OPN3 - Википедия - OPN3

OPN3
Идентификаторы
ПсевдонимыOPN3, ECPN, PPP1R116, опсин 3
Внешние идентификаторыOMIM: 606695 MGI: 1338022 ГомолоГен: 40707 Генные карты: OPN3
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение OPN3
Геномное расположение OPN3
Группа1q43Начинать241,590,102 бп[1]
Конец241,677,376 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE OPN3 219032 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23596

13603

Ансамбль

ENSG00000054277

ENSMUSG00000026525

UniProt

Q9H1Y3

Q9WUK7

RefSeq (мРНК)

NM_014322
NM_001030011
NM_001030012
NM_001381855
NM_001381856

NM_010098

RefSeq (белок)

NP_055137
NP_001368784
NP_001368785

NP_034228

Расположение (UCSC)Chr 1: 241.59 - 241.68 МбChr 1: 175.66 - 175.69 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Опсин-3 также известный как энцефалопсин или же панопсин[5] это белок что у людей кодируется OPN3 ген.[6][7][8] Альтернативная сварка этого гена приводит к множественным стенограмма варианты кодирования разные изоформы белка.[9]

Функция

Опсины являются членами Рецептор, связанный с G-белком надсемейство. Помимо зрительных опсинов, млекопитающие обладают несколькими светочувствительный невизуальные опсины, которые экспрессируются в тканях за пределами глаза. Ген опсина-3 сильно экспрессируется в головном мозге и яичко и слабо выражен в печени, плацента, сердце, легкие, скелетные мышцы, почка, и поджелудочная железа. Ген выражен в коже[9] а также может быть выражено в сетчатка. Белок имеет канонические характеристики фоторецептивного белка опсина,[8] однако в коже человека OPN3 не является светочувствительным и действует как негативный регулятор меланогенез.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000054277 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026525 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Коянаги М., Такада Е., Нагата Т., Цукамото Х., Теракита А. (март 2013 г.). «Гомологи Opn3 позвоночных потенциально могут служить датчиком света в нефоторецептивной ткани». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (13): 4998–5003. Дои:10.1073 / pnas.1219416110. ЧВК  3612648. PMID  23479626.
  6. ^ Блэкшоу С., Снайдер С.Х. (май 1999 г.). «Энцефалопсин: новый экстраретинальный опсин млекопитающих, дискретно локализованный в головном мозге». Журнал неврологии. 19 (10): 3681–90. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-10-03681.1999. ЧВК  6782724. PMID  10234000.
  7. ^ Halford S, Freedman MS, Bellingham J, Inglis SL, Poopalasundaram S, Soni BG, Foster RG, Hunt DM (март 2001 г.). «Характеристика нового гена опсина человека с широкой тканевой экспрессией и идентификация встроенных и фланкирующих генов на хромосоме 1q43». Геномика. 72 (2): 203–8. Дои:10.1006 / geno.2001.6469. PMID  11401433.
  8. ^ а б «Энтрез Ген: OPN3 опсин 3 (энцефалопсин, панопсин)».
  9. ^ а б Haltaufderhyde K, Ozdeslik RN, Wicks NL, Najera JA, Oancea E (январь 2015 г.). «Экспрессия опсина в эпидермальной коже человека». Фотохимия и фотобиология. 91 (1): 117–23. Дои:10.1111 / php.12354. ЧВК  4303996. PMID  25267311.
  10. ^ Олински, Лин, Оанча, Лорен Э, Эрика М., Елена (январь 2020 г.). «Прозрачное понимание функции опсина 3 в коже». Достижения в биологической регуляции. 75: 100668. Дои:10.1016 / j.jbior.2019.100668. ЧВК  7059126. PMID  31653550. Получено 26 мая 2020.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)

дальнейшее чтение

  • Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
  • Хэлфорд С., Беллингхэм Дж., Окака Л., Фокс М., Джонсон С., Фостер Р. Г., Хант Д. М. (2002). «Отнесение панопсина (OPN3) к полосе хромосомы человека 1q43 путем гибридизации in situ и гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика. 95 (3–4): 234–5. Дои:10.1159/000059351. PMID  12063405. S2CID  24099335.
  • Kasper G, Taudien S, Staub E, Mennerich D, Rieder M, Hinzmann B., Dahl E, Schwidetzky U, Rosenthal A, Rump A (июль 2002 г.). «Различная структурная организация гена энцефалопсина у человека и мыши». Ген. 295 (1): 27–32. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00799-0. PMID  12242008.
  • Алам Н.А., Горман П., Джегер Е.Е., Келселл Д., Ли И.М., Ратнавел Р., Мердок М.Э., Хоулстон Р.С., Аалтонен Л.А., Ройланс Р.Р., Томлинсон И.П. (декабрь 2003 г.). «Деления зародышевой линии EXO1 не вызывают колоректальных опухолей, и поражения, которые являются нулевыми для EXO1, не имеют микросателлитной нестабильности». Генетика и цитогенетика рака. 147 (2): 121–7. Дои:10.1016 / S0165-4608 (03) 00196-1. PMID  14623461.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.