Гистоновая деацетилаза - Википедия - Histone deacetylase
Гистоновая деацетилаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Каталитический домен человека гистондеацетилаза 4 со связанным ингибитором. PDB рендеринг на основе 2vqj.[1] | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 3.5.1.98 | ||||||||
Количество CAS | 9076-57-7 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Суперсемейство гистоновых деацетилаз | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Hist_deacetyl | ||||||||
Pfam | PF00850 | ||||||||
ИнтерПро | IPR000286 | ||||||||
SCOP2 | 1c3s / Объем / СУПФАМ | ||||||||
|
Гистоновые деацетилазы (EC 3.5.1.98, HDAC) являются классом ферменты это удалить ацетильные группы (O = C-CH3) из ε-N-ацетил лизин аминокислота на гистон, позволяя гистонам более плотно обернуть ДНК.[2] Это важно, потому что ДНК оборачивается вокруг гистонов, а экспрессия ДНК регулируется ацетилированием и деацетилированием. Его действие противоположно действию гистонацетилтрансфераза. Белки HDAC теперь также называют лизиндеацетилазами (KDAC), чтобы описать их функцию, а не их мишень, которая также включает негистоновые белки.[3]
Суперсемейство HDAC
Вместе с ацетилполиамин амидогидролазы и белки утилизации ацетоина гистондеацетилазы образуют древнее суперсемейство белков, известное как суперсемейство гистондеацетилаз.[4]
Классы HDAC у высших эукариот
HDAC подразделяются на четыре класса в зависимости от гомологии последовательности с исходными ферментами дрожжей и организации домена:[5]
Учебный класс | Члены | Каталитические сайты | Субклеточная локализация | Распределение тканей | Субстраты | Связующие партнеры | Нокаут-фенотип |
---|---|---|---|---|---|---|---|
я | HDAC1 | 1 | Ядро | Вездесущий | Рецептор андрогенов, SHP, p53, MyoD, E2F1, STAT3 | – | Эмбриональная летальность, повышенное ацетилирование гистонов, увеличение стр.21 и стр. 27 |
HDAC2 | 1 | Ядро | Вездесущий | Рецептор глюкокортикоидов, YY1, BCL6, STAT3 | – | Сердечный дефект | |
HDAC3 | 1 | Ядро | Вездесущий | SHP, YY1, GATA1, РЕЛА, STAT3, MEF2D | – | – | |
HDAC8 | 1 | Ядро / цитоплазма | Вездесущий? | – | EST1B | – | |
IIA | HDAC4 | 1 | Ядро / цитоплазма | сердце, скелетные мышцы, мозг | GCMA, GATA1, HP1 | RFXANK | Дефекты в хондроцит дифференциация |
HDAC5 | 1 | Ядро / цитоплазма | сердце, скелетные мышцы, мозг | GCMA, SMAD7, HP1 | REA, рецептор эстрогена | Сердечный дефект | |
HDAC7 | 1 | Ядро / цитоплазма / митохондрии | сердце, скелетные мышцы, поджелудочная железа, плацента | PLAG1, PLAG2 | HIF1A, BCL6, рецептор эндотелина, ACTN1, ACTN4, рецептор андрогенов, Подсказка60 | Поддержание целостности сосудов, увеличение MMP10 | |
HDAC9 | 1 | Ядро / цитоплазма | мозг, скелетная мышца | – | FOXP3 | Сердечный дефект | |
МИБ | HDAC6 | 2 | Преимущественно цитоплазма | сердце, печень, почки, плацента | α-тубулин, HSP90, SHP, SMAD7 | RUNX2 | – |
HDAC10 | 1 | Преимущественно цитоплазма | печень, селезенка, почки | – | – | – | |
III | сиртуины у млекопитающих (SIRT1, SIRT2, SIRT3, SIRT4, SIRT5, SIRT6, SIRT7 ) | – | – | – | – | – | – |
Sir2 в дрожжах С. cerevisiae | – | – | – | – | – | – | |
IV | HDAC11 | 2 | Ядро / цитоплазма | мозг, сердце, скелетные мышцы, почки | – | – | – |
HDAC (кроме класса III) содержат цинк и известны как Zn2+-зависимые гистоновые деацетилазы.[6] Они имеют классическую складку аргиназы и структурно и механически отличаются от сиртуины (класс III), которые складываются в Россманн архитектура и есть НАД+ зависимый.[7]
Подтипы
Белки HDAC сгруппированы в четыре класса (см. Выше) на основании функции и сходства последовательностей ДНК. Классы I, II и IV считаются «классическими» HDAC, активность которых ингибируется трихостатин А (TSA) и имеют цинк-зависимый активный центр, тогда как ферменты класса III являются семейством NAD+-зависимые белки, известные как сиртуины и на них не распространяется TSA.[8] Гомологи этих трех групп обнаружены у дрожжей, имеющих следующие названия: пониженная калиевая зависимость 3 (Rpd3), что соответствует классу I; гистондеацетилаза 1 (hda1), соответствующая Классу II; и регулятор тихой информации 2 (Sir2 ), соответствующий III классу. Класс IV содержит только одну изоформу (HDAC11), которая не имеет высокой гомологии ни с ферментами дрожжей Rpd3, ни с hda1,[9] и поэтому HDAC11 отнесен к собственному классу. Ферменты класса III считаются отдельным типом ферментов и имеют другой механизм действия; эти ферменты НАД+-зависимы, тогда как для HDAC других классов требуется Zn2+ в качестве кофактора.[10]
Эволюция
HDAC сохраняются в ходе эволюции, показывая ортологи у всех эукариот и даже у Археи. Все верхние эукариоты, включая позвоночных, растения и членистоногих, обладают по крайней мере одним HDAC на класс, в то время как большинство позвоночных несут 11 канонических HDAC, за исключением костных рыб, у которых отсутствует HDAC2, но, по-видимому, есть дополнительная копия HDAC11, получившая название HDAC12. . Растения несут дополнительные HDAC по сравнению с животными, предположительно для выполнения более сложной регуляции транскрипции, необходимой этим сидячим организмам. По-видимому, HDAC происходят из предкового ацетил-связывающего домена, поскольку гомологи HDAC были обнаружены в бактериях в форме белков утилизации ацетоина (AcuC).[2]
Субклеточное распределение
В HDAC класса I, HDAC 1, 2 и 3 обнаруживаются в основном в ядре, тогда как HDAC8 обнаруживается как в ядре, так и в цитоплазме, а также ассоциирован с мембраной. HDAC класса II (HDAC4, 5, 6, 7, 9 и 10) способны перемещаться в ядро и из него в зависимости от различных сигналов.[11][12]
HDAC6 - это цитоплазматический фермент, связанный с микротрубочками. Деацетилаты HDAC6 тубулин, Hsp90, и кортактин, и образует комплексы с другими белками-партнерами и, следовательно, участвует во множестве биологических процессов.[13]
Функция
Модификация гистона
Хвосты гистонов обычно заряжены положительно из-за амин группы присутствуют на своих лизин и аргинин аминокислоты. Эти положительные заряды помогают хвостам гистонов взаимодействовать с отрицательно заряженными и связываться с ними. фосфатные группы на основе ДНК. Ацетилирование, который обычно встречается в клетке, нейтрализует положительные заряды гистона, превращая амины в амиды и снижает способность гистонов связываться с ДНК. Это уменьшенное связывание позволяет хроматин расширение, разрешающее генетические транскрипция иметь место. Гистоновые деацетилазы удаляют эти ацетильные группы, увеличивая положительный заряд гистоновых хвостов и способствуя связыванию с высоким сродством между гистонами и основной цепью ДНК. Повышенное связывание ДНК уплотняет структуру ДНК, предотвращая транскрипцию.
Гистоновая деацетилаза участвует в ряде путей в живой системе. Согласно Киотская энциклопедия генов и геномов (КЕГГ ), это:
- Обработка экологической информации; преобразование сигнала; сигнальный путь notch ПУТЬ: ko04330
- Клеточные процессы; рост и гибель клеток; клеточный цикл ПУТЬ: ko04110
- Болезни человека; раковые образования; хронический миелоидный лейкоз ПУТЬ: ko05220
Ацетилирование гистонов играет важную роль в регуляции экспрессии генов. Гиперацетилированный хроматин транскрипционно активен, а гипоацетилированный хроматин неактивен. Исследование на мышах показало, что определенная подгруппа генов мыши (7%) не регулировалась в отсутствие HDAC1.[14] Их исследование также обнаружило регуляторный перекрестные помехи между HDAC1 и HDAC2 и предлагают новую функцию HDAC1 в качестве коактиватора транскрипции. Было обнаружено, что экспрессия HDAC1 повышена в префронтальной коре головного мозга пациентов с шизофренией,[15] отрицательно коррелируя с выражением GAD67 мРНК.
Негистоновые эффекты
Ошибочно рассматривать HDAC исключительно в контексте регуляции транскрипции генов путем модификации гистонов и структуры хроматина, хотя это, по-видимому, является преобладающей функцией. Функцию, активность и стабильность белков можно контролировать с помощью посттрансляционные модификации. Протеин фосфорилирование это, пожалуй, наиболее широко изученная и понятная модификация, в которой определенные аминокислотные остатки фосфорилируются под действием протеинкиназы или дефосфорилирован под действием фосфатазы. В ацетилирование остатков лизина возникает как аналогичный механизм, в котором на негистоновые белки действуют ацетилазы и деацетилазы.[16] Именно в этом контексте было обнаружено, что HDAC взаимодействуют с множеством негистоновых белков - некоторые из них факторы транскрипции и со-регуляторы некоторые нет. Обратите внимание на следующие четыре примера:
- HDAC6 связан с агресомы. Неправильно свернутые белковые агрегаты маркируются убиквитинирование и удаляется из цитоплазмы динеин двигатели через сеть микротрубочек к органелле, называемой агресомой. HDAC 6 связывает полиубиквитинированные неправильно свернутые белки и связывается с динеиновыми моторами, тем самым позволяя физически транспортировать неправильно свернутый белковый груз к шаперонам и протеасомам для последующего разрушения.[17] HDAC6 является важным регулятором функции HSP90, и его ингибитор предлагается для лечения метаболических нарушений.[18]
- PTEN является важной фосфатазой, участвующей в передаче клеточных сигналов через фосфоинозиты и AKT /PI3 киназа путь. PTEN подвергается сложному регуляторному контролю посредством фосфорилирования, убиквитинирования, окисления и ацетилирования. Ацетилирование PTEN гистонацетилтрансферазой p300 / CBP-ассоциированным фактором (PCAF ) может подавлять свою деятельность; наоборот, деацетилирование PTEN SIRT1 деацетилаза и, по HDAC1, может стимулировать его активность.[19][20]
- APE1 / Ref-1 (APEX1 ) представляет собой многофункциональный белок, обладающий как активностью репарации ДНК (на сайтах абазических и однонитевых разрывов), так и активностью регуляции транскрипции, связанной с окислительный стресс. APE1 / Ref-1 ацетилируется PCAF; напротив, он стабильно связывается и деацетилируется с HDAC класса I. Состояние ацетилирования APE1 / Ref-1, по-видимому, не влияет на его Ремонт ДНК активности, но он действительно регулирует его транскрипционную активность, такую как его способность связываться с промотором ПТГ и инициировать транскрипцию паратироидный гормон ген.[21][22]
- NF-κB является ключевым фактором транскрипции и эффекторной молекулой, участвующей в ответах на клеточный стресс, состоящей из гетеродимера p50 / p65. Субъединица p65 контролируется ацетилированием через PCAF и деацетилированием через HDAC3 и HDAC6.[23]
Это лишь некоторые примеры постоянно возникающих негистоновых, нехроматиновых ролей для HDAC.
Нейродегенеративные заболевания
Унаследованные мутации в гене, кодирующем FUS, РНК /ДНК связывающий белок, причинно связаны с боковой амиотрофический склероз (БАС).[24] FUS играет ключевую роль в Повреждение ДНК ответ, включающий его прямое взаимодействие с гистондеацетилазой 1 (HDAC1). Мутантные белки FUS с ALS дефектны в ответе на повреждение ДНК и в рекомбинационный Ремонт ДНК, а также демонстрируют снижение взаимодействия с HDAC1.[24]
Атаксия-телеангиэктазия происходит из-за мутации в Банкомат ген. Дикого типа Банкомат кодирует протеинкиназу, используемую в ремоделирование хроматина И в эпигенетические изменения которые необходимы для восстановление двухцепочечных разрывов ДНК.[25] Банкомат причины мутации нейроны накапливать ядерную гистоновую деацетилазу 4 (HDAC4), что приводит к усилению деацетилирования гистонов и изменению экспрессии нейрональных генов, что, вероятно, способствует нейродегенерация характеристика атаксии-телеангиэктазии.[26]
Ингибиторы HDAC
Ингибиторы гистондеацетилазы (ИГД) уже давно используются в психиатрии и неврологии в качестве стабилизаторов настроения и противоэпилептических средств, например, вальпроевая кислота. В последнее время ИЧР изучаются как средство смягчения или лечения нейродегенеративные заболевания.[27][28] Также в последние годы были предприняты усилия по разработке ИЧР для лечения рака.[29][30] Вориностат (САХА) был FDA одобрен в 2006 году для лечения кожных проявлений у пациентов с кожная Т-клеточная лимфома (CTCL), которые не прошли предыдущее лечение. Второй HDI, Istodax (ромидепсин ), был одобрен в 2009 г. для пациентов с ХТКЛ. Точные механизмы, с помощью которых могут работать соединения, неясны, но эпигенетический Предлагаются пути.[31] Кроме того, в клинических испытаниях изучается влияние вальпроевой кислоты на латентные пулы ВИЧ у инфицированных людей.[32] HDI в настоящее время исследуются в качестве хемосенсибилизаторов для цитотоксической химиотерапии или лучевой терапии или в сочетании с ингибиторами метилирования ДНК на основе синергии in vitro.[33] Были разработаны селективные изоформы HDI, которые могут помочь в выяснении роли отдельных изоформ HDAC.[34][35][36]
Ингибиторы HDAC влияют на негистоновые белки, связанные с ацетилированием. HDI могут изменять степень ацетилирования этих молекул и, следовательно, увеличивать или подавлять их активность. Для четырех приведенных выше примеров (см. Функция) на HDAC, действующих на негистоновые белки, в каждом из этих случаев ингибитор HDAC Трихостатин А (TSA) блокирует эффект. Было показано, что HDI изменяют активность многих факторов транскрипции, включая ACTR, cMyb, E2F1, EKLF, FEN 1, GATA, HNF-4, HSP90, Ku70, NFκB, PCNA, p53, РБ, Runx, SF1 Sp3, STAT, TFIIE, TCF, ГГ1.[37][38]
В кетоновое тело β-гидроксибутират было показано на мышах увеличить экспрессия гена FOXO3a путем ингибирования гистондеацетилазы.[39]
Ингибиторы гистондеацетилазы могут модулировать латентный период некоторых вирусов, что приводит к их реактивации.[40] Было показано, например, что это происходит со скрытым вирус герпеса человека-6 инфекционное заболевание.
Ингибиторы гистондеацетилазы показали активность против некоторых Плазмодий виды и стадии, которые могут указывать на их потенциал в лечении малярии. Было показано, что HDI накапливают ацетилированный гистон H3K9 / H3K14, нижестоящую мишень HDAC класса I.[41]
Смотрите также
- Гистонацетилтрансфераза (HAT)
- Ингибитор гистон-деацетилазы
- Гистон-метилтрансфераза (HMT)
- Ферменты, модифицирующие гистоны
- Контроль РНК-полимеразы структурой хроматина
Рекомендации
- ^ Боттомли М.Дж., Ло Сурдо П., Ди Джовин П., Чирилло А., Скарпелли Р., Ферриньо Ф., Джонс П., Неддерман П. и др. (Сентябрь 2008 г.). «Структурный и функциональный анализ каталитического домена HDAC4 человека выявил регуляторный структурный цинк-связывающий домен». Журнал биологической химии. 283 (39): 26694–704. Дои:10.1074 / jbc.M803514200. PMID 18614528.
- ^ а б c Milazzo G, Mercatelli D, Di Muzio G, Triboli L, De Rosa P, Perini G, Giorgi FM (май 2020 г.). «Деацетилазы гистонов (HDAC): эволюция, специфичность, роль в транскрипционных комплексах и фармакологическая активность». Гены. 11 (5): 556–604. Дои:10.3390 / genes11050556. PMID 32429325.
- ^ Чоудхари К., Кумар С., Гнад Ф., Нильсен М.Л., Рехман М., Вальтер Т.К., Олсен Дж. В., Манн М. (август 2009 г.). «Ацетилирование лизина нацелено на белковые комплексы и ко-регулирует основные клеточные функции». Наука. 325 (5942): 834–40. Дои:10.1126 / science.1175371. PMID 19608861.
- ^ Лейпе Д. Д., Ландсман Д. (сентябрь 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы, белки утилизации ацетоина и ацетилполиамин амидогидролазы являются членами древнего суперсемейства белков». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (18): 3693–7. Дои:10.1093 / nar / 25.18.3693. ЧВК 146955. PMID 9278492.
- ^ Докманович М., Кларк С., Маркс П.А. (октябрь 2007 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: обзор и перспективы». Молекулярные исследования рака. 5 (10): 981–9. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-07-0324. PMID 17951399.
- ^ Marks PA, Xu WS (июль 2009 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы: потенциал в терапии рака». Журнал клеточной биохимии. 107 (4): 600–8. Дои:10.1002 / jcb.22185. ЧВК 2766855. PMID 19459166.
- ^ Бюргер М, Чори Дж (2018). «Структурная и химическая биология деацетилаз углеводов, белков, малых молекул и гистонов». Биология коммуникации. 1: 217. Дои:10.1038 / с42003-018-0214-4. ЧВК 6281622. PMID 30534609.
- ^ Imai S, Armstrong CM, Kaeberlein M, Guarente L (февраль 2000 г.). «Белок подавления транскрипции и долголетия Sir2 представляет собой НАД-зависимую гистоновую деацетилазу». Природа. 403 (6771): 795–800. Дои:10.1038/35001622. PMID 10693811.
- ^ Ян XJ, Сето Э. (март 2008 г.). «Семейство лизиндеацетилаз Rpd3 / Hda1: от бактерий и дрожжей до мышей и людей». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 9 (3): 206–18. Дои:10.1038 / nrm2346. ЧВК 2667380. PMID 18292778.
- ^ Барнеда-Захонеро Б., Парра М. (декабрь 2012 г.). «Гистоновые деацетилазы и рак». Молекулярная онкология. 6 (6): 579–89. Дои:10.1016 / j.molonc.2012.07.003. ЧВК 5528343. PMID 22963873.
- ^ де Руйтер А.Дж., ван Геннип А.Х., Карон Х.Н., Кемп С., ван Куйленбург А.Б. (март 2003 г.). «Гистоновые деацетилазы (HDAC): характеристика классического семейства HDAC». Биохимический журнал. 370 (Pt 3): 737–49. Дои:10.1042 / BJ20021321. ЧВК 1223209. PMID 12429021.
- ^ Лонгворт М.С., Лайминс Л.А. (июль 2006 г.). «Гистоновая деацетилаза 3 локализуется на плазматической мембране и является субстратом Src». Онкоген. 25 (32): 4495–500. Дои:10.1038 / sj.onc.1209473. PMID 16532030.
- ^ Валенсуэла-Фернандес А., Кабреро Дж. Р., Серрадор Дж. М., Санчес-Мадрид Ф (июнь 2008 г.). «HDAC6: ключевой регулятор цитоскелета, миграции клеток и межклеточных взаимодействий». Тенденции в клеточной биологии. 18 (6): 291–7. Дои:10.1016 / j.tcb.2008.04.003. PMID 18472263.
- ^ Zupkovitz G, Tischler J, Posch M, Sadzak I, Ramsauer K, Egger G, Grausenburger R, Schweifer N, Chiocca S, Decker T., Seiser C (ноябрь 2006 г.). «Отрицательная и положительная регуляция экспрессии гена гистондеацетилазой 1 мыши». Молекулярная и клеточная биология. 26 (21): 7913–28. Дои:10.1128 / MCB.01220-06. ЧВК 1636735. PMID 16940178.
- ^ Шарма Р.П., Грейсон Д.Р., Гэвин Д.П. (январь 2008 г.). «Экспрессия гистондеактилазы 1 повышена в префронтальной коре головного мозга пациентов с шизофренией: анализ коллекции микрочипов Национального банка данных мозга». Исследование шизофрении. 98 (1–3): 111–7. Дои:10.1016 / j.schres.2007.09.020. ЧВК 2254186. PMID 17961987.
- ^ Глозак М.А., Сенгупта Н., Чжан Х, Сэто Э. (декабрь 2005 г.). «Ацетилирование и деацетилирование негистоновых белков». Ген. 363: 15–23. Дои:10.1016 / j.gene.2005.09.010. PMID 16289629.
- ^ Родригес-Гонсалес А., Лин Т., Икеда А. К., Симмс-Уолдрип Т., Фу С., Сакамото К. М. (апрель 2008 г.). «Роль агресомного пути при раке: нацеливание на деградацию белка, зависимую от гистондеацетилазы 6». Исследования рака. 68 (8): 2557–60. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-5989. PMID 18413721.
- ^ Mahla RS (июль 2012 г.). «Комментарий на: Winkler et al. Гистондеацетилаза 6 (HDAC6) является важным модификатором глюкокортикоид-индуцированного глюконеогенеза в печени. Диабет 2012; 61: 513-523». Сахарный диабет. 61 (7): e10, ответ автора e11. Дои:10.2337 / db12-0323. ЧВК 3379673. PMID 22723278.
- ^ Икеноуэ Т., Иноки К., Чжао Б., Гуань К.Л. (сентябрь 2008 г.). «Ацетилирование PTEN модулирует его взаимодействие с доменом PDZ». Исследования рака. 68 (17): 6908–12. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1107. PMID 18757404.
- ^ Яо XH, Nyomba BL (июнь 2008 г.). «Резистентность к инсулину печени, вызванная пренатальным воздействием алкоголя, связана со сниженным ацетилированием PTEN и TRB3 у потомства взрослых крыс». Американский журнал физиологии. Регуляторная, интегративная и сравнительная физиология. 294 (6): R1797–806. Дои:10.1152 / ajpregu.00804.2007. PMID 18385463.
- ^ Бхакат К.К., Идзуми Т., Ян С.Х., Хазра Т.К., Митра С. (декабрь 2003 г.). «Роль ацетилированной AP-эндонуклеазы человека (APE1 / Ref-1) в регуляции гена паратироидного гормона». Журнал EMBO. 22 (23): 6299–309. Дои:10.1093 / emboj / cdg595. ЧВК 291836. PMID 14633989.
- ^ Fantini D, Vascotto C, Deganuto M, Bivi N, Gustincich S, Marcon G, Quadrifoglio F, Damante G, Bhakat KK, Mitra S, Tell G (январь 2008 г.). «APE1 / Ref-1 регулирует экспрессию PTEN, опосредованную Egr-1». Свободные радикальные исследования. 42 (1): 20–9. Дои:10.1080/10715760701765616. ЧВК 2677450. PMID 18324520.
- ^ Hasselgren PO (декабрь 2007 г.). «Убиквитинирование, фосфорилирование и ацетилирование - тройная угроза при истощении мышц». Журнал клеточной физиологии. 213 (3): 679–89. Дои:10.1002 / jcp.21190. PMID 17657723.
- ^ а б Ван В.Й., Пан Л., Су СК, Куинн Э.Дж., Сасаки М., Хименес Дж.С., Маккензи И.Р., Хуанг Э.Дж., Цай Л.Х. (октябрь 2013 г.). «Взаимодействие FUS и HDAC1 регулирует реакцию на повреждение ДНК и восстановление нейронов». Nat. Неврологи. 16 (10): 1383–91. Дои:10.1038 / № 3514. ЧВК 5564396. PMID 24036913.
- ^ Бергер Н.Д., Стэнли Ф.К., Мур С., Гударзи А.А. (октябрь 2017 г.). «ATM-зависимые пути ремоделирования хроматина и ответов на окислительное повреждение ДНК». Филос. Пер. R. Soc. Лонд., Б, Биол. Наука. 372 (1731). Дои:10.1098 / rstb.2016.0283. ЧВК 5577461. PMID 28847820.
- ^ Ли Дж., Чен Дж., Рикуперо С.Л., Харт Р.П., Шварц М.С., Куснецов А., Херруп К. (май 2012 г.). «Ядерное накопление HDAC4 при дефиците ATM способствует нейродегенерации при атаксии и телеангиэктазии». Nat. Med. 18 (5): 783–90. Дои:10.1038 / нм.2709. ЧВК 3378917. PMID 22466704.
- ^ Ханен Э., Хауке Дж., Транкле С., Эйюпоглу И.Ю., Вирт Б., Блюмке I (февраль 2008 г.). «Ингибиторы гистоновой деацетилазы: возможные последствия для нейродегенеративных расстройств». Заключение эксперта по исследуемым препаратам. 17 (2): 169–84. Дои:10.1517/13543784.17.2.169. PMID 18230051.
- ^ «Ученые обращают вспять» потерю памяти ». Новости BBC. 2007-04-29. Получено 2007-07-08.
- ^ Мваквари SC, Патил В., Геррант В., Ойелере А.К. (2010). «Ингибиторы макроциклических гистондеацетилаз». Curr Top Med Chem. 10 (14): 1423–40. Дои:10.2174/156802610792232079. ЧВК 3144151. PMID 20536416.
- ^ Миллер Т.А., Виттер DJ, Belvedere S (ноябрь 2003 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы». Журнал медицинской химии. 46 (24): 5097–116. Дои:10.1021 / jm0303094. PMID 14613312.
- ^ Monneret C (апрель 2007 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы для эпигенетической терапии рака». Противораковые препараты. 18 (4): 363–70. Дои:10.1097 / CAD.0b013e328012a5db. PMID 17351388.
- ^ Истощение латентного ВИЧ в клетках CD4 - полный текст - ClinicalTrials.gov
- ^ Бэтти Н., Малуф Г.Г., Исса Дж. П. (август 2009 г.). «Ингибиторы гистон-деацетилазы как противоопухолевые средства». Письма о раке. 280 (2): 192–200. Дои:10.1016 / j.canlet.2009.03.013. PMID 19345475.
- ^ Патил В., Соджи QH, Корнацки-младший, Мрксич М., Ойелере А.К. (май 2013 г.). «3-гидроксипиридин-2-тион как новая группа, связывающая цинк для селективного ингибирования гистондеацетилазы». Журнал медицинской химии. 56 (9): 3492–506. Дои:10.1021 / jm301769u. ЧВК 3657749. PMID 23547652.
- ^ Мваквари С.К., Геррант В., Патил В., Хан С.И., Теквани Б.Л., Гурард-Левин З.А., Мрксич М., Ойелере А.К. (август 2010 г.). «Непептидные макроциклические ингибиторы гистондеацетилазы, полученные из трициклического кетолидного скелета». Журнал медицинской химии. 53 (16): 6100–11. Дои:10.1021 / jm100507q. ЧВК 2924451. PMID 20669972.
- ^ Батлер К.В., Калин Дж., Брошиер С., Вистоли Дж., Лэнгли Б., Козиковски А.П. (август 2010 г.). «Рациональный дизайн и простая химия позволяют получить превосходный нейрозащитный ингибитор HDAC6, тубастатин А». Журнал Американского химического общества. 132 (31): 10842–6. Дои:10.1021 / ja102758v. ЧВК 2916045. PMID 20614936.
- ^ Драммонд, округ Колумбия, Благородный CO, Кирпотин Д.Б., Го З., Скотт Г.К., Бенц СС (2005). «Клиническая разработка ингибиторов гистондеацетилазы как противораковых средств». Ежегодный обзор фармакологии и токсикологии. 45: 495–528. Дои:10.1146 / annurev.pharmtox.45.120403.095825. PMID 15822187.
- ^ Ян XJ, Сето Э (август 2007 г.). «HAT и HDAC: от структуры, функции и регуляции до новых стратегий терапии и профилактики». Онкоген. 26 (37): 5310–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1210599. PMID 17694074.
- ^ Симадзу Т., Хиршей, доктор медицины, Ньюман Дж, Вердин Э (2013). «Подавление оксидативного стресса β-гидроксибутиратом, эндогенным ингибитором гистондеацетилазы». Наука (журнал). 339 (6116): 211–214. Дои:10.1126 / science.1227166. ЧВК 3735349. PMID 23223453.
- ^ Арбакл Дж. Х., Медвецкий П. Г. (август 2011 г.). «Молекулярная биология латентного периода вируса герпеса-6 человека и интеграции теломер». Микробы и инфекции / Institut Pasteur. 13 (8–9): 731–41. Дои:10.1016 / j.micinf.2011.03.006. ЧВК 3130849. PMID 21458587.
- ^ Беус М., Райич З., Майсингер Д., Млинарич З., Антунович М., Мариьянович И. и др. (Август 2018 г.). «SAHAquines, новые гибриды на основе мотивов SAHA и примахина, как потенциальные цитостатические и антиплазмодиальные агенты». ХимияOpen. 7 (8): 624–638. Дои:10.1002 / открыто.201800117. ЧВК 6104433. PMID 30151334.
внешняя ссылка
- Гистон + деацетилаза в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- Анимация в Merck