Пателламид А - Patellamide A

Пателламид А
Пателламид A.svg
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ChemSpider
Характеристики
C35ЧАС50N8О6S2
Молярная масса742.96 г · моль−1
Если не указано иное, данные для материалов приводятся в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки на инфобоксы

Пателламид А это пептид натуральный продукт произведено Прохлор дидемни, цианобактериальный симбионт Lissoclinum patella, и впервые был выделен в 1981 году.[1] Пателламид А - один из многих пептидов дидемнида. Другие близкородственные пептиды включают: пателламиды B, C, и D и стволамид. Пателламиды и транкамид показывают умеренную цитотоксичность и активность против множественной лекарственной устойчивости рак Сотовые линии.[2]

История

Пателламид А был впервые выделен в 1981 г. из оболочка L. patella собраны с рифов острова Коррор, Палау Острова.[1] L. patella был богатым источником пептидных натуральных продуктов. Помимо пателламидов, лиссоклинамиды, улицикламид, улитиацикламид и асцидиацикламид были выделены из L. patella.[3] Абсолютный стереохимия позже был определен Рентгеновская кристаллография.[4]

Биосинтез

Пателламид А происходит из рибосомальный пептид, что делает его членом RiPP надсемейство натуральные продукты. Это было определено после секвенирования генома П. дидеми показали отсутствие нерибосомальных пептидных синтетаз.[2] Кластер биосинтетических генов пателламида А содержит гены patA, patB, patC, patD, погладить, patF и patG.[2] Эти гены при введении в Кишечная палочка, вызывают производство пателламида А, окончательно подтверждая их ответственность за биосинтез пателламида А. Ген погладить кодирует пептид-предшественник, который содержит первичные последовательности пателламидов A и C. Это было предложено Шмидтом и другие. что этот препателламид гетероциклизирован с образованием оксазолин и тиазолин кольца PatD2. Предполагается, что PatG1 впоследствии участвует в окислении тиазолиновых колец до тиазол кольца, обнаруженные в пателламиде A. Затем пептид расщепляется, возможно, с помощью PatA или PatG2, и циклизуется, циклизации, вероятно, способствует аденилирование с помощью PatD1 с образованием двух циклических пептидов, пателламидов A и C.[2] Хотя все аминокислоты, используемые при производстве пателламида A, являются L-аминокислотами, некоторые из аминокислот, обнаруженных в природном пателламиде A, являются D-эпимерами. Предлагается, чтобы эпимеризация этих аминокислот происходит спонтанно. Это было определено путем сравнения с аналогичной системой, лизоклинамидом 7.[5]

Пателламидбиосинтез[2]

Рекомендации

  1. ^ а б Ирландия, C .; Дюрсо, А .; Newman, R .; Хакер, Д. (1982). «Противоопухолевые циклические пептиды из морской оболочки Lissoclinum patella». J. Org. Chem. 47 (10): 1807–1811. Дои:10.1021 / jo00349a002.
  2. ^ а б c d е Schmidt, E .; Nelson, J .; Rasko, D .; Судек, С .; Eisen, J .; Haygood, M .; Равель, Дж. (2005). «Биосинтез пателламидов А и С с помощью микроцинового пути в Prochloron didemni, цианобактериальном симбионте Lissoclinum patella». Proc. Natl. Акад. Наука. 102 (20): 7315–7320. Bibcode:2005ПНАС..102.7315С. Дои:10.1073 / pnas.0501424102. ЧВК  1091749. PMID  15883371.
  3. ^ Дегнан, Б .; Hawkins, C .; Лавин, М .; Mccaffrey, E .; Parry, D .; Ванденбренк, А .; Уоттерс Д. (1989). «Новые циклические пептиды с цитотоксической активностью из асцидии Lissoclinum patella». J. Med. Chem. 32 (6): 1349–1354. Дои:10.1021 / jm00126a034. PMID  2724305.
  4. ^ In, Y .; Doi, M .; Inoue, M .; Исида, Т. (1994). «Пателламид А, цитотоксический циклический пептид асцидии Lissoclinum patella». Acta Crystallogr. 50 (3): 432–434. Дои:10.1107 / s010827019300811x. PMID  8018309.
  5. ^ Milne, B .; Long, P .; Starcevic, A .; Hranueli, D .; Джаспарс, М. (2006). «Спонтанность в пути биосинтеза пателламида». Орг. Biomol. Chem. 4 (4): 631–638. CiteSeerX  10.1.1.1027.4259. Дои:10.1039 / b515938e. PMID  16467937.