КУП-TFI - COUP-TFI

NR2F1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EBL
Идентификаторы
Псевдонимы	NR2F1, BBOAS, BBSOAS, COUP-TFI, EAR-3, EAR3, ERBAL3, NR2F2, SVP44, TCFCOUP1, TFCOUP1, ядерный рецептор подсемейства 2, группа F, член 1, COUPTF1
Внешние идентификаторы	OMIM: 132890 MGI: 1352451 ГомолоГен: 21158 Генные карты: NR2F1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 5 (человек)
Конец	93,594,611 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	78,199,757 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • активность рецепторов стероидных гормонов; • последовательное связывание ДНК; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • Связывание ДНК; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора; • связывание ионов цинка; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II; • Связывание элементов, чувствительных к ретиноевой кислоте;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • преобразование сигнала; • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами; • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора; • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах; • развитие нервной системы; • негативная регуляция развития проекции нейронов; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7025
	13865
	ENSG00000175745
	ENSMUSG00000069171
	P10589
	Q60632
	NM_005654
	NM_010151; NM_001347538; NM_001347539
	NP_005645
	NP_001334467; NP_001334468; NP_034281
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

КУПЕ-TF1 (КУПЕ Ттранскрипция Fактер 1) также известный как NR2F1 (Nнеясный рподсемейство рецепторов 2, группа F, член 1) это белок что у людей кодируется NR2F1 ген.^[5]^[6] Этот белок входит в состав рецептор ядерного гормона семья рецепторы стероидных гормонов.

Функция

Переворот (курица овальбумин вышестоящий промотор) фактор транскрипции связывается с овальбумином промоутер и в сочетании с другим белком (S300-II ) стимулирует инициация транскрипции.^[7]^[8] COUP-TF1 связывается как с прямыми повторами, так и с палиндромы мотива 5'-AGGTCA-3 '.^[9]

Взаимодействия

COUP-TFI было показано взаимодействовать с:

Клинический

Мутации в этом гене были связаны с Синдром оптической атрофии Боша-Бунстра-Шааф.^[13]

внешняя ссылка

Человек NR2F1 расположение генома и NR2F1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
Человек NR2F2 расположение генома и NR2F2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Kliewer SA, Umesono K, Heyman RA, Mangelsdorf DJ, Dyck JA, Evans RM (февраль 1992 г.). «Взаимодействия рецептора ретиноида X-COUP-TF модулируют передачу сигналов ретиноевой кислоты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (4): 1448–52. Bibcode:1992PNAS ... 89.1448K. Дои:10.1073 / pnas.89.4.1448. ЧВК 48468. PMID 1311101.
Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора тироидного гормона, рецептора ретиноевой кислоты, ретиноидного рецептора X, фактора транскрипции вышестоящего промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени». Молекулярная эндокринология. 6 (9): 1468–78. Дои:10.1210 / me.6.9.1468. PMID 1331778.
Ing NH, Beekman JM, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (сентябрь 1992 г.). «Члены суперсемейства рецепторов стероидных гормонов взаимодействуют с TFIIB (S300-II)». Журнал биологической химии. 267 (25): 17617–23. PMID 1517211.
Ван Л.Х., Цай С.Ю., Кук Р.Г., Битти В.Г., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (июль 1989 г.). «Фактор транскрипции COUP является членом суперсемейства стероидных рецепторов». Природа. 340 (6229): 163–6. Bibcode:1989 Натур. 340..163 Вт. Дои:10.1038 / 340163a0. PMID 2739739. S2CID 4364164.
Миядзима Н., Кадоваки Ю., Фукусигэ С., Симидзу С., Семба К., Яманаси Ю., Мацубара К., Тоошима К., Ямамото Т. (декабрь 1988 г.). «Идентификация двух новых членов суперсемейства erbA путем молекулярного клонирования: генные продукты этих двух тесно связаны друг с другом». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (23): 11057–74. Дои:10.1093 / nar / 16.23.11057. ЧВК 338996. PMID 2905047.
Савая Б.Е., Рор О., Аунис Д., Шеффер Э. (сентябрь 1996 г.). "Фактор транскрипции перед промотором куриного овальбумина, активатор транскрипции экспрессии гена ВИЧ-1 в клетках мозга человека". Журнал биологической химии. 271 (38): 23572–6. Дои:10.1074 / jbc.271.38.23572. PMID 8798567.
Рор О., Онис Д., Шеффер Э. (декабрь 1997 г.). «COUP-TF и Sp1 взаимодействуют и кооперируются в активации транскрипции длинного концевого повтора вируса иммунодефицита человека типа 1 в клетках микроглии человека». Журнал биологической химии. 272 (49): 31149–55. Дои:10.1074 / jbc.272.49.31149. PMID 9388268.
Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999 г.). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3383–94. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3383. ЧВК 84131. PMID 10207062.
Klinge CM, Kaur K, Swanson HI (январь 2000 г.). «Арилуглеводородный рецептор взаимодействует с рецептором эстрогена альфа и сиротскими рецепторами COUP-TFI и ERRalpha1». Архивы биохимии и биофизики. 373 (1): 163–74. Дои:10.1006 / abbi.1999.1552. PMID 10620335.
Рор О., Шварц С., Хери С., Онис Д., Тардье М., Шеффер Э. (январь 2000 г.). «Ядерный рецептор куриного овальбумина, вышестоящий промоторный фактор транскрипции, взаимодействует с Tat ВИЧ-1 и стимулирует репликацию вируса в клетках микроглии человека». Журнал биологической химии. 275 (4): 2654–60. Дои:10.1074 / jbc.275.4.2654. PMID 10644726.
Сугияма Т., Ван Дж.С., Скотт Д.К., Граннер Д.К. (февраль 2000 г.). «Активация транскрипции орфанным ядерным рецептором, куриным овальбумином выше промотора-фактора транскрипции I (COUP-TFI). Определение домена, участвующего в глюкокортикоидном ответе гена фосфоенолпируваткарбоксикиназы». Журнал биологической химии. 275 (5): 3446–54. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3446. PMID 10652338.
Vlahou A, Flytzanis CN (февраль 2000 г.). «Субклеточный транспорт ядерного рецептора COUP-TF в раннем эмбриональном клеточном цикле». Биология развития. 218 (2): 284–98. Дои:10.1006 / dbio.1999.9456. PMID 10656770.
Аврам Д., Филдс А., Pretty On Top K, Невривой Д.И., Измаил Дж. Э., Лейд М. (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной куриным овальбумином, вышестоящим промоторным фактором транскрипции фактора транскрипции (COUP-TF), орфанные ядерные рецепторы». Журнал биологической химии. 275 (14): 10315–22. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10315. ЧВК 2819356. PMID 10744719.
Гей F, Anglade I, Gong Z, Salbert G (октябрь 2000 г.). «LIM / гомеодоменный белок islet-1 модулирует функции рецептора эстрогена». Молекулярная эндокринология. 14 (10): 1627–48. Дои:10.1210 / me.14.10.1627. PMID 11043578.
Ю М., Фишер М., Чо В.К., Крабб Д. (февраль 2002 г.). «Транскрипционный контроль промотора альдегиддегидрогеназы 2 человека с помощью ядерного фактора гепатоцитов 4: ингибирование циклическими факторами транскрипции AMP и COUP». Архивы биохимии и биофизики. 398 (1): 79–86. Дои:10.1006 / abbi.2001.2713. PMID 11811951.
Линь Ф, Коллури СК, Чен ГК, Чжан ХК (июнь 2002 г.). «Регулирование индуцированного ретиноевой кислотой ингибирования активности AP-1 с помощью орфанного рецептора куриного овальбумина перед промотором фактора транскрипции». Журнал биологической химии. 277 (24): 21414–22. Дои:10.1074 / jbc.M201885200. PMID 11934895.
Métivier R, Gay FA, Hübner MR, Flouriot G, Salbert G, Gannon F, Kah O, Pakdel F (июль 2002 г.). «Образование комплекса hER альфа-COUP-TFI усиливает hER альфа AF-1 за счет фосфорилирования Ser118 с помощью MAPK». Журнал EMBO. 21 (13): 3443–53. Дои:10.1093 / emboj / cdf344. ЧВК 126093. PMID 12093745.
Yu X, Mertz JE (февраль 2003 г.). «Отличные способы регуляции транскрипции вируса гепатита В ядерными рецепторами HNF4alpha и COUP-TF1». Журнал вирусологии. 77 (4): 2489–99. Дои:10.1128 / JVI.77.4.2489-2499.2003. ЧВК 141100. PMID 12551987.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175745 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000069171 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Ген Entrez: подсемейство 2 ядерных рецепторов NR2F1, группа F, член 1».

[pmid8530078-6] Цю Ю., Кришнан В., Цзэн З., Гилберт Д. Д., Коупленд Н. Г., Гибсон Л., Ян-Фэн Т., Дженкинс Н. А., Цай М. Дж., Цай С. Ю. (сентябрь 1995 г.). «Выделение, характеристика и хромосомная локализация генов COUP-TF I и II мыши и человека». Геномика. 29 (1): 240–6. Дои:10.1006 / geno.1995.1237. PMID 8530078.

[pmid3796602-7] Сагами I, Цай С.Ю., Ван Х., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (декабрь 1986 г.). «Идентификация двух факторов, необходимых для транскрипции гена овальбумина». Молекулярная и клеточная биология. 6 (12): 4259–67. Дои:10.1128 / MCB.6.12.4259. ЧВК 367207. PMID 3796602.

[pmid3040258-8] Цай С.Ю., Сагами И., Ван Х., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (август 1987 г.). «Взаимодействие между ДНК-связывающим фактором транскрипции (COUP) и не-ДНК-связывающим фактором (S300-II)». Клетка. 50 (5): 701–9. Дои:10.1016 / 0092-8674 (87) 90328-Х. PMID 3040258. S2CID 25136877.

[pmid9101138-9] Цай С.Ю., Цай М.Дж. (апрель 1997 г.). "Факторы транскрипции перед промотором овальбумина цыпленка (COUP-TF): наступление зрелости". Эндокринные обзоры. 18 (2): 229–40. Дои:10.1210 / er.18.2.229. PMID 9101138.

[pmid10744719-10] а ^б Аврам Д., Филдс А., Pretty On Top K, Невривой DJ, Измаил Дж. Э., Лейд М. (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной куриным овальбумином, вышестоящим промоторным фактором транскрипции фактора транскрипции (COUP-TF), орфанные ядерные рецепторы». Журнал биологической химии. 275 (14): 10315–22. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10315. ЧВК 2819356. PMID 10744719.

[pmid10207062-11] Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999 г.). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3383–94. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3383. ЧВК 84131. PMID 10207062.

[pmid12093745-12] Métivier R, Gay FA, Hübner MR, Flouriot G, Salbert G, Gannon F, Kah O, Pakdel F (июль 2002 г.). «Образование комплекса hER альфа-COUP-TFI усиливает hER альфа AF-1 за счет фосфорилирования Ser118 с помощью MAPK». Журнал EMBO. 21 (13): 3443–53. Дои:10.1093 / emboj / cdf344. ЧВК 126093. PMID 12093745.

[Hobbs2020-13] Hobbs MM, Wolters WC, Rayapati AO (2020) Синдром оптической атрофии Боша-Бунстра-Шаафа, проявляющийся как впервые возникший психоз у 32-летнего мужчины: отчет о клиническом случае и обзор литературы. J Psychiatr Pract 26 (1): 58-62

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]