НК2 гомеобокс 1 - NK2 homeobox 1

NKX2-1
Белок TITF1 PDB 1ftt.png
Идентификаторы
ПсевдонимыNKX2-1, Nkx2-1, AV026640, Nkx2.1, T / EBP, Titf1, Ttf-1, BCH, BHC, NK-2, NKX2A, TEBP, TTF1, NMTC1, NK2 homeobox 1
Внешние идентификаторыOMIM: 600635 MGI: 108067 ГомолоГен: 2488 Генные карты: NKX2-1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человек)[1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение NKX2-1
Геномное расположение NKX2-1
Группа14q13.3Начните36,516,392 бп[1]
Конец36,521,149 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TITF1 210673 x at fs.png

PBB GE TITF1 211024 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001079668
NM_003317

NM_001146198
NM_009385

RefSeq (белок)

NP_001073136
NP_003308

NP_033411

Расположение (UCSC)Chr 14: 36,52 - 36,52 МбChr 12: 56,53 - 56,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

НК2 гомеобокс 1 (NKX2-1), также известен как фактор транскрипции щитовидной железы 1 (TTF-1), это белок который у человека кодируется NKX2-1 ген.[5][6]

Функция

Фактор транскрипции щитовидной железы-1 (TTF-1) представляет собой белок что регулирует транскрипция из гены специфический для щитовидная железа, легкое, и промежуточный мозг. Он также известен как белок, связывающий энхансер, специфичный для щитовидной железы. Он используется в анатомическая патология в качестве маркера, чтобы определить, опухоль возникает из легких или щитовидной железы. NKX2.1 может быть индуцирован активин А через SMAD2 передача сигналов в модели дифференцировки эмбриональных стволовых клеток человека.[7]

Клиническое значение

Микрофотография метастатической аденокарциномы легкого (обнаруженной в головном мозге), имеющей ядерное окрашивание (коричневое) для TTF-1.

Положительные TTF-1 клетки обнаруживаются в легких как пневмоциты II типа и клубные клетки. В щитовидной железе фолликулярный и парафолликулярные клетки также положительны для TTF-1.

Для рак легких, аденокарциномы обычно положительные, а плоскоклеточный рак и крупноклеточные карциномы редко бывают положительными. Мелкоклеточные карциномы (любого первичного сайта) обычно положительные. TTF1 - это больше, чем просто клинический маркер аденокарциномы легких. Он играет активную роль в поддержании клеток рака легких, учитывая экспериментальные наблюдения, что он мутирует при раке легких.[8][9][10][11]

Было замечено, что потеря Nkx2-1 позволяет нарушить регуляцию факторов транскрипции. FOXA1 / 2 (расслабляя деацетилирование гистонов и метилирование -опосредованная репрессия Foxa1 / 2 с помощью Nkx2-1), вызывающая реактивацию программы эмбриональной желудочной дифференцировки в легочных клетках. Это приводит к муцинозная аденокарцинома легкого, источник плохих клинических результатов для пациентов.[12]

Однако другие обнаружили, что окрашивание TTF-1 часто бывает положительным при аденокарциномах легких, крупноклеточных карциномах, мелкоклеточных карциномах легких, нейроэндокринных опухолях, отличных от мелкоклеточных карцином легких и внелегочных мелкоклеточных карциномах.[13]

Это также положительно в рак щитовидной железы и используется для мониторинга метастаз и повторение.[14]

Взаимодействия

NK2 homeobox 1 был показан взаимодействовать с участием Кальретикулин[15] и PAX8.[16]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136352 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001496 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ "Энтрез Джин: NKX2-1".
  6. ^ Guazzi S, Price M, De Felice M, Damante G, Mattei MG, Di Lauro R (ноябрь 1990 г.). «Ядерный фактор 1 щитовидной железы (TTF-1) содержит гомеодомен и демонстрирует новую специфичность связывания ДНК». Журнал EMBO. 9 (11): 3631–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07574.x. ЧВК  552115. PMID  1976511.
  7. ^ Ли И, Эггермонт К., Ванслембрук В., Верфейли К.М. (май 2013 г.). «Активация NKX2-1 с помощью передачи сигналов SMAD2 после дифференцировки дефинитивной энтодермы в эмбриональных стволовых клетках человека». Стволовые клетки и развитие. 22 (9): 1433–42. Дои:10.1089 / scd.2012.0620. ЧВК  3629846. PMID  23259454.
  8. ^ Кендалл Дж., Лю К., Бакле А., Красниц А., Нгуен К. К., Лакшми Б., Джеральд В. Л., Пауэрс С., Мю Д. (октябрь 2007 г.). «Онкогенное сотрудничество и коамплификация генов факторов транскрипции при раке легких». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (42): 16663–8. Bibcode:2007ПНАС..10416663К. Дои:10.1073 / pnas.0708286104. ЧВК  2034240. PMID  17925434.
  9. ^ Tanaka H, ​​Yanagisawa K, Shinjo K, Taguchi A, Maeno K, Tomida S, Shimada Y, Osada H, Kosaka T., Matsubara H, Mitsudomi T., Sekido Y, Tanimoto M, Yatabe Y, Takahashi T. (июль 2007 г.). «Зависимость аденокарцином легких от регулятора развития легких TTF-1».. Исследования рака. 67 (13): 6007–11. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-4774. PMID  17616654.
  10. ^ Weir BA, Woo MS, Getz G, Perner S, Ding L, Beroukhim R, Lin WM, Province MA, Kraja A, Johnson LA, Shah K, Sato M, Thomas RK, Barletta JA, Borecki IB, Broderick S, Chang AC , Chiang DY, Chirieac LR, Cho J, Fujii Y, Gazdar AF, Giordano T, Greulich H, Hanna M, Johnson BE, Kris MG, Lash A, Lin L, Lindeman N, Mardis ER, McPherson JD, Minna JD, Morgan МБ, Надел М., Оррингер МБ, Осборн-младший, Озенбергер Б., Рамос А.Х., Робинсон Дж., Рот Дж. А., Руш В., Сасаки Х., Шеперд Ф., Сугнез С., Шпиц М.Р., Цао М.С., Туми Д., Верхаак Р.Г., Вайншток ГМ, Уиллер Д.А., Винклер В., Йошизава А., Ю С., Заковски М.Ф., Чжан К., Бир Д.Г., Вистуба II, Уотсон М.А., Гарравей Л.А., Ладани М., Трэвис В.Д., Пао В., Рубин М.А., Габриэль С.Б., Гиббс Р.А., Вармус Х. , Уилсон Р.К., Ландер Э.С., Мейерсон М. (декабрь 2007 г.). «Характеристика генома рака при аденокарциноме легкого». Природа. 450 (7171): 893–8. Bibcode:2007 Натур.450..893Вт. Дои:10.1038 / природа06358. ЧВК  2538683. PMID  17982442.
  11. ^ Kwei KA, Kim YH, Girard L, Kao J, Pacyna-Gengelbach M, Salari K, Lee J, Choi YL, Sato M, Wang P, Hernandez-Boussard T., Gazdar AF, Petersen I, Minna JD, Pollack JR (июн. 2008 г.). «Геномное профилирование идентифицирует TITF1 как клон-специфичный онкоген, амплифицированный при раке легких». Онкоген. 27 (25): 3635–40. Дои:10.1038 / sj.onc.1211012. ЧВК  2903002. PMID  18212743.
  12. ^ Снайдер, Эрик Л .; Ватанабэ, Хидео; Магенданц, Маргарет; Хёрш, Себастьян; Чен, Тиффани А .; Ван, Диана Г .; Кроули, Дениз; Whittaker, Charles A .; Мейерсон, Мэтью; Кимура, Сиоко; Джекс, Тайлер (2013-04-25). «Nkx2-1 подавляет программу латентной желудочной дифференцировки при аденокарциноме легкого». Молекулярная клетка. 50 (2): 185–199. Дои:10.1016 / j.molcel.2013.02.018. ISSN  1097-2765. ЧВК  3721642. PMID  23523371.
  13. ^ Калхор Н., Зандер Д.С., Лю Дж. (Август 2006 г.). «TTF-1 и p63 для отличия мелкоклеточной карциномы легких от низкодифференцированной плоскоклеточной карциномы в цитологическом материале, ранее окрашенном pap». Современная патология. 19 (8): 1117–23. Дои:10.1038 / modpathol.3800629. PMID  16680154.
  14. ^ Эспиноза ЧР, Шмитт Т.Л., Лоос У. (август 2001 г.). «Фактор транскрипции щитовидной железы 1 и Pax8 синергетически активируют промотор гена тиреоглобулина человека». Журнал молекулярной эндокринологии. 27 (1): 59–67. Дои:10.1677 / jme.0.0270059. PMID  11463576.
  15. ^ Перроне Л., Телль Дж., Ди Лауро Р. (февраль 1999 г.). «Кальретикулин усиливает транскрипционную активность фактора транскрипции щитовидной железы-1, связываясь с его гомеодоменом». Журнал биологической химии. 274 (8): 4640–5. Дои:10.1074 / jbc.274.8.4640. PMID  9988700.
  16. ^ Ди Пальма Т., Нитч Р., Mascia А., Нитч Л., Ди Лауро Р., Заннини М. (январь 2003 г.). «Парный фактор, содержащий домен Pax8, и фактор, содержащий гомеодомен, TTF-1, напрямую взаимодействуют и синергетически активируют транскрипцию». Журнал биологической химии. 278 (5): 3395–402. Дои:10.1074 / jbc.M205977200. PMID  12441357.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.