Подавитель бессмыслицы - Википедия - Nonsense suppressor

А подавитель бессмыслицы является фактором, который может подавлять действие бессмысленная мутация. Подавители бессмыслицы можно в целом разделить на два класса: а) мутировавшие тРНК который может связываться с кодоном терминации на мРНК; б) мутация на рибосомы уменьшение эффекта терминирующего кодона. Считается, что подавители бессмыслицы сохраняют низкую концентрацию в клетке и не нарушают нормального перевод большую часть времени. Кроме того, многие гены не имеют только одного кодона терминации, и клетки обычно используют кодоны охры в качестве сигнала терминации, чьи бессмысленные супрессоры обычно неэффективны.[1][2][3]

Подавитель бессмыслицы - полезный генетический инструмент, но он также может приводить к проблемным побочным эффектам, поскольку все идентичные стоп-кодоны в геноме также будут подавляться в одинаковой степени. Гены с разными или множественными стоп-кодонами не пострадают.

SUP35, подавитель бессмыслицы, идентифицированный Wickner в 1994 г. прионный белок.

В синтетической биологии искусственные тРНК-супрессоры-удлинители используются для включения неприродные аминокислоты на бессмысленных кодонах, помещенных в кодирующую последовательность гена.[4] Старт-кодоны также могут быть подавлены с помощью супрессорных тРНК инициатора, таких как янтарная супрессорная тРНК стоп-кодона.fMet2(CUA).[5] Янтарная тРНК инициатора заряжена метионином.[6] и глютамин[7].

Рекомендации

  1. ^ Дэвид Л. Нельсон; и другие. (2013). Принципы биохимии (том 3). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: В. Х. Фриман и компания. п. 1134. ISBN  978-1-4292-3414-6.
  2. ^ Хартвелл, Лиланд; Л. Худ; М. Гольдберг; А. Рейнольдс; Л. Сильвер; Р. Верес (2004). Генетика: от генов к геномам. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Макгроу-Хилл. п. 267. ISBN  978-0-07-246248-7.
  3. ^ "Глушители глупостей". Государственный университет Сан-Диего.
  4. ^ Янг, Дуглас Д.; Шульц, Питер G (2018). «Игра с молекулами жизни». ACS Химическая биология. 13 (4): 854–870. Дои:10.1021 / acschembio.7b00974. ЧВК  6061972. PMID  29345901.
  5. ^ Варшней, У .; Радж Бхандари, У. Л. (1 февраля 1990 г.). «Инициирование синтеза белка с терминационного кодона». Труды Национальной академии наук. 87 (4): 1586–1590. Bibcode:1990ПНАС ... 87,1586В. Дои:10.1073 / pnas.87.4.1586. ISSN  0027-8424. ЧВК  53520. PMID  2406724.
  6. ^ Винсент, Рассел М .; Райт, Брэдли У .; Яшке, Пол Р. (11.03.2019). "Измерение ортогональности тРНК инициатора янтаря в геномно перекодированном организме". Синтетическая биология ACS. 8 (4): 675–685. Дои:10.1021 / acssynbio.9b00021. PMID  30856316.
  7. ^ Говиндан, Ашвин; Мирьяла, Сандип; Мондал, Санджай; Варшней, Умеш (2018-09-04). «Разработка систем анализа для декодирования янтарных кодонов на этапах инициации и удлинения микобактерий». Журнал бактериологии. 200 (22). Дои:10.1128 / jb.00372-18. ISSN  0021-9193. ЧВК  6199473. PMID  30181124.