Белковый домен SWAP - SWAP protein domain

Surp
PDB 1ug0 EBI.jpg
Структура решения домена SURP в BAB30904.
Идентификаторы
СимволSurp
PfamPF01805
ИнтерПроIPR000061

В молекулярная биология, то белковый домен ЗАМЕНА происходит от термина Suppressor-of-White-APricot, регулятора сращивания из модельный организм Дрозофила меланогастр. В белковый домен содержится в регуляторах, контролирующих сращивание. Он находится в сращивание регулирующий белки.[1]Когда ген выразил то ДНК должно быть записано в информационная РНК (мРНК). Однако иногда он содержит промежуточные или прерывающие последовательности, называемые интроны. сплайсинг мРНК помогает удалить эти последовательности, оставив более благоприятную последовательность. сплайсинг мРНК - важное событие в посттранскрипционная модификация процесс экспрессия гена.[2] SWAP помогает контролировать этот процесс во всех ячейках, кроме гаметы.

Функция

Роль белкового домена SWAP заключается в контроле независящего от пола пре-мРНК обработка в соматический ячеек, то есть в каждой ячейке, кроме половые клетки Это включает ауторегуляцию, посредством которой он регулирует сплайсинг своей собственной пре-мРНК.[3] Гомолог SWAP у млекопитающих действует как ген, регулируемый гормоном щитовидной железы. Это означает, что он контролируется щитовидной железой.[4][5]

Структура

ЗАМЕНА белки поделитесь коллинеарно выстроенной серией романов мотивы последовательности.[3] Это означает, что они сохранялись с течением времени. Белок SWAP у разных организмов имеет некоторое сходство с точки зрения последовательности и, возможно, в какой-то момент эволюционной истории был связан.

Рекомендации

  1. ^ Денхез Ф., Лафятис Р. (июнь 1994 г.). «Сохранение регулируемого альтернативного сплайсинга и идентификация функциональных доменов в гомологах позвоночных регулятору сплайсинга Drosophila, супрессору белого абрикоса». Журнал биологической химии. 269 (23): 16170–9. PMID  8206918.
  2. ^ Клэнси, Сюзанна (2008). «Сплайсинг РНК: интроны, экзоны и сплайсосомы». Природное образование. 1 (1). Получено 31 марта 2011.
  3. ^ а б Спайкс Д.А., Крамер Дж., Бингем П.М., Ван Дорен К. (октябрь 1994 г.). «Регуляторы сплайсинга пре-мРНК SWAP представляют собой новое, древнее семейство белков, разделяющее высококонсервативный мотив последовательности с семейством prp21 конститутивных белков сплайсинга». Исследования нуклеиновых кислот. 22 (21): 4510–9. Дои:10.1093 / nar / 22.21.4510. ЧВК  308487. PMID  7971282.
  4. ^ Куадрадо А., Берналь Дж., Муньос А. (август 1999 г.). «Идентификация у млекопитающих гомолога регулятора сплайсинга супрессора белого абрикоса как гена, регулируемого гормоном щитовидной железы». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 71 (2): 332–40. Дои:10.1016 / s0169-328x (99) 00212-0. PMID  10521587.
  5. ^ Хан А., Сулковски З.Л., Чен Т., Завацкий А.М., Сайдель-Сулковска Е.М. (июнь 2012 г.). «Зависимые от пола изменения в экспрессии генов, зависимых от гормонов щитовидной железы мозжечка, после перинатального воздействия тимеросала у крыс». Журнал физиологии и фармакологии. 63 (3): 277–83. PMID  22791642.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000061