Аллели псевдодефицита - Википедия - Pseudodeficiency alleles

А аллель псевдодефицита или же псевдодефицитная мутация представляет собой мутацию, которая изменяет белковый продукт или изменяет экспрессию гена, но не вызывает заболевания. Например, в лизосомные болезни накопления, пациенты с аллелем псевдодефицита демонстрируют значительно сниженную активность ферментов, но при этом остаются клинически здоровыми.

В медицинской генетике ложный положительный результат результат происходит в ферментный анализ Тестировать, если результаты теста положительные, но болезни или заболеваемости нет. Одна из возможных причин ложноположительных результатов - аллель псевдодефицита. Заболевание также может присутствовать, но на субклиническом уровне.

Примеры

  • Болезнь Тея – Сакса. Тестирование ферментов было особенно эффективным среди евреев-ашкенази, потому что в этой популяции обнаруживается меньше аллелей псевдодефицита по сравнению с общей популяцией. Скрининг на носительство среди населения в целом не был таким надежным.[1][2]
  • Метахроматическая лейкодистрофия. Низкий арилсульфатаза А активность может возникать у здоровых людей. Это создает проблему для генетического тестирования, затрудняя различение пациентов, которые подвержены риску развития заболевания, и тех, кто является здоровым носителем мутации псевдодефицита. Метахроматическая лейкодистрофия является классическим примером трудностей, вызванных псевдодефицитом при скрининге носителей, потому что в некоторых популяциях были обнаружены очень высокие частоты псевдодефицитных носителей.[3]

Подразумеваемое

Аллель псевдодефицита может указывать на недостаток метода анализа ферментов или может отражать неполное понимание активности фермента.

  • Ферментный анализ может быть недействительным из-за различий между природным субстратом и искусственным субстратом, используемым в тестировании.
  • Ген может по-разному экспрессироваться в разных тканях, вызывая положительный результат в проверяемой ткани, даже если болезни нет. Сыворотка крови часто используется для тестирования ферментов, потому что ее можно взять недорого. Тестирование с другими типами тканей может дать более надежные результаты.
  • Ферментный анализ может быть верным, но понимание болезни и метаболический путь в котором это происходит, может быть неправильным или неполным.

Из-за аллелей псевдодефицита результаты тестирования ферментов в одной популяции не могут быть распространены на другие популяции. Например, в то время как скрининг Тея – Сакса смог почти устранить болезнь Тея – Сакса среди Евреи ашкенази, аналогичный скрининг среди населения в целом оказался менее эффективным.[1]

Для некоторых генетических заболеваний, особенно тех, которые имеют низкий пенетрантность или легко поддаются лечению, проверка носителей может иметь сомнительную ценность, когда аллели псевдодефицита присутствуют с высокой частотой.[4]

Рекомендации

  1. ^ а б Триггс-Рейн Б.Л., Мулз Е.Н., Кабак М.М., Линн-Стил Дж.С., Даулинг К.Э., Акерман Б.Р. (1992). «Аллель псевдодефицита, распространенный у нееврейских носителей Тея – Сакса: значение для скрининга носителей». Американский журнал генетики человека. 51 (4): 793–801. ЧВК  1682803. PMID  1384323.
  2. ^ Cao, Z; Natowicz, MR; Кабак, ММ; Лим-Стил, Дж. С.; Prence, EM; Браун, D; Шабо, Т; Триггс-Рейн, BL. (1993). «Вторая мутация, связанная с очевидным псевдодефицитом бета-гексозаминидазы A: идентификация и оценка частоты». Американский журнал генетики человека. 53 (6): 1198–1205. ЧВК  1682498. PMID  7902672.
  3. ^ Барт М.Л., Уорд С., Харрис А., Саад А., Фенсом А. (1994). «Частота мутаций, связанных с псевдодефицитом арилсульфатазы А, у здорового населения». Журнал медицинской генетики. 31 (9): 667–71. Дои:10.1136 / jmg.31.9.667. ЧВК  1050073. PMID  7815433.
  4. ^ Цукерман С., Лахад А., Шмуэли А., Зимран А., Пелег Л., Орр-Уртрегер А., Леви-Лахад Е., Саги М. (19 сентября 2007 г.). «Скрининг носителей болезни Гоше: уроки излечимых болезней с низкой пенетрантностью». Журнал Американской медицинской ассоциации. 298 (11): 1281–90. Дои:10.1001 / jama.298.11.1281. PMID  17878420.