HOXC6 - HOXC6

HOXC6
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXC6, CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, гомеобокс C6
Внешние идентификаторы	OMIM: 142972 MGI: 96197 ГомолоГен: 19533 Генные карты: HOXC6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	54,030,823 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	103,011,881 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • спецификация переднего / заднего рисунка; • развитие эмбриональной скелетной системы; • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты; • развитие многоклеточного организма; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3223
	15425
	ENSG00000197757
	ENSMUSG00000001661
	P09630
	P10629
	NM_153693; NM_004503
	NM_010465
	NP_004494; NP_710160
	NP_034595
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин Hox-C6 это белок что у людей кодируется HOXC6 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству гомеобоксов, члены которого кодируют высококонсервативное семейство факторов транскрипции, которые играют важную роль в морфогенезе у всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя схожими кластерами генов гомеобокса, HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9-11 генов, расположенных тандемно. Этот ген, HOXC6, является одним из нескольких генов HOXC, расположенных в кластере на хромосоме 12. Три гена, HOXC5, HOXC4 и HOXC6, имеют общий 5'-некодирующий экзон. Транскрипты могут включать общий экзон, сплайсированный с ген-специфическими экзонами, или они могут включать только ген-специфичные экзоны. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, были идентифицированы для HOXC6. Второй вариант транскрипта включает общий экзон, а первый вариант транскрипта включает только ген-специфичные экзоны.^[7]

Смотрите также

Homeobox

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197757 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001661 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.
^ Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^а ^б "Entrez Gene: HOXC6 гомеобокс C6".

дальнейшее чтение

Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (24): 10385–402. Дои:10.1093 / nar / 17.24.10385. ЧВК 335308. PMID 2574852.
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1990). «Организация генов гомеобокса класса I человека». Геном. 31 (2): 745–56. Дои:10.1139 / g89-133. PMID 2576652.
Рабин М., Фергюсон-Смит А., Харт С. П., Раддл Ф. Х. (декабрь 1986 г.). «Познайте локусы гомео-бокса, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (23): 9104–8. Bibcode:1986PNAS ... 83.9104R. Дои:10.1073 / пнас.83.23.9104. ЧВК 387083. PMID 2878432.
Симеоне А., Мавилио Ф, Акампора Д., Джампаоло А., Файелла А., Заппавинья В., Д'Эспозито М., Паннесе М., Руссо Дж., Бончинелли Е. (июль 1987 г.). «Два гомеобокса человека, c1 и c8: анализ структуры и экспрессия в эмбриональном развитии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (14): 4914–8. Bibcode:1987PNAS ... 84.4914S. Дои:10.1073 / pnas.84.14.4914. ЧВК 305217. PMID 2885844.
Симеоне А., Паннесе М., Акампора Д., Д'Эспозито М., Бончинелли Е. (июнь 1988 г.). «По крайней мере, три гомеобокса человека на хромосоме 12 принадлежат одной транскрипционной единице». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (12): 5379–90. Дои:10.1093 / nar / 16.12.5379. ЧВК 336773. PMID 2898768.
Corsetti MT, Levi G, Lancia F, Sanseverino L, Ferrini S, Boncinelli E, Corte G (январь 1995 г.). «Ядрышковая локализация трех гомеопротеинов Hox». Журнал клеточной науки. 108 (Pt 1) (1): 187–93. PMID 7738096.
Апиу Ф, Флагиелло Д., Силло С., Малфой Б., Поупон М. Ф., Датрилло Б. (1996). «Тонкое картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (1–2): 114–5. Дои:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Колесница A, Кастроново V, Ле П, Жилле С., Собель М.Э., Гилен Дж. (Октябрь 1996 г.). «Клонирование и экспрессия нового транскрипта HOXC6, кодирующего репрессирующий белок». Биохимический журнал. 319 (Pt 1) (1): 91–7. Дои:10.1042 / bj3190091. ЧВК 1217739. PMID 8870653.
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёсихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология. 65 (2): 50–62. Дои:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Рамачандран С., Лю П., Янг А. Н., Инь-Гоен К., Лим С. Д., Лэйкок Н., Амин МБ, Карни Дж. К., Маршалл Ф. Ф., Петрос Дж. А., Морено К. С. (январь 2005 г.). «Потеря экспрессии HOXC6 вызывает апоптоз в клетках рака простаты». Онкоген. 24 (1): 188–98. Дои:10.1038 / sj.onc.1207906. PMID 15637592.
Хори И, Гу Икс, Се Икс, Ким С.К. (апрель 2005 г.). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток от клеток-предшественников нейронов человека». PLOS Медицина. 2 (4): e103. Дои:10.1371 / journal.pmed.0020103. ЧВК 1087208. PMID 15839736.
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
Чжан X, Хамада Дж., Нисимото А., Такахаши Ю., Мурай Т., Тада М., Мориучи Т. (2007). «HOXC6 и HOXC11 увеличивают транскрипцию гена S100beta в BrdU-индуцированной in vitro дифференцировке клеток нейробластомы GOTO в шванновские клетки». Журнал клеточной и молекулярной медицины. 11 (2): 299–306. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2007.00020.x. ЧВК 3822828. PMID 17488478.