TAS2R1 - TAS2R1

TAS2R1
Идентификаторы
ПсевдонимыTAS2R1, T2R1, TRB7, рецептор вкуса 2, член 1
Внешние идентификаторыOMIM: 604796 MGI: 2681253 ГомолоГен: 10480 Генные карты: TAS2R1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение TAS2R1
Геномное расположение TAS2R1
Группа5п15.31Начинать9,628,997 бп[1]
Конец9,712,378 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TAS2R1 221324 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_019599

NM_020503

RefSeq (белок)

NP_062545

NP_065249

Расположение (UCSC)Chr 5: 9.63 - 9.71 МбChr 15: 32,18 - 32,18 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Вкусовой рецептор типа 2, член 1 (TAS2R1 / T2R1) это белок что у людей кодируется TAS2R1 ген.[5][6][7] Он принадлежит к Рецептор, связанный с G-белком (GPCR) и относится к класс А -подобные GPCR, они содержат 7 пучков трансмембранных спиралей и короткую петлю на N-конце.[8] Кроме того, TAS2R1 является членом 25 известных рецепторов горького вкуса человека, которые позволяют восприятие горького вкуса в ротовой полости. Все больше данных указывает на функциональную роль TAS2R в экстраоральных тканях.[9]

Выражение и функция

Внеротовые роли TAS2R

Рецепторы горького вкуса выражаются в вкусовые рецепторные клетки, который организован в вкусовые рецепторы на сосочках язык и эпителий неба.

Кроме того, было обнаружено, что TAS2R экспрессируются в экстраоральных тканях, например. мозг, легкие, желудочно-кишечный тракт и др.[9] Однако пока об их функциях известно меньше, например, было показано, что:

  • TAS2R опосредуют расслабление гладких мышц дыхательных путей.[10]
  • TAS2R43 участвует в секреции желудочного сока в желудке.[11]

Внеротовые роли TAS2R1

Структура рецептора TAS2R1

На основе недавнего модель гомологии из BitterDB[14][15] несколько консервированных мотивы, которые являются аналогами GPCR класса A[8] были найдены:

  • Трансмембранная спираль 1: N1.50xxI1.53
  • Трансмембранная спираль 2: L2.46xxxR2.50
  • Трансмембранная спираль 3: F3.49Y3.50xxK3.53
  • Трансмембранная спираль 5: P5.50
  • Трансмембранная спираль 6: F6.44xxxY6.46
  • Трансмембранная спираль 7: H7.49S7.50xxL7.53

Нумерация по шкале Баллероса-Вайнштейна.[16] система.

В отличие от GPCR класса A, в трансмембранной спирали 4 нет DRY[17] был найден мотив, а позиция 6.50 не консервативна.

TAS2R1 ген

Этот ген кодирует члена семьи кандидата вкусовые рецепторы которые являются членами Рецептор, связанный с G-белком надсемейством, которые специфически экспрессируются вкусовыми рецепторными клетками эпителия языка и неба. Этот ген безинтронного вкусового рецептора кодирует 7-трансмембранный рецепторный белок, функционирующий как рецептор горького вкуса.

SNP

В T2R1 два SNP известны в R111H и R206W (dbSNP ).

Факторы транскрипции

Пока что AML1a, AP-1, AREB6, FOXL1, IRF-7A, Lmo2, NF-E2, NF-E2 p45 были обнаружены как верхние фактор транскрипции сайты связывания QIAGEN в TAS2R1 промотор гена.

Мутагенез данные

Несколько мутации было показано, что они влияют на связывание лиганда с TAS2R1 (на основе BitterDB ):

Рецепторная областьНомер BWОстатокСсылка
TM11.5N24DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM11.53I27DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM22.5R55DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM22.56F61DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM22.61N66doi: 10.3389 / fmolb.2017.00063 doi: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983
ECL1E74DOI: 10.3389 / fmolb.2017.00063
TM33.32L85DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.33L86DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.36N89doi: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983 doi: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 doi: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM33.37E90DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM33.41W94DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM33.46L99DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM55.46E182DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM55.61L197DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM55.64S200DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM55.65L201DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM77.39I263DOI: 10.1016 / bs.mcb.2015.10.005 DOI: 10.3109 / 10799893.2011.578141
TM77.49H273DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM77.53L277DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983
TM77.54I278DOI: 10.1021 / acs.jctc.5b00472 DOI: 10.1074 / jbc.M111.246983

Лиганды

К настоящему времени идентифицировано 39 лигандов для T2R1 в BitterDB, среди них L-аминокислоты, пептиды, гумулоны, небольшие молекулы и т. д.[18]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169777 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045267 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Адлер Э., Хун М.А., Мюллер К.Л., Чандрашекар Дж., Рыба Н.Дж., Цукер С.С. (апрель 2000 г.). «Новое семейство вкусовых рецепторов млекопитающих». Клетка. 100 (6): 693–702. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80705-9. PMID  10761934. S2CID  14604586.
  6. ^ Matsunami H, Montmayeur JP, Buck LB (апрель 2000 г.). «Семейство кандидатов на вкусовые рецепторы человека и мыши». Природа. 404 (6778): 601–4. Bibcode:2000Натура.404..601М. Дои:10.1038/35007072. PMID  10766242. S2CID  4336913.
  7. ^ «Ген Entrez: вкусовой рецептор TAS2R1, тип 2, член 1».
  8. ^ а б Ди Пицио, Антонелла; Левит, Анат; Слуцки, Михал; Беренс, Майк; Караман, Рафик; Нив, Маша Ю. (2016), «Сравнение GPCR класса A с рецепторами горького вкуса», Методы клеточной биологии, Эльзевьер, 132: 401–427, Дои:10.1016 / bs.mcb.2015.10.005, ISBN  9780128035955, PMID  26928553
  9. ^ а б Лу, Пинг; Чжан, Ченг-Хай; Лифшиц, Лоуренс М .; ЧжуГэ, Жунхуа (04.01.2017). «Внеротовые рецепторы горечи в здоровье и болезни». Журнал общей физиологии. 149 (2): 181–197. Дои:10.1085 / jgp.201611637. ISSN  0022-1295. ЧВК  5299619. PMID  28053191.
  10. ^ Дешпанде, Дипак А; Ван, Уэйн С. Х .; Макилмойл, Элизабет Л; Робинетт, Кэтрин С; Шиллингер, Рэйчел М; Ан, Стивен С; Шам, Джеймс С. К.; Лиггетт, Стивен Б. (24.10.2010). «Рецепторы горького вкуса бронходилата гладкой мускулатуры дыхательных путей посредством локальной передачи сигналов кальция и обратной обструкции». Природа Медицина. 16 (11): 1299–1304. Дои:10,1038 / нм 2237. ISSN  1078-8956. ЧВК  3066567. PMID  20972434.
  11. ^ Лист, Катрин Ингрид; Лей, Якоб Питер; Лидер, Барбара; Беренс, Майк; Стёгер, Верена; Райнер, Анжелика; Хохкоглер, Кристина Мария; Кёк, Эльке; Марчиори, Алессандро (10.07.2017). «Кофеин вызывает секрецию желудочного сока посредством передачи сигналов горького вкуса в париетальных клетках желудка». Труды Национальной академии наук. 114 (30): E6260 – E6269. Дои:10.1073 / pnas.1703728114. ISSN  0027-8424. ЧВК  5544304. PMID  28696284.
  12. ^ Сингх, Ниша; Чакраборти, Раджа; Бхуллар, Раджиндер Пал; Челикани, Прашен (апрель 2014 г.). «Дифференциальная экспрессия рецепторов горького вкуса в доброкачественных эпителиальных клетках груди и раковых клетках груди». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 446 (2): 499–503. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.02.140. ISSN  0006-291X. PMID  24613843.
  13. ^ Упадхьяя, Джасбир Д .; Сингх, Ниша; Sikarwar, Anurag S .; Чакраборти, Раджа; Pydi, Sai P .; Bhullar, Rajinder P .; Дакшинамурти, Шьямала; Челикани, Прашен (23.10.2014). «Активация рецепторов горького вкуса, опосредованная декстрометорфаном в легочном контуре, вызывает сужение сосудов». PLOS ONE. 9 (10): e110373. Bibcode:2014PLoSO ... 9k0373U. Дои:10.1371 / journal.pone.0110373. ISSN  1932-6203. ЧВК  4207743. PMID  25340739.
  14. ^ Винер, Аяна; Шудлер, Марина; Левит, Анат; Нив, Маша Ю. (22.09.2011). «BitterDB: база данных горьких соединений». Исследования нуклеиновых кислот. 40 (D1): D413 – D419. Дои:10.1093 / nar / gkr755. ISSN  1362-4962. ЧВК  3245057. PMID  21940398.
  15. ^ Даган-Винер, Аяна; Ди Пицио, Антонелла; Ниссим, Идо; Bahia, Malkeet S; Дубовский, Ницан; Маргулис, Эйтан; Нив, Маша Ю (2018-10-24). «BitterDB: база данных вкусовых лигандов и рецепторов в 2019 году». Исследования нуклеиновых кислот. 47 (D1): D1179 – D1185. Дои:10.1093 / нар / gky974. ISSN  0305-1048. ЧВК  6323989. PMID  30357384.
  16. ^ Ballesteros, Juan A .; Weinstein, Harel (1995), «[19] Интегрированные методы построения трехмерных моделей и компьютерного исследования структурно-функциональных отношений в рецепторах, связанных с G-белком», Методы в неврологии, Elsevier, стр. 366–428, Дои:10.1016 / с1043-9471 (05) 80049-7, ISBN  9780121852955
  17. ^ Ровати, Г. Э .; Capra, V .; Нойбиг, Р. Р. (12 января 2007 г.). "Высококонсервативный DRY-мотив рецепторов, связанных с белком G: за пределами основного состояния". Молекулярная фармакология. 71 (4): 959–964. Дои:10.1124 / моль.106.029470. ISSN  0026-895X. PMID  17192495. S2CID  15536186.
  18. ^ «hTAS2R1». BitterDB. Еврейский университет Иерусалима.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.