FOXA1 - FOXA1

FOXA1
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXA1, HNF3A, TCF3A, вилка A1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602294 MGI: 1347472 ГомолоГен: 3307 Генные карты: FOXA1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 14 (человек)
Конец	37,596,059 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	57,546,916 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • специфическое связывание белкового домена; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• микроворсинки; • ядро клетки; • фибриллярный центр; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• Notch сигнальный путь; • морфогенез стромы предстательной железы; • дифференцировка дофаминергических нейронов; • положительная регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена; • ответ на эстрадиол; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • морфогенез легких; • гомеостаз глюкозы; • положительная регуляция сглаженного сигнального пути; • развитие легких; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • спецификация судьбы нейрона; • формирование анатомической структуры, участвующее в морфогенезе; • положительная регуляция митотического клеточного цикла; • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • морфогенез трубки; • дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в развитии ацинуса предстательной железы; • транскрипция, ДНК-шаблон; • регулирование клеточного цикла; • развитие многоклеточного организма; • морфогенез эпителия предстательной железы; • развитие соединительной ткани; • положительная регуляция дифференцировки нейронов; • созревание эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы; • регуляция экспрессии генов; • дифференцировка эпителиальных клеток легких; • формирование паттерна спинной / вентральной нервной трубки; • эпителиально-мезенхимальная передача сигналов, участвующих в развитии предстательной железы; • разветвление эпителиальной трубки, участвующее в морфогенезе легких; • респираторная дифференцировка базальных клеток; • гормональный метаболический процесс; • развитие вторичной альвеолярной перегородки; • отрицательная регуляция перехода эпителия в мезенхиму; • положительная регуляция межклеточной адгезии, опосредованная кадгерином; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • ремоделирование хроматина; • морфогенез анатомической структуры; • положительная регуляция апоптотического процесса; • организация хроматина; • дифференциация клеток;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3169
	15375
	ENSG00000129514
	ENSMUSG00000035451
	P55317
	P35582
	NM_004496
	NM_008259
	NP_004487
	NP_032285
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Форкхед Box Protein A1 (FOXA1), также известный как ядерный фактор гепатоцитов 3-альфа (HNF-3A), является белок что у людей кодируется FOXA1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

FOXA1 является членом вилка класс ДНК-связывающих белков. Эти ядерные факторы гепатоцитов являются активаторами транскрипции для специфичных для печени транскриптов, таких как альбумин и транстиретин, и они также взаимодействуют с хроматин как фактор первопроходца. Подобные члены семейства у мышей играют роль в регуляции метаболизма и дифференцировке поджелудочной железы и печени.^[5]

Маркер рака груди

FOXA1 в рак молочной железы сильно коррелирует с ERα⁺, GATA3⁺, и PR⁺ экспрессия белка а также эндокринная сигнализация. FOXA1 действует как фактор первопроходца для ERa в ERα⁺ рак груди, и его экспрессия может идентифицировать ERα⁺ раковые образования, которые подвергаются быстрому перепрограммированию передачи сигналов ERa, что связано с плохими результатами и резистентностью к лечению.^[8] Наоборот, в ERα⁻ рак молочной железы FOXA1 сильно коррелирует с морфологией низкой степени злокачественности и повышенной выживаемостью без болезней. FOXA1 является последующей целью GATA3 в молочной железе.^[9] Экспрессия в ERα⁻ раковые заболевания могут идентифицировать подмножество опухолей, которые реагируют на другие эндокринные методы лечения, такие как рецептор андрогенов лечение антагонистами.^[10]^[11]

Роль в раке

Мутации в этом гене неоднократно наблюдались при раке простаты.^[12]

Экспрессия FOXA1 коррелирует с двумя маркерами EMT, а именно Twist1 и E-кадгерином при раке груди.^[13]

дальнейшее чтение

Song L, Xu Z, Zhang C и др. (2009). «Повышение регуляции HSP72 с помощью Foxa1 в линии клеток рака груди человека MCF-7». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 386 (1): 30–4. Дои:10.1016 / j.bbrc.2009.05.120. PMID 19486887.
Чжан Ю., Али Т.З., Чжоу Х. и др. (2010). «Связывающий белок 1 ErbB3 подавляет белок 2 переднего градиента гена, способствующий метастазированию, при раке простаты». Рак Res. 70 (1): 240–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2904. ЧВК 3724404. PMID 20048076.
Макмаллин Р.П., Доби А., Баттон Л.Н. и др. (2010). «Усилитель связывания FOXA1 регулирует экспрессию Hoxb13 в предстательной железе». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 107 (1): 98–103. Дои:10.1073 / pnas.0902001107. ЧВК 2806740. PMID 20018680.
Сан Q, Yu X, Degraff DJ, Matusik RJ (2009). «Восходящий стимулирующий фактор 2, новый белок, взаимодействующий с FoxA1, участвует в экспрессии гена, специфичного для простаты». Мол. Эндокринол. 23 (12): 2038–47. Дои:10.1210 / me.2009-0092. ЧВК 2796152. PMID 19846536.
Лю Н, Ню Й, Ван С.Л. и др. (2010). «[Диагностическое и прогностическое значение экспрессии FOXA1 в молекулярных подтипах инвазивной карциномы протоков молочной железы]». Чжунхуа И Сюэ За Чжи. 90 (20): 1403–7. PMID 20646630.
Хайман С.А., Гарсия Р.Р., Хсу С.и др. (2009). «Скрининг и ассоциативное тестирование общих вариантов кодирования генов коактиватора и ко-репрессора рецепторов стероидных гормонов в отношении риска рака груди: многонациональная когорта». BMC Рак. 9: 43. Дои:10.1186/1471-2407-9-43. ЧВК 2637888. PMID 19183483.
Колер С., Чирилло Л.А. (2010). «Стабильное связывание хроматина предотвращает ацетилирование FoxA, сохраняя ремоделирование хроматина FoxA». J. Biol. Chem. 285 (1): 464–72. Дои:10.1074 / jbc.M109.063149. ЧВК 2804194. PMID 19897491.
Малик С., Цзян С., Гари Дж. П. и др. (2010). «Гистон-деацетилаза 7 и FoxA1 в эстроген-опосредованной репрессии RPRM». Мол. Клетка. Биол. 30 (2): 399–412. Дои:10.1128 / MCB.00907-09. ЧВК 2798473. PMID 19917725.
Motallebipour M, Ameur A, Reddy Bysani MS и др. (2009). «Дифференциальное связывание и паттерн совместного связывания FOXA1 и FOXA3 и их связь с H3K4me3 в клетках HepG2, выявленная с помощью ChIP-seq». Геном Биол. 10 (11): R129. Дои:10.1186 / gb-2009-10-11-r129. ЧВК 3091322. PMID 19919681.
Eeckhoute J, Lupien M, Meyer CA и др. (2009). «Селективное ремоделирование хроматина клеточного типа определяет активную подгруппу FOXA1-связанных энхансеров». Genome Res. 19 (3): 372–80. Дои:10.1101 / гр.084582.108. ЧВК 2661808. PMID 19129543.
Накшатри Х, Бадве С (2007). «FOXA1 как терапевтическая мишень при раке груди». Мнение эксперта. Ther. Цели. 11 (4): 507–14. Дои:10.1517/14728222.11.4.507. PMID 17373880.
Якобацци V, Инфантино V, Бисачча Ф. и др. (2009). «Роль FOXA в экспрессии гена митохондриального цитрата-носителя и секреции инсулина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 385 (2): 220–4. Дои:10.1016 / j.bbrc.2009.05.030. PMID 19445897.
Nucera C, Eeckhoute J, Finn S и др. (2009). «FOXA1 - потенциальный онкоген при анапластической карциноме щитовидной железы». Clin. Рак Res. 15 (11): 3680–9. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-08-3155. PMID 19470727.
Накшатри Х, Бадве С (2009). «FOXA1 при раке груди». Эксперт Рев Мол Мед. 11: e8. Дои:10.1017 / S1462399409001008. PMID 19261198.
Песня Y, Вашингтон МК, Кроуфорд ХК (2010). «Потеря FOXA1 / 2 необходима для перехода эпителия в мезенхиму при раке поджелудочной железы». Рак Res. 70 (5): 2115–25. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2979. ЧВК 2831111. PMID 20160041.
Ли HJ, Chattopadhyay S, Yoon WH и др. (2010). «Сверхэкспрессия ядерного фактора гепатоцитов-3альфа вызывает апоптоз за счет активации и накопления цитоплазматического р53 в клетках рака простаты». Предстательная железа. 70 (4): 353–61. Дои:10.1002 / pros.21069. PMID 19866472.
Бернардо Г.М., Лозада К.Л., Мидлер Д.Д. и др. (2010). «FOXA1 является важным детерминантом экспрессии ERalpha и морфогенеза протоков молочной железы». Разработка. 137 (12): 2045–54. Дои:10.1242 / dev.043299. ЧВК 2875844. PMID 20501593.
Альбергария А., Паредес Дж., Суза Б. и др. (2009). «Экспрессия FOXA1 и GATA-3 при раке груди: прогностическое значение в опухолях, отрицательных по рецепторам гормонов». Рак груди Res. 11 (3): R40. Дои:10.1186 / bcr2327. ЧВК 2716509. PMID 19549328.
Хуан Цюй, Ли Г.Х., Кунг А.В. (2009). «Полиморфизм -9247 T / C в вышестоящей регуляторной области SOST, который потенциально влияет на связывание C / EBPalpha и FOXA1, связан с остеопорозом». Кость. 45 (2): 289–94. Дои:10.1016 / j.bone.2009.03.676. PMID 19371798.
Сано М., Аояги К., Такахаши Х. и др. (2010). «Путь транскрипции Forkhead box A1 в плоскоклеточной карциноме пищевода, экспрессирующей KRT7, с обширными метастазами в лимфатические узлы». Int. Дж. Онкол. 36 (2): 321–30. Дои:10.3892 / ijo_00000503. PMID 20043065.

внешняя ссылка

FactorBook FOXA1

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129514 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035451 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б "Entrez Gene: вилка A1".

[pmid8652662-6] Bingle CD, Gowan S (1996). «Молекулярное клонирование фактора транскрипции вилки HNF-3 альфа из линии клеток легочной аденокарциномы человека». Biochim Biophys Acta. 1307 (1): 17–20. Дои:10.1016/0167-4781(96)00058-9. PMID 8652662.

[pmid9119385-7] Минчева А., Лихтер П., Шютц Г., Кестнер К. Х. (1997). «Отнесение человеческих генов ядерного фактора гепатоцитов 3-альфа, -бета и -гамма (HNF3A, HNF3B, HNF3G) к 14q12-q13, 20p11 и 19q13.2-q13.4». Геномика. 39 (3): 417–9. Дои:10.1006 / geno.1996.4477. PMID 9119385.

[8] Росс-Иннес К.С., Старк Р., Тешендорф А.Е., Холмс К.А., Али Х.Р., Даннинг М.Дж., Браун Г.Д., Годжис О., Эллис И.О., Грин А.Р., Али С., Чин С.Ф., Палмиери С., Калдас С., Кэрролл Д.С. (4 января 2012 г. ). «Дифференциальное связывание рецептора эстрогена связано с клиническим исходом рака груди». Природа. 481 (7381): 389–93. Дои:10.1038 / природа10730. ЧВК 3272464. PMID 22217937.

[pmid17129787-9] Курос-Мехр Х., Слорах Э.М., Штернлихт М.Д., Верб Z (декабрь 2006 г.). «GATA-3 поддерживает дифференцировку судьбы люминальных клеток в молочной железе». Клетка. 127 (5): 1041–55. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.048. ЧВК 2646406. PMID 17129787.

[Albergaria_2009-10] Албергария А., Паредес Дж., Соуза Б., Миланези Ф., Карнейро В., Бастос Дж., Коста С., Виейра Д., Лопес Н., Лам Е. В., Лунет Н., Шмитт Ф (2009). «Экспрессия FOXA1 и GATA-3 при раке груди: прогностическое значение в опухолях, отрицательных по рецепторам гормонов». Исследование рака груди. 11 (3): R40. Дои:10.1186 / bcr2327. ЧВК 2716509. PMID 19549328.

[Sanga_2009-11] Санга С., Брум Б.М., Кристини В., Эджертон М.Э. (2009). «Мета-анализ экспрессии генов подтверждает существование апокринного молекулярного рака груди с ролью рецептора андрогенов и предполагает взаимодействие с семейством ErbB». BMC Medical Genomics. 2: 59. Дои:10.1186/1755-8794-2-59. ЧВК 2753593. PMID 19747394.

[Barbieri_2012-12] Барбьери К.Э., Бака С.К., Лоуренс М.С., Демикелис Ф., Блаттнер М., Теуриллат Дж. П., Уайт Т.А., Стоянов П., Ван Аллен Е., Странски Н., Никерсон Е., Чае С.С., Бойсен Дж., Оклер Д., Онофрио Р. К., Парк К., Китабаяси N, Макдональд Т.Ю., Шейх К., Вуонг Т., Гвидуччи К., Цибульскис К., Сиваченко А., Картер С.Л., Саксена Г., Воет Д., Хуссейн В.М., Рамос А.Х., Винклер В., Редман М.С., Ардли К., Тевари А.К., Москера Дж. М., Рупп Н., Вайлд П.Дж., Мох Х., Моррисси С., Нельсон П.С., Кантофф П.В., Габриэль С.Б., Голуб Т.Р., Мейерсон М., Лендер Э.С., Гетц Дж., Рубин М.А., Гарравей Л.А. (июнь 2012 г.). «Секвенирование экзома выявляет повторяющиеся мутации SPOP, FOXA1 и MED12 при раке простаты». Nat. Genet. 44 (6): 685–9. Дои:10,1038 / нг.2279. ЧВК 3673022. PMID 22610119.

[13] Бен-Айед-Герфали, Дорра; Даббеш-Бурича, Эмна; Аяди, Ваджди; Трифа, Фатьма; Charfi, Slim; Хабир, Абдельмаджид; Селлами-Будавара, Тахия; Мокдад-Гаргури, Раджа (2019). «Ассоциация маркеров FOXA1 и EMT (Twist1 и E-cadherin) при раке груди». Отчеты по молекулярной биологии. 46 (3): 3247–3255. Дои:10.1007 / s11033-019-04784-w. ISSN 0301-4851. PMID 30941644.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]