Фактор ответа сыворотки - Serum response factor

SRF
Протеин ПБД SRF image.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSRF, MCM1, фактор ответа сыворотки
Внешние идентификаторыOMIM: 600589 MGI: 106658 ГомолоГен: 31135 Генные карты: SRF
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение SRF
Геномное расположение SRF
Группа6п21.1Начинать43,171,269 бп[1]
Конец43,181,506 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SRF 202400 s в формате fs.png

PBB GE SRF 202401 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003131
NM_001292001

NM_020493

RefSeq (белок)

NP_001278930
NP_003122
NP_003122.1

NP_065239

Расположение (UCSC)Chr 6: 43.17 - 43.18 МбChr 17: 46,55 - 46,56 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор ответа сыворотки, также известный как SRF, это белок фактора транскрипции.[5]

Функция

Фактор ответа сыворотки входит в MADS (MCM1, Аграндиозный Deficiens и SRF) суперсемейство транскрипционных факторов.[6] Этот белок связывается с элементом ответа сыворотки (SRE) в промоутер область целевых генов. Этот белок регулирует деятельность многих немедленные ранние гены, Например c-fos, и тем самым участвует в клеточный цикл регулирование апоптоз, рост клеток и дифференциация клеток. Этот ген является мишенью для многих путей; например, митоген-активированная протеинкиназа путь (MAPK), который действует через тройные комплексные факторы (TCF).[7][8]

SRF важен во время развития эмбриона, так как он связан с формированием мезодерма.[9][10] У полностью развитых млекопитающих SRF имеет решающее значение для роста скелетных мышц.[11] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как рецепторы стероидных гормонов, может способствовать регулированию роста мышц за счет стероиды.[12] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как миокардин или Elk-1, может усиливать или подавлять экспрессию генов, важных для роста гладких мышц сосудов.

Клиническое значение

Отсутствие кожного SRF связано с псориаз и другие кожные заболевания.[13]

Взаимодействия

Фактор ответа сыворотки показал взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112658 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015605 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Норман К., Рансвик М., Поллок Р., Трейсман Р. (декабрь 1988 г.). «Выделение и свойства клонов кДНК, кодирующих SRF, фактор транскрипции, который связывается с элементом ответа сыворотки c-fos». Клетка. 55 (6): 989–1003. Дои:10.1016/0092-8674(88)90244-9. PMID  3203386. S2CID  20004673.
  6. ^ Shore P, Sharrocks AD (апрель 1995 г.). «Семейство транскрипционных факторов MADS-box». Евро. J. Biochem. 229 (1): 1–13. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.0001l.x. PMID  7744019.
  7. ^ Далтон С., Марэ Р., Винн Дж, Трейсман Р. (июнь 1993 г.). «Выделение и характеристика дополнительных белков SRF». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Наука. 340 (1293): 325–32. Bibcode:1993РСПТБ.340..325Д. Дои:10.1098 / рстб.1993.0074. PMID  8103935.
  8. ^ «Сывороточный фактор ответа SRF». Entrez Gene. Национальный центр биотехнологической информации, Национальные институты здравоохранения.
  9. ^ Сепульведа Дж. Л., Влахопулос С., Айер Д., Белагули Н., Шварц Р. Дж. (Июль 2002 г.). «Комбинаторная экспрессия GATA4, Nkx2-5 и сывороточного фактора ответа направляет активность ранних сердечных генов». J. Biol. Chem. 277 (28): 25775–82. Дои:10.1074 / jbc.M203122200. PMID  11983708.
  10. ^ Barron MR, Belaguli NS, Zhang SX, Trinh M, Iyer D, Merlo X, Lough JW, Parmacek MS, Bruneau BG, Schwartz RJ (март 2005 г.). «Сывороточный фактор ответа, обогащенный обязательный фактор сердечной мезодермы, является нижестоящей генной мишенью для генов Tbx». J. Biol. Chem. 280 (12): 11816–28. Дои:10.1074 / jbc.M412408200. PMID  15591049.
  11. ^ Ли С., Чубрит М.П., ​​Маканалли Дж., Бассель-Дуби Р., Ричардсон Дж. А., Вибель Ф. Ф., Нордхайм А., Олсон Э. Н. (январь 2005 г.). «Потребность в сывороточном факторе ответа для роста и созревания скелетных мышц, выявленная делецией тканеспецифического гена у мышей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (4): 1082–7. Bibcode:2005ПНАС..102.1082Л. Дои:10.1073 / pnas.0409103102. ЧВК  545866. PMID  15647354.
  12. ^ Влахопулос С., Циммер В.Е., Йенстер Г., Белагули Н.С., Балк С.П., Бринкманн А.О., Ланц Р.Б., Зумпурлис В.К., Шварц Р.Дж. (март 2005 г.). «Рекрутирование рецептора андрогена через фактор ответа сыворотки способствует экспрессии миогенного гена». J. Biol. Chem. 280 (9): 7786–92. Дои:10.1074 / jbc.M413992200. PMID  15623502.
  13. ^ Koegel H, von Tobel L, Schäfer M, Alberti S, Kremmer E, Mauch C, Hohl D, Wang XJ, Beer HD, Bloch W, Nordheim A, Werner S (апрель 2009 г.). «Потеря сывороточного фактора ответа в кератиноцитах приводит к гиперпролиферативному заболеванию кожи у мышей». J. Clin. Вкладывать деньги. 119 (4): 899–910. Дои:10.1172 / JCI37771. ЧВК  2662566. PMID  19307725.
  14. ^ Jung DJ, Sung HS, Goo YW, Lee HM, Park OK, Jung SY, Lim J, Kim HJ, Lee SK, Kim TS, Lee JW, Lee YC (июль 2002 г.). «Новый комплекс коактиватора транскрипции, содержащий коинтегратор активирующего сигнала 1». Мол. Клетка. Биол. 22 (14): 5203–11. Дои:10.1128 / mcb.22.14.5203-5211.2002. ЧВК  139772. PMID  12077347.
  15. ^ а б Чжу С., Йохансен Ф. Э., Приуэс Р. (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие ATF6 и сывороточного фактора ответа». Мол. Клетка. Биол. 17 (9): 4957–66. Дои:10.1128 / MCB.17.9.4957. ЧВК  232347. PMID  9271374.
  16. ^ Хэнлон М., Сили Л. (май 1999 г.). «Ras регулирует ассоциацию сывороточного фактора ответа и CCAAT / связывающий энхансер белок бета». J. Biol. Chem. 274 (20): 14224–8. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14224. PMID  10318842.
  17. ^ Сили Л., Малоун Д., Павлак М. (март 1997 г.). «Регулирование элемента ответа сыворотки cfos с помощью C / EBPbeta». Мол. Клетка. Биол. 17 (3): 1744–55. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1744. ЧВК  231899. PMID  9032301.
  18. ^ а б Мацудзаки К., Минами Т., Тодзё М., Хонда И., Сайто Н., Нагахиро С., Сая Н., Накао М. (март 2003 г.). «PML-ядерные тельца участвуют в клеточном сывороточном ответе». Гены Клетки. 8 (3): 275–86. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2003.00632.x. PMID  12622724. S2CID  9697837.
  19. ^ Хасслер М., Ричмонд Т.Дж. (июнь 2001 г.). «B-бокс доминирует над взаимодействиями SAP-1-SRF в структуре тройного комплекса». EMBO J. 20 (12): 3018–28. Дои:10.1093 / emboj / 20.12.3018. ЧВК  150215. PMID  11406578.
  20. ^ Белагули Н.С., Сепульведа Дж. Л., Нигам В., Чаррон Ф., Немер М., Шварц Р. Дж. (Октябрь 2000 г.). «Факторы, обогащенные сердечной тканью, сывороточный фактор ответа и GATA-4 являются взаимными корегуляторами». Мол. Клетка. Биол. 20 (20): 7550–8. Дои:10.1128 / mcb.20.20.7550-7558.2000. ЧВК  86307. PMID  11003651.
  21. ^ Морин С., Паради П., Овен А., Немер М. (февраль 2001 г.). «Тройной комплекс фактора ответа сыворотки-GATA, необходимый для ядерной передачи сигналов рецептором, связанным с G-белком». Мол. Клетка. Биол. 21 (4): 1036–44. Дои:10.1128 / MCB.21.4.1036-1044.2001. ЧВК  99558. PMID  11158291.
  22. ^ Жолио В., Демма М., Приуэс Р. (февраль 1995 г.). «Взаимодействие с субъединицей RAP74 TFIIF необходимо для активации транскрипции фактором ответа сыворотки». Природа. 373 (6515): 632–5. Bibcode:1995Натура.373..632J. Дои:10.1038 / 373632a0. PMID  7854423. S2CID  47196160.
  23. ^ Чжу Х., Жолио В., Привес Р. (февраль 1994 г.). «Роль фактора транскрипции TFIIF в транскрипции, активируемой фактором ответа сыворотки». J. Biol. Chem. 269 (5): 3489–97. PMID  8106390.
  24. ^ Грюнеберг Д.А., Генри Р.В., Брауэр А., Новина С.Д., Черият В., Рой А.Л., Гилман М. (октябрь 1997 г.). «Многофункциональный ДНК-связывающий белок, который способствует образованию комплексов сывороточный фактор ответа / гомеодомен: идентичность TFII-I». Genes Dev. 11 (19): 2482–93. Дои:10.1101 / gad.11.19.2482. ЧВК  316568. PMID  9334314.
  25. ^ Ким Д. В., Черият В., Рой А. Л., Кокран Б. Х. (июнь 1998 г.). «TFII-I усиливает активацию промотора c-fos за счет взаимодействия с вышестоящими элементами». Мол. Клетка. Биол. 18 (6): 3310–20. Дои:10.1128 / mcb.18.6.3310. ЧВК  108912. PMID  9584171.
  26. ^ Гройсман Р., Масутани Х., Лейбович М.П., ​​Робин П., Судан И., Труш Д., Харель-Беллан А. (март 1996 г.). «Физическое взаимодействие между митоген-чувствительным фактором ответа сыворотки и миогенными белками основной спирали, петли, спирали». J. Biol. Chem. 271 (9): 5258–64. Дои:10.1074 / jbc.271.9.5258. PMID  8617811.
  27. ^ Биесиада Е., Хамамори Ю., Кедес Л., Сарторелли В. (апрель 1999 г.). «Миогенные основные белки спираль-петля-спираль и Sp1 взаимодействуют как компоненты многопротеинового транскрипционного комплекса, необходимого для активности промотора сердечного альфа-актина человека». Мол. Клетка. Биол. 19 (4): 2577–84. Дои:10.1128 / MCB.19.4.2577. ЧВК  84050. PMID  10082523.
  28. ^ Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». FEBS Lett. 460 (1): 41–5. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 01311-3. PMID  10571058. S2CID  28576187.
  29. ^ Ли СК, Ким Дж. Х., Ли Ю. Си, Чеонг Дж., Ли Дж. У. (апрель 2000 г.). «Медиатор подавления рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы, как новая транскрипционная молекула-корепрессор, активирующая белок-1, ядерный фактор-каппаВ и фактор сывороточного ответа». J. Biol. Chem. 275 (17): 12470–4. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12470. PMID  10777532.
  30. ^ Ким Х. Дж., Ким Дж. Х., Ли Дж. У. (октябрь 1998 г.). «Коактиватор-1 стероидного рецептора взаимодействует с сывороточным фактором ответа и коактивирует трансактивацию, опосредованную сывороточным элементом ответа». J. Biol. Chem. 273 (44): 28564–7. Дои:10.1074 / jbc.273.44.28564. PMID  9786846.
  31. ^ Гупта М., Когут П., Дэвис Ф. Дж., Белагули Н. С., Шварц Р. Дж., Гупта М. П. (март 2001 г.). «Физическое взаимодействие между MADS-боксом сывороточного фактора ответа и ДНК-связывающим доменом TEA / ATTS фактора-1 усилителя транскрипции». J. Biol. Chem. 276 (13): 10413–22. Дои:10.1074 / jbc.M008625200. PMID  11136726.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США  ([1] ), который находится в всеобщее достояние.