Prp24 - Prp24

Prp24 (прекурсор рNA ппроцессинг, ген 24) является белковой частью пре-мессенджер РНК сращивание процесс и помогает связывать U6 мяРНК к U4 мяРНК во время формирования сплайсосомы. Нашел в эукариоты из дрожжи к Кишечная палочка, грибы и людей, Prp24 был первоначально обнаружен как важный элемент сплайсинга РНК в 1989 году.[1][2] Мутации в Prp24 были позже обнаружены в 1991 г. для подавления мутации в U4, что привело к появлению чувствительных к холоду штаммов дрожжей, что указывает на его участие в реформировании дуплекса U4 / U6 после каталитических стадий сплайсинга.[3]

Prp24 RRMs 1 и 2

Биологическая роль

В процессе образования сплайсосом участвуют U4 и U6 snRNPs связывание и формирование ди-snRNP в ядро клетки. Затем этот ди-snRNP набирает другого члена (U5 ), чтобы стать tri-snRNP. U6 должен затем отделиться от U4, чтобы соединиться с U2 и становятся каталитически активными. После того, как сплайсинг был выполнен, U6 должен отделиться от сплайсосомы и снова соединиться с U4, чтобы перезапустить цикл.

Было показано, что Prp24 способствует связыванию snRNP U4 и U6. Удаление Prp24 приводит к накоплению свободных U4 и U6, а последующее добавление Prp24 регенерирует U4 / U6 и уменьшает количество свободных U4 и U6.[4] Голая мяРНК U6 очень компактна и имеет мало места для формирования пар оснований с другой РНК. Однако, когда U6 snRNP связывается с белками, такими как Prp24, структура становится намного более открытой, что облегчает связывание с U4.[5] Prp24 не присутствует в самом дуплексе U6 / U4, и было высказано предположение, что Prp24 должен покинуть комплекс, чтобы сформировались правильные пары оснований.[6][7] Также было высказано предположение, что Prp24 может играть роль в дестабилизации U4 / U6, чтобы U6 мог спаривать основания с U2.[8]

Структура

Прп 24 РРМ 3

Prp24 имеет молекулярный вес из 50 кДа и было показано, что он содержит четыре распознающих РНК мотивы (RRMs) и консервативная 12-аминокислотная последовательность на C-конец.[9][10] Показано, что RRM 1 и 2 важны дляблизость связывание U6, тогда как RRM 3 и 4 связываются в сайтах с более низким сродством на U6.[11] Первые три RRM интенсивно взаимодействуют друг с другом и содержат канонические складки, содержащие четырехцепочечный бета-лист и два альфа-спирали. Электроположительная поверхность RRM 1 и 2 представляет собой РНК. отжиг домен, в то время как щель между RRM 1 и 2, включая поверхность бета-листа RRM2, представляет собой сайт связывания РНК, специфичный для последовательности.[1] С-концевой мотив необходим для ассоциации с LSm белков и способствует субстрат (U6) связывание, а не каталитическая скорость сплайсинга.[10]

U6 snRNP с ассоциированными белками Prp24 и LSm

Взаимодействия

Prp24 взаимодействует с мяРНК U6 через свои RRM. Это было показано через химическая модификация тестирование этого нуклеотиды 39–57 из U6 (в частности 40–43)[5] участвуют в связывании Prp24.[12]

Белки LSm находятся в согласованной конфигурации на РНК U6.[9][требуется разъяснение ] Было высказано предположение, что белки LSm и Prp24 взаимодействуют как физически, так и функционально.[6] и С-концевой мотив Prp24 важен для этого взаимодействия.[10] Связывание Prp24 с U6 усиливается связыванием белков Lsm с U6, как и связывание U4 и U6.[13] Это было обнаружено электронная микроскопия что Prp24 может взаимодействовать с белковым кольцом LSm в LSm2.[9]

Гомологи

Prp24 имеет человека гомолог, SART3. SART3 - отторжение опухоли антиген (SART3 означает "sплоскоклеточный рак аntigen рпризнанный Т клетки, ген 3). RRM 1 и 2 в дрожжах аналогичны RRM в SART3 человека.[1][11] С-концевой домен также является высококонсервативным от дрожжей для человека.[14] Этот белок, как и Prp24, взаимодействует с белками LSm.[9][15] для рециркуляции U6 в snRNP U4 / U6. Было предложено, чтобы SART3 нацелил U6 на Тело Кахала или ядерное включение как место сборки мяРНП U4 / U6.[15] SART3 находится на хромосома 12, а мутация вероятно причина диссеминированный поверхностный актинический порокератоз.[16]

Рекомендации

  1. ^ а б c Bae, E .; и другие. (2007). «Структура и взаимодействия первых трех мотивов распознавания РНК фактора сплайсинга Prp24». Журнал молекулярной биологии. 367 (5): 1447–1458. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.01.078. ЧВК  1939982. PMID  17320109.
  2. ^ Vijayraghavan, U .; Компания, М .; Абельсон, Дж. (1989). «Выделение и характеристика мутантов сплайсинга пре-мРНК Saccharomyces cerevisiae". Гены и развитие. 3 (8): 1206–1216. Дои:10.1101 / gad.3.8.1206. PMID  2676722.
  3. ^ Шеннон, К. В .; Гатри, К. (1991). «Супрессоры мутации мяРНК U4 определяют новый белок мяРНП U6 с РНК-связывающими мотивами». Гены и развитие. 5 (5): 773–785. Дои:10.1101 / gad.5.5.773. PMID  1827420.
  4. ^ Raghunathan, P.L .; Гатри, К. А. (1998). "Фактор рециклинга сплайсосом, который повторно отжигает U4 и U6 малые ядерные частицы рибонуклеопротеина". Наука. 279 (5352): 857–860. Bibcode:1998Научный ... 279..857R. Дои:10.1126 / science.279.5352.857. PMID  9452384.
  5. ^ а б Карадуман, Р .; и другие. (2006). «Структура РНК и РНК-белковые взаимодействия в очищенных дрожжевых мяРНП U6». Журнал молекулярной биологии. 356 (5): 1248–1262. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.12.013. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-E5F7-6. PMID  16410014.
  6. ^ а б Vidal, V.P .; и другие. (1995). «Характеристика взаимодействий U6 snRNA-белок». РНК. 5 (11): 1470–1481. Дои:10.1017 / S1355838299991355. ЧВК  1369868. PMID  10580475.
  7. ^ Jandrositz, A .; Гатри, А. (1995). «Доказательства наличия сайта связывания Prp24 в мяРНК U6 и предполагаемого промежуточного продукта при отжиге мяРНК U6 и U4». Журнал EMBO. 14 (4): 820–832. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07060.x. ЧВК  398149. PMID  7882985.
  8. ^ Vidaver, R.M .; Фортнер, DM; Лоос-Остин, LS; Бровь, Д.А. (1999). «Множественные функции белка сплайсинга Prp24 Saccharomyces cerevisiae в структурных перестройках РНК U6». Генетика. 153 (3): 1205–1218. ЧВК  1460831. PMID  10545453.
  9. ^ а б c d Карадуман, Р .; и другие. (2008). «Структура дрожжевых snRNPs U6: расположение Prp24p и комплекса LSm, выявленное с помощью электронной микроскопии». РНК. 14 (12): 1–10. Дои:10.1261 / rna.1369808. ЧВК  2590955. PMID  18971323.
  10. ^ а б c Rader, S.D .; Гатри, К. (2002). «Консервативный мотив Lsm-взаимодействия в Prp24, необходимый для эффективного образования ди-snRNP U4 / U6». РНК. 8 (11): 1378–1392. Дои:10.1017 / S1355838202020010. ЧВК  1370345. PMID  12458792.
  11. ^ а б Kwan, S. S .; Бров, Д. А. (2005). «Мотивы распознавания N- и C-концевой РНК фактора сплайсинга Prp24 выполняют различные функции в связывании РНК U6». РНК. 11 (5): 808–820. Дои:10.1261 / rna.2010905. ЧВК  1370765. PMID  15811912.
  12. ^ Ghetti, A .; Компания, М .; Абельсон, Дж. (1995). «Специфичность связывания Prp24 с РНК: роль Prp24 в динамическом взаимодействии мяРНК U4 и U6». РНК. 1 (2): 132–145. ЧВК  1369067. PMID  7585243.
  13. ^ Райан, Д. Э .; Stevens, S.W .; Абельсон, Дж. (2002). «5 'и 3' домены дрожжевой мяРНК U6: Lsm белков способствуют связыванию белка Prp24 с областью телестемы U6». РНК. 8 (8): 1011–1033. Дои:10.1017 / S1355838202026092. ЧВК  1370313. PMID  12212846.
  14. ^ Bell, M .; и другие. (2002). «p110, новый белок snRNP U6 человека и фактор рециклинга snRNP U4 / U6». Журнал EMBO. 21 (11): 2724–2735. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2724. ЧВК  126028. PMID  12032085.
  15. ^ а б Stanek, D .; и другие. (2003). "Нацеливание фактора сборки малых ядерных RNP U4 / U6 SART3 / p110 на тельца Кахаля". Журнал клеточной биологии. 160 (4): 505–516. Дои:10.1083 / jcb.200210087. ЧВК  2173746. PMID  12578909.
  16. ^ «ОМИМ - ПОРОКЕРАТОЗ, РАСПРОСТРАНЕННЫЙ ПОВЕРХНОСТНЫЙ АКТИНИК, 1; ДСАП1». Получено 2009-04-05.

внешняя ссылка