Разделение сайта - Segregating site
Разделение сайтов позиции, которые показывают различия (полиморфизмы ) между родственными генами в выравнивание последовательностей (не консервированный ).[1] Сайты разделения включают консервативный, полуконсервативные и неконсервативные мутации.
Доля сегрегационных сайтов в гене является важной статистикой в популяционная генетика поскольку его можно использовать для оценки скорость мутации при условии, что нет отбор. Например, он используется для расчета Таджима D нейтральная статистика эволюции.
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b5/Histone_Alignment.png/595px-Histone_Alignment.png)
А выравнивание последовательностей, произведено ClustalO, млекопитающих гистон белки.
Последовательности аминокислоты для остатков 120-180 белков. Остатки, которые сохраняются во всех последовательностях, выделены серым цветом. Ниже белковых последовательностей находится ключ, обозначающий консервативная последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) и неконсервативные мутации ().[2]
Последовательности аминокислоты для остатков 120-180 белков. Остатки, которые сохраняются во всех последовательностях, выделены серым цветом. Ниже белковых последовательностей находится ключ, обозначающий консервативная последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) и неконсервативные мутации ().[2]
Смотрите также
- Консервированная последовательность
- Ультра-консервативный элемент
- Выравнивание последовательности
- Программное обеспечение для выравнивания последовательностей
- ClustalW
Рекомендации
- ^ Fu, YX (октябрь 1995 г.). «Статистические свойства сегрегационных сайтов». Теоретическая популяционная биология. 48 (2): 172–97. Дои:10.1006 / tpbi.1995.1025. PMID 7482370.
- ^ "Часто задаваемые вопросы по Clustal # Символы". Clustal. Получено 8 декабря 2014.
![]() | Этот генетика статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |