Фактор NKX-гомеодомена - NKX-homeodomain factor

Факторы NKX-гомеодомена семья гомеодомен факторы транскрипции которые являются важными регуляторами органов развитие.^[1]

Гены человека, кодирующие факторы гомеодомена NKX, включают:

использованная литература

^ Stanfel MN, Moses KA, Schwartz RJ, Zimmer WE (2005). «Регуляция развития органов факторами NKX-гомеодомена: код NKX». Cell. Мол. Биол. (Шумный-ле-гран). Приложение 51: OL785–99. PMID 16405855.

Факторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы

(1) Базовые домены

(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP )

Активирующий фактор транскрипции
- AATF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
АП-1
БАХ
- 1
- 2
BATF
BLZF1
C / EBP
- α
- β
- γ
- δ
- ε
- ζ
CREB
- 1
- 3
- L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
- B
- F
- г
- K
NFE
- 2
- L1
- L2
- L3
NFIL3
NRL
NRF
- 1
- 2
- 3
XBP1

(1.2) Основная спираль-петля-спираль (bHLH )

Группа А	ASC ASCL1 ASCL2 ATOH1 РУКА 1 2 MESP2 Миогенные регуляторные факторы MyoD Миогенин MYF5 MYF6 NeuroD 1 2 Нейрогенины 1 2 3 ОЛИГ 1 2 Paraxis TCF15 Склераксис SLC LYL1 TAL 1 2 Твист
Группа B	FIGLA Мой с c-Myc l-Myc n-Myc MXD4 TCF4
Группа C bHLH-PAS	AhR AHRR ARNT ARNTL ARNTL2 ЧАСЫ HIF 1А EPAS1 3А NPAS 1 2 3 SIM 1 2
Группа D	BHLH 2 3 9 Pho4 МНЕ БЫ 1 2 3 4
Группа E	HES 1 2 3 4 5 6 7 ПРИВЕТ 1 2 L
Группа F bHLH-COE	EBF1

(1.3) bHLH-ZIP

(1.4) НФ-1

NFI
- А
- B
- C
- Икс
SMAD
- R-SMAD
  - 1
  - 2
  - 3
  - 5
  - 9
- I-SMAD
  - 6
  - 7
- 4 )

(1.5) RF-X

RFX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- АНК

(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)

АП-2
- α
- β
- γ
- δ
- ε

(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены

(2.1) Ядерный рецептор (Cys₄)

подсемейство 1	Гормон щитовидной железы α β МАШИНА FXR LXR α β PPAR α β / δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
подсемейство 2	КУП-ТФ (я II Ухо-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Рецептор яичка 2 4 TLX
подсемейство 3	Стероидный гормон Андроген Эстроген α β Глюкокортикоид Минералокортикоид Прогестерон Связанный с эстрогеном α β γ
подсемейство 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
подсемейство 5	LRH-1 SF1
подсемейство 6	GCNF
подсемейство 0	DAX1 SHP

(2.2) Другой Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂Его₂

Общие факторы транскрипции
- TFIIA
- TFIIB
- TFIID
- TFIIE
  - 1
  - 2
- ТФИИФ
- 1
- 2
  - TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3А
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 6
- 11А
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI-Krüppel семья
- 1
- 2
- 3
- ОСТАЛЬНЫЕ
- S1
- S2
- YY1
ИК
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7А
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинковый палец
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655
- 804A

(2.4) Cys₆

HIVEP1

(2.5) Чередующийся состав

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 4
ДЖАРИД
- 1А
- 1B
- 1С
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Спираль-поворот-спираль домены

(3.1) Homeodomain

protoHOX	ParaHox GSX 1 2 Xlox PDX1 Cdx 1 2 4 расширенный Hox: Evx1 Evx2 MEOX1 MEOX2 Homeobox A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 Би 2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 GBX1 GBX2 MNX1
metaHOX	BARHL1 BARHL2 BARX1 BARX2 BSX DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 HHEX HLX LBX1 LBX2 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 HMX1 HMX2 HMX3 6-1 6-2 НАТО TLX1 TLX2 TLX3 VAX1 VAX2
Другой	ARX CRX CUTL1 FHL 1 2 3 HESX1 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1А 1B NOBOX СКАЗКА Я ЕСТЬ 1 2 АТС 1 2 3 PKNOX 1 2 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21А PHOX 2А 2B PITX 1 2 3 POU домен PIT-1 БРН-3: А B C Фактор транскрипции октамера: 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 SATB2 SHOX2 ШЕСТЬ 1 2 3 4 5 ZEB 1 2

(3.2) Парная коробка

PAX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
PRRX
- 1
- 2
RAX

(3.3) Головка вилки / крылатая спираль

E2F
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
FOX белки
- A1
- A2
- A3
- C1
- C2
- D3
- D4
- E1
- E3
- F1
- G1
- H1
- I1
- J1
- J2
- K1
- K2
- L2
- M1
- N1
- N3
- O1
- O3
- O4
- P1
- P2
- P3
- P4

(3.4) Факторы теплового шока

HSF
- 1
- 2
- 4

(3.5) Кластеры триптофана

ELF
- 2
- 4
- 5
EGF
ELK
- 1
- 3
- 4
ERF
ETS
- 1
- 2
- ЭРГ
- СПИБ
ETV
- 1
- 4
- 5
- 6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
MYB
MYBL2

(3.6) TEA домен

фактор усиления транскрипции
- 1
- 2
- 3
- 4

(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок

(4.1) Rel область гомологии	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL РЕЛА RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) СТАТ	СТАТ 1 2 3 4 5 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) Коробка MADS	Mef2 А B C D SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки	TBP TBPL1
(4.7) Группа высокой мобильности	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1А 1B SOX 1 2 3 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14 15 18 21 SRY SSRP1 TCF / LEF TCF 1 3 4 LEF1 ТОКС 1 2 3 4
(4.9) Зернистая голова	TFCP2
(4.10) Область холодного удара	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Другие факторы транскрипции

(0.2) HMGI (Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Карманный домен	Руб. RBL1 RBL2
(0.5) АП-2/EREBP-связанные факторы	Апетала 2 EREBP B3
(0.6) Разное	ARID 1А 1B 2 3А 3B 4А КЕПКА ЕСЛИ Я 16 35 MLL 2 3 Т1 MNDA NFY А B C Ро /Сигма

смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора