USF1 - USF1

USF1
Белок USF1 PDB 1an4.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUSF1, FCHL, FCHL1, HYPLIP1, MLTF, MLTFI, UEF, bHLHb11, вышестоящий фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторыOMIM: 191523 MGI: 99542 ГомолоГен: 31426 Генные карты: USF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное местоположение для USF1
Геномное местоположение для USF1
Группа1q23.3Начните161,039,251 бп[1]
Конец161,045,977 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_207005
NM_001276373
NM_007122

NM_009480
NM_001305676
NM_001305677
NM_001305678

RefSeq (белок)

NP_001263302
NP_009053
NP_996888

NP_001292605
NP_001292606
NP_001292607
NP_033506

Расположение (UCSC)Chr 1: 161.04 - 161.05 МбChr 1: 171.41 - 171.42 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Верхний стимулирующий фактор 1 это белок что у людей кодируется USF1 ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует член основная спираль-петля-спираль лейциновая молния семья и может функционировать как сотовый фактор транскрипции. Кодируемый белок может активировать транскрипцию через богатый пиримидином инициатор (Inr) элементы и Электронная коробка мотивы. Этот ген был связан с семейная комбинированная гиперлипидемия (FCHL). Два варианта транскрипции, кодирующие разные изоформы были идентифицированы для этого гена.[6]

Исследование на мышах показало, что снижение уровня USF1 увеличивает метаболизм в бурый жир.[7]

Взаимодействия

Было показано, что USF1 (человеческий ген) взаимодействовать с участием USF2,[8][9] FOSL1[10] и GTF2I.[11][12]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158773 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026641 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шие Б.Х., Спаркс Р.С., Гейнор Р.Б., Лусис А.Дж. (апрель 1993 г.). «Локализация ген-кодирующего вышестоящего стимулирующего фактора (USF) на хромосоме человека 1q22-q23». Геномика. 16 (1): 266–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1174. PMID  8486371.
  6. ^ а б «Ген Entrez: передний фактор транскрипции 1 USF1».
  7. ^ Лаурила П.П., Соронен Дж., Коойман С., Форсстрём С., Бун М.Р., Суракка И. и др. (2016). «Дефицит USF1 активирует коричневую жировую ткань и улучшает кардиометаболическое здоровье». Научная трансляционная медицина. 8 (323): 323ra13. Дои:10.1126 / scitranslmed.aad0015. PMID  26819196. S2CID  24737539.
  8. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
  9. ^ Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Генрион А., Кан А., Раймонджан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и трансакционные свойства изоформ вышестоящих стимулирующих факторов». Журнал биологической химии. 271 (3): 1405–15. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1405. PMID  8576131.
  10. ^ Pognonec P, Boulukos KE, Aperlo C, Fujimoto M, Ariga H, Nomoto A, Kato H (май 1997 г.). «Межсемейное взаимодействие между белками bHLHZip USF и bZip Fra1 приводит к подавлению активности AP1». Онкоген. 14 (17): 2091–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1201046. PMID  9160889.
  11. ^ Рой А.Л., Дю Х., Грегор П.Д., Новина С.Д., Мартинес Э., Родер Р.Г. (декабрь 1997 г.). «Клонирование белка, связывающего inr- и E-бокс, TFII-I, который физически и функционально взаимодействует с USF1». Журнал EMBO. 16 (23): 7091–104. Дои:10.1093 / emboj / 16.23.7091. ЧВК  1170311. PMID  9384587.
  12. ^ Рой А.Л., Мейстерернст М., Погнонец П., Родер Р.Г. (ноябрь 1991 г.). «Совместное взаимодействие фактора инициации транскрипции, связывающего инициатор, и активатора спирали-петли-спирали USF». Природа. 354 (6350): 245–8. Bibcode:1991Натура.354..245р. Дои:10.1038 / 354245a0. PMID  1961251. S2CID  4260885.

дальнейшее чтение

внешние ссылки