HOPX - HOPX

HOPX
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1 грн, 2HI3
Идентификаторы
Псевдонимы	HOPX, CAMEO, HOD, HOP, LAGY, NECC1, OB1, SMAP31, TOTO, HOP homeobox
Внешние идентификаторы	OMIM: 607275 MGI: 1916782 ГомолоГен: 15859 Генные карты: HOPX
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	56,681,899 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	77,115,121 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция дифференцировки клеток; • развитие многоклеточного организма; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • дифференцировка трофэктодермальных клеток; • сборка опосредованного шапероном белкового комплекса; • дифференциация клеток;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84525
	74318
	ENSG00000171476
	ENSMUSG00000059325
	Q9BPY8
	Q8R1H0
	NM_001145459; NM_001145460; NM_032495; NM_139211; NM_139212
	NM_001159900; NM_001159901; NM_175606
	NP_001138931; NP_001138932; NP_115884; NP_631957; NP_631958
	NP_001153372; NP_001153373; NP_783199
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий только гомеодомен это белок что у людей кодируется HOPX ген.^[5] Это важный регулятор сердечное развитие^[6] и маркер из гиппокамп нервные стволовые клетки.^[7]^[8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой гомеодомен белок, в котором отсутствуют определенные консервативные остатки, необходимые для связывания ДНК. Сообщалось, что клеточные линии и ткани хориокарциномы не могут экспрессировать этот ген, что указывает на возможное участие этого гена в злокачественном превращении трофобластов плаценты. Исследования на мышах показали, что этот белок может взаимодействовать с фактором ответа сыворотки (SRF) и модулировать SRF-зависимую экспрессию кардиоспецифичных генов и развитие сердца.^[6] Наблюдались множественные альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок, полноразмерная природа только некоторых была определена.^[5]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171476 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059325 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: гомеодоменный белок HOP».
^ ^а ^б Чен, Фабиан; Кук, Хён; Милевски, Рита; Гитлер, Аарон Д .; Лу, Мин Мин; Ли, Цзюнь; Назарян, Ронниэль; Шнепп, Роберт; Джен, Куанъюй; Бибен, Кристина; Рунке, Грег; Mackay, Joel P .; Новотный, Иржи; Шварц, Роберт Дж .; Харви, Ричард П .; Маллинз, Мэри С .; Эпштейн, Джонатан А. (сентябрь 2002 г.). «Хмель - необычный ген гомеобокса, который модулирует сердечное развитие». Ячейка. 110 (6): 713–723. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00932-7. PMID 12297045. S2CID 12189105.
^ Ли, Дэцян; Такеда, Норифуми; Джайн, Раджан; Мандерфилд, Лорен Дж .; Лю, Фэйянь; Ли, Ли; Андерсон, Стюарт А .; Эпштейн, Джонатан А. (ноябрь 2015 г.). «Hopx отличает гиппокамп от нервных стволовых клеток бокового желудочка». Исследования стволовых клеток. 15 (3): 522–529. Дои:10.1016 / j.scr.2015.09.015. ЧВК 4704104. PMID 26451648.
^ Berg, Daniel A .; Су, Ицзин; Хименес-Сайрус, Деннисс; Патель, Аник; Хуанг, Нэнси; Моризе, Дэвид; Ли, Стефани; Шах, Рити; Ринглинг, Франциска Рохас; Джайн, Раджан; Эпштейн, Джонатан А .; У, Цин-Фэн; Канзар, Стефан; Мин, Го-Ли; Сун, Хунцзюнь; Бонд, Эллисон М. (апрель 2019 г.). «Общее эмбриональное происхождение стволовых клеток движет нейрогенезом развития и взрослых». Ячейка. 177 (3): 654–668.e15. Дои:10.1016 / j.cell.2019.02.010. ЧВК 6496946. PMID 30929900.

дальнейшее чтение

Кук Х, Эпштейн Дж. А. (октябрь 2003 г.). «Хмель в такт. Регулирование экспрессии сердечных генов». Тенденции в сердечно-сосудистой медицине. 13 (7): 261–4. Дои:10.1016 / S1050-1738 (03) 00107-5. PMID 14522464.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Асанома К., Мацуда Т., Кондо Х., Като К., Кишино Т., Ниикава Н., Уэйк Н., Като Х. (январь 2003 г.). «NECC1, кандидатный ген-супрессор хориокарциномы, который кодирует гомеодоменный консенсусный мотив». Геномика. 81 (1): 15–25. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 00011-3. PMID 12573257.
Чен Ю., Петерсен С., Пацина-Генгельбах М., Пьетас А., Петерсен I (2003). «Идентификация нового гена, содержащего гомеобокс, LAGY, который подавляется при раке легких». Онкология. 64 (4): 450–8. Дои:10.1159/000070306. PMID 12759545. S2CID 3205741.
Кук Х, Лепор Дж. Дж., Гитлер А. Д., Лу М. М., Ведомый Юнг В., Маккей Дж., Чжоу Р., Феррари В., Грубер П., Эпштейн Дж. А. (сентябрь 2003 г.). «Сердечная гипертрофия и зависимая от гистондеацетилазы репрессия транскрипции, опосредованная атипичным гомеодоменным белком Hop». Журнал клинических исследований. 112 (6): 863–71. Дои:10.1172 / JCI19137. ЧВК 193673. PMID 12975471.
Аду Дж., Леонг Ф. Т., Смит Н. Р., Лик Дж. П., Маркхэм А. Ф., Робинсон П. А., Мигелл А. Дж. (Декабрь 2002 г.). «Экспрессия mOb1, нового атипичного гомеодоменного белка К50 из 73 аминокислот, во время развития мышей». Механизмы развития. 119. 119 Дополнение 1: S43-7. Дои:10.1016 / S0925-4773 (03) 00090-X. PMID 14516659. S2CID 11648378.
Лемер Ф., Миллон Р., Мюллер Д., Рабуэль Й., Бракко Л., Абекассис Дж., Василик Б. (июль 2004 г.). «Потеря экспрессии опухолевого супрессора HOP при плоскоклеточной карциноме головы и шеи». Британский журнал рака. 91 (2): 258–61. Дои:10.1038 / sj.bjc.6601952. ЧВК 2409811. PMID 15213722.
Поус Э., Саймонс Г.Г., Яка С., Рис-Сталперс С. (июль 2004 г.). «Новый ген гомеобокса сверхэкспрессируется при карциноме щитовидной железы». Щитовидная железа. 14 (7): 500–5. Дои:10.1089/1050725041517020. PMID 15307938.
Торунер Г.А., Ульгер С., Алкан М., Галанте А.Т., Ринаджо Дж., Уилк Р., Тиан Б., Сотеропулос П., Хамид М.Р., Швальб М.Н., Дермоди Дж.Дж. (октябрь 2004 г.). «Связь между профилем экспрессии генов и опухолевой инвазией при плоскоклеточном раке полости рта». Генетика и цитогенетика рака. 154 (1): 27–35. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2004.01.026. PMID 15381369.
Асанома К., Като Х., Иноуэ Т., Мацуда Т., Уэйк Н. (август 2004 г.). «Анализ гена-кандидата, связанного с подавлением роста хориокарциномы и дифференцировкой трофобластов». Журнал репродуктивной медицины. 49 (8): 617–26. PMID 15457851.
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.) «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК 1347501. PMID 16381901.
Кук Х, Юнг У. В., Симпсон Р. Дж., Ки Х. Дж., Шин С., Лоури Дж. А., Лафлин Ф. Е., Инь З., Эпштейн Дж. А., Маккей Дж. П. (сентябрь 2006 г.). «Анализ структуры и функции корегулятора транскрипции HOP». Биохимия. 45 (35): 10584–90. Дои:10.1021 / bi060641s. PMID 16939210.
Kee HJ, Kim JR, Nam KI, Park HY, Shin S, Kim JC, Shimono Y, Takahashi M, Jeong MH, Kim N, Kim KK, Kook H (март 2007 г.). «Усилитель polycomb1, нового гомеодоменного партнера по связыванию белка, индуцирует дифференцировку скелетных мышц». Журнал биологической химии. 282 (10): 7700–9. Дои:10.1074 / jbc.M611198200. PMID 17192267.
Америко Т.А., Кьярини Л.Б., Линден Р. (июнь 2007 г.). «Передача сигналов, индуцированная хмелем / STI-1, зависит от эндоцитоза». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 358 (2): 620–5. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.04.202. PMID 17498662.

внешние ссылки

HOPX + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 4 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171476 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059325 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Энтрез Ген: гомеодоменный белок HOP».

[Chen-6] а ^б Чен, Фабиан; Кук, Хён; Милевски, Рита; Гитлер, Аарон Д .; Лу, Мин Мин; Ли, Цзюнь; Назарян, Ронниэль; Шнепп, Роберт; Джен, Куанъюй; Бибен, Кристина; Рунке, Грег; Mackay, Joel P .; Новотный, Иржи; Шварц, Роберт Дж .; Харви, Ричард П .; Маллинз, Мэри С .; Эпштейн, Джонатан А. (сентябрь 2002 г.). «Хмель - необычный ген гомеобокса, который модулирует сердечное развитие». Ячейка. 110 (6): 713–723. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00932-7. PMID 12297045. S2CID 12189105.

[7] Ли, Дэцян; Такеда, Норифуми; Джайн, Раджан; Мандерфилд, Лорен Дж .; Лю, Фэйянь; Ли, Ли; Андерсон, Стюарт А .; Эпштейн, Джонатан А. (ноябрь 2015 г.). «Hopx отличает гиппокамп от нервных стволовых клеток бокового желудочка». Исследования стволовых клеток. 15 (3): 522–529. Дои:10.1016 / j.scr.2015.09.015. ЧВК 4704104. PMID 26451648.

[8] Berg, Daniel A .; Су, Ицзин; Хименес-Сайрус, Деннисс; Патель, Аник; Хуанг, Нэнси; Моризе, Дэвид; Ли, Стефани; Шах, Рити; Ринглинг, Франциска Рохас; Джайн, Раджан; Эпштейн, Джонатан А .; У, Цин-Фэн; Канзар, Стефан; Мин, Го-Ли; Сун, Хунцзюнь; Бонд, Эллисон М. (апрель 2019 г.). «Общее эмбриональное происхождение стволовых клеток движет нейрогенезом развития и взрослых». Ячейка. 177 (3): 654–668.e15. Дои:10.1016 / j.cell.2019.02.010. ЧВК 6496946. PMID 30929900.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]