Белок SecY - Википедия - SecY protein
| Белок SecY / Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Строение белок-проводящего канала.[1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | SecY | ||||||||
| Pfam | PF00344 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002208 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 19 | ||||||||
| Белок OPM | 1rh5 | ||||||||
| Мембранома | 165 | ||||||||
| |||||||||
В SecY белок это главный трансмембранный субъединица бактериального Sec или типа II секреторный путь и белок-секретирующая АТФаза комплекс, также известный как SecYEG Translocon. Гомологи комплекса SecYEG обнаружены в эукариоты, где субъединица известна как Sec61α, а у архей.[2]
Секреция некоторых белков, несущих сигнальный пептид через внутренняя мембрана в Грамотрицательные бактерии происходит через путь препротеин-транслоказ. Белки продуцируются в цитоплазме в качестве предшественников, и им требуется шаперонная субъединица, чтобы направлять их к компоненту транслоказы внутри мембраны.[3] Оттуда зрелые белки либо направляются на внешнюю мембрану, либо остаются в виде периплазматических белков. Белковые субъединицы транслоказы кодируются на бактериальной хромосоме.
Путь транслоказы включает 7 белков, в том числе шаперонный белок (SecB ), АТФаза (SecA ), интегральный мембранный комплекс (SecY, SecE и SecG) и два дополнительных мембранных белка, которые способствуют высвобождению зрелого пептида в периплазму (SecD и SecF).[3] Белок-шаперон SecB[4] представляет собой высококислотный гомотетрамерный белок, существующий в виде «димера димеров» в бактериальной цитоплазме. SecB поддерживает препротеины в развернутом состоянии после трансляции и направляет их на периферический мембранный белок АТФазу SecA для секреции.[5] Структура сборки SecYEG Escherichia coli выявила сэндвич из двух мембран, взаимодействующих через обширные цитоплазматические домены.[6] Каждая мембрана состоит из димеров SecYEG. Мономерный комплекс содержит 15 трансмембранных спиралей.
Белок SecY эубактерий взаимодействует с сигнальными последовательностями секреторных белков, а также с двумя другими компонентами системы транслокации белков: SecA и SecE. SecY является интегральным белком плазматической мембраны, состоящим из 419–492 аминокислотных остатков, который, по-видимому, содержит 10 трансмембранных (TM), 6 цитоплазматических и 5 периплазматических областей.[7]
Цитоплазматические области 2 и 3, а также TM-домены 1, 2, 4, 5, 7 и 10 хорошо консервативны: консервативные цитоплазматические области, как полагают, взаимодействуют с факторами цитоплазматической секреции, в то время как TM-домены могут участвовать в экспорте белка.[8] SecY также кодируется в геноме хлоропластов некоторых водорослей, где он может участвовать в системе экспорта белка, подобной прокариотам, через две мембраны эндоплазматического ретикулума хлоропластов (CER), который присутствует в хромофитных и криптофитных водорослях.[9]
Подсемейства
Белки человека, содержащие этот домен
Рекомендации
- ^ Ван ден Берг Б., Клемонс В. М., Коллинсон И., Модис Ю., Хартманн Е., Харрисон С. К., Рапопорт Т. А. (январь 2004 г.). «Рентгеновское строение белок-проводящего канала». Природа. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004Натура 427 ... 36Б. Дои:10.1038 / природа02218. PMID 14661030. S2CID 4360143.
- ^ Ауэр Дж., Спикер Дж., Бёк А. (июнь 1991 г.). «Присутствие в архебактериях Methanococcus vannielii гена, гомологичного secY эубактерий». Биохимия. 73 (6): 683–8. Дои:10.1016/0300-9084(91)90048-6. PMID 1764515.
- ^ а б Бикер К.Л., Филлипс Г.Дж., Силхави Т.Дж. (июнь 1990 г.). «Гены sec и prl Escherichia coli». Журнал биоэнергетики и биомембран. 22 (3): 291–310. Дои:10.1007 / BF00763169. PMID 2202721. S2CID 10694864.
- ^ Дриссен AJ (май 2001 г.). «SecB, молекулярный шаперон с двумя лицами» (PDF). Тенденции в микробиологии. 9 (5): 193–6. Дои:10.1016 / S0966-842X (01) 01980-1. PMID 11336818.
- ^ Мюллер JP (июль 1999 г.). «Влияние сверхэкспрессии пре-белков на синтез SecB в Escherichia coli». Письма о микробиологии FEMS. 176 (1): 219–27. Дои:10.1016 / s0378-1097 (99) 00239-6. PMID 10418149.
- ^ Брейтон К., Хааз В., Рапопорт Т.А., Кюльбрандт В., Коллинсон И. (август 2002 г.). «Трехмерная структура бактериального комплекса транслокации белков SecYEG». Природа. 418 (6898): 662–5. Bibcode:2002Натура.418..662Б. Дои:10.1038 / природа00827. PMID 12167867. S2CID 4347664.
- ^ Ито К. (сентябрь 1992 г.). «SecY и интегральные мембранные компоненты системы транслокации белков Escherichia coli». Молекулярная микробиология. 6 (17): 2423–8. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x. PMID 1406280. S2CID 37452721.
- ^ Сух Дж. У., Бойлан С. А., Томас С. М., Долан К. М., Оливер Д. Б., Прайс CW (февраль 1990 г.). «Выделение гомолога secY из Bacillus subtilis: свидетельство общего пути экспорта белка в эубактериях». Молекулярная микробиология. 4 (2): 305–14. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1990.tb00597.x. PMID 2110998. S2CID 27373166.
- ^ Дуглас С.Е. (февраль 1992 г.). «Гомолог secY обнаружен в пластидном геноме Cryptomonas phi». Письма FEBS. 298 (1): 93–6. Дои:10.1016 / 0014-5793 (92) 80029-G. PMID 1544427. S2CID 22351990.