Программное обеспечение OpenEye Scientific - OpenEye Scientific Software

Программное обеспечение OpenEye Scientific
Тип	Частная, принадлежащий сотруднику, C Corporation
Промышленность	Компьютерное программное обеспечение; Исследования и разработки; Биотехнологии; Хеминформатика
Основан	1997
Штаб-квартира	Санта-Фе, Нью-Мексико, Соединенные Штаты
Количество работников	100-200
Интернет сайт	www.глаза открыты.com

Программное обеспечение OpenEye Scientific американская софтверная компания, которая занимается крупномасштабной молекулярное моделирование Приложения и наборы инструментов.

Объем

В первую очередь ориентирована на открытие лекарств и дизайн, области применения включают создание конформации, стыковка, сравнение форм, обвинять /электростатика, хеминформатика и визуализация. Программное обеспечение разработано с учетом научной строгости, а также скорости, масштабируемости и независимость от платформы.

OpenEye делает большую часть своих технологий доступной в виде наборы инструментов подходит для индивидуальной разработки. Наборы инструментов доступны на нескольких языках: C ++, Python, Ява и C #.^{[нужна цитата ]}

Программное обеспечение

AFITT - Кристаллографический уточнение и анализ.
БРУД - Bioisostere идентификация с использованием формы, химии и электростатическое подобие.
EON - Химическая анализ сходства путем сравнения электростатическое покрытие.
FastROCS - поиск трехмерных форм молекул в реальном времени с использованием технологии графического процессора.
ФИЛЬТР - Молекулярный скрининг и отбор на основе физического свойства или функциональной группы.
OEDocking - инструменты молекулярной стыковки, в том числе FRED (быстрая стыковка), HYBRID (стыковка под контролем лиганда) и POSIT (прогнозирование позы под контролем лиганда).
OMEGA - Быстро, точно поколение конформеров, для линейных и макроциклических молекул.
pKa Prospector - база данных высококачественных измерений pKa.
QUACPAC - Таутомеры, состояния протонирования и заряды для малых молекулы и белки.
ROCS - Химическое сходство анализ с помощью быстрого поиска трехмерных форм молекул.
SZMAP - Определите участки воды в сайте связывания белка для повышения активности лиганда.
SZYBKI - Быстрая оптимизация силового поля лиганды в газовая фаза, решение, или в пределах активный сайт белка.
VIDA - графический пользовательский интерфейс, который визуализирует, анализирует и управляет корпоративными коллекциями молекулярные структуры и информация.

Наборы инструментов

Библиотеки программирования, предоставляющие другим приложениям объектно-ориентированный доступ к заданному набору возможностей.

OEChem TK - Химинформатика и обработка трехмерных молекулярных данных.
OEDepict TK - Элегантная двухмерная структурная визуализация соединений.
OEDocking TK - Стыковка и подсчет очков.
Grapheme TK - Улучшенная визуализация структуры соединений.
GraphSim TK - 2D молекулярные отпечатки пальцев и расчеты подобия.
Lexichem TK - Современное преобразование составных названий и структур с поддержкой нескольких языков.
МолПроп ТК - 2D расчет и фильтрация молекулярных свойств.
QuacPac TK - поколение таутомеров.
Омега ТК - Конформер поколения.
Shape TK - Сравнение форм молекул на основе трехмерных наложений.
Spicoli TK - быстрое создание и обработка поверхности молекул.
Szmap TK - Взаимодействие с водой в сайте связывания.
Szykbi TK - Оптимизация обобщенных функций, например оптимизация молекулярной структуры.
Зап ТК - Эффективный Пуассона-Больцмана электростатика решатель.