АТС1 - PBX1

АТС1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1B72, 1PUF
Идентификаторы
Псевдонимы	АТС1, PBX homeobox 1, ЗАГРЕБАЕТСЯ
Внешние идентификаторы	OMIM: 176310 MGI: 97495 ГомолоГен: 20574 Генные карты: АТС1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	164,899,296 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	168,432,270 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • активность гетеродимеризации белков; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Связывание ДНК; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма; • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II;
Биологический процесс	• спецификация переднего / заднего рисунка; • формирование проксимального / дистального рисунка; • положительная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла; • развитие эмбриональных органов; • эмбриональный гемопоэз; • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции; • транскрипция, ДНК-шаблон; • половая дифференциация; • развитие многоклеточного организма; • эмбриональный морфогенез конечностей; • поддержание популяции соматических стволовых клеток; • регулирование пролиферации клеток; • развитие надпочечников; • развитие селезенки; • развитие тимуса; • положительное регулирование пролиферации клеток; • развитие мочеполовой системы; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регулирование окостенения; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов; • развитие эмбриональной скелетной системы; • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника; • процесс биосинтеза стероидов; • дифференциация клеток; • морфогенез органов животных; • положительная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5087
	18514
	ENSG00000185630
	ENSMUSG00000052534
	P40424
	P41778
	NM_001204961; NM_001204963; NM_002585; NM_001353130; NM_001353131
	NM_001291508; NM_001291509; NM_008783; NM_183355
	NP_001191890; NP_001191892; NP_002576; NP_001340059; NP_001340060
	NP_001278437; NP_001278438; NP_032809; NP_899198
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции пре-В-клеточного лейкоза 1 это белок что у людей кодируется АТС1 ген.^[5]

Взаимодействия

УАТС1 показана взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Sanyal M, Tung JW, Karsunky H, Zeng H, Selleri L, Weissman IL, Herzenberg LA, Cleary ML (май 2007 г.). «Развитие В-клеток не удается из-за отсутствия протоонкогена Pbx1». Кровь. 109 (10): 4191–9. Дои:10.1182 / кровь-2006-10-054213. ЧВК 1885499. PMID 17244677.
Хуэй Х., Перфетти Р. (февраль 2002 г.). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки регулирует развитие поджелудочной железы во время эмбриогенеза и функцию островковых клеток в зрелом возрасте». Европейский журнал эндокринологии. 146 (2): 129–41. Дои:10.1530 / eje.0.1460129. PMID 11834421.
Голод С.П., Галили Н., Кэрролл А.Дж., Крист В.М., Линк М.П., Клири М.Л. (февраль 1991 г.). «T (1; 19) (q23; p13) приводит к последовательному слиянию кодирующих последовательностей E2A и PBX1 при остром лимфобластном лейкозе». Кровь. 77 (4): 687–93. Дои:10.1182 / blood.V77.4.687.687. PMID 1671560.
Моника К., Галили Н., Нурс Дж., Солтман Д., Клири М.Л. (декабрь 1991 г.). «PBX2 и PBX3, новые гены гомеобокса с обширной гомологией с протоонкогеном человека PBX1». Молекулярная и клеточная биология. 11 (12): 6149–57. Дои:10.1128 / mcb.11.12.6149. ЧВК 361792. PMID 1682799.
Норс Дж., Меллентин Дж. Д., Галили Н., Уилкинсон Дж., Стэнбридж Е., Смит С. Д., Клири М. Л. (февраль 1990 г.). «Хромосомная транслокация t (1; 19) приводит к синтезу гомеобоксовой гибридной мРНК, которая кодирует потенциальный химерный фактор транскрипции». Клетка. 60 (4): 535–45. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90657-Z. PMID 1967982. S2CID 7975269.
Кампс М.П., Мюрр С., Сан XH, Балтимор Д. (февраль 1990 г.). «Новый ген гомеобокса вносит вклад в ДНК-связывающий домен белка транслокации t (1; 19) в пре-B ALL». Клетка. 60 (4): 547–55. Дои:10.1016/0092-8674(90)90658-2. PMID 1967983. S2CID 39661371.
Лу Кью, Райт Д.Д., Кампс депутат (июнь 1994 г.). «Слияние с E2A превращает белок гомеодомена Pbx1 в конститутивный активатор транскрипции лейкозов человека, несущий транслокацию t (1; 19)». Молекулярная и клеточная биология. 14 (6): 3938–48. Дои:10.1128 / mcb.14.6.3938. ЧВК 358760. PMID 7910944.
Ван Дейк М.А., Вурхове П.М., Мюрр С. (июль 1993 г.). «Pbx1 превращается в активатор транскрипции после приобретения N-концевой области E2A при пре-B-клеточном остром лимфобластоидном лейкозе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (13): 6061–5. Bibcode:1993ПНАС ... 90.6061D. Дои:10.1073 / пнас.90.13.6061. ЧВК 46867. PMID 8327485.
Лу Кью, депутат Кампс (апрель 1996 г.). «Структурные детерминанты внутри Pbx1, которые опосредуют кооперативное связывание ДНК с пентапептид-содержащими белками Hox: предложение для модели комплекса Pbx1-Hox-ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 16 (4): 1632–40. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1632. ЧВК 231149. PMID 8657138.
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Prep1, новый функциональный партнер белков Pbx». Журнал EMBO. 17 (5): 1423–33. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1423. ЧВК 1170490. PMID 9482739.
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Е., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox». Журнал EMBO. 17 (5): 1434–45. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1434. ЧВК 1170491. PMID 9482740.
Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменной спирали в образовании комплекса». Клетка. 96 (4): 587–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80662-5. PMID 10052460. S2CID 16122785.
Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Ком вес Л.Г., Лоуренс Г.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (4): 3051–61. Дои:10.1128 / MCB.19.4.3051. ЧВК 84099. PMID 10082572.
Джейкобс Ю., Шнабель CA, Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменных белков Hox и TALE опосредует активность усилителя заднего мозга Hoxb2». Молекулярная и клеточная биология. 19 (7): 5134–42. Дои:10.1128 / MCB.19.7.5134. ЧВК 84356. PMID 10373562.
Ноепфлер П.С., Бергстрем Д.А., Уэцуки Т., Дак-Корытко И., Сан Ю.Х., Райт В.Е., Тапскотт С.Д., Кампс М.П. (сентябрь 1999 г.) «Консервативный мотив, N-конец ДНК-связывающих доменов миогенных факторов транскрипции bHLH, опосредует кооперативное связывание ДНК с pbx-Meis1 / Prep1». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (18): 3752–61. Дои:10.1093 / nar / 27.18.3752. ЧВК 148632. PMID 10471746.
McWhirter JR, Neuteboom ST, Wancewicz EV, Monia BP, Downing JR, Murre C (сентябрь 1999 г.). «Онкогенный гомеодоменный фактор транскрипции E2A-Pbx1 активирует новый ген WNT при остром лимфобластоидном лейкозе пре-B». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (20): 11464–9. Bibcode:1999ПНАС ... 9611464М. Дои:10.1073 / пнас.96.20.11464. ЧВК 18056. PMID 10500199.
Шанмугам К., Грин NC, Рамбальди И., Сарагови Х.У., Фезерстоун М.С. (ноябрь 1999 г.). «PBX и MEIS как партнеры, не связывающиеся с ДНК в тримерных комплексах с белками HOX». Молекулярная и клеточная биология. 19 (11): 7577–88. Дои:10.1128 / MCB.19.11.7577. ЧВК 84774. PMID 10523646.
Миккола И., Бруун Дж. А., Холм Т., Йохансен Т. (февраль 2001 г.). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из парных сайтов связывания домена путем независимого от ДНК рекрутирования различных белков гомеодомена». Журнал биологической химии. 276 (6): 4109–18. Дои:10.1074 / jbc.M008882200. PMID 11069920.
Thameem F, Wolford JK, Bogardus C, Prochazka M (март 2001 г.). «Анализ PBX1 в качестве гена-кандидата на сахарный диабет 2 типа у индейцев пима». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1518 (1–2): 215–20. Дои:10.1016 / S0167-4781 (01) 00189-0. PMID 11267683.
Лю Ю., Макдональд Р.Дж., Свифт Г.Х. (май 2001 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции тримером PDX1.PBX1b.MEIS2b и сотрудничество со специфическим для поджелудочной железы базовым комплексом спираль-петля-спираль». Журнал биологической химии. 276 (21): 17985–93. Дои:10.1074 / jbc.M100678200. PMID 11279116.
Mal A, Sturniolo M, Schiltz RL, Ghosh MK, Harter ML (апрель 2001 г.). «Роль гистондеацетилазы HDAC1 в модулировании транскрипционной активности MyoD: ингибирование миогенной программы». Журнал EMBO. 20 (7): 1739–53. Дои:10.1093 / emboj / 20.7.1739. ЧВК 145490. PMID 11285237.

внешняя ссылка

PBX1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P40424 (Фактор транскрипции пре-В-клеточного лейкоза человека 1) на PDBe-KB.
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P41778 (Фактор транскрипции пре-B-клеточного лейкоза мыши 1) на PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185630 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000052534 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[5] «Ген Энтреса: гомеобокс 1 пре-В-клеточного лейкоза PBX1».

[pmid9482740-6] Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Е., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox». Журнал EMBO. 17 (5): 1434–45. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1434. ЧВК 1170491. PMID 9482740.

[pmid10052460-7] Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменной спирали в образовании комплекса». Клетка. 96 (4): 587–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80662-5. PMID 10052460. S2CID 16122785.

[pmid7729685-8] Чанг С.П., Шен В.Ф., Розенфельд С., Лоуренс Г.Дж., Ларгман С., Клири М.Л. (март 1995 г.). «Белки Pbx демонстрируют гексапептид-зависимое кооперативное связывание ДНК с подмножеством белков Hox». Гены и развитие. 9 (6): 663–74. Дои:10.1101 / gad.9.6.663. PMID 7729685.

[pmid10082572-9] Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Ком вес Л.Г., Лоуренс Г.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (4): 3051–61. Дои:10.1128 / MCB.19.4.3051. ЧВК 84099. PMID 10082572.

[pmid10523646-10] Шанмугам К., Грин NC, Рамбальди I., Сарагови Х.У., Фезерстоун М.С. (ноябрь 1999 г.). «PBX и MEIS как партнеры, не связывающиеся с ДНК в тримерных комплексах с белками HOX». Молекулярная и клеточная биология. 19 (11): 7577–88. Дои:10.1128 / MCB.19.11.7577. ЧВК 84774. PMID 10523646.

[pmid10373562-11] Джейкобс Ю., Шнабель CA, Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменных белков Hox и TALE опосредует активность усилителя заднего мозга Hoxb2». Молекулярная и клеточная биология. 19 (7): 5134–42. Дои:10.1128 / MCB.19.7.5134. ЧВК 84356. PMID 10373562.

[pmid16705164-12] Зубаир М., Исихара С., Ока С., Окумура К., Морохаши К. (июнь 2006 г.). «Двухэтапная регуляция транскрипции гена Ad4BP / SF-1 во время развития надпочечников плода: инициация комплексом Hox-Pbx1-Prep1 и поддержание посредством ауторегуляции с помощью Ad4BP / SF-1». Молекулярная и клеточная биология. 26 (11): 4111–21. Дои:10.1128 / MCB.00222-06. ЧВК 1489093. PMID 16705164.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

АТС1 - PBX1

Содержание

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение

внешняя ссылка