Бета рецептора X печени - Liver X receptor beta

NR1H2
Белок NR1H2 PDB 1p8d.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNR1H2, LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, бета-рецептор X печени, ядерный рецептор подсемейства 1, группа H, член 2
Внешние идентификаторыOMIM: 600380 MGI: 1352463 ГомолоГен: 21397 Генные карты: NR1H2
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение NR1H2
Геномное расположение NR1H2
Группа19q13.33Начинать50,329,653 бп[1]
Конец50,383,388 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NR1H2 218215 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_007121
NM_001256647

NM_001285517
NM_001285518
NM_001285519
NM_009473

RefSeq (белок)

NP_001243576
NP_009052
NP_009052.3

NP_001272446
NP_001272447
NP_001272448
NP_033499

Расположение (UCSC)Chr 19: 50.33 - 50.38 МбChr 7: 44,55 - 44,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Бета рецептора X печени (LXR-β) является членом ядерный рецептор семья факторы транскрипции. LXR-β кодируется NR1H2 ген (ядерный рецептор подсемейства 1, группа H, член 2).[5]

Функция

В Х-рецепторы печени (LXR) первоначально были идентифицированы как сирота члены суперсемейства ядерных рецепторов, потому что их лиганды были неизвестны. Как и другие рецепторы в семействе, LXR гетеродимеризуются с рецептор ретиноида X и привязать к конкретным элементы ответа (LXRE), характеризующиеся прямыми повторами, разделенными 4 нуклеотидами. Два гена, альфа (LXRA ) и бета, как известно, кодируют белки LXR.[5][6]

Структура

Кристаллическая структура человеческого рецептора X β (LXRβ), образующего гетеродимер с его партнером ретиноидным рецептором X α (RXRα) на его родственном элементе, прямой повтор AGGTCA, расположенный на расстоянии 4 нуклеотидов, демонстрирует расширенное X-образное расположение с ДНК- и лигандом. связывающие домены пересекаются. Ядро LXRβ связывает ДНК посредством канонических контактов и вспомогательных контактов ДНК, которые усиливают сродство к элементу ответа.[7]

Взаимодействия

Бета Х-рецептора печени взаимодействовать с NCOA6[8] и Ретиноидный рецептор X альфа.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131408 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060601 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: ядерный рецептор NR1H2 подсемейства 1, группа H, член 2».
  6. ^ Song C, Hiipakka RA, Kokontis JM, Liao S (июнь 1995 г.). «Повсеместный рецептор: структуры, иммуноцитохимическая локализация и модуляция активации генов рецепторами ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 761 (2): 38–49. Bibcode:1995НЯСА.761 ... 38С. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1995.tb31367.x. PMID  7625741. S2CID  27208069.
  7. ^ Лу Х, Торессон Дж., Бенод С., Су Дж. Х., Филипс К. Дж., Уэбб П., Густафссон Дж. А. (март 2014 г.). «Структура гетеродимера ретиноидного рецептора X α-рецептора X печени β (RXRα-LXRβ) на ДНК». Структурная и молекулярная биология природы. 21 (3): 277–81. Дои:10.1038 / nsmb.2778. PMID  24561505. S2CID  23226682.
  8. ^ Ли С.К., Чон С.Ю., Ким И.С., На С.И., Ли Ю.С., Ли Дж.В. (февраль 2001 г.). «Два различных домена взаимодействия ядерных рецепторов и CREB-связывающий белок-зависимая трансактивационная функция активирующего сигнального коинтегратора-2». Молекулярная эндокринология. 15 (2): 241–54. Дои:10.1210 / me.15.2.241. PMID  11158331.
  9. ^ Соль В., Чой Х.С., Мур Д.Д. (январь 1995 г.). «Выделение белков, которые специфически взаимодействуют с ретиноидным рецептором X: два новых сиротских рецептора». Молекулярная эндокринология. 9 (1): 72–85. Дои:10.1210 / исправление.9.1.7760852. PMID  7760852.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.