HEY1 - HEY1

HEY1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2DB7
Идентификаторы
Псевдонимы	HEY1, BHLHb31, CHF2, HERP2, HESR1, HRT-1, OAF1, hHRT1, фактор транскрипции bHLH родственного семейства hes с мотивом 1 YRPW, NERP2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602953 MGI: 1341800 ГомолоГен: 7756 Генные карты: HEY1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 8 (человек)
Конец	79,767,857 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	8,667,256 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• микросателлитное связывание; • Связывание ДНК; • активность димеризации белков; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание фактора транскрипции; • GO: 0000983 Активность общего фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • последовательное связывание ДНК; • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• морфогенез дорсальной аорты; • морфогенез клапана легочной артерии; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в дифференцировке гладкомышечных клеток; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • образование трабекулы сердца; • регуляция васкулогенеза; • морфогенез сердечной перегородки; • морфогенез межжелудочковой перегородки; • развитие кровеносных сосудов лабиринтного слоя; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • морфогенез эндокардиальной подушки; • развитие многоклеточного организма; • формирование атриовентрикулярного клапана; • дифференцировка артериальных эндотелиальных клеток; • клеточный ответ на глюкокортикоидный стимул; • морфогенез пуповины; • отрицательная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции; • ангиогенез; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • морфогенез сердечного желудочка; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция сигнального пути Notch; • сердечный эпителиальный переход в мезенхимальный; • Передача сигналов Notch участвует в развитии сердца; • Notch сигнальный путь; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие кровеносных сосудов; • развитие сердца; • дифференциация клеток; • регуляция нейрогенеза; • положительная регуляция экспрессии генов; • отрицательная регуляция развития биоминеральной ткани; • спецификация переднего / заднего рисунка; • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов; • развитие системы кровообращения;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23462
	15213
	ENSG00000164683
	ENSMUSG00000040289
	Q9Y5J3
	Q9WV93; Q9QUM5
	NM_012258; NM_001040708; NM_001282851
	NM_010423
	NP_001035798; NP_001269780; NP_036390
	NP_034553
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Волосатый / энхансер расщепления, связанный с белком мотива YRPW 1 это белок что у людей кодируется HEY1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок принадлежащий к семейству волосатых и энхансеров расщепленных (HESR) основная спираль-петля-спираль (bHLH) -тип транскрипционный репрессоры. Выражение этого гена индуцируется Notch и с-июн пути передачи сигналов. Для эмбрионального развития у мыши необходимы два одинаковых и повторяющихся гена. сердечно-сосудистый развития, а также вовлечены в нейрогенез и сомитогенез. Альтернативная сварка приводит к нескольким варианты расшифровки.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164683 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040289 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Leimeister C, Externbrink A, Klamt B, Gessler M (июль 1999 г.). «Эй, гены: новое подсемейство волосатых и энхансеров расщепленных генов, специфически экспрессируемых во время эмбриогенеза мышей». Механизмы развития. 85 (1–2): 173–7. Дои:10.1016 / S0925-4773 (99) 00080-5. PMID 10415358. S2CID 17342136.
^ Кокубо Х., Лун И, Джонсон Р.Л. (июль 1999 г.). «Идентификация и экспрессия нового семейства кДНК bHLH, родственных Drosophila hairy и энхансеру расщепления». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 260 (2): 459–65. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0880. PMID 10403790.
^ ^а ^б «Ген Entrez: волосатый / энхансер расщепления HEY1, связанный с мотивом 1 YRPW».

дальнейшее чтение

Исо Т., Кедес Л., Хамамори Ю. (март 2003 г.). «Семейства HES и HERP: множественные эффекторы пути передачи сигналов Notch». Журнал клеточной физиологии. 194 (3): 237–55. Дои:10.1002 / jcp.10208. PMID 12548545. S2CID 6463286.
Кокубо Х., Миягава-Томита С., Джонсон Р.Л. (июль 2005 г.). «Hesr, медиатор передачи сигналов Notch, действует в развитии сердца и сосудов». Тенденции в сердечно-сосудистой медицине. 15 (5): 190–4. Дои:10.1016 / j.tcm.2005.05.005. PMID 16165016.
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Чин М.Т., Маэмура К., Фукумото С., Джейн М.К., Лейн, доктор медицины, Ватанабе М., Се К.М., Ли М.Э. (март 2000 г.). «Сердечно-сосудистый фактор 1 основной спирали, новый репрессор транскрипции, экспрессируемый преимущественно в сердечно-сосудистой системе развивающихся и взрослых». Журнал биологической химии. 275 (9): 6381–7. Дои:10.1074 / jbc.275.9.6381. PMID 10692439.
Стейдл С., Леймейстер С., Кламт Б., Майер М., Нанда И., Диксон М., Кларк Р., Шмид М., Гесслер М. (июнь 2000 г.). «Характеристика генов HEY1, HEY2 и HEYL человека и мыши: клонирование, картирование и скрининг мутаций нового семейства генов bHLH». Геномика. 66 (2): 195–203. Дои:10.1006 / geno.2000.6200. PMID 10860664.
Майер М.М., Гесслер М. (август 2000 г.). «Сравнительный анализ промотора Hey1 человека и мыши: гены Hey представляют собой новые гены-мишени Notch». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 275 (2): 652–60. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3354. PMID 10964718.
Накагава О., Макфадден Д.Г., Накагава М., Янагисава Х., Ху Т., Шривастава Д., Олсон Е.Н. (декабрь 2000 г.). «Члены семейства HRT основных белков спираль-петля-спираль действуют как репрессоры транскрипции ниже по ходу передачи сигналов Notch». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (25): 13655–60. Дои:10.1073 / pnas.250485597. ЧВК 17631. PMID 11095750.
Sun J, Kamei CN, Layne MD, Jain MK, Liao JK, Lee ME, Chin MT (май 2001 г.). «Регулирование миогенной терминальной дифференцировки с помощью связанного с шерстью фактора транскрипции CHF2». Журнал биологической химии. 276 (21): 18591–6. Дои:10.1074 / jbc.M101163200. PMID 11279181.
Исо Т., Сарторелли В., Чанг Дж., Шичинохе Т., Кедес Л., Хамамори И. (сентябрь 2001 г.). «HERP, новая первичная мишень Notch, регулируемая связыванием лиганда». Молекулярная и клеточная биология. 21 (17): 6071–9. Дои:10.1128 / MCB.21.17.6071-6079.2001. ЧВК 87324. PMID 11486044.
Тейлор К.Л., Хендерсон А.М., Хьюз С.С. (ноябрь 2002 г.). «Активация Notch во время формирования сети эндотелиальных клеток in vitro нацелена на основной фактор транскрипции HLH HESR-1 и подавляет экспрессию VEGFR-2 / KDR». Микрососудистые исследования. 64 (3): 372–83. Дои:10.1006 / mvre.2002.2443. PMID 12453432.
Элагиб К.Е., Сяо М., Хусайни И.М., Делеханти Л.Л., Палмер Л.А., Раке Ф.К., Биррер М.Дж., Ганапати-Канниаппан С., Шанмугасундарам Г., Макдевитт М.А., Гольдфарб А.Н. (сентябрь 2004 г.). «Джун блокада эритропоэза: роль репрессии GATA-1 с помощью HERP2». Молекулярная и клеточная биология. 24 (17): 7779–94. Дои:10.1128 / MCB.24.17.7779-7794.2004. ЧВК 506977. PMID 15314183.
Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК 515316. PMID 15342556.
Кокубо Х., Миягава-Томита С., Накадзава М., Сага Y, Джонсон Р.Л. (февраль 2005 г.). «Мышиные гены hesr1 и hesr2 избыточно необходимы для передачи сигналов Notch в развивающейся сердечно-сосудистой системе». Биология развития. 278 (2): 301–9. Дои:10.1016 / j.ydbio.2004.10.025. PMID 15680351.