MAFB (ген) - MAFB (gene)

MAFB
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMAFB, KRML, MCTO, фактор транскрипции B MAF bZIP, DURS3
Внешние идентификаторыOMIM: 608968 MGI: 104555 ГомолоГен: 31315 Генные карты: MAFB
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение MAFB
Геномное расположение MAFB
Группа20q12Начните40,685,848 бп[1]
Конец40,689,236 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE MAFB 218559 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005461

NM_010658

RefSeq (белок)

NP_005452

NP_034788

Расположение (UCSC)Chr 20: 40.69 - 40.69 МбChr 2: 160.36 - 160.37 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции MafB также известен как Гомолог B онкогена мышечно-апоневротической фибросаркомы V-maf это белок что у людей кодируется MAFB ген. Этот ген соответствует хромосома 20q 11.2-q13.1, состоит из одного экзона и занимает около 3 т.п.н.[5][6]

Функция

MafB - это базовая лейциновая молния (bZIP ) фактор транскрипции который играет важную роль в регуляции клон-специфичных кроветворение. Закодированный ядерный белок репрессирует ETS1 -опосредованная транскрипция эритроид-специфических генов в миелоидный клетки.[6]

Клиническое значение

Мутации в гене Mafb мыши ответственны за мутантную мышь Kreisler (kr), которая демонстрирует аномальную сегментацию заднего мозга и проявляет гиперактивное поведение, включая подергивание головы и бег по кругу.[7] Эти мыши умирают при рождении из-за почечной недостаточности, тогда как мыши Mafb - / - умирают от центрального апноэ.[8]

Недавно, однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) возле MAFB были обнаружены связанные с несиндромными заячья губа и нёбо. [9] Исследование GENEVA Cleft Consortium, исследование общегеномной ассоциации с участием 1908 троих случайных родителей из Европы, США, Китая, Тайваня, Сингапура, Кореи и Филиппин, впервые выявило связь MAFB с расщелиной губы и / или неба с более сильным общегеномное значение в азиатском, чем европейском населении. Разница в популяциях может отражать переменный охват доступными маркерами или истинную аллельную гетерогенность. [10] В моделях мышей мРНК и белок Mafb были обнаружены в черепно-лицевых эктодерма и мезодерма, происходящая из нервного гребня, между 13,5 и 14,5 днями эмбриона; экспрессия была сильной в эпителии вокруг небных полок и в эпителии медиального края во время слияния неба. После слияния экспрессия Mafb была сильнее в эпителии полости рта по сравнению с мезенхимальной тканью.[9] Кроме того, анализ секвенирования обнаружил новый миссенс-мутация в филиппинской популяции, H131Q, это было значительно чаще в случаях, чем в подобранной контрольной группе.[9] Бедные по генам области по обе стороны от гена MAFB включают многочисленные сайты связывания для факторов транскрипции, которые, как известно, играют роль в развитии неба. [11]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000204103 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074622 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван П. У., Эйзенбарт Дж. Д., Кордес С. П., Барш Г. С., Стоффель М., Ле Бо М. М. (август 1999 г.). «Человеческий KRML (MAFB): клонирование кДНК, геномная структура и оценка в качестве гена-кандидата опухолевого супрессора при миелоидных лейкозах». Геномика. 59 (3): 275–81. Дои:10.1006 / geno.1999.5884. PMID  10444328.
  6. ^ а б "Ген Entrez: MAFB v-maf мышечно-апоневротический гомолог B онкогена фибросаркомы (птичий)".
  7. ^ Кордес С.П., Барш Г.С. (декабрь 1994 г.). «Ген сегментации мыши kr кодирует новый фактор транскрипции основного домена - лейциновой молнии». Ячейка. 79 (6): 1025–34. Дои:10.1016/0092-8674(94)90033-7. PMID  8001130. S2CID  19938958.
  8. ^ Artner I, Blanchi B, Raum JC, Guo M, Kaneko T., Cordes S, Sieweke M, Stein R (март 2007 г.). «MafB необходим для созревания островковых бета-клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (10): 3853–8. Bibcode:2007ПНАС..104.3853А. Дои:10.1073 / pnas.0700013104. ЧВК  1803762. PMID  17360442.
  9. ^ а б c Beaty TH, Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I, Hetmanski JB, Liang KY, Wu T, Murray T., Fallin MD, Redett RA, Raymond G, Schwender H, Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M, Mansilla MA , Leslie E, Bullard S, Lidral AC, Moreno LM, Menezes R, Vieira AR, Petrin A, Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H, Ye X, Huang S, Yeow V , Chong SS, Jee SH, Shi B, Christensen K, Melbye M, Doheny KF, Pugh EW, Ling H, Castilla EE, Cheizel AE, Ma L, Field LL, Brody L, Pangilinan F, Mills JL, Molloy AM, Kirke ПН, Скотт Дж. М., Скотт Дж. М., Аркос-Бургос М., Скотт А.Ф. (июнь 2010 г.). «Полногеномное исследование ассоциации заячьей губы с волчьей пастью и без нее выявляет варианты риска рядом с MAFB и ABCA4». Природа Генетика. 42 (6): 525–9. Дои:10,1038 / нг.580. ЧВК  2941216. PMID  20436469.
  10. ^ Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC. 2011. Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний. Природа Обзоры Генетика. 12: 167-178
  11. ^ Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC. 2011. Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний. Природа Обзоры Генетика. 12: 167-178

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.