Рецептор ретиноевой кислоты бета - Retinoic acid receptor beta

RARB
Протеин RARB PDB 1dsz.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRARB, HAP, MCOPS12, NR1B2, RRB2, RARbeta1, бета-рецептор ретиноевой кислоты
Внешние идентификаторыOMIM: 180220 MGI: 97857 ГомолоГен: 68100 Генные карты: RARB
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение RARB
Геномное расположение RARB
Группа3п24.2Начинать25,174,332 бп[1]
Конец25,597,932 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RARB 205080 в формате fs.png

PBB GE RARB 208412 s в формате fs.png

PBB GE RARB 208530 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5915

218772

Ансамбль

ENSG00000077092

ENSMUSG00000017491

UniProt

P10826
Q5QHG3

P22605

RefSeq (мРНК)

NM_001289760
NM_001289761
NM_001289762
NM_011243

RefSeq (белок)

NP_001276689
NP_001276690
NP_001276691
NP_035373

Расположение (UCSC)Chr 3: 25,17 - 25,6 МбChr 14: 16.43 - 16.82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Рецептор ретиноевой кислоты бета (RAR-бета), также известный как NR1B2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа B, член 2) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется RARB ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует рецептор бета-ретиноевой кислоты, член суперсемейства рецепторов тироидных стероидных гормонов ядерных регуляторов транскрипции. Этот рецептор находится в цитоплазме и субядерных компартментах. Он связывает ретиноевую кислоту, биологически активную форму витамин А который опосредует клеточную передачу сигналов в эмбриональном морфогенезе, росте и дифференцировке клеток. Считается, что этот белок ограничивает рост многих типов клеток, регулируя экспрессию генов. Ген был впервые идентифицирован в гепатоцеллюлярной карциноме, где он фланкирует гепатит Б сайт интеграции вирусов. Нарушение регуляции этого гена также было обнаружено в матке. рак шейки матки предопухолевые поражения.[7] Ген экспрессирует по крайней мере два варианта транскрипта; была описана еще одна транскрипция, но ее полная длина не была определена.[5]

Эпигенетика

Аберрантный промотор бета-рецептора ретиноевой кислоты Гиперметилирование ДНК наблюдалось, связанное с началом / прогрессированием рака. Действительно, это неправильное эпигенетический явление наблюдалось у женщин, пострадавших от Плоскоклеточный рак вульвы возник из склеротический вульверный лишай.[8] Метилирование бета-промотора рецептора ретиноевой кислоты может быть маркером риска рака у пациентов, страдающих этим заболеванием.[8]

Взаимодействия

Бета-рецептор ретиноевой кислоты взаимодействовать с NR4A2.[9]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077092 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017491 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: рецептор ретиноевой кислоты RARB, бета».
  6. ^ Маттей М.Г., де Те Х., Маттей Дж. Ф., Маркио А., Тиолле П., Дежан А. (октябрь 1988 г.). «Отнесение гена RAR бета рецептора ретиноевой кислоты человека hap к полосе p24 хромосомы 3». Генетика человека. 80 (2): 189–90. Дои:10.1007 / BF00702867. PMID  2844650. S2CID  23090420.
  7. ^ Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID  25205602. S2CID  24986454.
  8. ^ а б Rotondo JC, Borghi A, Selvatici R, Mazzoni E, Bononi I, Corazza M, Kussini J, Montinari E, Gafà R, Tognon M, Martini F (2018). «Ассоциация гена рецептора ретиноевой кислоты β с началом и прогрессированием плоскоклеточной карциномы вульвы, связанной со склеротическим лишаем». JAMA Дерматология. 154 (7): 819–823. Дои:10.1001 / jamadermatol.2018.1373. ЧВК  6128494. PMID  29898214.
  9. ^ Перлманн Т., Янссон Л. (апрель 1995 г.). «Новый путь передачи сигналов витамина А, опосредованный гетеродимеризацией RXR с NGFI-B и NURR1». Гены и развитие. 9 (7): 769–82. Дои:10.1101 / gad.9.7.769. PMID  7705655.

дальнейшее чтение

  • Dejean A, de Thé H (июнь 1990 г.). «Вирус гепатита B как инсерционный мутаген в гепатоцеллюлярной карциноме человека». Молекулярная биология и медицина. 7 (3): 213–22. PMID  2170809.
  • Sun SY (январь 2004 г.). «Бета-рецептор ретиноевой кислоты и рак толстой кишки». Биология и терапия рака. 3 (1): 87–8. Дои:10.4161 / cbt.3.1.686. PMID  14726690.
  • Саба Н., Джайн С., Хури Ф. (2004). «Химиопрофилактика рака легких». Текущие проблемы при раке. 28 (5): 287–306. Дои:10.1016 / j.currproblcancer.2004.05.005. PMID  15375805.
  • Klein O, Grignon Y, Civit T, Auque J, Marchal JC (сентябрь 2005 г.). «[Статус метилирования промотора гена RARbeta в глиоме головного мозга низкой и высокой степени злокачественности. Сравнение с нормальной тканью. Иммуно-гистохимическое исследование ядерной экспрессии RARbeta в клетках глиомы головного мозга низкой и высокой степени злокачественности. Сравнение с нормальными клетками. 48 опухолей]». Нейро-Хирургия. 51 (3–4, часть 1): 147–54. Дои:10.1016 / S0028-3770 (05) 83470-8. PMID  16389900.
  • Katahira M, Knegtel RM, Boelens R, Eib D, Schilthuis JG, van der Saag PT, Kaptein R (июль 1992 г.). «Гомо- и гетероядерные ЯМР-исследования ДНК-связывающего домена бета рецептора ретиноевой кислоты человека: последовательное отнесение и идентификация элементов вторичной структуры». Биохимия. 31 (28): 6474–80. Дои:10.1021 / bi00143a017. PMID  1321662.
  • Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора тироидного гормона, рецептора ретиноевой кислоты, ретиноидного рецептора X, фактора транскрипции вышестоящего промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени». Молекулярная эндокринология. 6 (9): 1468–78. Дои:10.1210 / me.6.9.1468. PMID  1331778.
  • ван дер Лиде Б.Дж., Folkers GE, Kruyt FA, van der Saag PT (октябрь 1992 г.). «Геномная организация человеческого рецептора бета 2 ретиноевой кислоты». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 188 (2): 695–702. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 91112-4. PMID  1332705.
  • Прентис А., Мэтьюз К.Дж., Томас Э.Дж., Редферн С.П. (май 1992 г.). «Экспрессия рецепторов ретиноевой кислоты в культивируемых стромальных клетках эндометрия человека и эффекты ретиноевой кислоты». Репродукция человека. 7 (5): 692–700. Дои:10.1093 / oxfordjournals.humrep.a137721. PMID  1379266.
  • Шен С., Крюйт Ф.А., ден Хертог Дж., Ван дер Сааг П. Т., Круиджер В. (1992). «Промоторы бета 2 рецепторов ретиноевой кислоты человека и мыши: сравнение последовательностей и локализация чувствительности к ретиноевой кислоте». Последовательность ДНК. 2 (2): 111–9. Дои:10.3109/10425179109039679. PMID  1663808.
  • de Thé H, Vivanco-Ruiz MM, Tiollais P, Stunnenberg H, Dejean A (январь 1990 г.). «Идентификация элемента, чувствительного к ретиноевой кислоте в бета-гене рецептора ретиноевой кислоты». Природа. 343 (6254): 177–80. Bibcode:1990Натура.343..177D. Дои:10.1038 / 343177a0. PMID  2153268. S2CID  4314508.
  • Hoffmann B, Lehmann JM, Zhang XK, Hermann T., Husmann M, Graupner G, Pfahl M (ноябрь 1990 г.). «Элемент, специфичный для рецептора ретиноевой кислоты, контролирует промотор рецептора бета-ретиноевой кислоты». Молекулярная эндокринология. 4 (11): 1727–36. Дои:10.1210 / mend-4-11-1727. PMID  2177841.
  • de Thé H, Marchio A, Tiollais P, Dejean A (1988). «Новый ген, связанный с рецептором стероидного гормона щитовидной железы, неправильно экспрессируется в гепатоцеллюлярной карциноме человека». Природа. 330 (6149): 667–70. Дои:10.1038 / 330667a0. PMID  2825037. S2CID  4327614.
  • Brand N, Petkovich M, Krust A, Chambon P, de Thé H, Marchio A, Tiollais P, Dejean A (апрель 1988 г.). «Идентификация второго рецептора ретиноевой кислоты человека». Природа. 332 (6167): 850–3. Bibcode:1988Натура.332..850Б. Дои:10.1038 / 332850a0. PMID  2833708. S2CID  4349193.
  • Бенбрук Д., Лернхардт Э., Пфаль М. (июнь 1988 г.). «Новый рецептор ретиноевой кислоты, идентифицированный из гепатоцеллюлярной карциномы». Природа. 333 (6174): 669–72. Bibcode:1988Натура.333..669Б. Дои:10.1038 / 333669a0. PMID  2836738. S2CID  4313063.
  • Дежан А., Бугелере Л., Гжешик К. Х., Тиолле П. (1986). «Интеграция ДНК вируса гепатита B в последовательность, гомологичную генам v-erb-A и стероидным рецепторам в гепатоцеллюлярной карциноме». Природа. 322 (6074): 70–2. Bibcode:1986Натура.322 ... 70Д. Дои:10.1038 / 322070a0. PMID  3014347. S2CID  4355348.
  • Si SP, Tsou HC, Lee X, Peacocke M (июль 1995 г.). «Влияние клеточного старения и ретиноевой кислоты на экспрессию клеточных белков, связывающих ретиноевую кислоту в фибробластах кожи». Экспериментальные исследования клеток. 219 (1): 243–8. Дои:10.1006 / excr.1995.1224. PMID  7628539.
  • Хоул Б., Пеллетье М., Ву Дж., Гудьер К., Брэдли В.Е. (январь 1994 г.). «Фетальная изоформа человеческого рецептора ретиноевой кислоты бета, экспрессируемая в линиях мелкоклеточного рака легких». Исследования рака. 54 (2): 365–9. PMID  8275470.
  • Knegtel RM, Katahira M, Schilthuis JG, Bonvin AM, Boelens R, Eib D, van der Saag PT, Kaptein R (январь 1993 г.). «Структура раствора ДНК-связывающего домена рецептора бета-рецептора ретиноевой кислоты человека». Журнал биомолекулярного ЯМР. 3 (1): 1–17. Дои:10.1007 / BF00242472. PMID  8383553. S2CID  24063437.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.