Орфанный рецептор - Orphan receptor

В биохимия, сиротский рецептор представляет собой белок, который имеет структуру, аналогичную другим идентифицированным рецепторы но чей эндогенный лиганд еще не идентифицирован. Если позже будет обнаружен лиганд для сиротского рецептора, этот рецептор называют «принятым сиротой».[1] И наоборот, термин сиротский лиганд относится к биологическому лиганду, чей родственный рецептор еще не идентифицирован.

Примеры

Примеры орфанных рецепторов можно найти в Рецептор, связанный с G-белком (GPCR)[2][3][4] и ядерный рецептор[5][6][7] семьи.

Если обнаружен эндогенный лиганд, орфанный рецептор «усыновляется» или «де-орфанизируется».[8] Пример - ядерный рецептор Рецептор фарнезоида X (FXR) и GPCR TGR5 / GPCR19 / G рецептор желчных кислот, связанный с белком, оба из которых активируются желчные кислоты.[9] Принятые орфанные рецепторы в ядерный рецептор группа включает FXR, Х-рецептор печени (LXR) и рецептор, активируемый пролифератором пероксисом (PPAR). Другим примером орфанного рецепторного сайта является PCP сайт привязки в Рецептор NMDA,[10] тип лиганд-управляемый ионный канал. Это место, где работает рекреационный препарат PCP, но не известно, что эндогенный лиганд связывается с этим сайтом.

Рецепторам-сиротам GPCR обычно дают название "GPR", за которым следует номер, например GPR1. В семействе GPCR почти 100 генов, подобных рецепторам, остаются сиротами.[11]

Открытие

Исторически рецепторы были открыты с помощью лигандов, «ловящих» их рецепторы. Следовательно, по определению, эти рецепторы не были сиротами. Однако современные методы молекулярной биологии, такие как скрининг библиотеки кДНК и полногеномное секвенирование, рецепторы были идентифицированы на основе сходства последовательностей с известными рецепторами, без знания их лигандов.

Рекомендации

  1. ^ Нандури, Равикантх; Бутани, Иша; Сомаварапу, Арун Кумар; Махаджан, Сахил; Паркеш, Раман; Гупта, Паван (01.01.2015). «ONRLDB - вручную созданная база данных экспериментально подтвержденных лигандов для орфанных ядерных рецепторов: понимание новых открытий лекарств». База данных. 2015: bav112. Дои:10.1093 / база данных / bav112. ЧВК  4669993. PMID  26637529.
  2. ^ Левуа А., Дам Дж., Аюб М.А., Гийом Дж. Л., Джокерс Р. (2006). «Обладают ли орфанные рецепторы, связанные с G-белком, лиганд-независимыми функциями? Новые идеи гетеродимеров рецепторов». EMBO Rep. 7 (11): 1094–8. Дои:10.1038 / sj.embor.7400838. ЧВК  1679777. PMID  17077864.
  3. ^ Civelli O, Сайто Y, Wang Z, Nothacker HP, Reinscheid RK (2006). «Орфанные GPCR и их лиганды». Pharmacol Ther. 110 (3): 525–32. Дои:10.1016 / j.pharmthera.2005.10.001. PMID  16289308.
  4. ^ Мудрый А., Юп С.К., Рис С. (2004). «Идентификация лигандов на рецепторах, связанных с G-белками-сиротами». Анну Рев Фармакол Токсикол. 44 (Февраль): 43–66. Дои:10.1146 / annurev.pharmtox.44.101802.121419. PMID  14744238.
  5. ^ Жигер V (октябрь 1999 г.). «Орфанные ядерные рецепторы: от гена к функции». Endocr. Rev. 20 (5): 689–725. Дои:10.1210 / эр.20.5.689. PMID  10529899.
  6. ^ Бенуа Дж., Куни А., Жигер В., Ингрэм Х., Лазар М., Мускат Дж., Перлманн Т., Рено Дж. П., Швабе Дж., Сладек Ф., Цай М. Дж., Лауде В. (2006). "Международный союз фармакологии. LXVI. Орфанные ядерные рецепторы". Pharmacol Rev. 58 (4): 798–836. Дои:10.1124 / пр.58.4.10. PMID  17132856.
  7. ^ Ши И (июнь 2007 г.). «Орфанные ядерные рецепторы в открытии лекарств». Drug Discov. Сегодня. 12 (11–12): 440–5. Дои:10.1016 / j.drudis.2007.04.006. ЧВК  2748783. PMID  17532527.
  8. ^ SHI, Y (2007). «Орфанные ядерные рецепторы в открытии лекарств». Открытие наркотиков сегодня. 12 (11–12): 440–445. Дои:10.1016 / j.drudis.2007.04.006. ЧВК  2748783. PMID  17532527.
  9. ^ Mi LZ, Devarakonda S, Harp JM, Han Q, Pellicciari R, Willson TM, Khorasanizadeh S, Rastinejad F (апрель 2003 г.). «Структурная основа связывания желчных кислот и активации ядерного рецептора FXR». Мол. Клетка. 11 (4): 1093–100. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00112-6. PMID  12718893.
  10. ^ Fagg GE (май 1987 г.). «Фенциклидин и родственные ему препараты связываются с активированным комплексом рецептор-канал N-метил-D-аспартата в мембранах мозга крысы». Neurosci. Латыш. 76 (2): 221–7. Дои:10.1016/0304-3940(87)90719-1. PMID  2438606.
  11. ^ Laschet, C; Dupuis, N; Хэнсон, Дж (2018). «Пейзаж деорфанизации рецепторов, связанных с G-белками». Биохимическая фармакология. 153: 62–74. Дои:10.1016 / j.bcp.2018.02.016. PMID  29454621.

внешняя ссылка

  • «Сироты класса А». Руководство IUPHAR / BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ. Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
  • «GPCR класса адгезии». Руководство IUPHAR / BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ. Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
  • «Сироты класса C GPCR». Руководство IUPHAR / BPS по базе данных ФАРМАКОЛОГИИ. Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.