ZNF330 - ZNF330

ZNF330

Идентификаторы

Псевдонимы

ZNF330, HSA6591, NOA36, белок цинковых пальцев 330

Внешние идентификаторы

OMIM: 609550 MGI: 1353574 ГомолоГен: 8714 Генные карты: ZNF330

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 4 (человек)^[1]

Группа	4q31.21	Начинать	141,220,887 бп^[1]
Группа	4q31.21	Конец	141,234,697 бп^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 8 (мышь)^[2]

Группа	8 \| 8 C2	Начинать	82,763,607 бп^[2]
Группа	8 \| 8 C2	Конец	82,774,160 бп^[2]

Экспрессия РНК шаблон

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками
Сотовый компонент	• хромосома • ядро клетки • хромосома, центромерная область • ядрышко • середина тела
Биологический процесс	• биологический процесс
Источники:Амиго / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь


27309


30932

Ансамбль


ENSG00000109445


ENSMUSG00000031711


Q9Y3S2


Q922H9

RefSeq (мРНК)


NM_001292002 NM_014487


NM_145600

RefSeq (белок)


NP_001278931 NP_055302


NP_663575 NP_001355272 NP_001355273 NP_001355274 NP_001355275

Расположение (UCSC)

Chr 4: 141.22 - 141.23 Мб

Chr 8: 82,76 - 82,77 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Цинк палец протеин 330 это белок что у людей кодируется ZNF330 ген.^[5]^[6]^[7]

Рекомендации

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109445 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031711 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Боливар Дж., Гарсия-Козар Ф. Дж., Астола А., Иглесиас С., Пендон С., Вальдивия М. М. (август 2001 г.). «Геномная структура и расположение хромосом человеческого гена, кодирующего аутоантиген цинкового пальца ZNF330». Cytogenet Cell Genet. 93 (3–4): 234–238. Дои:10.1159/000056989. PMID 11528117. S2CID 8487708.
^ Боливар Дж., Диас I, Иглесиас К., Вальдивия М.М. (январь 2000 г.). «Молекулярное клонирование аутоантигена цинкового пальца, временно связанного с межфазным ядрышком и митотическими центромерами и средними телами. Ортологические белки с девятью мотивами CXXC, высоко консервативными от нематод к человеку». J Biol Chem. 274 (51): 36456–36464. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36456. PMID 10593942.
^ "Entrez Gene: ZNF330, цинковый палец, белок 330".

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–1323. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК 442147. PMID 15231747.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.

внешняя ссылка

ZNF330 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Факторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы

(1) Базовые домены

(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP )

Активирующий фактор транскрипции
- AATF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
АП-1
БАХ
- 1
- 2
BATF
BLZF1
C / EBP
- α
- β
- γ
- δ
- ε
- ζ
CREB
- 1
- 3
- L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
- B
- F
- грамм
- K
NFE
- 2
- L1
- L2
- L3
NFIL3
NRL
NRF
- 1
- 2
- 3
XBP1

(1.2) Базовая спираль-петля-спираль (bHLH )

bHLH-PAS	AhR ARNTL ARNTL ARNTL2 ЧАСЫ HIF 1А EPAS1 3А NPAS 1 2 3 SIM 1 2
ATOH1 AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 FIGLA РУКА 1 2 HES 1 2 3 4 5 6 7 ПРИВЕТ 1 2 L Я БЫ 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL1 MYCN Миогенные регуляторные факторы MyoD Миогенин MYF5 MYF6 Нейрогенины 1 2 3 NeuroD 1 2 ОЛИГ 1 2 Pho4 Склераксис TAL 1 2 Крутить

(1.3) bHLH-ZIP

(1.4) НФ-1

NFI
- А
- B
- C
- Икс
SMAD
- R-SMAD
  - 1
  - 2
  - 3
  - 5
  - 9
- I-SMAD
  - 6
  - 7
- 4 )

(1.5) RF-X

RFX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- АНК

(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)

АП-2
- α
- β
- γ
- δ
- ε

(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены

(2.1) Ядерный рецептор (Cys₄)

подсемейство 1	Гормон щитовидной железы α β МАШИНА FXR LXR α β PPAR α β / δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
подсемейство 2	КУП-ТФ (я II Ухо-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Рецептор яичка 2 4 TLX
подсемейство 3	Стероидный гормон Андроген Эстроген α β Глюкокортикоид Минералокортикоид Прогестерон Связанный с эстрогеном α β γ
подсемейство 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
подсемейство 5	LRH-1 SF1
подсемейство 6	GCNF
подсемейство 0	DAX1 SHP

(2.2) Другой Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂Его₂

Общие факторы транскрипции
- TFIIA
- TFIIB
- TFIID
- TFIIE
  - 1
  - 2
- ТФИИФ
- 1
- 2
  - TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3А
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 6
- 11А
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI-Krüppel семья
- 1
- 2
- 3
- ОТДЫХ
- S1
- S2
- YY1
ИК
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7А
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинковый палец
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655
- 804A

(2.4) Cys₆

HIVEP1

(2.5) Чередующийся состав

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 4
ДЖАРИД
- 1А
- 1B
- 1С
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Спираль-поворот-спираль домены

(3.1) Homeodomain

protoHOX	ParaHox GSX 1 2 Xlox PDX1 Cdx 1 2 4 расширенный Hox: Evx1 Evx2 MEOX1 MEOX2 Homeobox A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 Би 2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 GBX1 GBX2 MNX1
metaHOX	BARHL1 BARHL2 BARX1 BARX2 BSX DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 HHEX HLX LBX1 LBX2 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 HMX1 HMX2 HMX3 6-1 6-2 НАТО TLX1 TLX2 TLX3 VAX1 VAX2
Другой	ARX CRX CUTL1 FHL 1 2 3 HESX1 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1А 1B NOBOX СКАЗКА Я ЕСТЬ 1 2 АТС 1 2 3 PKNOX 1 2 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21А PHOX 2А 2B PITX 1 2 3 POU домен PIT-1 БРН-3: А B C Фактор транскрипции октамера: 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 SATB2 SHOX2 ШЕСТЬ 1 2 3 4 5 ZEB 1 2

(3.2) Парная коробка

PAX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
PRRX
- 1
- 2
RAX

(3.3) Головка вилки / крылатая спираль

E2F
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
FOX белки
- A1
- A2
- A3
- C1
- C2
- D3
- D4
- E1
- E3
- F1
- G1
- H1
- I1
- J1
- J2
- K1
- K2
- L2
- M1
- N1
- N3
- O1
- O3
- O4
- P1
- P2
- P3
- P4

(3.4) Факторы теплового шока

HSF
- 1
- 2
- 4

(3.5) Кластеры триптофана

ELF
- 2
- 4
- 5
EGF
ELK
- 1
- 3
- 4
ERF
ETS
- 1
- 2
- ЭРГ
- СПИБ
ETV
- 1
- 4
- 5
- 6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
MYB
MYBL2

(3.6) TEA домен

фактор усиления транскрипции
- 1
- 2
- 3
- 4

(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок

(4.1) Rel область гомологии	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL РЕЛА RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) СТАТ	СТАТ 1 2 3 4 5 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) Коробка MADS	Mef2 А B C D SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки	TBP TBPL1
(4.7) Группа высокой мобильности	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1А 1B SOX 1 2 3 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14 15 18 21 SRY SSRP1 TCF / LEF TCF 1 3 4 LEF1 ТОКС 1 2 3 4
(4.9) Зернистая голова	TFCP2
(4.10) Область холодного удара	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Другие факторы транскрипции

(0.2) HMGI (Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Карманный домен	Руб. RBL1 RBL2
(0.5) АП-2/EREBP-связанные факторы	Апетала 2 EREBP B3
(0.6) Разное	ARID 1А 1B 2 3А 3B 4А КОЛПАЧОК ЕСЛИ Я 16 35 MLL 2 3 Т1 MNDA NFY А B C Ро /Сигма

смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора

Эта статья о ген на хромосома человека 4 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.