SOX5 - SOX5

SOX5
Идентификаторы
Псевдонимы	SOX5, L-L-SOX5B, L-SOX5F, LAMSHF, SRY-box 5, фактор транскрипции SRY-box 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 604975 MGI: 98367 ГомолоГен: 21378 Генные карты: SOX5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	24,562,544 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	144,781,977 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки;
Биологический процесс	• клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция развития хряща; • положительная регуляция дифференцировки хондроцитов; • положительная регуляция дифференцировки мезенхимальных стволовых клеток; • транскрипция, ДНК-шаблон; • асимметричное деление нейробластов; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • обязательство клеточной судьбы; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6660
	20678
	ENSG00000134532
	ENSMUSG00000041540
	P35711
	P35710
NM_001261414; NM_001261415; NM_006940; NM_152989; NM_178010;
	NM_001330785
	NM_001113559; NM_001243163; NM_011444; NM_001347506
NP_001248343; NP_001248344; NP_001317714; NP_008871; NP_694534;
	NP_821078
	NP_001107031; NP_001230092; NP_001334435; NP_035574
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции SOX-5 это белок что у людей кодируется SOX5 ген.^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов SOX (SRY-related HMG-box), участвующих в регуляции эмбрионального развития и в определении судьбы клетки. Кодируемый белок может действовать как регулятор транскрипции после образования белкового комплекса с другими белками. Кодируемый белок может играть роль в хондрогенезе. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 8. Для этого гена было идентифицировано множество вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы.^[6]

Смотрите также

SOX гены

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134532 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041540 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Вундерл В.М., Кричер Р., Эшворт А., Гудфеллоу П.Н. (сентябрь 1996 г.). «Клонирование и характеристика SOX5, нового члена семейства генов SOX человека». Геномика. 36 (2): 354–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0474. PMID 8812465.
^ ^а ^б "Entrez Gene: SOX5 SRY (область определения пола Y) -box 5".

дальнейшее чтение

Камачи Ю., Утикава М., Кондо Х. (апрель 2000 г.). «Объединение SOX: с партнерами в регуляции эмбрионального развития». Тенденции в генетике. 16 (4): 182–7. Дои:10.1016 / S0168-9525 (99) 01955-1. PMID 10729834.
Bowles J, Schepers G, Koopman P (ноябрь 2000 г.). «Филогения семейства SOX факторов транскрипции развития на основе последовательностей и структурных индикаторов». Биология развития. 227 (2): 239–55. Дои:10.1006 / dbio.2000.9883. PMID 11071752.
Уилсон М., Купман П. (август 2002 г.). «Соответствие SOX: белки-партнеры и кофакторы семейства SOX регуляторов транскрипции». Текущее мнение в области генетики и развития. 12 (4): 441–6. Дои:10.1016 / S0959-437X (02) 00323-4. PMID 12100890.
Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (август 2002 г.). «Двадцать пар sox: степень, гомология и номенклатура семейств генов фактора транскрипции sox мыши и человека». Клетка развития. 3 (2): 167–70. Дои:10.1016 / S1534-5807 (02) 00223-X. PMID 12194848.
Денни П., Свифт С., Бренд N, Дабхад Н., Бартон П., Эшворт А. (июнь 1992 г.). «Консервативное семейство генов, связанных с геном, определяющим яички, SRY». Исследования нуклеиновых кислот. 20 (11): 2887. Дои:10.1093 / nar / 20.11.2887. ЧВК 336939. PMID 1614875.
Коннор Ф., Кэри П.Д., Рид К.М., Престон Н.С., Дрисколл П.С., Денни П., Крейн-Робинсон С., Эшворт А. (август 1994 г.). «Связывание ДНК и свойства изгиба пост-мейотически экспрессируемого Sry-родственного белка Sox-5». Исследования нуклеиновых кислот. 22 (16): 3339–46. Дои:10.1093 / nar / 22.16.3339. ЧВК 523727. PMID 8078769.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Лефевр В., Ли П., де Кромбрюгге Б. (октябрь 1998 г.). «Новая длинная форма Sox5 (L-Sox5), Sox6 и Sox9 коэкспрессируются в хондрогенезе и совместно активируют ген коллагена типа II». Журнал EMBO. 17 (19): 5718–33. Дои:10.1093 / emboj / 17.19.5718. ЧВК 1170900. PMID 9755172.
Ууситало Х., Хилтунен А., Ахонен М., Гао Т.Дж., Лефевр В., Харлей В., Кяхари В.М., Вуорио Э. (октябрь 2001 г.). «Ускоренная активация L-Sox5, Sox6 и Sox9 посредством переноса гена BMP-2 во время заживления перелома мыши». Журнал исследований костей и минералов. 16 (10): 1837–45. Дои:10.1359 / jbmr.2001.16.10.1837. PMID 11585348. S2CID 42947355.
Зафарана Дж., Гиллис А.Дж., ван Гурп Р.Дж., Олссон П.Г., Элстродт Ф., Ступ Х., Миллан Дж. Л., Остерхейс Дж. В., Лойенга Л. Х. (март 2002 г.) «Коамплификация DAD-R, SOX5 и EKI1 в семиномах яичка человека со специфической сверхэкспрессией DAD-R коррелирует со снижением уровней апоптоза и более ранними клиническими проявлениями». Исследования рака. 62 (6): 1822–31. PMID 11912161.
Икеда Т., Чжан Дж., Чано Т., Мабучи А., Фукуда А., Кавагути Н., Накамура К., Икегава С. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация и характеристика длинной формы гена Sox5 (L-SOX5) человека». Ген. 298 (1): 59–68. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00927-7. PMID 12406576.

Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134532 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041540 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8812465-5] Вундерл В.М., Кричер Р., Эшворт А., Гудфеллоу П.Н. (сентябрь 1996 г.). «Клонирование и характеристика SOX5, нового члена семейства генов SOX человека». Геномика. 36 (2): 354–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0474. PMID 8812465.

[entrez-6] а ^б "Entrez Gene: SOX5 SRY (область определения пола Y) -box 5".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]