ГАБПА - GABPA

ГАБПА
Белок GABPA PDB 1awc.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыГАБПА, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, субъединица фактора транскрипции GA связывающего белка, субъединица фактора транскрипции GA связывающего белка
Внешние идентификаторыOMIM: 600609 MGI: 95610 ГомолоГен: 1543 Генные карты: ГАБПА
Расположение гена (человек)
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека)[1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение GABPA
Геномное расположение GABPA
Группа21q21.3Начинать25,734,570 бп[1]
Конец25,772,460 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GABPA 210188 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001197297
NM_002040

NM_008065

RefSeq (белок)

NP_001184226
NP_002031
NP_002031.2

NP_032091

Расположение (UCSC)Chr 21: 25.73 - 25.77 МбChr 16: 84,83 - 84,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Альфа-цепь GA-связывающего белка это белок что у людей кодируется ГАБПА ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует одну из трех субъединиц фактора транскрипции GA-связывающего белка, которая функционирует как ДНК-связывающая субъединица. Поскольку эта субъединица идентична субъединице, кодирующей ген ядерного респираторного фактора 2, она, вероятно, участвует в активации экспрессии цитохромоксидазы и ядерном контроле митохондриальной функции. Эта субъединица также идентична субъединице, составляющей фактор транскрипции E4TF1, ответственный за экспрессию гена аденовируса E4. Из-за своей хромосомной локализации и способности образовывать гетеродимеры с другими полипептидами этот ген может играть роль в фенотипе синдрома Дауна.[6]

Взаимодействия

GABPA было показано взаимодействовать с Фактор клетки-хозяина C1,[7] Фактор транскрипции Sp1[8] и Фактор транскрипции Sp3.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154727 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000008976 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ватанабэ Х., Савада Дж., Яно К., Ямагути К., Гото М., Ханда Х. (март 1993 г.). «Клонирование кДНК субъединиц фактора транскрипции E4TF1 с Ets и мотивами notch». Молекулярная и клеточная биология. 13 (3): 1385–91. Дои:10.1128 / MCB.13.3.1385. ЧВК  359448. PMID  8441384.
  6. ^ «Ген Entrez: фактор транскрипции GABPA GA, альфа-субъединица 60 кДа».
  7. ^ Vogel JL, Kristie TM (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции GABP». Журнал EMBO. 19 (4): 683–90. Дои:10.1093 / emboj / 19.4.683. ЧВК  305606. PMID  10675337.
  8. ^ а б Galvagni F, Capo S, Oliviero S (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора атрофина» (PDF). Журнал молекулярной биологии. 306 (5): 985–96. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4335. HDL:2318/141203. PMID  11237613.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка