Никелирующий фермент - Nicking enzyme

А выщипывающий фермент (или же щипать эндонуклеаза) является фермент который разрезает одну нить двухниточного ДНК при особом признании нуклеотид последовательности, известные как сайт ограничения. Такие ферменты гидролизуют (разрезают) только одну цепь дуплекса ДНК с образованием молекул ДНК, которые «разорваны», а не расщеплены.[1][2]

Их можно использовать для усиления со смещением цепей,[3] Реакция амплификации фермента Nicking, экзонуклеотическая деградация, создание небольших промежутков,[4] или же ник перевод.[5] Последний процесс был успешно использован для включения как радиоактивно меченых нуклеотидов, так и флуоресцентных нуклеотидов, что позволило исследовать определенные области на двухцепочечной ДНК.[5][6] Было изучено более 200 никелирующих ферментов, 13 из них коммерчески доступны.[7] и обычно используются для исследований и в коммерческих продуктах.

Рекомендации

  1. ^ Андо Т; и другие. (Июль 1969 г.). «Выделение и характеристика ферментов с никелирующим действием из Escherichia coli, инфицированных фагом Т4». J. Biochem. 66 (1): 1–10. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a129107. PMID  4309718.
  2. ^ Морган Р.Д., Конг Х. и др. (Ноябрь 2000 г.). «Характеристика специфической ДНК-активности рестрикционной эндонуклеазы N.BstNBI». Биол. Chem. 381 (11): 1123–5. Дои:10.1515 / BC.2000.137. PMID  11154070.
  3. ^ Walker GT, Little MC, Nadeau JG, Shank DD (январь 1992 г.). «Изотермическая амплификация in vitro ДНК с помощью системы рестрикционных ферментов / ДНК-полимераз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (1): 392–6. Bibcode:1992PNAS ... 89..392Вт. Дои:10.1073 / pnas.89.1.392. ЧВК  48243. PMID  1309614.
  4. ^ Ван Х., Хейс Дж. Б. (октябрь 2001 г.). «Простая и быстрая подготовка плазмидной ДНК с разрывом для включения олигомеров, содержащих специфические повреждения ДНК». Мол. Биотехнология. 19 (2): 133–40. Дои:10.1385 / МБ: 19: 2: 133. PMID  11725483.
  5. ^ а б Ригби П. У., Дикманн М., Родос С., Берг П. (июнь 1977 г.). «Маркировка дезоксирибонуклеиновой кислоты для высокой специфической активности in vitro путем ник-трансляции ДНК-полимеразой I». J. Mol. Биол. 113 (1): 237–51. Дои:10.1016/0022-2836(77)90052-3. PMID  881736.
  6. ^ Джо К., Дхингра Д.М., Одийк Т., де Пабло Дж. Дж., Грэм, доктор медицины, Раннхейм Р., Форрест Д., Шварц, округ Колумбия (2007). «Система штрихового кодирования одной молекулы с использованием нанощелей для анализа ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (8): 2673–8. Bibcode:2007PNAS..104.2673J. Дои:10.1073 / pnas.0611151104. ЧВК  1815240. PMID  17296933.
  7. ^ "REBASE ферменты". Получено 2009-06-01. Неизвестный параметр | энциклопедия = игнорируется (помощь)

внешняя ссылка