TAS2R1 - TAS2R1
Вкусовой рецептор типа 2, член 1 (TAS2R1 / T2R1) это белок что у людей кодируется TAS2R1 ген.[5][6][7] Он принадлежит к Рецептор, связанный с G-белком (GPCR) и относится к класс А -подобные GPCR, они содержат 7 пучков трансмембранных спиралей и короткую петлю на N-конце.[8] Кроме того, TAS2R1 является членом 25 известных рецепторов горького вкуса человека, которые позволяют восприятие горького вкуса в ротовой полости. Все больше данных указывает на функциональную роль TAS2R в экстраоральных тканях.[9]
Выражение и функция
Внеротовые роли TAS2R
Рецепторы горького вкуса выражаются в вкусовые рецепторные клетки, который организован в вкусовые рецепторы на сосочках язык и эпителий неба.
Кроме того, было обнаружено, что TAS2R экспрессируются в экстраоральных тканях, например. мозг, легкие, желудочно-кишечный тракт и др.[9] Однако пока об их функциях известно меньше, например, было показано, что:
- TAS2R опосредуют расслабление гладких мышц дыхательных путей.[10]
- TAS2R43 участвует в секреции желудочного сока в желудке.[11]
Внеротовые роли TAS2R1
- Было обнаружено, что TAS2R1, TAS2R4, TAS2R10, TAS2R38 и TAS2R49 подавляются в рак молочной железы клетки[12].
- TAS2R1, вызывает вазоконстрикторные реакции в легочный контур и расслабление в дыхательных путях[13].
Структура рецептора TAS2R1
На основе недавнего модель гомологии из BitterDB[14][15] несколько консервированных мотивы, которые являются аналогами GPCR класса A[8] были найдены:
- Трансмембранная спираль 1: N1.50xxI1.53
- Трансмембранная спираль 2: L2.46xxxR2.50
- Трансмембранная спираль 3: F3.49Y3.50xxK3.53
- Трансмембранная спираль 5: P5.50
- Трансмембранная спираль 6: F6.44xxxY6.46
- Трансмембранная спираль 7: H7.49S7.50xxL7.53
Нумерация по шкале Баллероса-Вайнштейна.[16] система.
В отличие от GPCR класса A, в трансмембранной спирали 4 нет DRY[17] был найден мотив, а позиция 6.50 не консервативна.
TAS2R1 ген
Этот ген кодирует члена семьи кандидата вкусовые рецепторы которые являются членами Рецептор, связанный с G-белком надсемейством, которые специфически экспрессируются вкусовыми рецепторными клетками эпителия языка и неба. Этот ген безинтронного вкусового рецептора кодирует 7-трансмембранный рецепторный белок, функционирующий как рецептор горького вкуса.
SNP
В T2R1 два SNP известны в R111H и R206W (dbSNP ).
Факторы транскрипции
Пока что AML1a, AP-1, AREB6, FOXL1, IRF-7A, Lmo2, NF-E2, NF-E2 p45 были обнаружены как верхние фактор транскрипции сайты связывания QIAGEN в TAS2R1 промотор гена.
Мутагенез данные
Несколько мутации было показано, что они влияют на связывание лиганда с TAS2R1 (на основе BitterDB ):
Рецепторная область | Номер BW | Остаток | Ссылка |
TM1 | 1.5 | N24 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM1 | 1.53 | I27 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM2 | 2.5 | R55 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM2 | 2.56 | F61 | DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM2 | 2.61 | N66 | doi: 10.3389 / fmolb.2017.00063 doi: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
ECL1 | E74 | DOI: 10.3389 / fmolb.2017.00063 | |
TM3 | 3.32 | L85 | DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141 |
TM3 | 3.33 | L86 | DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141 |
TM3 | 3.36 | N89 | doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983 doi: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM3 | 3.37 | E90 | DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141 |
TM3 | 3.41 | W94 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM3 | 3.46 | L99 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM5 | 5.46 | E182 | DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141 |
TM5 | 5.61 | L197 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM5 | 5.64 | S200 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM5 | 5.65 | L201 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM7 | 7.39 | I263 | DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141 |
TM7 | 7.49 | H273 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM7 | 7.53 | L277 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
TM7 | 7.54 | I278 | DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983 |
Лиганды
К настоящему времени идентифицировано 39 лигандов для T2R1 в BitterDB, среди них L-аминокислоты, пептиды, гумулоны, небольшие молекулы и т. д.[18]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169777 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045267 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Адлер Э., Хун М.А., Мюллер К.Л., Чандрашекар Дж., Рыба Н.Дж., Цукер С.С. (апрель 2000 г.). «Новое семейство вкусовых рецепторов млекопитающих». Клетка. 100 (6): 693–702. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80705-9. PMID 10761934. S2CID 14604586.
- ^ Matsunami H, Montmayeur JP, Buck LB (апрель 2000 г.). «Семейство кандидатов на вкусовые рецепторы человека и мыши». Природа. 404 (6778): 601–4. Bibcode:2000Натура.404..601М. Дои:10.1038/35007072. PMID 10766242. S2CID 4336913.
- ^ «Ген Entrez: вкусовой рецептор TAS2R1, тип 2, член 1».
- ^ а б Ди Пицио, Антонелла; Левит, Анат; Слуцки, Михал; Беренс, Майк; Караман, Рафик; Нив, Маша Ю. (2016), «Сравнение GPCR класса A с рецепторами горького вкуса», Методы клеточной биологии, Эльзевьер, 132: 401–427, Дои:10.1016 / bs.mcb.2015.10.005, ISBN 9780128035955, PMID 26928553
- ^ а б Лу, Пинг; Чжан, Ченг-Хай; Лифшиц, Лоуренс М .; ЧжуГэ, Жунхуа (04.01.2017). «Внеротовые рецепторы горечи в здоровье и болезни». Журнал общей физиологии. 149 (2): 181–197. Дои:10.1085 / jgp.201611637. ISSN 0022-1295. ЧВК 5299619. PMID 28053191.
- ^ Дешпанде, Дипак А; Ван, Уэйн С. Х .; Макилмойл, Элизабет Л; Робинетт, Кэтрин С; Шиллингер, Рэйчел М; Ан, Стивен С; Шам, Джеймс С. К.; Лиггетт, Стивен Б. (24.10.2010). «Рецепторы горького вкуса бронходилата гладкой мускулатуры дыхательных путей посредством локальной передачи сигналов кальция и обратной обструкции». Природа Медицина. 16 (11): 1299–1304. Дои:10,1038 / нм 2237. ISSN 1078-8956. ЧВК 3066567. PMID 20972434.
- ^ Лист, Катрин Ингрид; Лей, Якоб Питер; Лидер, Барбара; Беренс, Майк; Стёгер, Верена; Райнер, Анжелика; Хохкоглер, Кристина Мария; Кёк, Эльке; Марчиори, Алессандро (10.07.2017). «Кофеин вызывает секрецию желудочного сока посредством передачи сигналов горького вкуса в париетальных клетках желудка». Труды Национальной академии наук. 114 (30): E6260 – E6269. Дои:10.1073 / pnas.1703728114. ISSN 0027-8424. ЧВК 5544304. PMID 28696284.
- ^ Сингх, Ниша; Чакраборти, Раджа; Бхуллар, Раджиндер Пал; Челикани, Прашен (апрель 2014 г.). «Дифференциальная экспрессия рецепторов горького вкуса в доброкачественных эпителиальных клетках груди и раковых клетках груди». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 446 (2): 499–503. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.02.140. ISSN 0006-291X. PMID 24613843.
- ^ Упадхьяя, Джасбир Д .; Сингх, Ниша; Sikarwar, Anurag S .; Чакраборти, Раджа; Pydi, Sai P .; Bhullar, Rajinder P .; Дакшинамурти, Шьямала; Челикани, Прашен (23.10.2014). «Активация рецепторов горького вкуса, опосредованная декстрометорфаном в легочном контуре, вызывает сужение сосудов». PLOS ONE. 9 (10): e110373. Bibcode:2014PLoSO ... 9k0373U. Дои:10.1371 / journal.pone.0110373. ISSN 1932-6203. ЧВК 4207743. PMID 25340739.
- ^ Винер, Аяна; Шудлер, Марина; Левит, Анат; Нив, Маша Ю. (22.09.2011). «BitterDB: база данных горьких соединений». Исследования нуклеиновых кислот. 40 (D1): D413 – D419. Дои:10.1093 / nar / gkr755. ISSN 1362-4962. ЧВК 3245057. PMID 21940398.
- ^ Даган-Винер, Аяна; Ди Пицио, Антонелла; Ниссим, Идо; Bahia, Malkeet S; Дубовский, Ницан; Маргулис, Эйтан; Нив, Маша Ю (2018-10-24). «BitterDB: база данных вкусовых лигандов и рецепторов в 2019 году». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (D1): D1179 – D1185. Дои:10.1093 / нар / gky974. ISSN 0305-1048. ЧВК 6323989. PMID 30357384.
- ^ Ballesteros, Juan A .; Weinstein, Harel (1995), «[19] Интегрированные методы построения трехмерных моделей и компьютерного исследования структурно-функциональных отношений в рецепторах, связанных с G-белком», Методы в неврологии, Elsevier, стр. 366–428, Дои:10.1016 / с1043-9471 (05) 80049-7, ISBN 9780121852955
- ^ Ровати, Г. Э .; Capra, V .; Нойбиг, Р. Р. (12 января 2007 г.). "Высококонсервативный DRY-мотив рецепторов, связанных с белком G: за пределами основного состояния". Молекулярная фармакология. 71 (4): 959–964. Дои:10.1124 / моль.106.029470. ISSN 0026-895X. PMID 17192495. S2CID 15536186.
- ^ «hTAS2R1». BitterDB. Еврейский университет Иерусалима.
дальнейшее чтение
- Kinnamon SC (2000). «Множество вкусовых рецепторов». Нейрон. 25 (3): 507–10. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81054-5. PMID 10774719.
- Маргольское РФ (2002). «Молекулярные механизмы передачи горького и сладкого вкуса». J. Biol. Chem. 277 (1): 1–4. Дои:10.1074 / jbc.R100054200. PMID 11696554.
- Montmayeur JP, Matsunami H (2002). «Рецепторы горького и сладкого вкуса». Curr. Мнение. Нейробиол. 12 (4): 366–71. Дои:10.1016 / S0959-4388 (02) 00345-8. PMID 12139982. S2CID 37807140.
- Чандрашекар Дж., Мюллер К.Л., Хун М.А., Адлер Э., Фенг Л., Гуо В., Цукер С.С., Рыба Нью-Джерси (2000). «T2R действуют как рецепторы горького вкуса». Клетка. 100 (6): 703–11. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80706-0. PMID 10761935. S2CID 7293493.
- Файрестейн С (2000). «Хороший вкус геномики». Природа. 404 (6778): 552–3. Дои:10.1038/35007167. PMID 10766221. S2CID 35741332.
- Чжан Й, Хун М.А., Чандрашекар Дж., Мюллер К.Л., Кук Б., Ву Д., Цукер С.С., Рыба Нью-Джерси (2003). «Кодирование сладкого, горького и умами вкусов: разные рецепторные клетки имеют сходные пути передачи сигналов». Клетка. 112 (3): 293–301. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00071-0. PMID 12581520. S2CID 718601.
- Фишер А., Гилад Ю., Ман О, Пэабо С. (2005). «Эволюция рецепторов горького вкуса у людей и обезьян». Мол. Биол. Evol. 22 (3): 432–6. Дои:10.1093 / molbev / msi027. PMID 15496549.
- Go Y, Satta Y, Takenaka O, Takahata N (2006). «Потеря функции генов рецепторов горького вкуса у людей и нечеловеческих приматов».. Генетика. 170 (1): 313–26. Дои:10.1534 / генетика.104.037523. ЧВК 1449719. PMID 15744053.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.