S100P - S100P

S100P
Доступные конструкции
PDB	Human UniProt search: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1J55, 1OZO, 2MJW
Идентификаторы
Псевдонимы	S100P, MIG9, кальций-связывающий белок P S100
Внешние идентификаторы	OMIM: 600614 ГомолоГен: 81743 Генные карты: S100P
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	6,697,170 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов кальция; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание рецептора RAGE; • связывание ионов металлов; • кальций-зависимое связывание с белками; • связывание ионов магния; • связывание кадгерина; • связывание ионов переходных металлов; • активность гомодимеризации белков;
Сотовый компонент	• клеточная мембрана; • проекция клетки; • внеклеточная экзосома; • мембрана; • ядро клетки; • мембрана микроворсинок; • цитоплазма; • внеклеточная область; • ядерное тело; • просвет секреторной гранулы;
Биологический процесс	• реакция на органическое вещество; • миграция эндотелиальных клеток; • дегрануляция нейтрофилов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6286
	н / д
	ENSG00000163993
	н / д
	P25815
	н / д
	NM_005980
	н / д
	NP_005971
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека

S100 кальций-связывающий белок P (S100P) это белок что у людей кодируется S100P ген.^[3]^[4]^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом Семейство белков S100 содержащий 2 кальций-связывающих мотива EF-hand. Белки S100 локализованы в цитоплазме и / или ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессия и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21; однако этот ген расположен в 4p16. Этот белок, помимо связывания Са²⁺, также связывает Zn²⁺ и Mg²⁺. Этот белок может играть роль в этиологии рака простаты.^[5]

Взаимодействия

S100P был показан взаимодействовать с участием EZR ^[6] и RAGE.^[7] Взаимодействие между S100P и RAGE нарушается кромолином.^[8] и пентамидин.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163993 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г., Эрне П., Хейцманн С.В. (август 1993 г.). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (14): 6547–51. Дои:10.1073 / пнас.90.14.6547. ЧВК 46969. PMID 8341667.
^ Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хейцманн С.В. (июнь 1995 г.). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.
^ ^а ^б «Ген Entrez: кальций-связывающий белок P S100P S100».
^ Кольцшер М., Нойман С., Кёниг С., Герке В. (июнь 2003 г.). «Са2 + -зависимое связывание и активация спящего эзрина димерным S100P». Молекулярная биология клетки. 14 (6): 2372–84. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0553. ЧВК 194886. PMID 12808036.
^ ^а ^б Penumutchu SR, Chou RH, Yu C. (2014-08-01). «Структурные сведения о кальций-связанном S100P и V-домене комплекса RAGE». PLOS ONE. 9 (8): e103947. Дои:10.1371 / journal.pone.0103947. ЧВК 4118983. PMID 25084534.
^ Penumutchu SR, Chou RH, Yu C. (октябрь 2014 г.). «Взаимодействие между S100P и противоаллергическим препаратом кромолин». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 454 (3): 404–409. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.10.048. PMID 25450399.

дальнейшее чтение

Шефер Б.В., Хейцманн С.В. (1996). «Семейство S100 кальций-связывающих белков руки EF: функции и патология». Trends Biochem. Наука. 21 (4): 134–40. Дои:10.1016 / S0968-0004 (96) 80167-8. PMID 8701470.
Эмото Й, Кобаяши Р., Акацука Х, Хидака Х (1992). «Очистка и характеристика нового члена семейства белков S-100 из плаценты человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 182 (3): 1246–53. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 91865-N. PMID 1540168.
Беккер Т., Герке В., Кубе Е., Вебер К. (1992). «S100P, новый Ca (2 +) - связывающий белок из плаценты человека. Клонирование кДНК, экспрессия рекомбинантного белка и свойства связывания Ca2 +». Евро. J. Biochem. 207 (2): 541–7. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17080.x. PMID 1633809.
Грибенко А.В., Махатадзе Г.И. (1998). «Олигомеризация и свойства связывания двухвалентных ионов белка S100P: модель Ca2 + / Mg2 +-переключателя». J. Mol. Биол. 283 (3): 679–94. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2116. PMID 9784376.
Кольцшер М, Герке В (2000). «Идентификация гидрофобных аминокислотных остатков, участвующих в образовании гомодимеров S100P in vivo». Биохимия. 39 (31): 9533–9. Дои:10.1021 / bi000257 +. PMID 10924150.
Харвелл Дж. Д., Фултон Р., Джонс CD, Террис Д. Д., Варнке Р. А. (2001). «Составное новообразование дендритных клеток (БДУ) и малая лимфоцитарная лимфома». Appl. Immunohistochem. Мол. Морфол. 8 (4): 322–8. Дои:10.1097/00022744-200012000-00010. PMID 11127925.
Грибенко А.В., Хоппер Ю.Е., Махатадзе Г.И. (2002). «Молекулярная характеристика и тканевое распределение нового члена семейства S100 белков EF-hand». Биохимия. 40 (51): 15538–48. Дои:10.1021 / bi0114731. PMID 11747429.
Грибенко А.В., Гусман-Касадо М, Лопес М.М., Махатадзе Г.И. (2003). «Конформационные и термодинамические свойства связывания пептида с человеческим белком S100P». Белковая наука. 11 (6): 1367–75. Дои:10.1110 / л.с. 0202202. ЧВК 2373636. PMID 12021435.
Filipek A, Jastrzebska B, Nowotny M, Kuznicki J (2002). «CacyBP / SIP, кальциклин и белок, взаимодействующий с Siah-1, связывает белки EF-hand семейства S100». J. Biol. Chem. 277 (32): 28848–52. Дои:10.1074 / jbc.M203602200. PMID 12042313.
Чжан Х, Ван Г, Дин И, Ван З, Барраклаф Р, Рудланд П.С., Ферниг Д.Г., Рао З. (2003). «Кристаллическая структура Са2 + -связывающего белка S100P с разрешением 2А». J. Mol. Биол. 325 (4): 785–94. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 01278-0. PMID 12507480.
Nowotny M, Spiechowicz M, Jastrzebska B, Filipek A, Kitagawa K, Kuznicki J (2003). «Регулируемое кальцием взаимодействие Sgt1 с S100A6 (кальциклин) и другими белками S100». J. Biol. Chem. 278 (29): 26923–8. Дои:10.1074 / jbc.M211518200. PMID 12746458.
Кольцшер М, Нойман С, Кёниг С, Герке В. (2004). «Са2 + -зависимое связывание и активация спящего эзрина димерным S100P». Мол. Биол. Ячейка. 14 (6): 2372–84. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0553. ЧВК 194886. PMID 12808036.
Арумугам Т., Симеоне Д.М., Шмидт А.М., Logsdon CD (2004). «S100P стимулирует пролиферацию и выживание клеток через рецептор для конечных продуктов активированного гликирования (RAGE)». J. Biol. Chem. 279 (7): 5059–65. Дои:10.1074 / jbc.M310124200. PMID 14617629.
Цзинь Г, Ван С, Ху X, Цзин З, Чен Дж, Инь К, Се Y, Мао Y (2004). «Характеристика тканеспецифической экспрессии гена s100P, который кодирует Ca2 + -связывающий белок EF-hand». Мол. Биол. Представитель. 30 (4): 243–8. Дои:10.1023 / А: 1026311423326. PMID 14672411. S2CID 2276667.
Сато Н., Фукусима Н., Мацубаяси Х., Гоггинс М. (2004). «Идентификация маспина и S100P как новых мишеней гипометилирования при раке поджелудочной железы с использованием глобального профилирования экспрессии генов». Онкоген. 23 (8): 1531–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207269. PMID 14716296.
Ли YC, Volk DE, Thiviyanathan V, Kleerekoper Q, Gribenko AV, Zhang S, Gorenstein DG, Makhatadze GI, Luxon BA (2005). «Структура ЯМР белка Apo-S100P». J. Biomol. ЯМР. 29 (3): 399–402. Дои:10.1023 / B: JNMR.0000032617.88899.4b. PMID 15213440. S2CID 86444278.

Эта статья о ген на хромосома человека 4 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163993 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8341667-3] Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г., Эрне П., Хейцманн С.В. (август 1993 г.). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (14): 6547–51. Дои:10.1073 / пнас.90.14.6547. ЧВК 46969. PMID 8341667.

[pmid7759097-4] Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хейцманн С.В. (июнь 1995 г.). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID 7759097.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: кальций-связывающий белок P S100P S100».

[pmid12808036-6] Кольцшер М., Нойман С., Кёниг С., Герке В. (июнь 2003 г.). «Са2 + -зависимое связывание и активация спящего эзрина димерным S100P». Молекулярная биология клетки. 14 (6): 2372–84. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0553. ЧВК 194886. PMID 12808036.

[pmid25084534-7] а ^б Penumutchu SR, Chou RH, Yu C. (2014-08-01). «Структурные сведения о кальций-связанном S100P и V-домене комплекса RAGE». PLOS ONE. 9 (8): e103947. Дои:10.1371 / journal.pone.0103947. ЧВК 4118983. PMID 25084534.

[8] Penumutchu SR, Chou RH, Yu C. (октябрь 2014 г.). «Взаимодействие между S100P и противоаллергическим препаратом кромолин». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 454 (3): 404–409. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.10.048. PMID 25450399.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]