HDAC7 - HDAC7

HDAC7
Белок HDAC7A PDB 2nvr.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, гистондеацетилаза 7
Внешние идентификаторыOMIM: 606542 MGI: 1891835 ГомолоГен: 9124 Генные карты: HDAC7
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение HDAC7
Геномное расположение HDAC7
Группа12q13.11Начните47,782,722 бп[1]
Конец47,833,132 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HDAC7A 217937 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

51564

56233

Ансамбль

ENSG00000061273

ENSMUSG00000022475

UniProt

Q8WUI4

Q8C2B3

RefSeq (мРНК)

NM_001098416
NM_001308090
NM_015401
NM_016596
NM_001368046

RefSeq (белок)

NP_001091886
NP_001295019
NP_056216
NP_001354975

Расположение (UCSC)Chr 12: 47,78 - 47,83 МбChr 15: 97,79 - 97,84 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гистоновая деацетилаза 7 является фермент что у людей кодируется HDAC7 ген.[5][6][7]

Функция

Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции, прогрессии клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование / деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию последовательностей с членами семейства гистондеацетилаз. Этот ген является ортологом мышиного гена HDAC7, белок которого способствует репрессии, опосредованной транскрипционным корепрессором SMRT. Для этого гена обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих несколько изоформ.[7] HDAC7 имеет структурное и функциональное сходство с HDACs 4, 5 и 9, поскольку эти четыре HDAC составляют класс IIa HDAC у высших эукариот. HDAC класса IIa фосфорилируются кальций / кальмодулин-зависимой типазой (CaMK ) и протеинкиназы D (PKD) в ответ на киназозависимую передачу сигналов. HDAC7 обладает небольшой внутренней деацетилазной активностью и, следовательно, требует ассоциации с HDAC класса I, HDAC3 для подавления экспрессии генов. С помощью кристаллических структур человеческого HDAC7 было продемонстрировано, что каталитический домен HDAC7 имеет дополнительный связывающий цинк мотив, специфичный для класса IIa HDAC, прилегающий к активному сайту.[8] Это, скорее всего, позволит обеспечить распознавание субстрата и белок-белковые взаимодействия, которые необходимы для ферментов HDAC класса IIa.

Альтернативные функции

Хотя было показано, что HDAC7 обладает небольшой внутренней активностью деацетилазы, исследования показали, что HDAC7 может иметь различные альтернативные функции, связанные с развитием, пролиферацией и воспалением.

Одно исследование показало, что HDAC7 подавляет пролиферацию и β-катенин активность в хондроцитах. Это было продемонстрировано путем нокаута HDAC7 у мышей, что затем привело к повышению уровня регулятора клеточного цикла, циклин D3; снижение уровня опухолевого супрессора, стр.21; и повышенный уровень активного бета-катенина. Поскольку каждый из них способствует регулированию пролиферации клеток, делеция HDAC7 увеличивает хондроцит распространение. Это исследование также показало, что передача сигналов через инсулин /Инсулиноподобный фактор роста 1 рецептор привел к увеличению уровней HDAC7 в цитозоле, чем в ядре, и к увеличению уровней активного β-катенина, что указывает на то, что HDAC7 ассоциируется с β-катенином. В течение хондрогенез, HDAC7 перемещается в цитозоль для разложения, указывая на то, что в целом HDAC7 подавляет активность β-катенина в хондроцитах.[9]

Другое исследование подтвердило вывод, что HDAC7 и β-catenin связаны вместе, продемонстрировав, что HDAC7 контролирует рост эндотелиальных клеток посредством модуляции β-catenin. Это было показано противоположным образом по сравнению с предыдущим исследованием, поскольку HDAC7 был сверхэкспрессирован, а не удален. Они обнаружили, что сверхэкспрессия HDAC7 предотвращает ядерную транслокацию β-катенина, которая затем совпадает с подавлением регулятора клеточного цикла, циклин D1. В целом, это исследование продемонстрировало, что HDAC7 снова взаимодействует с β-катенином, чтобы поддерживать эндотелиальные клетки на стадии низкой пролиферации.[10]

HDAC7 не только играет роль в пролиферации роста клеток в хондроцитах и ​​эндотелиальных клетках, но также было продемонстрировано, что HDAC7 является решающим игроком в пролиферации раковых клеток, благодаря исследованию, которое продемонстрировало механистическое понимание вклада HDAC7 в прогрессирование опухоли. . Это исследование показало, что нокдаун HDAC7 приводит к значительному аресту клеток между G (1) и S фазами клеточного цикла. Впоследствии нокдаун HDAC7 подавил c-Мой с экспрессия, которая в свою очередь блокирует развитие клеточного цикла. Через иммунопреципитация хроматина Анализы показали, что HDAC7 напрямую связывается с геном c-Myc и, следовательно, подавление HDAC7 снижает уровни мРНК c-Myc.[11]

Помимо распространения, дополнительное исследование продемонстрировало, что HDAC7 способствует воспалительным ответам у макрофаги. Это было показано сверхэкспрессией HDAC7 в воспалительных макрофагах у мышей. Это чрезмерное выражение способствовало липополисахарид (LPS) -индуцируемая экспрессия HDAC-зависимых генов через HIF-1альфа -зависимый механизм. Это продемонстрировало, что HDAC7 может быть жизнеспособной мишенью для разработки новых противовоспалительных препаратов.[12]

Взаимодействия

HDAC7A показал себя взаимодействовать с участием:

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000061273 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022475 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Маркс П.А., Ричон В.М., Рифкинд Р.А. (август 2000 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: индукторы дифференцировки или апоптоза трансформированных клеток». Журнал Национального института рака. 92 (15): 1210–6. Дои:10.1093 / jnci / 92.15.1210. PMID  10922406.
  6. ^ Као Х.Й., Даунс М., Ордентлич П., Эванс Р.М. (январь 2000 г.). «Выделение новой гистоновой деацетилазы показывает, что деацетилазы класса I и класса II способствуют репрессии, опосредованной SMRT». Гены и развитие. 14 (1): 55–66. Дои:10.1101 / gad.14.1.55 (неактивно 12.10.2020). ЧВК  316336. PMID  10640276.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (ссылка на сайт)
  7. ^ а б «Ген Entrez: гистондеацетилаза 7A HDAC7A».
  8. ^ Шуэц А., Мин Дж., Аллали-Хассани А., Шапира М., Шуен М., Лоппнау П., Мазичек Р., Квятковски Н. П., Льюис Т.А., Маглатин Р.Л., Маклин Т.Х., Бочкарев А., Плотников А.Н., Ведади М., Эроусмит СН (апрель 2008 г.) . «HDAC7 человека несет в себе цинк-связывающий мотив, специфичный для гистондеацетилазы класса IIa, и скрытую деацетилазную активность». Журнал биологической химии. 283 (17): 11355–63. Дои:10.1074 / jbc.M707362200. ЧВК  2431080. PMID  18285338.
  9. ^ Брэдли Э.В., Карпио Л. Р., Олсон Э. Н., Вестендорф Дж. Дж. (Январь 2015 г.). «Гистоновая деацетилаза 7 (Hdac7) подавляет пролиферацию хондроцитов и активность β-катенина во время эндохондральной оссификации». Журнал биологической химии. 290 (1): 118–26. Дои:10.1074 / jbc.M114.596247. ЧВК  4281714. PMID  25389289.
  10. ^ Маргарити А., Зампетаки А., Сяо К., Чжоу Б., Карамарити Е., Мартин Д., Инь Икс, Майр М., Ли Х., Чжан З., Де Фалько Е., Ху И., Кокерилл Г., Сюй К., Цзэн Л. (апрель 2010 г.). «Гистоновая деацетилаза 7 контролирует рост эндотелиальных клеток посредством модуляции бета-катенина». Циркуляционные исследования. 106 (7): 1202–11. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.109.213165. PMID  20224040.
  11. ^ Чжу Ц., Чен Ц., Се З, Ай Дж, Тонг Л., Дин Дж, Гэн М. (март 2011 г.). «Роль гистондеацетилазы 7 (HDAC7) в пролиферации раковых клеток: регуляция c-Myc». Журнал молекулярной медицины. 89 (3): 279–89. Дои:10.1007 / s00109-010-0701-7. PMID  21120446. S2CID  13099326.
  12. ^ Шекспир М.Р., Гогенхаус Д.М., Келли Г.М., Камаль Н.А., Гупта П., Лабзин Л.И., Шредер К., Гарсо В., Барберо С., Айер А., Хьюм Д.А., Рид Р.С., Ирвин К.М., Фэрли Д.П., Sweet MJ (2013). «Гистондеацетилаза 7 способствует Toll-подобному рецептору 4-зависимой экспрессии провоспалительного гена в макрофагах». Журнал биологической химии. 288 (35): 25362–74. Дои:10.1074 / jbc.M113.496281. ЧВК  3757200. PMID  23853092.
  13. ^ Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II напрямую задействуются репрессором транскрипции BCL6» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (24): 22045–52. Дои:10.1074 / jbc.M201736200. PMID  11929873. S2CID  19024903.
  14. ^ Ли Х.Дж., Чун М., Кандрор К.В. (май 2001 г.). «Tip60 и HDAC7 взаимодействуют с рецептором эндотелина а и могут участвовать в передаче сигналов ниже по течению». Журнал биологической химии. 276 (20): 16597–600. Дои:10.1074 / jbc.C000909200. PMID  11262386.
  15. ^ а б Fischle W., Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность гистондеацетилазы HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo». Журнал биологической химии. 276 (38): 35826–35. Дои:10.1074 / jbc.M104935200. PMID  11466315.
  16. ^ Сяо Х, Чанг Дж, Као ХЙ, Ян YC (март 2003 г.). «Tip60 - корепрессор для STAT3». Журнал биологической химии. 278 (13): 11197–204. Дои:10.1074 / jbc.M210816200. PMID  12551922.
  17. ^ Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.