Ген ниф - Википедия - Nif gene

В ниф гены находятся гены кодирующие ферменты, участвующие в фиксация атмосферного азота в форме азот доступны для живых организмов. Первичный фермент, кодируемый ниф гены - это нитрогеназа комплекс, отвечающий за преобразование атмосферного азота (N2) к другим формам азота, таким как аммиак которые организм может использовать для различных целей. Помимо фермента нитрогеназы, ниф гены также кодируют ряд регуляторных белков, участвующих в азотфиксации. В ниф гены находятся в обоих свободноживущие азотфиксирующие бактерии и симбиотические бактерии связаны с различными растениями. Выражение ниф гены индуцируются как ответ на низкие концентрации фиксированных концентраций азота и кислорода (низкие концентрации кислорода активно поддерживаются в корневой среде растений-хозяев). Первые гены Rhizobium для азотфиксация (nif) и для клубеньков (nod) были клонированы в начале 1980-х гг. Гэри Рувкун и Шэрон Р. Лонг в Фредерик М. Осубель лаборатория.[1]

Регулирование

У большинства бактерий регуляция ниф транскрипция генов осуществляется азот-чувствительным белком NifA. Когда фиксированного азота недостаточно для использования организмом, NtrC запускает экспрессию NifA, а NifA активирует остальную часть ниф гены. Если имеется достаточное количество восстановленного азота или кислорода, активируется другой белок: NifL. NifL подавляет активность NifA, что приводит к ингибированию образования нитрогеназы. NifL регулируется продуктами glnD и glnK. В ниф гены можно найти на бактериальных хромосомы, но у симбиотических бактерий они часто встречаются на плазмиды или же острова симбиоза с другими генами, связанными с азотфиксацией (такими как кивок гены ).

Примеры в природе

Выражение и регулирование ниф гены, обладая общими чертами у всех или большинства азотфиксирующих организмов в природе, обладают различными характеристиками и качествами, которые различаются от одного диазотрофа к другому. Примеры ниф генная структура и регуляция у разных диазотрофов включают:

Клебсиелла пневмонии - свободноживущая анаэробная азотфиксирующая бактерия. Всего в нем 20 ниф гены, расположенные на хромосоме в области 24 Kb. nifH, nifD, и nifK кодируют субъединицы нитрогеназы, а NIFE, nifN, нифу, НИФС, nifV, nifW, nifX, nifB, и nifQ кодируют белки, участвующие в сборке и включении утюг и молибден атомы в субъединицы нитрогеназы. nifF и nifJ кодируют белки, связанные с переносом электронов в процессе восстановления и НИФА и нифл являются регуляторными белками, отвечающими за регулирование экспрессии других ниф гены.[2][3]

Rhodospirillum rubrum - свободноживущая анаэробная фотосинтезирующая бактерия, которая, в дополнение к средствам контроля транскрипции, описанным выше, регулирует экспрессию ниф гены также метаболическим путем через обратимый АДФ-рибозилирование конкретного аргинин остаток в нитрогеназном комплексе. Рибозилирование происходит, когда присутствует восстановленный азот, и оно создает барьер для потока переноса электронов и тем самым инактивирует активность нитрогеназы. Ферменты, катализирующие рибозилирование, называются DraG и DraT.[3][4]

Rhodobacter capsulatus - свободноживущий анаэробный фототроф, содержащий транскрипционный ниф система регуляции генов. R. capsulatus регулирует ниф экспрессия гена через НИФА таким же образом, как описано ранее, но использует другой НИФА активатор, который инициирует NtrC. NtrC активирует другую экспрессию НИФА и другие ниф гены.[3][4]

Ризобий spp. - грамотрицательные симбиотические азотфиксирующие бактерии, которые обычно образуют симбиотические отношения с бобовые разновидность. У некоторых ризобий ниф гены расположены на плазмидах, называемых «сим-плазмидами» (сим = симбиоз), которые содержат гены, связанные с фиксацией азота и метаболизмом, тогда как хромосомы содержат большинство генов домашнего хозяйства бактерий. Регулирование ниф гены находятся на уровне транскрипции и зависят от колонизации растения-хозяина.[3][4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Спанек, Герман П. (1998). Rhizobiaceae: молекулярная биология модельных бактерий, ассоциированных с растениями. Springer. ISBN  978-0792351801.
  2. ^ [1]
  3. ^ а б c d Иво Ватанабе, «Биологическая фиксация азота и его использование в сельском хозяйстве (схема)»
  4. ^ а б c Меррик MJ, Эдвардс RA (1995). Контроль азота в бактериях. Обзор Microbiol 59 (4): 604-22

внешняя ссылка