Гистон - Histone

Схематическое изображение сборки ядер гистонов в нуклеосому.

В биология, гистоны очень базовый белки нашел в эукариотический ядра клеток этот пакет и заказать ДНК в структурные подразделения, называемые нуклеосомы.[1][2] Гистоны в большом количестве лизин и аргинин. Гистоны - главные белковые компоненты хроматин, действуя как катушки, вокруг которых наматывается ДНК, и играя роль в генная регуляция. Без гистонов размотанная ДНК в хромосомы будет очень длинным (отношение длины к ширине более 10 миллионов к 1 в ДНК человека). Например, каждый человек диплоид клетка (содержащая 23 пары хромосом) имеет около 1,8 метра ДНК; рана на гистонах, диплоидная клетка имеет около 90 микрометров (0,09 мм) хроматина. Когда диплоидные клетки дублируются и конденсируются во время митоз, в результате получается около 120 мкм хромосомы.[3]

Ядровый гистон H2A / H2B / H3 / H4
Белок H2AFJ PDB 1aoi.png
PDB рендеринг комплекса между ядерной частицей нуклеосомы (h3, h4, h2a, h2b) и фрагментом ДНК длиной 146 п.н. на основе 1aoi.
Идентификаторы
СимволГистон
PfamPF00125
Pfam кланCL0012
ИнтерПроIPR007125
SCOP21hio / Объем / СУПФАМ
линкерный гистон H1 и семейство H5
Белок ПБД HIST1H1B image.jpg
PDB оказание HIST1H1B на базе 1ghc.
Идентификаторы
СимволLinker_histone
PfamPF00538
ИнтерПроIPR005818
УМНАЯSM00526
SCOP21 час / Объем / СУПФАМ

Классы и варианты гистонов

Существует пять основных семейств гистонов: H1 / H5, H2A, H2B, H3, и H4.[2][4][5][6] Гистоны H2A, H2B, H3 и H4 известны как гистоны ядра, а гистоны H1 / H5 известны как гистоны-линкеры.

Все основные гистоны существуют как димеры, которые похожи в том, что все они обладают складчатым доменом гистонов: три альфа-спирали, соединенные двумя петлями. Именно эта спиральная структура позволяет взаимодействовать между отдельными димерами, особенно в стиле «голова-хвост» (также называемом мотивом рукопожатия).[7] Полученные четыре различных димера затем объединяются, чтобы сформировать один октамерный нуклеосома ядро диаметром примерно 63 Angstrom ( соленоид (ДНК) -подобная частица). Около 146 пар оснований (п.н.) ДНК оборачивается вокруг этой частицы ядра 1,65 раза в виде левого суперспирального поворота, чтобы получить частицу размером около 100 ангстрем.[8] Линкерный гистон H1 связывает нуклеосому на участках входа и выхода ДНК, таким образом фиксируя ДНК на месте.[9] и позволяя формировать структуру более высокого порядка. Самым основным из таких образований является волокно или бусинки длиной 10 нм на нити. Это включает в себя обертывание ДНК вокруг нуклеосом примерно с 50 парами оснований ДНК разделяя каждую пару нуклеосомы (также называется линкером ДНК ). Структуры более высокого порядка включают 30-нм волокно (образующее неправильный зигзаг) и 100-нм волокно, это структуры, обнаруженные в нормальных клетках. Во время митоза и мейоза конденсированный хромосомы собираются посредством взаимодействий между нуклеосомами и другими регуляторными белками.

Гистоны подразделяются на канонические репликационно-зависимые гистоны, которые экспрессируются во время S-фаза из клеточный цикл и независимые от репликации варианты гистонов, экспрессируется в течение всего клеточного цикла. У животных гены, кодирующие канонические гистоны, обычно сгруппированы вдоль хромосомы, не имея интроны и используйте структуру петли стержня на 3 'конец вместо полиА хвост. Гены, кодирующие варианты гистонов, обычно не кластеризованы, имеют интроны, а их мРНК регулируются полиА-хвостами. Сложные многоклеточные организмы обычно имеют большее количество вариантов гистонов, обеспечивающих множество различных функций. В последнее время накапливаются данные о роли различных вариантов гистонов, подчеркивающие функциональные связи между вариантами и тонкую регуляцию развития организма.[10] Варианты гистонов от разных организмов, их классификацию и особенности вариантов можно найти в «HistoneDB 2.0 - Варианты» база данных.

Ниже приводится список белков гистонов человека:

Супер семьяСемьяПодсемействоЧлены
КомпоновщикH1H1FH1F0, H1FNT, H1FOO, H1FX
H1H1HIST1H1A, HIST1H1B, HIST1H1C, HIST1H1D, HIST1H1E, HIST1H1T
ОсновнойH2AH2AFH2AFB1, H2AFB2, H2AFB3, H2AFJ, H2AFV, H2AFX, H2AFY, H2AFY2, H2AFZ
H2A1HIST1H2AA, HIST1H2AB, HIST1H2AC, HIST1H2AD, HIST1H2AE, HIST1H2AG, HIST1H2AI, HIST1H2AJ, HIST1H2AK, HIST1H2AL, HIST1H2AM
H2A2HIST2H2AA3, HIST2H2AC
H2BH2BFH2BFM, H2BFS, H2BFWT
H2B1HIST1H2BA, HIST1H2BB, HIST1H2BC, HIST1H2BD, HIST1H2BE, HIST1H2BF, HIST1H2BG, HIST1H2BH, HIST1H2BI, HIST1H2BJ, HIST1H2BK, HIST1H2BL, HIST1H2BM, HIST1H2BN, HIST1H2BO
H2B2HIST2H2BE
H3H3A1HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J
H3A2HIST2H3C
H3A3HIST3H3
H4H41HIST1H4A, HIST1H4B, HIST1H4C, HIST1H4D, HIST1H4E, HIST1H4F, HIST1H4G, HIST1H4H, HIST1H4I, HIST1H4J, HIST1H4K, HIST1H4L
H44HIST4H4

Структура

Этапы сборки нуклеосом

В нуклеосома ядро состоит из двух H2A-H2B димеры и тетрамер H3-H4, образуя два почти симметричный половинки третичная структура (C2 симметрия; один макромолекула является зеркальным отражением другого).[8] Димеры H2A-H2B и тетрамер H3-H4 также демонстрируют псевдодиадную симметрию. Четыре «ядерных» гистона (H2A, H2B, H3 и H4) относительно схожи по структуре и высоко консервативны благодаря эволюция, все с 'спираль поворот спираль мотив поворота спирали (мотив ДНК-связывающего белка, который распознает специфическую последовательность ДНК). У них также есть характерная черта длинных "хвостов" на одном конце аминокислота структура - это место посттрансляционной модификации (см. ниже).[11]

Гистон архей содержит только H3-H4-подобную димерную структуру, состоящую из того же белка. Такие димерные структуры могут складываться в высокую суперспираль («супернуклеосому»), на которой ДНК наматывается подобно катушкам нуклеосом.[12] Только у некоторых гистонов архей есть хвосты.[13]

Было высказано предположение, что гистоновые белки эволюционно связаны со спиральной частью расширенного AAA + ATPase домена, C-доменом и с N-концевым доменом узнавания субстрата белков Clp / Hsp100. Несмотря на различия в их топологии, эти три складки имеют гомологичный мотив спираль-цепь-спираль (HSH).[11]

Используя электронный парамагнитный резонанс Метод спин-мечения, британские исследователи измерили расстояния между катушками, вокруг которых эукариотические клетки наматывают свою ДНК. Они определили диапазон расстояний от 59 до 70 Å.[14]

В целом гистоны взаимодействуют с ДНК пяти типов:

  • Форма спирали-диполя альфа-спирали в H2B, H3 и H4 вызывают накопление чистого положительного заряда в точке взаимодействия с отрицательно заряженными фосфат группы по ДНК
  • Водородные связи между основой ДНК и амид группа в основной цепи гистоновых белков
  • Неполярные взаимодействия между гистоном и дезоксирибоза сахара на ДНК
  • Соляные мостики и водородные связи между боковыми цепями основных аминокислот (особенно лизин и аргинин ) и фосфатные атомы кислорода на ДНК
  • Неспецифические вставки малых бороздок N-концевых хвостов H3 и H2B в две малые бороздки на молекуле ДНК каждая

Очень основная природа гистонов, помимо облегчения взаимодействия ДНК-гистонов, способствует их растворимости в воде.

Гистоны подвергаются посттрансляционной модификации ферментами в первую очередь на их N-концевых хвостах, но также и в их глобулярных доменах.[15][16] Такие модификации включают метилирование, цитруллинирование, ацетилирование, фосфорилирование, СУМОилирование, убиквитинирование, и АДФ-рибозилирование. Это влияет на их функцию генной регуляции.

В целом, гены которые являются активными, имеют менее связанный гистон, в то время как неактивные гены сильно связаны с гистонами во время межфазный.[17] Также кажется, что структура гистонов была изменена. эволюционно сохранены, как и любой вредный мутации было бы сильно дезадаптивным. Все гистоны имеют высоко положительно заряженный N-конец со многими лизин и аргинин остатки.

История

Гистоны были открыты в 1884 г. Альбрехт Коссель.[18] Слово «гистон» датируется концом 19 века и происходит от немецкого слова «Хистон», само слово неопределенного происхождения - возможно, от греческого гистанаи или же histos.

В начале 1960-х годов, до того, как были известны типы гистонов и до того, как стало известно, что гистоны обладают высокой консервативностью у различных таксономически разнообразных организмов, Джеймс Ф. Боннер и его сотрудники начали изучение этих белков, которые, как было известно, тесно связаны с ДНК в ядрах высших организмов.[19] Боннер и его научный сотрудник Ру Чжи К. Хуанг показали, что изолированный хроматин не поддерживает транскрипцию РНК в пробирке, но если гистоны были извлечены из хроматина, РНК могла быть транскрибирована из оставшейся ДНК.[20] Их статья стала классикой цитирования.[21] Пол Т'со и Джеймс Боннер созвали Всемирный конгресс по химии и биологии гистонов в 1964 году, на котором стало ясно, что нет единого мнения о количестве видов гистонов и что никто не знает, как они будут сравнивать, если их изолировать от разные организмы.[22][19] Затем Боннер и его сотрудники разработали методы разделения каждого типа гистонов, очистили отдельные гистоны, сравнили аминокислотные составы в одном и том же гистоне из разных организмов и сравнили аминокислотные последовательности одного и того же гистона из разных организмов в сотрудничестве с Эмиль Смит из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе.[23] Например, они обнаружили, что последовательность гистона IV является высококонсервативной между горохом и тимусом теленка.[23] Однако их работа над биохимическими характеристиками отдельных гистонов не показала, как гистоны взаимодействуют друг с другом или с ДНК, с которой они были прочно связаны.[22]

Также в 1960-х Винсент Олфри и Альфред Мирский предположили, основываясь на своем анализе гистонов, что ацетилирование и метилирование гистонов может обеспечить механизм контроля транскрипции, но не имели доступного детального анализа, который более поздние исследователи смогли провести, чтобы показать, как такая регуляция может быть ген-специфичной. .[24] До начала 1990-х годов гистоны отвергались большинством как инертный упаковочный материал для ядерной ДНК эукариот, и эта точка зрения частично основывалась на моделях Марк Пташне и другие, которые считали, что транскрипция активируется взаимодействиями белок-ДНК и белок-белок на в основном голых матрицах ДНК, как в случае с бактериями.

В 1980-х Яхли Лорч и Роджер Корнберг[25] показали, что нуклеосома на кор-промоторе предотвращает инициацию транскрипции in vitro, и Майкл Грюнштейн[26] продемонстрировали, что гистоны репрессируют транскрипцию in vivo, что привело к идее о нуклеосоме как о репрессоре общего гена. Считается, что облегчение репрессии связано как с модификацией гистонов, так и с действием комплексов ремоделирования хроматина. Винсент Олфри и Альфред Мирски ранее предположили роль модификации гистонов в активации транскрипции,[27] рассматривается как молекулярное проявление эпигенетики. Майкл Грюнштейн[28] и Дэвид Эллис[29] нашли поддержку этого предложения в важности ацетилирования гистонов для транскрипции в дрожжах и активности активатора транскрипции Gcn5 в качестве гистонацетилтрансферазы.

Открытие гистона H5 датируется 1970-ми годами.[30] и теперь считается изоформа из Гистон H1.[2][4][5][6]

Сохранение разных видов

Ядровые гистоны находятся в ядра из эукариотический клетки, а в некоторых Археи, а именно Протеоархеи и Эвриархея, но не в бактерии.[13] Одноклеточные водоросли, известные как динофлагелляты, ранее считались единственными эукариотами, у которых полностью отсутствуют гистоны,[31] однако более поздние исследования показали, что их ДНК все еще кодирует гистоновые гены.[32] В отличие от коровых гистонов, в бактериях обнаружены богатые лизином линкерные гистоны (H1), также известные как нуклеопротеин HC1 / HC2.[33]

Гистоны архей могут напоминать эволюционных предшественников гистонов эукариот.[13] Гистоновые белки являются одними из наиболее консервативных белков у эукариот, что подчеркивает их важную роль в биологии ядра.[2]:939 Напротив, зрелые сперматозоиды в основном используют протамины чтобы упаковать свою геномную ДНК, скорее всего, потому, что это позволяет им достичь еще более высокого коэффициента упаковки.[34]

Есть некоторые вариант формы в некоторых из основных классов. Они имеют гомологию аминокислотных последовательностей и структурное сходство ядра с определенным классом основных гистонов, но также имеют свои собственные особенности, которые отличаются от основных гистонов. Эти второстепенные гистоны обычно выполняют специфические функции метаболизма хроматина. Например, гистон H3-подобный CENPA связан только с центромера область хромосомы. Вариант гистона H2A H2A.Z связан с промоторами активно транскрибируемых генов, а также участвует в предотвращении распространения молчащих генов. гетерохроматин.[35] Кроме того, H2A.Z играет роль в хроматине для стабильности генома.[36] Другой вариант H2A, H2A.X, фосфорилируется по S139 в регионах вокруг двухниточные разрывы и отмечает регион, в котором Ремонт ДНК.[37] Гистон H3.3 связан с телом активно транскрибируемых генов.[38]

Эволюционное происхождение

Нуклеосомные (стержневые) гистоны могли развиться из рибосомных белков (RPS6 /RPS15 ), с которыми они имеют много общего, будучи короткими и основными белками.[39]

Линкерные гистоны имеют гомологи у бактерий.[33]

Функция

Основные единицы структуры хроматина

Уплотнение цепей ДНК

Гистоны действуют как катушки, вокруг которых наматывается ДНК. Это обеспечивает уплотнение, необходимое для размещения больших геномы эукариот внутри ядер клеток: уплотненная молекула в 40 000 раз короче неупакованной молекулы.

Регулирование хроматина

Хвосты гистонов и их функция в образовании хроматина

Гистоны подвергаются посттрансляционные модификации которые меняют их взаимодействие с ДНК и ядерные белки. Гистоны H3 и H4 имеют длинные хвосты, торчащие из нуклеосома, который может быть ковалентно изменен в нескольких местах. Модификации хвоста включают метилирование, ацетилирование, фосфорилирование, убиквитинирование, СУМОилирование, цитруллинирование, и АДФ-рибозилирование. Ядро гистонов H2A и H2B также может быть изменено. Считается, что комбинации модификаций составляют код, так называемый "гистоновый код ".[40][41] Модификации гистонов действуют в различных биологических процессах, таких как генная регуляция, Ремонт ДНК, конденсация хромосом (митоз ) и сперматогенез (мейоз ).[42]

Общая номенклатура модификаций гистонов:

  • Название гистона (например, H3)
  • Однобуквенный аминокислота сокращение (например, K для Лизин ) и аминокислотное положение в белке
  • Тип модификации (Я: метил, П: фосфат, Ас: ацетил, Ub: убиквитин )
  • Количество модификаций (известно, что только Me встречается более чем в одной копии на остаток. 1, 2 или 3 - это моно-, ди- или три-метилирование)

Так H3K4me1 обозначает монометилирование 4-го остатка (лизина) с самого начала (т.е. N-концевой ) белка H3.

Примеры модификаций гистонов в регуляции транскрипции
Тип
модификация		Гистон
H3K4H3K9H3K14H3K27H3K79H3K36H4K20H2BK5H2BK20
мононуклеоз-метилированиеактивация[43]активация[44]активация[44]активация[44][45]активация[44]активация[44]
диметилированиеподавление[46]подавление[46]активация[45]
триметилированиеактивация[47]подавление[44]подавление[44]активация,[45]
подавление[44]		активацияподавление[46]
ацетилированиеактивация[48]активация[47]активация[47]активация[49]активация


Функции модификаций гистонов

Схематическое изображение модификаций гистонов. По материалам Rodriguez-Paredes and Esteller, Nature, 2011.

Был описан огромный каталог модификаций гистонов, но функциональное понимание большинства из них все еще отсутствует. В совокупности считается, что модификации гистонов могут лежать в основе гистоновый код, посредством чего комбинации модификаций гистонов имеют определенные значения. Однако большинство функциональных данных касается отдельных заметных модификаций гистонов, которые биохимически поддаются детальному изучению.

Химия модификаций гистонов

Метилирование лизина

Метиллизин.svg

Добавление одной, двух или многих метильных групп к лизину мало влияет на химию гистона; Метилирование оставляет заряд лизина нетронутым и добавляет минимальное количество атомов, поэтому стерические взаимодействия в основном не затрагиваются. Однако белки, содержащие Tudor, хромо или PHD домены, среди прочего, могут распознавать метилирование лизина с исключительной чувствительностью и дифференцировать моно, ди и триметиллизин до такой степени, что для некоторых лизинов (например, H4K20) моно, ди и три -метилирование, по-видимому, имеет разные значения. Из-за этого метилирование лизина имеет тенденцию быть очень информативной меткой и доминирует над известными функциями модификации гистонов.

Серотонилирование глутамина

Недавно было показано, что добавление серотонин группа в положение 5 глутамин H3, происходит в серотонинергических клетках, таких как нейроны. Это часть дифференцировки серотонинергических клеток. Эта посттрансляционная модификация происходит вместе с модификацией H3K4me3. Серотонилирование усиливает связывание общего фактора транскрипции. TFIID к Коробка ТАТА.[50]

Метилирование аргинина

Метил аргинин.svg

То, что было сказано выше о химии метилирования лизина, также применимо к метилированию аргинина, и некоторые белковые домены, например, тюдоровские домены, могут быть специфичными для метиларгинина вместо метиллизина. Известно, что аргинин моно- или диметилирован, и метилирование может быть симметричным или асимметричным, потенциально с разными значениями.

Цитруллинирование аргинина

Ферменты под названием пептидиларгининдезиминазы (PAD) гидролизуют иминную группу аргининов и присоединяют кетогруппу, так что на аминокислотном остатке на один положительный заряд меньше. Этот процесс участвует в активации экспрессии генов, делая модифицированные гистоны менее прочно связанными с ДНК и, таким образом, делая хроматин более доступным.[51] PAD также могут оказывать противоположный эффект, удаляя или ингибируя монометилирование остатков аргинина на гистонах и, таким образом, противодействуя положительному эффекту метилирования аргинина на транскрипционную активность.[52]

Ацетилирование лизина

Ацетиллизин.tif

Добавление ацетильной группы оказывает сильное химическое воздействие на лизин, поскольку нейтрализует положительный заряд. Это снижает электростатическое притяжение между гистоном и отрицательно заряженным остовом ДНК, ослабляя структуру хроматина; высокоацетилированные гистоны образуют более доступный хроматин и, как правило, связаны с активной транскрипцией. Ацетилирование лизина, по-видимому, имеет менее точное значение, чем метилирование, поскольку гистоновые ацетилтрансферазы имеют тенденцию воздействовать более чем на один лизин; по-видимому, это отражает необходимость изменения множества лизинов, чтобы иметь значительный эффект на структуру хроматина. Модификация включает H3K27ac.

Фосфорилирование серина / треонина / тирозина

Фосфорилирование аминокислот .tif

Добавление отрицательно заряженной фосфатной группы может привести к серьезным изменениям в структуре белка, что приводит к хорошо известной роли фосфорилирование в контроле функции белка. Неясно, какие структурные последствия имеет фосфорилирование гистонов, но фосфорилирование гистонов имеет четкие функции как посттрансляционная модификация, и были охарактеризованы связывающие домены, такие как BRCT.

Функции в транскрипции

Наиболее хорошо изученные модификации гистонов участвуют в контроле транскрипции.

Активно транскрибируемые гены

Две модификации гистонов особенно связаны с активной транскрипцией:

Триметилирование H3 лизина 4 (H3K4me3)
Это триметилирование происходит на промоторе активных генов.[53][54][55] и выполняется КОМПАС комплекс.[56][57][58] Несмотря на сохранение этого комплекса и модификации гистонов от дрожжей до млекопитающих, не совсем ясно, какую роль играет эта модификация. Однако это отличный признак активных промоторов, и уровень этой модификации гистона на промоторе гена в значительной степени коррелирует с транскрипционной активностью гена. Формирование этой метки связано с транскрипцией довольно запутанным образом: в начале транскрипция гена, РНК-полимераза II претерпевает переключение с инициирование ' к 'удлинение', характеризующийся изменением состояний фосфорилирования С-концевой домен РНК-полимеразы II (CTD). Тот же фермент, что фосфорилаты CTD также фосфорилирует комплекс Rad6,[59][60] который, в свою очередь, добавляет метку убиквитина к H2B K123 (K120 у млекопитающих).[61] H2BK123Ub встречается во всех транскрибируемых областях, но эта метка необходима для COMPASS для триметилирования H3K4 на промоторах.[62][63]
Триметилирование лизина H3 36 (H3K36me3 )
Это триметилирование происходит в теле активных генов и откладывается метилтрансферазой Set2.[64] Этот белок ассоциируется с удлинением РНК-полимераза II, а H3K36Me3 указывает на активно транскрибируемые гены.[65] H3K36Me3 распознается гистон-деацетилазным комплексом Rpd3, который удаляет ацетильные модификации из окружающих гистонов, увеличивая уплотнение хроматина и подавляя ложную транскрипцию.[66][67][68] Повышенное уплотнение хроматина предотвращает доступ факторов транскрипции к ДНК и снижает вероятность инициации новых событий транскрипции в теле гена. Таким образом, этот процесс помогает гарантировать, что транскрипция не прерывается.

Репрессированные гены

Три модификации гистонов особенно связаны с репрессированными генами:

Триметилирование H3 лизина 27 (H3K27me3)
Эта модификация гистона откладывается поликомбина комплекс PRC2.[69] Это явный маркер репрессии генов,[70] и, вероятно, связан с другими белками, чтобы выполнять репрессивную функцию. Другой поликомбина комплекс, PRC1, может связывать H3K27me3[70] и добавляет модификацию гистона H2AK119Ub, которая способствует уплотнению хроматина.[71][72] На основании этих данных выясняется, что PRC1 рекрутируется за счет действия PRC2, однако недавние исследования показывают, что PRC1 рекрутируется в те же сайты в отсутствие PRC2.[73][74]
Ди- и три-метилирование H3 лизина 9 (H3K9me2 / 3)
H3K9me2 / 3 - хорошо охарактеризованный маркер для гетерохроматин, и поэтому тесно связан с репрессией генов. Образование гетерохроматина лучше всего изучено на дрожжевых Schizosaccharomyces pombe, где это инициируется вербовкой РНК-индуцированное подавление транскрипции (RITS) комплекс с двухцепочечными РНК, полученными из центромерный повторяется.[75] RITS набирает Clr4 гистон-метилтрансфераза который вносит H3K9me2 / 3.[76] Этот процесс называется метилирование гистонов. H3K9Me2 / 3 служит сайтом связывания для рекрутирования Swi6 (гетерохроматиновый белок 1 или HP1, другой классический маркер гетерохроматина)[77][78] что, в свою очередь, задействует дополнительные репрессивные действия, включая модификаторы гистонов, такие как гистоновые деацетилазы и гистоновые метилтрансферазы.[79]
Триметилирование лизина Н4 20 (H4K20me 3)
Эта модификация тесно связана с гетерохроматином,[80][81] хотя его функциональное значение остается неясным. Этот знак ставится метилтрансферазой Suv4-20h, которая, по крайней мере, частично задействована гетерохроматиновый белок 1.[80]

Бивалентные промоутеры

Анализ модификаций гистонов в эмбриональных стволовых клетках (и других стволовых клетках) выявил множество промоторов генов, несущих оба H3K4Me3 и H3K27Me3 Другими словами, эти промоторы одновременно отображают как активирующие, так и репрессивные метки. Эта своеобразная комбинация модификаций маркирует гены, готовые к транскрипции; они не требуются в стволовых клетках, но быстро требуются после дифференцировки в некоторые клоны. Как только клетка начинает дифференцироваться, эти двухвалентные промоторы переходят либо в активное, либо в репрессивное состояние, в зависимости от выбранного клона.[82]

Прочие функции

Повреждение ДНК

Маркировка участков повреждения ДНК является важной функцией модификаций гистонов. Он также защищает ДНК от разрушения ультрафиолетовая радиация солнца.

Фосфорилирование H2AX по серину 139 (γH2AX)
Фосфорилированный H2AX (также известный как гамма H2AX) является маркером для Двухцепочечные разрывы ДНК,[83] и является частью ответ на повреждение ДНК.[37][84] H2AX фосфорилируется на ранней стадии после обнаружения двухцепочечного разрыва ДНК и образует домен, простирающийся на много тысяч оснований по обе стороны от повреждения.[83][85][86] Гамма H2AX действует как сайт связывания для белка MDC1, который, в свою очередь, привлекает ключевые белки репарации ДНК.[87] (эта сложная тема хорошо рассмотрена в[88]) и, как таковой, гамма H2AX составляет жизненно важную часть механизма, обеспечивающего стабильность генома.
Ацетилирование лизина 56 H3 (H3K56Ac)
H3K56Acx требуется для стабильности генома.[89][90] H3K56 ацетилируется комплексом p300 / Rtt109,[91][92][93] но быстро деацетилируется вокруг участков повреждения ДНК. Ацетилирование H3K56 также необходимо для стабилизации застопорившихся вилок репликации, предотвращая опасные коллапсы вилок репликации.[94][95] Хотя в целом млекопитающие гораздо чаще используют модификации гистонов, чем микроорганизмы, основная роль H3K56Ac в репликации ДНК существует только в грибах, и это стало мишенью для разработки антибиотиков.[96]

Ремонт ДНК

Триметилирование H3 лизина 36 (H3K36me3)

H3K36me3 обладает способностью рекрутировать комплекс MSH2-MSH6 (hMutSα) Ремонт несоответствия ДНК путь.[97] Соответственно, участки генома человека с высоким уровнем H3K36me3 накапливают меньше соматических мутаций из-за ремонт несоответствия Мероприятия.[98]

Хромосомная конденсация

Фосфорилирование H3 по серину 10 (фосфо-H3S10)
Митотическая киназа Аврора Б фосфорилирует гистон H3 по серину 10, запуская каскад изменений, которые опосредуют конденсацию митотических хромосом.[99][100] Конденсированные хромосомы поэтому очень сильно окрашивают эту метку, но фосфорилирование H3S10 также присутствует на определенных участках хромосомы вне митоза, например, в перицентрическом гетерохроматине клеток во время G2. Фосфорилирование H3S10 также было связано с повреждением ДНК, вызванным R-петля формирование на высокотранскрибируемых сайтах.[101]
Фосфорилирование H2B по серину 10/14 (фосфо-H2BS10 / 14)
Фосфорилирование H2B по серину 10 (дрожжи) или серину 14 (млекопитающие) также связано с конденсацией хроматина, но с совершенно другой целью - опосредовать конденсацию хромосом во время апоптоза.[102][103] Этот знак не является просто свидетелем позднего действия в апоптозе, поскольку дрожжи, несущие мутации этого остатка, устойчивы к индуцированной перекисью водорода апоптотической гибели клеток.

Зависимость

Эпигенетические модификации гистоновых хвостов в определенных областях мозга имеют центральное значение при зависимости.[104][105][106] Как только происходят определенные эпигенетические изменения, они, по-видимому, представляют собой долговременные «молекулярные шрамы», которые могут объяснить стойкость зависимости.[104]

Сигарета курильщики (около 15% населения США) обычно зависимы от никотин.[107] После 7 дней лечения мышей никотином ацетилирование гистона H3 и гистона H4 увеличивалось на промоторе FosB в прилежащее ядро мозга, вызывая увеличение экспрессии FosB на 61%.[108] Это также увеличило бы выражение вариант сращивания Delta FosB. в прилежащее ядро мозга, Delta FosB функционирует как «устойчивый молекулярный переключатель» и «главный управляющий белок» в развитии зависимость.[109][110]

Около 7% населения США зависимы от алкоголь. У крыс, подвергшихся воздействию алкоголя в течение 5 дней, наблюдалось усиление ацетилирования гистона 3, лизина 9 в промоторе пронцицептина в головном мозге. миндалина сложный. Это ацетилирование является активирующей меткой для пронцицептина. Система опиоидных рецепторов ноцицептина / ноцицептина участвует в усиливающих или кондиционирующих эффектах алкоголя.[111]

Метамфетамин зависимость встречается примерно у 0,2% населения США.[112] Причины хронического употребления метамфетамина метилирование лизина в позиции 4 гистона 3, расположенного на промоутеры из c-fos и C-C хемокиновый рецептор 2 (ccr2) гены, активирующие эти гены в прилежащем ядре (NAc).[113] c-fos, как известно, играет важную роль в зависимость.[114] В ccr2 ген также важен при зависимости, поскольку мутационная инактивация этого гена ослабляет зависимость.[113]

Синтез гистонов

Первым этапом дупликации структуры хроматина является синтез гистоновых белков: H1, H2A, H2B, H3, H4. Эти белки синтезируются во время S-фазы клеточного цикла. Существуют различные механизмы, которые способствуют увеличению синтеза гистонов.

Дрожжи

Дрожжи несут одну или две копии каждого гистонового гена, которые не сгруппированы, а разбросаны по хромосомам. Транскрипция гена гистона контролируется множеством регуляторных белков гена, таких как факторы транскрипции, которые связываются с участками промотора гистонов. В почкующихся дрожжах ген-кандидат для активации экспрессии гистонового гена - SBF. SBF - это фактор транскрипции, который активируется в конце фазы G1, когда он отделяется от своего репрессора. Whi5. Это происходит, когда Whi5 фосфорилируется Cdc8, который представляет собой G1 / S Cdk.[115] Подавление экспрессии гистоновых генов вне S-фаз зависит от белков Hir, которые образуют неактивную структуру хроматина в локусе гистоновых генов, вызывая блокировку активаторов транскрипции.[116][117]

Metazoans

У многоклеточных животных увеличение скорости синтеза гистонов обусловлено увеличением процессинга пре-мРНК до ее зрелой формы, а также уменьшением деградации мРНК; это приводит к увеличению активной мРНК для трансляции гистоновых белков. Было обнаружено, что механизм активации мРНК заключается в удалении сегмента на 3'-конце цепи мРНК и зависит от ассоциации с белком, связывающим стебель-петлю (SLBP ).[118] SLBP также стабилизирует мРНК гистонов во время S-фазы, блокируя деградацию нуклеазой 3'hExo.[119] Уровни SLBP контролируются белками клеточного цикла, заставляя SLBP накапливаться, когда клетки входят в S-фазу, и деградировать, когда клетки покидают S-фазу. SLBP маркируются для деградации путем фосфорилирования по двум остаткам треонина циклин-зависимыми киназами, возможно, циклином A / cdk2, в конце S-фазы.[120] У многоклеточных животных также есть множественные копии гистоновых генов, сгруппированных на хромосомах, которые локализованы в структурах, называемых тельцами Кахаля, что определяется анализом захвата конформации хромосомы по всему геному (4C-Seq).[121]

Связь между механизмами контроля клеточного цикла и синтезом гистонов

Ядерный белок атаксии-телеангиэктазии (NPAT), также известный как ядерный белок-коактиватор транскрипции гистонов, представляет собой фактор транскрипции, который активирует транскрипцию гена гистона на хромосомах 1 и 6 клеток человека. NPAT также является субстратом циклина E-Cdk2, который необходим для перехода между фазой G1 и фазой S. NPAT активирует экспрессию гистонового гена только после того, как он был фосфорилирован G1 / S-Cdk циклином E-Cdk2 в ранней S-фазе.[122] Это показывает важную регуляторную связь между контролем клеточного цикла и синтезом гистонов.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Янгсон Р.М. (2006). Словарь Коллинза по биологии человека. Глазго: HarperCollins. ISBN  978-0-00-722134-9.
  2. ^ а б c d Кокс М., Нельсон Д.Р., Ленингер А.Л. (2005). Принципы биохимии Ленингера. Сан-Франциско: W.H. Фримен. ISBN  978-0-7167-4339-2.
  3. ^ Редон С., Пильч Д., Рогаку Е., Седельникова О., Ньюрок К., Боннер В. (апрель 2002 г.). «Варианты гистона H2A H2AX и H2AZ». Текущее мнение в области генетики и развития. 12 (2): 162–9. Дои:10.1016 / S0959-437X (02) 00282-4. PMID  11893489.
  4. ^ а б «База данных вариантов гистонов 2.0». Национальный центр биотехнологической информации. Получено 13 января 2017.
  5. ^ а б Бхасин М, Рейнхерц Э.Л., Реч ПА (2006). «Распознавание и классификация гистонов с помощью машины опорных векторов» (PDF). Журнал вычислительной биологии. 13 (1): 102–12. Дои:10.1089 / cmb.2006.13.102. PMID  16472024.
  6. ^ а б Хартл Д.Л., Фрайфельдер Д., Снайдер Л.А. (1988). Базовая генетика. Бостон: Джонс и Бартлетт Издательство. ISBN  978-0-86720-090-4.
  7. ^ Мариньо-Рамирес Л., Канн М.Г., Сапожник Б.А., Ландсман Д. (октябрь 2005 г.). «Структура гистонов и стабильность нуклеосом». Экспертный обзор протеомики. 2 (5): 719–29. Дои:10.1586/14789450.2.5.719. ЧВК  1831843. PMID  16209651.
  8. ^ а б Luger K, Mäder AW, Richmond RK, Sargent DF, Richmond TJ (сентябрь 1997 г.). «Кристаллическая структура ядерной частицы нуклеосомы при разрешении 2,8 A». Природа. 389 (6648): 251–60. Bibcode:1997Натура.389..251Л. Дои:10.1038/38444. PMID  9305837. S2CID  4328827. PDB: 1AOI​
  9. ^ Фаркас Д. (1996). Упрощенная ДНК: автостопом по ДНК. Вашингтон, округ Колумбия: AACC Press. ISBN  978-0-915274-84-0.
  10. ^ Янг, CW; Шибата, Й; Стармер, Дж; Да, D; Магнусон, Т. (1 июля 2015 г.). «Гистон H3.3 поддерживает целостность генома во время развития млекопитающих». Гены и развитие. 29 (13): 1377–92. Дои:10.1101 / gad.264150.115. ЧВК  4511213. PMID  26159997.
  11. ^ а б Альва В., Аммельбург М., Сёдинг Дж., Лупас А.Н. (март 2007 г.). «О происхождении гистоновой складки». BMC Структурная биология. 7: 17. Дои:10.1186/1472-6807-7-17. ЧВК  1847821. PMID  17391511.
  12. ^ Маттироли Ф., Бхаттачарья С., Дайер П.Н., Уайт А.Е., Сандман К., Буркхарт Б.В., Бирн К.Р., Ли Т., Ан Н.Г., Сантанджело Т.Дж., Рив Дж. Н., Люгер К. (август 2017 г.). «Структура хроматина на основе гистонов в архее». Наука. 357 (6351): 609–612. Bibcode:2017Научный ... 357..609M. Дои:10.1126 / science.aaj1849. ЧВК  5747315. PMID  28798133.
  13. ^ а б c Хеннеман Б., ван Эммерик К., ван Инген Х., Дама RT (сентябрь 2018 г.). «Структура и функции гистонов архей». PLOS Genetics. 14 (9): e1007582. Bibcode:2018BpJ ... 114..446H. Дои:10.1371 / journal.pgen.1007582. ЧВК  6136690. PMID  30212449.
  14. ^ Уорд Р., Боуман А., Эль-Мками Х., Оуэн-Хьюз Т., Норман Д. Г. (февраль 2009 г.). «Измерения PELDOR на больших расстояниях на гистоновой частице ядра». Журнал Американского химического общества. 131 (4): 1348–9. Дои:10.1021 / ja807918f. ЧВК  3501648. PMID  19138067.
  15. ^ Mersfelder EL, Parthun MR (19 мая 2006 г.). «Сказка за хвостом: модификации основного домена гистонов и регуляция структуры хроматина». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (9): 2653–62. Дои:10.1093 / нар / gkl338. ЧВК  1464108. PMID  16714444.
  16. ^ Тропбергер П., Шнайдер Р. (июнь 2013 г.). «Почесывание (боковой) поверхности регуляции хроматина модификациями гистонов». Структурная и молекулярная биология природы. 20 (6): 657–61. Дои:10.1038 / nsmb.2581. PMID  23739170. S2CID  2956823.
  17. ^ Эллисон, Лизабет А. (2012). Фундаментальная молекулярная биология, второе издание. Соединенные Штаты Америки: John Wiley & Sons. п. 102. ISBN  9781118059814.
  18. ^ Удача JM (1965). «Химия гистонов: пионеры». В Bonner J, Ts'o P (ред.). Нуклеогистоны. Сан-Франциско, Лондон и Амстердам: Holden-Day, Inc.
  19. ^ а б Боннер, Джеймс (1994). «Главы из моей жизни». Ежегодный обзор физиологии растений и молекулярной биологии растений. 45: 1–23. Дои:10.1146 / annurev.pp.45.060194.000245.
  20. ^ Хуан Р.С., Боннер Дж. (Июль 1962 г.). «Гистон, супрессор синтеза хромосомной РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 48 (7): 1216–22. Bibcode:1962ПНАС ... 48.1216Н. Дои:10.1073 / pnas.48.7.1216. ЧВК  220935. PMID  14036409.
  21. ^ "Хуанг Р. и Боннер Дж. Гистон, супрессор синтеза хромосомной РНК. Proc. Nat. Acad. Sci. US 48: 1216-22, 1962" (PDF). Цитата Классика (12): 79. 20 марта 1978 г.
  22. ^ а б Джеймс Боннер и Пол Т'со (1965) Нуклеогистоны. Holden-Day Inc, Сан-Франциско, Лондон, Амстердам.
  23. ^ а б Деланж Р.Дж., Фамбро Д.М., Смит Е.Л., Боннер Дж. (Октябрь 1969 г.). «Гистон IV теленка и гороха. 3. Полная аминокислотная последовательность гистона IV проростков гороха; сравнение с гомологичным гистоном тимуса теленка». Журнал биологической химии. 244 (20): 5669–79. PMID  5388597.
  24. ^ Олфри В.Г., Фолкнер Р., Мирский А.Е. (май 1964 г.). «Ацетилирование и метилирование гистонов и их возможная роль в регуляции синтеза РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 51 (5): 786–94. Bibcode:1964ПНАС ... 51..786А. Дои:10.1073 / пнас.51.5.786. ЧВК  300163. PMID  14172992.
  25. ^ Lorch Y, LaPointe JW, Kornberg RD (апрель 1987 г.). «Нуклеосомы подавляют начало транскрипции, но допускают удлинение цепи со смещением гистонов». Клетка. 49 (2): 203–10. Дои:10.1016/0092-8674(87)90561-7. PMID  3568125. S2CID  21270171.
  26. ^ Кейн П.С., Ким Ю.Дж., Хан М., Маллен Дж.Р., Йошизаки Ф., Грюнштейн М. (октябрь 1988 г.). «Чрезвычайно консервативный N-конец гистона H4 необязателен для роста, но необходим для репрессии молчаливых локусов спаривания у дрожжей». Клетка. 55 (1): 27–39. Дои:10.1016/0092-8674(88)90006-2. PMID  3048701. S2CID  7994350.
  27. ^ Пого Б.Г., Оллфри В.Г., Мирский А.Е. (апрель 1966 г.). «Синтез РНК и ацетилирование гистонов в процессе активации генов в лимфоцитах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 55 (4): 805–12. Bibcode:1966ПНАС ... 55..805П. Дои:10.1073 / pnas.55.4.805. ЧВК  224233. PMID  5219687.
  28. ^ Дуррин Л.К., Манн Р.К., Кейн П.С., Грюнштейн М. (июнь 1991 г.). «Для активации промотора in vivo требуется N-концевая последовательность гистона H4 дрожжей». Клетка. 65 (6): 1023–31. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90554-с. PMID  2044150. S2CID  28169631.
  29. ^ Brownell JE, Zhou J, Ranalli T., Kobayashi R, Edmondson DG, Roth SY, Allis CD (март 1996). «Гистонацетилтрансфераза A Tetrahymena: гомолог дрожжевого Gcn5p, связывающий ацетилирование гистона с активацией гена». Клетка. 84 (6): 843–51. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81063-6. PMID  8601308.
  30. ^ Авилес Ф.Дж., Чепмен Г.Е., Книл Г.Г., Крэйн-Робинсон С., Брэдбери Е.М. (август 1978 г.) «Конформация гистона H5. Выделение и характеристика глобулярного сегмента». Европейский журнал биохимии. 88 (2): 363–71. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1978.tb12457.x. PMID  689022.
  31. ^ Риццо PJ (август 2003 г.). «Эти удивительные хромосомы динофлагеллят». Клеточные исследования. 13 (4): 215–7. Дои:10.1038 / sj.cr.7290166. PMID  12974611.
  32. ^ Тальберт ПБ, Хеникофф С (2012). «Хроматин: упаковка без нуклеосом». Текущая биология. 22 (24): R1040 – R1043. Дои:10.1016 / j.cub.2012.10.052. PMID  23257187.
  33. ^ а б Kasinsky HE, Lewis JD, Dacks JB, Ausió J (январь 2001 г.). «Происхождение гистонов линкера H1». Журнал FASEB. 15 (1): 34–42. Дои:10.1096 / fj.00-0237rev. PMID  11149891.
  34. ^ Кларк HJ (1992). «Ядерный и хроматиновый состав гамет и ранних эмбрионов млекопитающих». Биохимия и клеточная биология. 70 (10–11): 856–66. Дои:10.1139 / o92-134. PMID  1297351.
  35. ^ Гийометт Б., Батай А.Р., Жеври Н., Адам М., Бланшетт М., Роберт Ф., Годро Л. (декабрь 2005 г.). «Вариант гистона H2A.Z глобально локализован на промоторах неактивных генов дрожжей и регулирует положение нуклеосом». PLOS Биология. 3 (12): e384. Дои:10.1371 / journal.pbio.0030384. ЧВК  1275524. PMID  16248679.
  36. ^ Billon P, Côté J (октябрь 2011 г.). «Точное отложение гистона H2A.Z в хроматине для экспрессии и поддержания генома». Biochim Biophys Acta. 1819 (3–4): 290–302. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2011.10.004. PMID  22027408.
  37. ^ а б Пол ТТ, Рогаку Е.П., Ямазаки В., Кирхгесснер К.Ю., Геллерт М., Боннер В.М. (2000). «Критическая роль гистона H2AX в привлечении факторов репарации к ядерным очагам после повреждения ДНК». Текущая биология. 10 (15): 886–95. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00610-2. PMID  10959836.
  38. ^ Ахмад К., Хеникофф С. (июнь 2002 г.). «Вариант гистона H3.3 маркирует активный хроматин за счет независимой от репликации сборки нуклеосом». Молекулярная клетка. 9 (6): 1191–200. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00542-7. PMID  12086617.
  39. ^ Hannon Bozorgmehr J (октябрь 2019 г.). «Происхождение хромосомных гистонов в рибосомном белке 30S». Ген. 726: 144155. Дои:10.1016 / j.gene.2019.144155. PMID  31629821.
  40. ^ Strahl BD, Allis CD (январь 2000 г.). «Язык ковалентных модификаций гистонов». Природа. 403 (6765): 41–5. Bibcode:2000Натура 403 ... 41С. Дои:10.1038/47412. PMID  10638745. S2CID  4418993.
  41. ^ Jenuwein T, Allis CD (август 2001 г.). «Перевод гистонового кода» (PDF). Наука. 293 (5532): 1074–80. CiteSeerX  10.1.1.453.900. Дои:10.1126 / science.1063127. PMID  11498575. S2CID  1883924.
  42. ^ Сон Н, Лю Дж., Ан С., Нишино Т., Хисикава Ю., Кодзи Т. (август 2011 г.). «Иммуногистохимический анализ модификаций гистона H3 в зародышевых клетках во время сперматогенеза мышей». Acta Histochemica et Cytochemica. 44 (4): 183–90. Дои:10.1267 / ahc.11027. ЧВК  3168764. PMID  21927517.
  43. ^ Беневоленская Е.В. (август 2007 г.). «Деметилазы гистона H3K4 необходимы для развития и дифференцировки». Биохимия и клеточная биология. 85 (4): 435–43. Дои:10.1139 / o07-057. PMID  17713579.
  44. ^ а б c d е ж грамм час Барски А., Куддапах С., Цуй К., Ро Т.Ю., Шонес Д.Э., Ван З., Вей Г., Чепелев И., Чжао К. (май 2007 г.). «Профилирование метилирования гистонов в геноме человека с высоким разрешением». Клетка. 129 (4): 823–37. Дои:10.1016 / j.cell.2007.05.009. PMID  17512414.
  45. ^ а б c Steger DJ, Lefterova MI, Ying L, Stonestrom AJ, Schupp M, Zhuo D, Vakoc AL, Kim JE, Chen J, Lazar MA, Blobel GA, Vakoc CR (апрель 2008 г.). «Рекрутирование DOT1L / KMT4 и метилирование H3K79 повсеместно связаны с транскрипцией генов в клетках млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 28 (8): 2825–39. Дои:10.1128 / MCB.02076-07. ЧВК  2293113. PMID  18285465.
  46. ^ а б c Розенфельд Дж.А., Ван З., Шонес Д.Э., Чжао К., ДеСалле Р., Чжан М.К. (2009). «Определение модификаций обогащенных гистонов в негенных частях генома человека». BMC Genomics. 10: 143. Дои:10.1186/1471-2164-10-143. ЧВК  2667539. PMID  19335899.
  47. ^ а б c Кох С.М., Эндрюс Р.М., Фличек П., Диллон С.К., Караоз Ю., Клелланд Г.К., Уилкокс С., Биэр Д.М., Фаулер Дж.С., Куттет П., Джеймс К.Д., Лефевр Г.К., Брюс А.В., Дови О.М., Эллис П.Д., Дами П., Лангфорд К.Ф. , Вен З., Бирни Э., Картер Н. П., Ветри Д., Данхэм I (июнь 2007 г.). «Пейзаж модификаций гистонов в 1% генома человека в пяти линиях клеток человека». Геномные исследования. 17 (6): 691–707. Дои:10.1101 / гр. 5704207. ЧВК  1891331. PMID  17567990.
  48. ^ Гиллеметт Б., Дрогарис П., Лин Х. Х., Армстронг Х., Хирагами-Хамада К., Имхоф А., Боннейл Е., Тибо П., Верро А., Фестенштейн Р. Дж. (31 марта 2011 г.). «Лизин 4 H3 ацетилируется на активных промоторах гена и регулируется метилированием лизина 4 H3». PLOS Genetics. 7 (3): e1001354. Дои:10.1371 / journal.pgen.1001354. ЧВК  3069113. PMID  21483810.
  49. ^ Creyghton MP, Cheng AW, Welstead GG, Kooistra T, Carey BW, Steine ​​EJ, Hanna J, Lodato MA, Frampton GM, Sharp PA, Boyer LA, Young RA, Jaenisch R (декабрь 2010 г.). «Гистон H3K27ac отделяет активные усилители от ожидаемых и предсказывает состояние развития». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (50): 21931–6. Дои:10.1073 / pnas.1016071107. ЧВК  3003124. PMID  21106759.
  50. ^ Фаррелли Л.А., Томпсон Р.Э., Чжао С., Лепак А.Е., Лю Й., Бхану Н.В. и др. (Март 2019 г.). «Серотонилирование гистонов - это разрешающая модификация, которая усиливает связывание TFIID с H3K4me3». Природа. 567 (7749): 535–539. Bibcode:2019Натура.567..535F. Дои:10.1038 / s41586-019-1024-7. ЧВК  6557285. PMID  30867594.
  51. ^ Christophorou MA, Castelo-Branco G, Halley-Stott RP, Oliveira CS, Loos R, Radzisheuskaya A, Mowen KA, Bertone P, Silva JC, Zernicka-Goetz M, Nielsen ML, Gurdon JB, Kouzarides T (март 2014 г.). «Цитруллинирование регулирует плюрипотентность и связывание гистона H1 с хроматином». Природа. 507 (7490): 104–8. Bibcode:2014Натура.507..104C. Дои:10.1038 / природа12942. ЧВК  4843970. PMID  24463520.
  52. ^ Cuthbert GL, Daujat S, Snowden AW, Erdjument-Bromage H, Hagiwara T., Yamada M, Schneider R, Gregory PD, Tempst P, Bannister AJ, Kouzarides T. (сентябрь 2004 г.). «Удаление гистона препятствует метилированию аргинина». Клетка. 118 (5): 545–53. Дои:10.1016 / j.cell.2004.08.020. PMID  15339660.
  53. ^ Кроган Нью-Джерси, Довер Дж., Вуд А., Шнайдер Дж., Хайдт Дж., Боатенг М.А., Дин К., Райан О.В., Гольшани А., Джонстон М., Гринблатт Дж. Ф., Шилатифард А. (март 2003 г.). «Комплекс Paf1 необходим для метилирования гистона H3 с помощью COMPASS и Dot1p: связывание удлинения транскрипции с метилированием гистона». Молекулярная клетка. 11 (3): 721–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00091-1. PMID  12667454.
  54. ^ Нг Х. Х., Роберт Ф., Янг Р. А., Струль К. (март 2003 г.). «Целевое привлечение гистон-метилазы Set1 путем удлинения Pol II обеспечивает локализованную метку и память о недавней транскрипционной активности». Молекулярная клетка. 11 (3): 709–19. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00092-3. PMID  12667453.
  55. ^ Бернштейн Б.Е., Камаль М., Линдблад-То К., Бекиранов С., Бейли Д.К., Хьюберт Д.Д., МакМахон С., Карлссон Е.К., Кульбокас Е.Дж., Джингерас Т.Р., Шрайбер С.Л., Ландер Э.С. «Геномные карты и сравнительный анализ модификаций гистонов у человека и мыши». Клетка. 120 (2): 169–81. Дои:10.1016 / j.cell.2005.01.001. PMID  15680324.
  56. ^ Krogan NJ, Dover J, Khorrami S, Greenblatt JF, Schneider J, Johnston M, Shilatifard A (март 2002 г.). «КОМПАС, гистон H3 (лизин 4) метилтрансфераза, необходимая для теломерного подавления экспрессии гена». Журнал биологической химии. 277 (13): 10753–5. Дои:10.1074 / jbc.C200023200. PMID  11805083.
  57. ^ Рогуев А., Шафт Д., Шевченко А., Пийнаппель В.В., Вильм М., Осланд Р., Стюарт А.Ф. (декабрь 2001 г.). «Комплекс Saccharomyces cerevisiae Set1 включает гомолог Ash2 и метилирует гистон 3, лизин 4». Журнал EMBO. 20 (24): 7137–48. Дои:10.1093 / emboj / 20.24.7137. ЧВК  125774. PMID  11742990.
  58. ^ Надь П.Л., Гризенбек Дж., Корнберг Р.Д., Клири М.Л. (январь 2002 г.). «Комплекс триторакс-группы, очищенный из Saccharomyces cerevisiae, необходим для метилирования гистона H3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (1): 90–4. Bibcode:2002ПНАС ... 99 ... 90Н. Дои:10.1073 / pnas.221596698. ЧВК  117519. PMID  11752412.
  59. ^ Wood A, Schneider J, Dover J, Johnston M, Shilatifard A (ноябрь 2005 г.). «Комплекс Bur1 / Bur2 необходим для моноубиквитинирования гистона H2B с помощью Rad6 / Bre1 и метилирования гистона с помощью COMPASS». Молекулярная клетка. 20 (4): 589–99. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.09.010. PMID  16307922.
  60. ^ Сарчевич Б., Моусон А., Бейкер Р.Т., Сазерленд Р.Л. (апрель 2002 г.). «Регулирование убиквитин-конъюгированного фермента hHR6A посредством CDK-опосредованного фосфорилирования». Журнал EMBO. 21 (8): 2009–18. Дои:10.1093 / emboj / 21.8.2009. ЧВК  125963. PMID  11953320.
  61. ^ Робзик К., Рехт Дж., Осли М.А. (январь 2000 г.). «Rad6-зависимое убиквитинирование гистона H2B в дрожжах». Наука. 287 (5452): 501–4. Bibcode:2000Sci ... 287..501R. Дои:10.1126 / science.287.5452.501. PMID  10642555.
  62. ^ Sun ZW, Allis CD (июль 2002 г.). «Убиквитинирование гистона H2B регулирует метилирование H3 и молчание генов у дрожжей». Природа. 418 (6893): 104–8. Bibcode:2002Натура.418..104С. Дои:10.1038 / природа00883. PMID  12077605. S2CID  4338471.
  63. ^ Довер Дж., Шнайдер Дж., Тавиа-Боатенг М.А., Вуд А., Дин К., Джонстон М., Шилатифард А. (август 2002 г.). «Метилирование гистона H3 с помощью COMPASS требует убиквитинирования гистона H2B с помощью Rad6». Журнал биологической химии. 277 (32): 28368–71. Дои:10.1074 / jbc.C200348200. PMID  12070136.
  64. ^ Strahl BD, Grant PA, Briggs SD, Sun ZW, Bone JR, Caldwell JA, Mollah S, Cook RG, Shabanowitz J, Hunt DF, Allis CD (март 2002 г.). «Set2 представляет собой нуклеосомную гистон-H3-селективную метилтрансферазу, которая опосредует репрессию транскрипции». Молекулярная и клеточная биология. 22 (5): 1298–306. Дои:10.1128 / MCB.22.5.1298-1306.2002. ЧВК  134702. PMID  11839797.
  65. ^ Ли Дж., Моазед Д., Гайги С.П. (декабрь 2002 г.). «Ассоциация гистон-метилтрансферазы Set2 с РНК-полимеразой II играет роль в удлинении транскрипции». Журнал биологической химии. 277 (51): 49383–8. Дои:10.1074 / jbc.M209294200. PMID  12381723.
  66. ^ Карроцца М.Дж., Ли Б., Флоренс Л., Суганума Т., Суонсон С.К., Ли К.К., Шайа В.Дж., Андерсон С., Йейтс Дж., Член парламента Уошберна, Уоркман Д.Л. (ноябрь 2005 г.). «Метилирование гистона H3 с помощью Set2 направляет деацетилирование кодирующих областей с помощью Rpd3S для подавления ложной внутригенной транскрипции». Клетка. 123 (4): 581–92. Дои:10.1016 / j.cell.2005.10.023. PMID  16286007.
  67. ^ Keogh MC, Kurdistani SK, Morris SA, Ahn SH, Podolny V, Collins SR, Schuldiner M, Chin K, Punna T., Thompson NJ, Boone C, Emili A, Weissman JS, Hughes TR, Strahl BD, Grunstein M, Greenblatt JF , Буратовски С., Кроган, штат Нью-Джерси (ноябрь 2005 г.). «Котранскрипционное метилирование set2 лизина 36 гистона H3 рекрутирует репрессивный комплекс Rpd3». Клетка. 123 (4): 593–605. Дои:10.1016 / j.cell.2005.10.025. PMID  16286008.
  68. ^ Джоши А.А., Струль К. (декабрь 2005 г.). «Взаимодействие хромодомена Eaf3 с метилированным H3-K36 связывает деацетилирование гистона с элонгацией Pol II». Молекулярная клетка. 20 (6): 971–8. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.11.021. PMID  16364921.
  69. ^ Кузьмичев А., Нисиока К., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Рейнберг Д. (ноябрь 2002 г.). «Активность гистон-метилтрансферазы, связанная с человеческим мультибелковым комплексом, содержащим энхансер белка Zeste». Гены и развитие. 16 (22): 2893–905. Дои:10.1101 / gad.1035902. ЧВК  187479. PMID  12435631.
  70. ^ а б Цао Р., Ван Л., Ван Х, Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Джонс Р. С., Чжан Ю. (ноябрь 2002 г.). «Роль метилирования гистона H3 лизина 27 в сайленсинге Polycomb-группы». Наука. 298 (5595): 1039–43. Bibcode:2002Sci ... 298.1039C. Дои:10.1126 / science.1076997. PMID  12351676. S2CID  6265267.
  71. ^ de Napoles M, Mermoud JE, Wakao R, Tang YA, Endoh M, Appanah R, Nesterova TB, Silva J, Otte AP, Vidal M, Koseki H, Brockdorff N (ноябрь 2004 г.). «Белки группы поликомб Ring1A / B связывают убиквитилирование гистона H2A с наследственным молчанием генов и инактивацией X». Клетка развития. 7 (5): 663–76. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.10.005. PMID  15525528.
  72. ^ Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, Vidal M, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (октябрь 2004 г.). «Роль убиквитинирования гистона H2A в сайленсинге Polycomb». Природа. 431 (7010): 873–8. Bibcode:2004 Натур.431..873Вт. Дои:10.1038 / природа02985. HDL:10261/73732. PMID  15386022. S2CID  4344378.
  73. ^ Таварес Л., Димитрова Е., Оксли Д., Вебстер Дж., Пут Р., Деммерс Дж., Безстарости К., Тейлор С., Ура Х, Койде Х, Вутц А., Видаль М., Элдеркин С., Брокдорф Н. (февраль 2012 г.). «Комплексы RYBP-PRC1 опосредуют убиквитилирование H2A по сайтам-мишеням поликомбов независимо от PRC2 и H3K27me3». Клетка. 148 (4): 664–78. Дои:10.1016 / j.cell.2011.12.029. ЧВК  3281992. PMID  22325148.
  74. ^ Гао З, Чжан Дж., Бонасио Р., Стрино Ф., Савай А., Паризи Ф., Клюгер Й., Рейнберг Д. (февраль 2012 г.). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально разные комплексы семейства PRC1». Молекулярная клетка. 45 (3): 344–56. Дои:10.1016 / j.molcel.2012.01.002. ЧВК  3293217. PMID  22325352.
  75. ^ Вердел А., Джиа С., Гербер С., Сугияма Т., Гайги С., Гревал С.И., Моазед Д. (январь 2004 г.). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS». Наука. 303 (5658): 672–6. Bibcode:2004Наука ... 303..672В. Дои:10.1126 / science.1093686. ЧВК  3244756. PMID  14704433.
  76. ^ Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (август 2000 г.). «Регуляция структуры хроматина с помощью сайт-специфичных гистоновых H3-метилтрансфераз». Природа. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Натура.406..593р. Дои:10.1038/35020506. PMID  10949293. S2CID  205008015.
  77. ^ Баннистер А. Дж., Зегерман П., Партридж Дж. Ф., Миска Е. А., Томас Дж. О., Оллшир Р. К., Кузаридес Т. (март 2001 г.) «Селективное распознавание метилированного лизина 9 на гистоне H3 хромо-доменом HP1». Природа. 410 (6824): 120–4. Bibcode:2001Натура.410..120Б. Дои:10.1038/35065138. PMID  11242054. S2CID  4334447.
  78. ^ Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С., Мехтлер К., Йенувейн Т. (март 2001 г.). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Натур.410..116л. Дои:10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
  79. ^ Баджпай Г., Джайн И., Инамдар М.М., Дас Д., Падинхатери Р. (январь 2017 г.). «Связывание ДНК-изгибающих негистоновых белков дестабилизирует регулярную 30-нм структуру хроматина». PLOS вычислительная биология. 13 (1): e1005365. Bibcode:2017PLSCB..13E5365B. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1005365. ЧВК  5305278. PMID  28135276.
  80. ^ а б Schotta G, Lachner M, Sarma K, Ebert A, Sengupta R, Reuter G, Reinberg D, Jenuwein T (июнь 2004 г.). «Путь сайленсинга для индукции триметилирования H3-K9 и H4-K20 на конститутивном гетерохроматине». Гены и развитие. 18 (11): 1251–62. Дои:10.1101 / gad.300704. ЧВК  420351. PMID  15145825.
  81. ^ Курмули Н., Джеппесен П., Махадевхайя С., Бургойн П., Ву Р., Гилберт Д.М., Бонджорни С., Прантера Г., Фанти Л., Пимпинелли С., Ши В., Фундел Р., Сингх П. Б. (май 2004 г.). «Гетерохроматин и триметилированный лизин 20 гистона H4 у животных». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 12): 2491–501. Дои:10.1242 / jcs.01238. PMID  15128874.
  82. ^ Bernstein BE, Mikkelsen TS, Xie X, Kamal M, Huebert DJ, Cuff J, Fry B, Meissner A, Wernig M, Plath K, Jaenisch R, Wagschal A, Feil R, Schreiber SL, Lander ES (апрель 2006 г.). «Двухвалентная структура хроматина отмечает ключевые гены развития в эмбриональных стволовых клетках». Клетка. 125 (2): 315–26. Дои:10.1016 / j.cell.2006.02.041. PMID  16630819.
  83. ^ а б Rogakou EP, Pilch DR, Orr AH, Иванова VS, Bonner WM (март 1998 г.). «Двухцепочечные разрывы ДНК вызывают фосфорилирование гистона H2AX по серину 139». Журнал биологической химии. 273 (10): 5858–68. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5858. PMID  9488723.
  84. ^ Селеста А., Петерсен С., Романиенко П.Дж., Фернандес-Капетильо О., Чен Х.Т., Седельникова О.А., Рейна-Сан-Мартин Б., Коппола В., Меффре Е., Дифилиппантонио М.Дж., Редон С., Пильч Д.Р., Олару А., Экхаус М., Камерини- Отеро Р.Д., Тессаролло Л., Ливак Ф., Манова К., Боннер В.М., Нуссенцвейг М.С., Нуссенцвейг А. (май 2002 г.). «Геномная нестабильность у мышей, лишенных гистона H2AX». Наука. 296 (5569): 922–7. Bibcode:2002Наука ... 296..922C. Дои:10.1126 / science.1069398. ЧВК  4721576. PMID  11934988.
  85. ^ Шрофф Р., Арбель-Эден А., Пильч Д., Ира Г., Боннер В. М., Петрини Дж. Х., Хабер Дж. Э., Лихтен М. (октябрь 2004 г.). «Распределение и динамика модификации хроматина, вызванной определенным двухцепочечным разрывом ДНК». Текущая биология. 14 (19): 1703–11. Дои:10.1016 / j.cub.2004.09.047. ЧВК  4493763. PMID  15458641.
  86. ^ Rogakou EP, Boon C, Redon C, Bonner WM (сентябрь 1999 г.). «Мегабазные домены хроматина, участвующие в двухцепочечных разрывах ДНК in vivo». Журнал клеточной биологии. 146 (5): 905–16. Дои:10.1083 / jcb.146.5.905. ЧВК  2169482. PMID  10477747.
  87. ^ Стюарт Г.С., Ван Б., Бигнелл К.Р., Тейлор А.М., Элледж С.Дж. (февраль 2003 г.). «MDC1 является медиатором контрольной точки повреждения ДНК млекопитающих». Природа. 421 (6926): 961–6. Bibcode:2003Натура.421..961S. Дои:10.1038 / природа01446. PMID  12607005. S2CID  4410773.
  88. ^ Bekker-Jensen S, Mailand N (декабрь 2010 г.). «Сборка и функция ДНК двухцепочечных очагов репарации разрывов в клетках млекопитающих». Ремонт ДНК. 9 (12): 1219–28. Дои:10.1016 / j.dnarep.2010.09.010. PMID  21035408.
  89. ^ Оздемир А., Спикулья С., Ласондер Е., Вермёлен М., Кэмпштейн С., Штунненберг Г. Г., Лоджи С. (июль 2005 г.). «Характеристика лизина 56 гистона H3 как сайта ацетилирования в Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 280 (28): 25949–52. Дои:10.1074 / jbc.C500181200. PMID  15888442.
  90. ^ Масумото Х., Хоук Д., Кобаяши Р., Верро А. (июль 2005 г.). «Роль регулируемого клеточного цикла ацетилирования лизина 56 гистона H3 в ответе на повреждение ДНК». Природа. 436 (7048): 294–8. Bibcode:2005Натура 436..294М. Дои:10.1038 / природа03714. PMID  16015338. S2CID  4414433.
  91. ^ Дрисколл Р., Хадсон А., Джексон СП (февраль 2007 г.). «Дрожжи Rtt109 способствуют стабильности генома за счет ацетилирования гистона H3 по лизину 56». Наука. 315 (5812): 649–52. Bibcode:2007Научный ... 315..649D. Дои:10.1126 / science.1135862. ЧВК  3334813. PMID  17272722.
  92. ^ Хан Дж., Чжоу Х., Хораздовски Б., Чжан К., Сюй Р.М., Чжан З. (февраль 2007 г.).«Rtt109 ацетилирует гистон H3 лизин 56 и функционирует в репликации ДНК». Наука. 315 (5812): 653–5. Bibcode:2007Научный ... 315..653H. Дои:10.1126 / science.1133234. PMID  17272723. S2CID  19056605.
  93. ^ Дас С., Люсия М.С., Хансен К.С., Тайлер Дж. К. (май 2009 г.). "CBP / p300-опосредованное ацетилирование гистона H3 по лизину 56". Природа. 459 (7243): 113–7. Bibcode:2009Натура.459..113D. Дои:10.1038 / природа07861. ЧВК  2756583. PMID  19270680.
  94. ^ Хан Дж, Чжоу Х, Ли З, Сюй Р.М., Чжан Зи (сентябрь 2007 г.). «Ацетилирование лизина 56 гистона H3, катализируемое RTT109 и регулируемое ASF1, необходимо для целостности реплисомы». Журнал биологической химии. 282 (39): 28587–96. Дои:10.1074 / jbc.M702496200. PMID  17690098.
  95. ^ Wurtele H, Kaiser GS, Bacal J, St-Hilaire E, Lee EH, Tsao S, Dorn J, Maddox P, Lisby M, Pasero P, Verreault A (январь 2012 г.). «Ацетилирование лизина 56 гистона H3 и ответ на повреждение вилки репликации ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 32 (1): 154–72. Дои:10.1128 / MCB.05415-11. ЧВК  3255698. PMID  22025679.
  96. ^ Wurtele H, Tsao S, Lépine G, Mullick A, Tremblay J, Drogaris P, Lee EH, Thibault P, Verreault A, Raymond M (июль 2010 г.). «Модуляция ацетилирования лизина 56 гистона H3 как противогрибковая терапевтическая стратегия». Природа Медицина. 16 (7): 774–80. Дои:10,1038 / нм.2175. ЧВК  4108442. PMID  20601951.
  97. ^ Ли Ф, Мао Г, Тонг Д, Хуанг Дж, Гу Л, Ян В, Ли ГМ (апрель 2013 г.). «Гистоновая метка H3K36me3 регулирует репарацию ошибочного спаривания ДНК человека посредством взаимодействия с MutSα». Клетка. 153 (3): 590–600. Дои:10.1016 / j.cell.2013.03.025. ЧВК  3641580. PMID  23622243.
  98. ^ Супек Ф., Ленер Б. (июль 2017 г.). «Кластерные сигнатуры мутаций показывают, что подверженная ошибкам репарация ДНК нацелена на мутации активных генов». Клетка. 170 (3): 534–547.e23. Дои:10.1016 / j.cell.2017.07.003. HDL:10230/35343. PMID  28753428.
  99. ^ Wilkins BJ, Rall NA, Ostwal Y, Kruitwagen T, Hiragami-Hamada K, Winkler M, Barral Y, Fischle W., Neumann H (январь 2014 г.). «Каскад модификаций гистонов вызывает конденсацию хроматина в митозе». Наука. 343 (6166): 77–80. Bibcode:2014Наука ... 343 ... 77 Вт. Дои:10.1126 / science.1244508. HDL:11858 / 00-001M-0000-0015-11C0-5. PMID  24385627. S2CID  7698266.
  100. ^ Йохансен К.М., Йохансен Дж. (2006). «Регуляция структуры хроматина путем фосфорилирования гистона H3S10». Хромосомные исследования. 14 (4): 393–404. Дои:10.1007 / s10577-006-1063-4. PMID  16821135. S2CID  8556959.
  101. ^ Castellano-Pozo M, Santos-Pereira JM, Rondón AG, Barroso S, Andújar E, Pérez-Alegre M, García-Muse T, Aguilera A (ноябрь 2013 г.). «Петли R связаны с фосфорилированием гистона H3 S10 и конденсацией хроматина». Молекулярная клетка. 52 (4): 583–90. Дои:10.1016 / j.molcel.2013.10.006. PMID  24211264.
  102. ^ Cheung WL, Ajiro K, Samejima K, Kloc M, Cheung P, Mizzen CA, Beeser A, Etkin LD, Chernoff J, Earnshaw WC, Allis CD (май 2003 г.). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредуется стерильной двадцать киназой млекопитающих». Клетка. 113 (4): 507–17. Дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00355-6. PMID  12757711.
  103. ^ Ан Ш., Чунг В. Л., Хсу Дж. Й., Диаз Р. Л., Смит М. М., Allis CD (январь 2005 г.). «Стерильная киназа 20 фосфорилирует гистон H2B по серину 10 во время апоптоза, индуцированного перекисью водорода у S. cerevisiae». Клетка. 120 (1): 25–36. Дои:10.1016 / j.cell.2004.11.016. PMID  15652479.
  104. ^ а б Робисон А.Дж., Нестлер Э.Д. (октябрь 2011 г.). «Транскрипционные и эпигенетические механизмы зависимости». Nat. Преподобный Neurosci. 12 (11): 623–37. Дои:10.1038 / nrn3111. ЧВК  3272277. PMID  21989194.
  105. ^ Хичкок Л.Н., Латтал К.М. (2014). «Гистон-опосредованная эпигенетика в зависимости». Эпигенетика и нейропластичность - доказательства и дебаты. Prog Mol Biol Transl Sci. Прогресс в молекулярной биологии и трансляционной науке. 128. С. 51–87. Дои:10.1016 / B978-0-12-800977-2.00003-6. ISBN  9780128009772. ЧВК  5914502. PMID  25410541.
  106. ^ McQuown SC, Wood MA (апрель 2010 г.). «Эпигенетическая регуляция при расстройствах, связанных с употреблением психоактивных веществ». Curr Psychiatry Rep. 12 (2): 145–53. Дои:10.1007 / s11920-010-0099-5. ЧВК  2847696. PMID  20425300.
  107. ^ "Вызывает ли никотиновая зависимость?".
  108. ^ Левин А., Хуанг Ю., Дрисальди Б., Гриффин Е.А., Поллак Д.Д., Сюй С., Инь Д., Шаффран С., Кандел Д. Б., Кандел ER (ноябрь 2011 г.). «Молекулярный механизм действия лекарственного средства: эпигенетические изменения, инициированные кокаином в результате экспрессии основного гена никотина». Sci Transl Med. 3 (107): 107ra109. Дои:10.1126 / scitranslmed.3003062. ЧВК  4042673. PMID  22049069.
  109. ^ Ruffle JK (ноябрь 2014 г.). «Молекулярная нейробиология зависимости: что такое (Δ) FosB?». Am J Злоупотребление алкоголем. 40 (6): 428–37. Дои:10.3109/00952990.2014.933840. PMID  25083822. S2CID  19157711.
  110. ^ Nestler EJ, Barrot M, Self DW (сентябрь 2001 г.). «DeltaFosB: устойчивый молекулярный переключатель от зависимости». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (20): 11042–6. Bibcode:2001ПНАС ... 9811042Н. Дои:10.1073 / пнас.191352698. ЧВК  58680. PMID  11572966.
  111. ^ D'Addario C, Caputi FF, Ekström TJ, Di Benedetto M, Maccarrone M, Romualdi P, Candeletti S (февраль 2013 г.). «Этанол вызывает эпигенетическую модуляцию экспрессии генов продинорфина и проноцицептина в комплексе миндалины крысы». J. Mol. Неврологи. 49 (2): 312–9. Дои:10.1007 / s12031-012-9829-y. PMID  22684622. S2CID  14013417.
  112. ^ «Каковы масштабы злоупотребления метамфетамином в Соединенных Штатах?».
  113. ^ а б Годино А., Джаянти С., Кадет Дж. Л. (2015). «Эпигенетический ландшафт зависимости от амфетамина и метамфетамина у грызунов». Эпигенетика. 10 (7): 574–80. Дои:10.1080/15592294.2015.1055441. ЧВК  4622560. PMID  26023847.
  114. ^ Круз ФК, Хавьер Рубио Ф, Надежда BT (декабрь 2015 г.). «Использование c-fos для изучения нейронных ансамблей в кортикостриатной схеме зависимости». Brain Res. 1628 (Pt A): 157–73. Дои:10.1016 / j.brainres.2014.11.005. ЧВК  4427550. PMID  25446457.
  115. ^ де Брюин Р.А., Макдональд У.Х., Калашникова Т.И., Йейтс Дж., Виттенберг С. (июнь 2004 г.). «Cln3 активирует G1-специфическую транскрипцию посредством фосфорилирования SBF-связанного репрессора Whi5». Клетка. 117 (7): 887–98. Дои:10.1016 / j.cell.2004.05.025. PMID  15210110.
  116. ^ Сюй Х., Ким У. Дж., Шустер Т., Грюнштейн М. (ноябрь 1992 г.). «Идентификация нового набора генов, регулирующих клеточный цикл, которые регулируют транскрипцию S-фазы гистоновых генов в Saccharomyces cerevisiae». Молекулярная и клеточная биология. 12 (11): 5249–59. Дои:10.1128 / mcb.12.11.5249. ЧВК  360458. PMID  1406694.
  117. ^ Димова Д., Накердиен З., Фургесон С., Эгучи С., Осли М.А. (1999). «Роль транскрипционных репрессоров в нацеливании на дрожжевой Swi / Snf комплекс». Молекулярная клетка. 4 (1): 75–83. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80189-6. PMID  10445029.
  118. ^ Dominski Z, Erkmann JA, Yang X, Sànchez R, Marzluff WF (январь 2002 г.). «Новый белок цинкового пальца связан с мяРНП U7 и взаимодействует с белком, связывающим стержень-петлю в пре-мРНП гистона, чтобы стимулировать процессинг 3'-конца». Гены и развитие. 16 (1): 58–71. Дои:10.1101 / gad.932302. ЧВК  155312. PMID  11782445.
  119. ^ Dominski Z, Yang XC, Kaygun H, Dadlez M, Marzluff WF (август 2003 г.). «3'-экзонуклеаза, которая специфически взаимодействует с 3'-концом мРНК гистона». Молекулярная клетка. 12 (2): 295–305. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00278-8. PMID  14536070.
  120. ^ Чжэн Л., Домински З., Ян XC, Элмс П., Раска К.С., Борхерс С.Х., Марзлафф В.Ф. (март 2003 г.). «Фосфорилирование белка, связывающего ствол и петлю (SLBP) на двух треонинах, запускает деградацию SLBP, единственного регулируемого клеточного цикла фактора, необходимого для регуляции процессинга мРНК гистонов, в конце S-фазы». Молекулярная и клеточная биология. 23 (5): 1590–601. Дои:10.1128 / MCB.23.5.1590-1601.2003. ЧВК  151715. PMID  12588979.
  121. ^ Ван К., Сойер И.А., Сунг М.Х., Стерджилл Д., Шевцов С.П., Пегораро Г., Хаким О., Бэк С., Хагер Г.Л., Дундр М. (март 2016 г.). «Тельца Кахаля связаны с конформацией генома». Nature Communications. 7: 10966. Bibcode:2016 НатКо ... 710966W. Дои:10.1038 / ncomms10966. ЧВК  4802181. PMID  26997247.
  122. ^ Чжао Дж., Кеннеди Б.К., Лоуренс Б.Д., Барби Д.А., Матера А.Г., Флетчер Дж. А., Харлоу Э. (сентябрь 2000 г.). «NPAT связывает циклин E-Cdk2 с регуляцией зависимой от репликации транскрипции гистонового гена». Гены и развитие. 14 (18): 2283–97. Дои:10.1101 / GAD.827700. ЧВК  316937. PMID  10995386.

внешняя ссылка