Специфический для миоцитов усиливающий фактор 2А - Myocyte-specific enhancer factor 2A

MEF2A
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1C7U, 1EGW, 1LEW, 3КОВ, 3MU6, 3П57
Идентификаторы
Псевдонимы	MEF2A, ADCAD1, RSRFC4, RSRFC9, mef2, фактор энхансера миоцитов 2A
Внешние идентификаторы	OMIM: 600660 MGI: 99532 ГомолоГен: 4080 Генные карты: MEF2A
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	99,716,466 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	67,372,858 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • Связывание ДНК; • активность димеризации белков; • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание гистондеацетилазы; • связывание хроматина; • активация связывания фактора транскрипции; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание гистонацетилтрансферазы; • активность гетеродимеризации белков; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • Привязка SMAD; • связывание протеинкиназы; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма; • ядерный хроматин; • ядро клетки; • цитозоль;
Биологический процесс	• клеточный ответ на ион кальция; • дифференциация клеток; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • поддержание митохондриального генома; • морфогенез дендритов; • положительное регулирование дифференцировки мышечных клеток; • развитие мышечных органов; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • развитие нервной системы; • ERK5 каскад; • развитие многоклеточного организма; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие сердца; • сердечная проводимость; • распределение митохондрий; • узел миофибрилл желудочков сердца; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • апоптотический процесс; • положительная регуляция гипертрофии сердечной мышцы; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • Каскад MAPK; • положительное регулирование импорта глюкозы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4205
	17258
	ENSG00000068305
	ENSMUSG00000030557
	Q02078
	Q60929
NM_001130926; NM_001130927; NM_001130928; NM_001171894; NM_005587;
	NM_001319206; NM_001352614; NM_001352615; NM_001352616; NM_001352617; NM_001352618; NM_001365201; NM_001365202; NM_001365203; NM_001365204; NM_001365205; NM_001365206; NM_001365207; NM_001365208; NM_001365209; NM_001365210; NM_001365211
NM_001033713; NM_001291191; NM_001291192; NM_001291195; NM_001291196;
	NM_001357324; NM_001357325
NP_001124398; NP_001124399; NP_001124400; NP_001165365; NP_001306135;
	NP_005578; NP_001339543; NP_001339544; NP_001339545; NP_001339546; NP_001339547; NP_001352130; NP_001352131; NP_001352132; NP_001352133; NP_001352134; NP_001352135; NP_001352136; NP_001352137; NP_001352138; NP_001352139; NP_001352140
NP_001028885; NP_001278120; NP_001278121; NP_001278124; NP_001278125;
	NP_001344253; NP_001344254
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Специфический для миоцитов усиливающий фактор 2А это белок что у людей кодируется MEF2A ген.^[5]^[6] MEF2A - это фактор транскрипции в Mef2 семья. У человека он расположен на хромосома 15q26. Определенный мутации в MEF2A вызывают аутосомно-доминантный форма ишемическая болезнь сердца и инфаркт миокарда.

Функция

Процесс дифференцировки мезодермальных клеток-предшественников в миобласты привел к открытию множества тканеспецифических факторов, которые регулируют экспрессию мышечных генов. Миогенные основные белки спираль-петля-спираль, включая myoD (MIM 159970), миогенин (MIM 159980), MYF5 (MIM 159990) и MRF4 (MIM 159991), представляют собой 1 класс идентифицированных факторов. Второе семейство ДНК-связывающих регуляторных белков представляет собой семейство миоцит-специфического энхансерного фактора-2 (MEF2). Каждый из этих белков связывается с последовательностью ДНК-мишени MEF2, присутствующей в регуляторных областях многих, если не всех, специфичных для мышц генов. Гены MEF2 являются членами семейства генов MADS (названного в честь дрожжевого спаривающегося специфического фактора транскрипции MCM1, гомеотических генов растений «агамус» и «дефицит» и фактора сывороточного ответа человека SRF (MIM 600589)), семейства, которое также включает несколько гомеотических генов и других факторов транскрипции, все из которых имеют общий консервативный ДНК-связывающий домен. [поставляется OMIM]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что специфический для миоцитов усиливающий фактор 2A взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000068305 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030557 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Yu YT, Breitbart RE, Smoot LB, Lee Y, Mahdavi V, Nadal-Ginard B (октябрь 1992 г.). «Человеческий миоцит-специфический фактор-энхансер 2 включает группу ограниченных тканью факторов транскрипции MADS-бокса». Genes Dev. 6 (9): 1783–98. Дои:10.1101 / gad.6.9.1783. PMID 1516833.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор 2 усилителя транскрипции MADS-бокса MEF2A, полипептид А (фактор 2А усилителя миоцитов)».
^ Мао З., Надаль-Жинар Б. (июнь 1996 г.). «Функциональные и физические взаимодействия между гомологом 1 achaete-scute млекопитающих и фактором усиления миоцитов 2A». J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.
^ ^а ^б Де Лука А., Северино А., Де Паолис П., Коттон Дж., Де Лука Л., Де Фалько М., Порселлини А., Вольпе М., Кондорелли Дж. (Февраль 2003 г.). «p300 / cAMP-ответный элемент-связывающий-белок ('CREB') - связывающий белок (CBP) модулирует взаимодействие между фактором усиления миоцитов 2A (MEF2A) и рецептором тироидного гормона-ретиноидным X рецептором». Biochem. J. 369 (Pt 3): 477–84. Дои:10.1042 / BJ20020057. ЧВК 1223100. PMID 12371907.
^ ^а ^б Миска Е.А., Карлссон С., Лэнгли Е., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывает и репрессирует фактор транскрипции MEF2». EMBO J. 18 (18): 5099–107. Дои:10.1093 / emboj / 18.18.5099. ЧВК 1171580. PMID 10487761.
^ ^а ^б ^c Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (май 2000 г.). «гистондеацетилаза mHDA1 / HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее». J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. Дои:10.1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.
^ Чжао М., Нью Л., Кравченко В. В., Като Ю., Грам Х, ди Падова Ф., Олсон Е. Н., Улевич Р. Дж., Хан Дж. (Январь 1999 г.). «Регулирование семейства транскрипционных факторов MEF2 с помощью p38». Мол. Cell. Биол. 19 (1): 21–30. Дои:10.1128 / mcb.19.1.21. ЧВК 83862. PMID 9858528.
^ Ян Ш., Галанис А., Шаррокс А. Д. (июнь 1999 г.). «Нацеливание митоген-активированных протеинкиназ p38 на факторы транскрипции MEF2». Мол. Cell. Биол. 19 (6): 4028–38. Дои:10.1128 / mcb.19.6.4028. ЧВК 104362. PMID 10330143.
^ Орнатский О.И., Макдермотт Дж.С. (октябрь 1996 г.). «Экспрессия белка MEF2, специфичность связывания ДНК и сложный состав, а также транскрипционная активность в мышечных и немышечных клетках». J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.
^ Куинн З.А., Ян СС, Врана Дж. Л., Макдермотт Дж. С. (февраль 2001 г.). «Белки Smad действуют как комодуляторы для белков, регулирующих транскрипцию MEF2». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (3): 732–42. Дои:10.1093 / nar / 29.3.732. ЧВК 30396. PMID 11160896.

дальнейшее чтение

Ван Кью (2005). "Достижения в генетической основе болезни коронарной артерии". Текущие отчеты об атеросклерозе. 7 (3): 235–41. Дои:10.1007 / s11883-005-0012-6. ЧВК 1783687. PMID 15811259.
Ван Кью (2005). «Молекулярная генетика ишемической болезни сердца». Curr. Мнение. Кардиол. 20 (3): 182–8. Дои:10.1097 / 01.hco.0000160373.77190.f1. ЧВК 1579824. PMID 15861005.
Funk WD, Wright WE (1992). «Циклическая амплификация и выбор мишеней для многокомпонентных комплексов: миогенин взаимодействует с факторами, распознающими сайты связывания для основной спирали-петли-спирали, ядерного фактора 1, миоцит-специфического фактора связывания энхансера 2 и фактора COMP1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (20): 9484–8. Bibcode:1992PNAS ... 89.9484F. Дои:10.1073 / пнас.89.20.9484. ЧВК 50156. PMID 1329097.
Поллок Р., Трейсман Р. (1992). «Белки, связанные с SRF человека: ДНК-связывающие свойства и потенциальные регуляторные мишени». Genes Dev. 5 (12A): 2327–41. Дои:10.1101 / gad.5.12a.2327. PMID 1748287.
Молькентин Дж. Д., Блэк Б. Л., Мартин Дж. Ф., Олсон Е. Н. (1996). «Совместная активация экспрессии мышечных генов с помощью MEF2 и миогенных белков bHLH». Ячейка. 83 (7): 1125–36. Дои:10.1016/0092-8674(95)90139-6. PMID 8548800.
Хобсон Г.М., Крахе Р., Гарсия Е., Сицилиано М.Дж., Funanage VL (1996). «Региональные хромосомные отнесения четырех членов семейства генов фактора 2 усилителя транскрипции домена MADS (MEF2) к человеческим хромосомам 15q26, 19p12, 5q14 и 1q12-q23». Геномика. 29 (3): 704–11. Дои:10.1006 / geno.1995.9007. PMID 8575763.
Мао З., Надаль-Жинар Б. (1996). «Функциональные и физические взаимодействия между гомологом 1 achaete-scute млекопитающих и фактором усиления миоцитов 2A». J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.
Сузуки Е., Лоури Дж, Сонода Дж, Теста Дж. Р., Уолш К. (1996). «Структуры и расположение хромосом человеческого гена MEF2A и псевдогена MEF2AP». Cytogenet. Cell Genet. 73 (3): 244–9. Дои:10.1159/000134348. PMID 8697817.
Орнатский О.И., Макдермотт Дж. К. (1996). «Экспрессия белка MEF2, специфичность связывания ДНК и сложный состав, а также транскрипционная активность в мышечных и немышечных клетках». J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.
Блэк Б.Л., Молькентин Дж. Д., Олсон Е. Н. (1998). «Множественные роли основной области MyoD в передаче сигналов активации транскрипции и взаимодействии с MEF2». Мол. Cell. Биол. 18 (1): 69–77. Дои:10.1128 / mcb.18.1.69. ЧВК 121453. PMID 9418854.
Ян СС, Орнатский О.И., Макдермотт Дж. К., Круз Т.Ф., Проди Калифорния (1998). «Взаимодействие фактора усиления миоцитов 2 (MEF2) с митоген-активируемой протеинкиназой ERK5 / BMK1». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (20): 4771–7. Дои:10.1093 / nar / 26.20.4771. ЧВК 147902. PMID 9753748.
Чжао М, Нью Л., Кравченко В.В., Като Ю., Грам Х, ди Падова Ф., Олсон Э. Н., Улевич Р. Дж., Хан Дж. (1999). "Регулирование семейства транскрипционных факторов MEF2 с помощью p38". Мол. Cell. Биол. 19 (1): 21–30. Дои:10.1128 / mcb.19.1.21. ЧВК 83862. PMID 9858528.
Ян Ш., Галанис А., Шаррокс А. Д. (1999). «Направление митоген-активированных протеинкиназ p38 на факторы транскрипции MEF2». Мол. Cell. Биол. 19 (6): 4028–38. Дои:10.1128 / mcb.19.6.4028. ЧВК 104362. PMID 10330143.
Иида К., Хидака К., Такеучи М., Накаяма М., Ютани С., Мукаи Т., Морисаки Т. (1999). «Экспрессия генов MEF2 во время сердечного развития человека». Tohoku J. Exp. Med. 187 (1): 15–23. Дои:10.1620 / tjem.187.15. PMID 10458488.
Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (1999). «Деацетилаза HDAC4 связывает и репрессирует фактор транскрипции MEF2». EMBO J. 18 (18): 5099–107. Дои:10.1093 / emboj / 18.18.5099. ЧВК 1171580. PMID 10487761.
Мао З, Бонни А., Ся Ф, Надаль-Висенс М., Гринберг М.Э. (1999). «Выживание клеток, зависящее от нейрональной активности, опосредованное фактором транскрипции MEF2». Наука. 286 (5440): 785–90. Дои:10.1126 / science.286.5440.785. PMID 10531066.
Лу Дж., МакКинси Т.А., Никол Р.Л., Олсон Э.Н. (2000). «Сигнально-зависимая активация фактора транскрипции MEF2 путем диссоциации от гистондеацетилаз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (8): 4070–5. Bibcode:2000PNAS ... 97.4070L. Дои:10.1073 / pnas.080064097. ЧВК 18151. PMID 10737771.
Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (2000). «гистондеацетилаза mHDA1 / HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее» (PDF). J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. Дои:10.1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098. S2CID 39220205.
Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (2000). «Кальций регулирует репрессию транскрипции фактора усиления миоцитов 2 гистондеацетилазой 4». J. Biol. Chem. 275 (29): 22563–7. Дои:10.1074 / jbc.C000304200. PMID 10825153.

внешние ссылки

FactorBook MEF2A

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000068305 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030557 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1516833-5] Yu YT, Breitbart RE, Smoot LB, Lee Y, Mahdavi V, Nadal-Ginard B (октябрь 1992 г.). «Человеческий миоцит-специфический фактор-энхансер 2 включает группу ограниченных тканью факторов транскрипции MADS-бокса». Genes Dev. 6 (9): 1783–98. Дои:10.1101 / gad.6.9.1783. PMID 1516833.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: фактор 2 усилителя транскрипции MADS-бокса MEF2A, полипептид А (фактор 2А усилителя миоцитов)».

[pmid8662987-7] Мао З., Надаль-Жинар Б. (июнь 1996 г.). «Функциональные и физические взаимодействия между гомологом 1 achaete-scute млекопитающих и фактором усиления миоцитов 2A». J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. Дои:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.

[pmid12371907-8] а ^б Де Лука А., Северино А., Де Паолис П., Коттон Дж., Де Лука Л., Де Фалько М., Порселлини А., Вольпе М., Кондорелли Дж. (Февраль 2003 г.). «p300 / cAMP-ответный элемент-связывающий-белок ('CREB') - связывающий белок (CBP) модулирует взаимодействие между фактором усиления миоцитов 2A (MEF2A) и рецептором тироидного гормона-ретиноидным X рецептором». Biochem. J. 369 (Pt 3): 477–84. Дои:10.1042 / BJ20020057. ЧВК 1223100. PMID 12371907.

[pmid10487761-9] а ^б Миска Е.А., Карлссон С., Лэнгли Е., Нильсен С.Дж., Пайнс Дж., Кузаридес Т. (сентябрь 1999 г.). «Деацетилаза HDAC4 связывает и репрессирует фактор транскрипции MEF2». EMBO J. 18 (18): 5099–107. Дои:10.1093 / emboj / 18.18.5099. ЧВК 1171580. PMID 10487761.

[pmid10748098-10] а ^б ^c Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (май 2000 г.). «гистондеацетилаза mHDA1 / HDAC5 взаимодействует с транскрипционной активностью MEF2A и подавляет ее». J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. Дои:10.1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.

[pmid9858528-11] Чжао М., Нью Л., Кравченко В. В., Като Ю., Грам Х, ди Падова Ф., Олсон Е. Н., Улевич Р. Дж., Хан Дж. (Январь 1999 г.). «Регулирование семейства транскрипционных факторов MEF2 с помощью p38». Мол. Cell. Биол. 19 (1): 21–30. Дои:10.1128 / mcb.19.1.21. ЧВК 83862. PMID 9858528.

[pmid10330143-12] Ян Ш., Галанис А., Шаррокс А. Д. (июнь 1999 г.). «Нацеливание митоген-активированных протеинкиназ p38 на факторы транскрипции MEF2». Мол. Cell. Биол. 19 (6): 4028–38. Дои:10.1128 / mcb.19.6.4028. ЧВК 104362. PMID 10330143.

[pmid8798771-13] Орнатский О.И., Макдермотт Дж.С. (октябрь 1996 г.). «Экспрессия белка MEF2, специфичность связывания ДНК и сложный состав, а также транскрипционная активность в мышечных и немышечных клетках». J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.

[pmid11160896-14] Куинн З.А., Ян СС, Врана Дж. Л., Макдермотт Дж. С. (февраль 2001 г.). «Белки Smad действуют как комодуляторы для белков, регулирующих транскрипцию MEF2». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (3): 732–42. Дои:10.1093 / nar / 29.3.732. ЧВК 30396. PMID 11160896.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]