ILF3 - Википедия - ILF3

ILF3
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыILF3, CBTF, DRBF, DRBP76, MMP4, MPHOSPH4, MPP4, NF-AT-90, NF110, NF110b, NF90, NF90a, NF90b, NFAR, NFAR-1, NFAR2, TCP110, TCP80, фактор связывания интерлейкина 10 3, MPPAR4110 , NFAR-2, NF90c, NFAR90, NF90ctv
Внешние идентификаторыOMIM: 603182 MGI: 1339973 ГомолоГен: 7785 Генные карты: ILF3
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Genomic location for ILF3
Genomic location for ILF3
Группа19p13.2Начинать10,654,261 бп[1]
Конец10,692,417 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ILF3 217805 at fs.png

PBB GE ILF3 211375 s at fs.png

PBB GE ILF3 208930 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3609

16201

Ансамбль

ENSG00000129351

ENSMUSG00000032178

UniProt

Q12906

Q9Z1X4

RefSeq (мРНК)

NM_001137673
NM_004516
NM_012218
NM_017620
NM_153464

RefSeq (белок)

NP_001131145
NP_004507
NP_036350
NP_060090
NP_703194

Расположение (UCSC)Chr 19: 10.65 - 10.69 МбChr 9: 21.37 - 21.41 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор связывания энхансера интерлейкина 3 это белок что у людей кодируется ILF3 ген.[5][6]

Функция

Ядерный фактор активированных Т-клеток (NFAT) - это фактор транскрипции, необходимый для экспрессии интерлейкина 2 Т-клетками. NFAT связывается с последовательностью в энхансере IL2, известной как элемент 2 ответа антигенного рецептора. Кроме того, NFAT может связывать РНК и является важным компонентом для инкапсуляция и белковое праймирование вирусной полимеразы гепатита В. NFAT представляет собой гетеродимер белков 45 кДа и 90 кДа, больший из которых является продуктом этого гена. Кодируемый белок, который преимущественно локализован в рибосомах, вероятно, регулирует транскрипцию на уровне элонгации мРНК. Для этого гена были обнаружены по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие три разные изоформы.[7]

Взаимодействия

Было показано, что ILF3 взаимодействовать с:

Небольшие РНК, ассоциированные с NF90 / ILF3 (snaR) (длиной ~ 120 нуклеотидов), как известно, взаимодействуют с двухцепочечными РНК-связывающими мотивами ILF3.[17] snaR-A в изобилии присутствует в семенниках человека и, как было показано, связывается с рибосомами в клетках HeLa. snaR-A присутствует у человека и гориллы, но не у шимпанзе. Другие snaR РНК обнаружены у африканских человекообразных обезьян (включая шимпанзе и бонобо).[18]

ILF2 и ILF3 были идентифицированы как аутоантигены у мышей с индуцированной волчанкой,[19][20] при системном ревматическом аутоиммунном заболевании собак,[21] и как редкая находка у людей с аутоиммунным заболеванием.[22]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129351 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032178 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Као П.Н., Чен Л., Брок Дж., Нг Дж., Кенни Дж., Смит А.Дж., Кортизи Б. (август 1994 г.). «Клонирование и экспрессия чувствительного к циклоспорину A и FK506 ядерного фактора активированных Т-клеток: NF45 и NF90». Журнал биологической химии. 269 (32): 20691–9. PMID  7519613.
  6. ^ Мацумото-Таниура Н., Пиролле Ф., Монро Р., Джерас Л., Вестендорф Дж. М. (сентябрь 1996 г.). «Идентификация новых фосфопротеинов M фазы путем клонирования экспрессии». Молекулярная биология клетки. 7 (9): 1455–69. Дои:10.1091 / mbc.7.9.1455. ЧВК  275994. PMID  8885239.
  7. ^ «Ген Entrez: фактор связывания усилителя интерлейкина ILF3, 90 кДа».
  8. ^ Тинг Н.С., Као П.Н., Чан Д.В., Линтотт Л.Г., Лис-Миллер С.П. (январь 1998 г.). «ДНК-зависимая протеинкиназа взаимодействует с белками, связывающими антигенный рецепторный элемент ответа NF90 и NF45». Журнал биологической химии. 273 (4): 2136–45. CiteSeerX  10.1.1.615.1747. Дои:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID  9442054. S2CID  8781571.
  9. ^ а б Сондерс Л. Р., Перкинс Д. Д., Балачандран С., Майклс Р., Форд Р., Майеда А., Барбер Г. Н. (август 2001 г.). «Характеристика двух эволюционно консервативных, альтернативно сплайсированных ядерных фосфопротеинов, NFAR-1 и -2, которые участвуют в процессинге мРНК и взаимодействуют с двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназой, PKR». Журнал биологической химии. 276 (34): 32300–12. Дои:10.1074 / jbc.M104207200. PMID  11438536.
  10. ^ Тан Дж, Као П.Н., Хершман HR (июнь 2000 г.). «Протеин-аргининметилтрансфераза I, преобладающая протеин-аргининметилтрансфераза в клетках, взаимодействует и регулируется фактором связывания интерлейкина-усилителя 3». Журнал биологической химии. 275 (26): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.M000023200. PMID  10749851.
  11. ^ Ли Дж., Бедфорд MT (март 2002 г.). «PABP1, идентифицированный как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием массивов белков высокой плотности». Отчеты EMBO. 3 (3): 268–73. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf052. ЧВК  1084016. PMID  11850402.
  12. ^ Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (май 1999 г.). «Ядерный фактор-90 активированных Т-клеток: двухцепочечный РНК-связывающий белок и субстрат для двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы, PKR». Биохимия. 38 (19): 6361–8. Дои:10.1021 / bi982410u. PMID  10320367.
  13. ^ Паркер Л.М., Фиерро-Монти I, Мэтьюз М.Б. (август 2001 г.). «Ядерный фактор 90 является субстратом и регулятором киназы эукариотического фактора инициации 2, двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы». Журнал биологической химии. 276 (35): 32522–30. Дои:10.1074 / jbc.M104408200. PMID  11438540.
  14. ^ Patel RC, Vestal DJ, Xu Z, Bandyopadhyay S, Guo W, Erme SM, Williams BR, Sen GC (июль 1999 г.). «DRBP76, двухцепочечный РНК-связывающий ядерный белок, фосфорилируется индуцированной интерфероном протеинкиназой, PKR». Журнал биологической химии. 274 (29): 20432–7. Дои:10.1074 / jbc.274.29.20432. PMID  10400669.
  15. ^ Brownawell AM, Macara IG (январь 2002 г.). «Экспортин-5, новый кариоферин, опосредует ядерный экспорт двухцепочечных РНК-связывающих белков». Журнал клеточной биологии. 156 (1): 53–64. Дои:10.1083 / jcb.200110082. ЧВК  2173575. PMID  11777942.
  16. ^ Чу Л., Су М.И., Магги Л. Б., Лу Л., Маллинс С., Кросби С., Хуанг Дж., Чнг В. Дж., Видж Р., Томассон М. Х. (август 2012 г.). «Хромосомная транслокация, связанная с множественной миеломой, активирует орфанную snoRNA ACA11 для подавления окислительного стресса». Журнал клинических исследований. 122 (8): 2793–806. Дои:10.1172 / jci63051. ЧВК  3408744. PMID  22751105.
  17. ^ Пэрротт AM, Мэтьюз МБ (2007). «Новые быстро эволюционирующие гоминидные РНК связывают ядерный фактор 90 и обнаруживают ограниченное тканевое распределение». Исследования нуклеиновых кислот. 35 (18): 6249–58. Дои:10.1093 / нар / гкм668. ЧВК  2094060. PMID  17855395.
  18. ^ Пэрротт AM, Цай М., Батчу П., Райан К., Озер Х.Л., Тиан Б., Мэтьюз МБ (март 2011 г.). «Эволюция и экспрессия семейства малых некодирующих РНК snaR». Исследования нуклеиновых кислот. 39 (4): 1485–500. Дои:10.1093 / nar / gkq856. ЧВК  3045588. PMID  20935053.
  19. ^ Сато М., Шахин В.М., Као П.Н., Окано Т., Шоу М., Йошида Х., Ричардс Х.Б., Ривз WH (декабрь 1999 г.). «Аутоантитела определяют семейство белков с консервативными двухцепочечными РНК-связывающими доменами, а также ДНК-связывающей активностью». Журнал биологической химии. 274 (49): 34598–604. Дои:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID  10574923.
  20. ^ Курода Ю., Оно Н., Акаоги Дж., Насионалес, округ Колумбия, Ямасаки Ю., Баркер Т. Т., Ривз В. Н., Сато М. (февраль 2006 г.). «Индукция специфических аутоантител, связанных с волчанкой, путем неспецифического воспаления, вызванного внутрибрюшинной инъекцией н-гексадекана мышам BALB / c». Токсикология. 218 (2–3): 186–96. Дои:10.1016 / j.tox.2005.10.011. PMID  16309812.
  21. ^ Bremer HD, Landegren N, Sjöberg R, Hallgren Å, Renneker S, Lattwein E, Leonard D, Eloranta ML, Rönnblom L, Nordmark G, Nilsson P, Andersson G, Lilliehöök I, Lindblad-Toh K, Kämpe O, Hansson-Hamlin H (март 2018 г.). «ILF2 и ILF3 являются аутоантигенами при системном аутоиммунном заболевании собак». Научные отчеты. 8 (1): 4852. Bibcode:2018НатСР ... 8.4852B. Дои:10.1038 / с41598-018-23034-в. ЧВК  5859008. PMID  29556082.
  22. ^ Сато М., Шахин В.М., Као П.Н., Окано Т., Шоу М., Йошида Х., Ричардс Х.Б., Ривз WH (декабрь 1999 г.). «Аутоантитела определяют семейство белков с консервативными двухцепочечными РНК-связывающими доменами, а также ДНК-связывающей активностью». Журнал биологической химии. 274 (49): 34598–604. Дои:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID  10574923.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.