Полония (биология) - Polony (biology)

Полония представляет собой сокращение «полимеразной колонии», маленькой колонии ДНК.

Полонии - это дискретные клональные амплификации одной молекулы ДНК, выращенные в гелевой матрице. Такой подход значительно улучшает отношение сигнал / шум. Полонии могут быть созданы с использованием нескольких методов, включая твердофазные. полимеразной цепной реакции (ПЦР]) в полиакриламидных гелях. Однако другие ранее запатентованные технологии, например, от Прогнозирующая медицина Manteia (приобретены Solexa), которые генерируют ДНК на твердофазной поверхности путем мостовой амплификации, обычно называются «кластерами».

Терминология и различие между «полонией» и «кластером» в последнее время запутались. Рост клональных копий ДНК на поверхности гранул еще не получил общего названия, хотя некоторые также пытаются назвать этот метод методом «полонии». Концепция локализации и анализа областей, содержащих популяции клональных нуклеиновых кислот, была впервые описана в патентах Брауна и др. (Принадлежащих Genomic Nanosystems), однако они находятся в жидкой фазе. Кластеры отличаются тем, что они основаны на твердофазной амплификации одиночных молекул ДНК, когда ДНК ковалентно прикреплена к поверхности. Эта технология, первоначально получившая название «генерация ДНК-колоний», была изобретена и разработана в конце 1996 года в Женевском институте биомедицинских исследований Glaxo-Welcome (GBRI) доктором Паскалем Майером и доктором Лораном Фаринелли,[1] и впервые была публично представлена ​​в 1998 году.[2] Наконец, компания Solexa вывела его на рынок. Solexa Ltd / INC (Бентли и др.).

Рекомендации

  1. ^ патенты WO 9844151, WO 9844152
  2. ^ Параллельное секвенирование колоний ДНК презентация ams98

внешняя ссылка

  • Руководство по технологиям Polony
  • «Методы амплификации и секвенирования нуклеиновых кислот».
  • Adessi C, Matton G, Ayala G и др. (Октябрь 2000 г.). «Твердая фаза амплификации ДНК: характеристика механизмов прикрепления праймеров и амплификации». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (20): E87. Дои:10.1093 / nar / 28.20.e87. ЧВК  110803. PMID  11024189.