют диплотип (синоним поэтапного мультилокусного генотипа).

Лабораторная процедура называется Multilocus_sequence_typing или «Мультилокусное генотипирование» может быть использовано при исследовании биологических популяций для идентификации и характеристики организма.

Рекомендации

  1. ^ Томпсон, Элизабет А. (2000). «Статистический вывод из генетических данных по родословным». JSTOR  4153187. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  2. ^ Ланге, Кеннет (2003). Математические и статистические методы генетического анализа. Нью-Йорк: Springer-Verlag. п. 4. ISBN  0-387-95389-2.
  3. ^ Причард, Джонатан К .; Стивенс, Мэтью; Доннелли, Питер (2000). «Вывод структуры популяции с использованием данных мультилокусного генотипа». Генетика. 155: 945–959.