MYB (ген) - Википедия - MYB (gene)
Myb-подобный ДНК-связывающий домен | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Myb_DNA-связывание | ||||||||
Pfam | PF00249 | ||||||||
ИнтерПро | IPR001005 | ||||||||
CATH | 1irz | ||||||||
SCOP2 | 1irz / Объем / СУПФАМ | ||||||||
CDD | cd00167 | ||||||||
|
Myb гены являются частью большого генная семья из факторы транскрипции содержится в животных и растениях. У человека он включает Myb протоонкоген типа 1 и Myb-родственный белок B в добавление к MYB правильный.[5][6] Члены расширенного SANT / Myb семья также включает SANT домен и другие подобные цельнозубые гомеобокс -подобные домены.
Функция
Популярный
Семейство генов Myb названо в честь одноименного гена в Вирус миелобластоза птиц. Вирусный Myb (v-Myb, P01104) распознает последовательность 5'-YAACKГ-3 '. Вызывает миелобластоз (миелоидный лейкоз) у кур.[7] По сравнению с клетками Myb нормального животного (c-myb), v-myb содержит делеции в С-концевом регуляторном домене, что приводит к аберрантной активации других онкогенов.[8]
Животные
Протоонкоген Myb является членом MYB (мойЭлобlastosis) семейство факторы транскрипции. Белок содержит три домена: N-концевой ДНК-связывающий домен, центральный домен активации транскрипции и C-концевой домен, участвующий в транскрипционном подавление. Он может играть роль в регуляции клеточного цикла. Как и вирусная версия, этот ген онкоген, а перестройки гена (часто включающие делецию в C-концевом домене) вызывают рак.[8]
Растения
Факторы MYB представляют собой семейство белков, которые включают консервативный ДНК-связывающий домен MYB. Растения содержат подсемейство белков MYB, которое характеризуется доменом MYB типа R2R3.[9]
В кукурузе флобафены синтезируются путем синтеза флавоноидов[10] от полимеризации флаван-4-олы[11][12] который кодирует R2R3 myb-подобный активатор транскрипции[13] гена A1, кодирующего дигидрофлавонол-4-редуктаза (сокращение дигидрофлавонолы в флаван-4-олы)[14] в то время как другой ген (супрессор пигментации перикарпия 1 или SPP1) действует как подавитель.[15] Ген P кукурузы кодирует гомолог Myb, который распознает последовательность CCWACC, что резко контрастирует с YAACGG, связанным с белками Myb позвоночных.[16]
У сорго соответствующий ген желтого семени 1 (y1)[17] также кодирует белок домена Myb типа R2R3, который регулирует экспрессию халкон-синтаза, халкон-изомераза и дигидрофлавонолредуктаза гены, необходимые для биосинтеза 3-дезоксифлавоноиды.[18]
Рубин является активатором транскрипции MYB генов, производящих антоцианы в цитрусовых. В большинстве сортов цитрусовых рубин не функционирует, но в апельсинах он активирует выработку антоцианов, чтобы дать плодам характерный красный цвет.[19]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118513 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019982 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Чен И, Сюй Х, Лю Дж, Чжан С., Лейтц А., Мо Х (июль 2007 г.). «C-Myb функционирует как нижележащая мишень для PDGF-опосредованного сигнала выживания в гладкомышечных клетках сосудов». Biochem Biophys Res Commun. 360 (2): 433–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.06.078. PMID 17599807.
- ^ «Ген Entrez: гомолог вирусного онкогена миелобластоза v-myb (птичий)».
- ^ Клемпнауэр К. Х., Симондс Г., Эван Г. И., Епископ Дж. М. (июнь 1984 г.). «Субклеточная локализация белков, кодируемых онкогенами вируса птичьего миелобластоза и вируса птичьего лейкоза E26, а также куриным геном c-myb». Клетка. 37 (2): 537–47. Дои:10.1016/0092-8674(84)90384-2. PMID 6327074. S2CID 46196167.
- ^ а б Джордж О.Л., Несс С.А. (октябрь 2014 г.). «Ситуационная осведомленность: регулирование фактора транскрипции myb в дифференцировке, клеточном цикле и онкогенезе». Рак. 6 (4): 2049–71. Дои:10.3390 / раки6042049. ЧВК 4276956. PMID 25279451.
- ^ Stracke R, Werber M, Weisshaar B (октябрь 2001 г.). «Семейство генов R2R3-MYB в Arabidopsis thaliana». Curr. Мнение. Биол растений. 4 (5): 447–56. Дои:10.1016 / с 1369-5266 (00) 00199-0. PMID 11597504.
- ^ Хими Э., Марес Д. Д., Янагисава А., Нода К. (июль 2002 г.). «Влияние гена окраски зерна (R) на состояние покоя зерна и чувствительность эмбриона к абсцизовой кислоте (ABA) в пшенице». J. Exp. Бот. 53 (374): 1569–74. Дои:10.1093 / jxb / erf005. PMID 12096095.
- ^ Винкель-Ширли Б. (июнь 2001 г.). «Биосинтез флавоноидов. Красочная модель для генетики, биохимии, клеточной биологии и биотехнологии». Физиология растений. 126 (2): 485–93. Дои:10.1104 / стр. 126.2.485. ЧВК 1540115. PMID 11402179.
- ^ Chopra S, Cocciolone SM, Bushman S, Sangar V, McMullen MD, Peterson T (март 2003 г.). «Фактор нестабильности кукурузы для апельсина1 является доминантным эпигенетическим модификатором тканевого специфически молчащего аллеля цвета околоплодника1». Генетика. 163 (3): 1135–46. ЧВК 1462483. PMID 12663550.
- ^ Структурный и транскрипционный анализ сложного кластера P1-wr кукурузы. Вольфганг Гёттель, Иоахим Мессинг. XVI конференция по геномам растений и животных В архиве 2012-02-18 в Wayback Machine
- ^ Донг X, Браун Э.Л., Гротевольд Э. (сентябрь 2001 г.). «Функциональная консервация вторичных метаболических ферментов растений, выявленная путем дополнения мутантов флавоноидов Arabidopsis генами кукурузы» (PDF). Физиология растений. 127 (1): 46–57. Дои:10.1104 / стр.127.1.46. ЧВК 117961. PMID 11553733.
- ^ Ли EA, Харпер V (2002). «Супрессор пигментации перикарпия 1 (SPP1), новый ген, участвующий в накоплении флобафена в перикарпиях кукурузы (Zea mays L.)». Майдика. 47 (1): 51–58. ИНИСТ:13772300
- ^ Гротевольд Э, Драммонд Б. Дж., Боуэн Б., Петерсон Т. (1994). «Ген Р, гомологичный myb, контролирует пигментацию флобафена в органах цветков кукурузы, напрямую активируя субнабор гена биосинтеза флавоноидов». Клетка. 76 (3): 543–554. Дои:10.1016/0092-8674(94)90117-1. PMID 8313474. S2CID 42197232.
- ^ Бодду Дж., Свабек С., Ибрагим Ф., Джонс А.Д., Чопра С. (2005). «Характеристика делеционного аллеля желтых семян гена сорго Myb, показывающая потерю 3-дезоксифлавоноидов». Растениеводство. 169 (3): 542–552. Дои:10.1016 / j.plantsci.2005.05.007. ИНИСТ:16983977
- ^ Бодду Дж., Цзян К., Сангар В., Олсон Т., Петерсон Т., Чопра С. (январь 2006 г.). «Сравнительная структурная и функциональная характеристика дупликаций сорго и кукурузы, содержащих ортологичные регуляторы транскрипции myb для биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов». Завод Мол. Биол. 60 (2): 185–99. Дои:10.1007 / s11103-005-3568-1. PMID 16429259. S2CID 23841582.
- ^ Бутелли Э., Личчарделло С., Чжан Ю., Лю Дж., Маккей С., Бейли П., Рефорджато-Рекуперо Дж., Мартин С. (2012). «Ретротранспозоны контролируют специфическое для фруктов, зависимое от холода накопление антоцианов в кровяных апельсинах». Растительная клетка. 24 (3): 1242–55. Дои:10.1105 / tpc.111.095232. ЧВК 3336134. PMID 22427337.
дальнейшее чтение
- О, я, Редди EP (1999). «Семейство генов myb в росте, дифференцировке и апоптозе клеток». Онкоген. 18 (19): 3017–33. Дои:10.1038 / sj.onc.1202839. PMID 10378697.
- Николаидес NC, Гуальди Р., Касадеваль С., Манцелла Л., Калабретта Б. (1991). «Положительная ауторегуляция экспрессии c-myb через сайты связывания Myb в 5'-фланкирующей области гена c-myb человека». Мол. Клетка. Биол. 11 (12): 6166–76. Дои:10.1128 / mcb.11.12.6166. ЧВК 361795. PMID 1944282.
- Калькбреннер Ф, Геманн С., Мёллинг К. (1990). «Активация транскрипции человеческими генами c-myb и v-myb». Онкоген. 5 (5): 657–61. PMID 2189102.
- Вестин Э. Х., Горс К. М., Кларк М. Ф. (1990). «Альтернативный сплайсинг человеческого гена c-myb». Онкоген. 5 (8): 1117–24. PMID 2202948.
- Дасгупта П., Редди EP (1990). «Идентификация альтернативно сплайсированных транскриптов человеческого c-myb: молекулярное клонирование и анализ последовательности последовательностей экзона 9A человеческого c-myb». Онкоген. 4 (12): 1419–23. PMID 2687764.
- Янссен Дж. В., Верноле П., де Бур П. А., Остерхейс Дж. В., Коллард Дж. Г. (1986). «Сублокализация c-myb на 6q21 ---- q23 посредством гибридизации in situ и экспрессии c-myb в тератокарциноме человека с перестройками 6q». Cytogenet. Cell Genet. 41 (3): 129–35. Дои:10.1159/000132217. PMID 3007038.
- Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Press MF, Larson RA, Souza LM (1986). «Исследования человеческого гена c-myb и его продукта при острых лейкозах человека». Наука. 233 (4761): 347–51. Bibcode:1986Sci ... 233..347S. Дои:10.1126 / science.3014652. PMID 3014652.
- Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). «Протоонкоген c-myb человека: нуклеотидная последовательность кДНК и организация геномного локуса». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (24): 9636–40. Дои:10.1073 / пнас.83.24.9636. ЧВК 387195. PMID 3540945.
- Щилик С., Скорски Т., Ку Д.Х., Николаидес Н.С., Вен С.К., Рудницка Л., Бонати А., Малагуарнера Л., Калабретта Б. (1993). «Регулирование пролиферации и экспрессии цитокинов фибробластов костного мозга: роль c-myb». J. Exp. Med. 178 (3): 997–1005. Дои:10.1084 / jem.178.3.997. ЧВК 2191153. PMID 7688794.
- Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). «Связывание ДНК с высоким сродством нативного полноразмерного c-Myb и дифференциальная протеолитическая чувствительность его N- и C-концевых доменов». Онкоген. 10 (11): 2221–8. PMID 7784067.
- Джейкобс С.М., Горс К.М., Вестин Э.Х. (1994). «Идентификация второго промотора в протоонкогене c-myb человека». Онкоген. 9 (1): 227–35. PMID 8302584.
- Фавье Д., Гонда Т.Дж. (1994). «Обнаружение белков, которые связываются с мотивом лейциновой молнии c-Myb». Онкоген. 9 (1): 305–11. PMID 8302594.
- Глейзер Р., Лафуз В.П., Бонно Р.Х., Аткинсон С., Киколт-Глейзер Дж.К. (1993). «Стресс-ассоциированная модуляция экспрессии протоонкогена в лейкоцитах периферической крови человека». Behav. Неврологи. 107 (3): 525–9. Дои:10.1037/0735-7044.107.3.525. PMID 8329139.
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (1996). «Мотив EVES опосредует как межмолекулярную, так и внутримолекулярную регуляцию c-Myb». Genes Dev. 10 (15): 1858–69. Дои:10.1101 / gad.10.15.1858. PMID 8756344.
- Форбрюгген Г., Ловрич Дж., Мёллинг К. (1997). «Функциональный анализ фосфорилирования серина 532 человеческого c-Myb с помощью MAP-киназы». Биол. Chem. 377 (11): 721–30. Дои:10.1515 / bchm3.1996.377.11.721. PMID 8960373.
- Тавнер Ф.Дж., Симпсон Р., Таширо С., Фавье Д., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Дж., Коупленд Н.Г., Макмиллан Э.М., Лютвиче Дж., Кео Р.А., Исии С., Гонда Т.Дж. (1998). «Молекулярное клонирование показывает, что белок p160, связывающий Myb, представляет собой новый, преимущественно ядрышковый белок, который может играть роль в трансактивации Myb». Мол. Клетка. Биол. 18 (2): 989–1002. Дои:10.1128 / MCB.18.2.989. ЧВК 108811. PMID 9447996.
- Хедж С.П., Кумар А., Куршнер С., Шапиро Л.Х. (1998). «c-Maf взаимодействует с c-Myb, чтобы регулировать транскрипцию раннего миелоидного гена во время дифференцировки». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2729–37. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2729. ЧВК 110652. PMID 9566892.
- Леверсон Дж. Д., Коскинен П. Дж., Оррико Ф. К., Райнио Е. М., Ялканен К. Дж., Даш А. Б., Эйзенман Р. Н., Несс С. А. (1998). «Киназа Pim-1 и p100 взаимодействуют для усиления активности c-Myb». Мол. Клетка. 2 (4): 417–25. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80141-0. PMID 9809063.
- Томпсон М.А., Розенталь М.А., Эллис С.Л., Френд А.Дж., Зорбас М.И., Уайтхед Р.Х., Рамзи Р.Г. (1998). «Подавление c-Myb связано с дифференцировкой клеток толстой кишки человека, апоптозом и снижением экспрессии Bcl-2». Рак Res. 58 (22): 5168–75. PMID 9823328.
- Вербеек В., Гомбарт А.Ф., Чумаков А.М., Мюллер С., Фридман А.Д., Кёффлер Х.П. (1999). «C / EBPepsilon напрямую взаимодействует с ДНК-связывающим доменом c-myb и кооперативно активирует транскрипцию миелоидных промоторов». Кровь. 93 (10): 3327–37. Дои:10.1182 / blood.V93.10.3327. PMID 10233885.
внешняя ссылка
- MYB + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- Дрозофила Myb онкогеноподобный - Интерактивная муха
- Arabidospsis thaliana Семейство MYB в базе данных факторов транскрипции арабидопсиса (DATF)
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.