АТС2 - PBX2

АТС2
Идентификаторы
Псевдонимы	АТС2, G17, HOX12, PBX2MHC, PBX homeobox 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 176311 MGI: 1341793 ГомолоГен: 48115 Генные карты: АТС2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	32,190,202 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	34,597,400 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • связывание фактора транскрипции; • связывание хроматина; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • комплекс регуляторов транскрипции;
Биологический процесс	• формирование проксимального / дистального рисунка; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • эмбриональный морфогенез конечностей; • транскрипция, ДНК-шаблон; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5089
	18515
ENSG00000224952; ENSG00000237344; ENSG00000236353; ENSG00000232005; ENSG00000225987;
	ENSG00000206315; ENSG00000204304
	ENSMUSG00000034673
	P40425
	O35984
	NM_002586
	NM_017463
	NP_002577
	NP_059491
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции пре-В-клеточного лейкоза 2 это белок что у людей кодируется АТС2 ген.^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует повсеместно экспрессируемого члена семейства гомеобоксов TALE / PBX. Он был идентифицирован по его сходству с геном гомеобокса, который участвует в транслокации t (1; 19) при остром пре-B-клеточном лейкозе. Этот белок является активатором транскрипции, который связывается с промотором TLX1. Ген расположен в главном комплексе гистосовместимости (MHC) на хромосоме 6.^[6]

Взаимодействия

PBX2 была показана взаимодействовать с участием HOXA9.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ENSG00000237344, ENSG00000236353, ENSG00000232005, ENSG00000225987, ENSG00000206315, ENSG00000204304 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000224952, ENSG00000237344, ENSG3000224952, ENSG00000237344, ENSG2002000, ENSG0020002000237344 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034673 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Сугая К., Фукагава Т., Мацумото К., Мита К., Такахаши Э., Андо А., Иноко Х., Икемура Т. (сентябрь 1994 г.). «Три гена в области MHC класса III человека рядом с соединением с классом II: ген рецептора конечных продуктов гликозилирования, ген гомеобокса PBX2 и гомолог notch, человеческий аналог гена опухоли молочной железы мыши int-3». Геномика. 23 (2): 408–19. Дои:10.1006 / geno.1994.1517. PMID 7835890.
^ ^а ^б "Ген Энтреза: гомеобокс 2 пре-В-клеточной лейкемии PBX2".
^ Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Ком вес Л.Г., Лоуренс Г.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (4): 3051–61. Дои:10.1128 / mcb.19.4.3051. ЧВК 84099. PMID 10082572.

дальнейшее чтение

Моника К., Галили Н., Нурс Дж., Солтман Д., Клири М.Л. (декабрь 1991 г.). «PBX2 и PBX3, новые гены гомеобокса с обширной гомологией с протоонкогеном человека PBX1». Молекулярная и клеточная биология. 11 (12): 6149–57. Дои:10.1128 / mcb.11.12.6149. ЧВК 361792. PMID 1682799.
Агуадо Б., Кэмпбелл Р. Д. (февраль 1995 г.). «Новый ген G17, расположенный в главном комплексе гистосовместимости человека, кодирует PBX2, гомеодомен-содержащий белок». Геномика. 25 (3): 650–9. Дои:10.1016/0888-7543(95)80007-9. PMID 7759099.
Лу Кью, Райт Д.Д., Кампс депутат (июнь 1994 г.). «Слияние с E2A превращает белок гомеодомена Pbx1 в конститутивный активатор транскрипции лейкозов человека, несущий транслокацию t (1; 19)». Молекулярная и клеточная биология. 14 (6): 3938–48. Дои:10.1128 / mcb.14.6.3938. ЧВК 358760. PMID 7910944.
Катсанис Н., Фитцгиббон Дж., Фишер Е.М. (июль 1996 г.). «Паралогическое картирование: идентификация области в человеческом MHC, тройной на хромосомах 1 и 9 человека, позволяет предсказывать и изолировать новые локусы PBX и NOTCH». Геномика. 35 (1): 101–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0328. PMID 8661110.
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Prep1, новый функциональный партнер белков Pbx». Журнал EMBO. 17 (5): 1423–33. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1423. ЧВК 1170490. PMID 9482739.
Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Ком вес Л.Г., Лоуренс Г.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках». Молекулярная и клеточная биология. 19 (4): 3051–61. Дои:10.1128 / MCB.19.4.3051. ЧВК 84099. PMID 10082572.
Fujino T, Yamazaki Y, Largaespada DA, Jenkins NA, Copeland NG, Hirokawa K, Nakamura T. (июль 2001 г.). «Ингибирование миелоидной дифференцировки генами гомеобокса Hoxa9, Hoxb8 и Meis». Экспериментальная гематология. 29 (7): 856–63. Дои:10.1016 / S0301-472X (01) 00655-5. PMID 11438208.
Тормоз Р.Л., Киз У.Р., Ватт ПМ (май 2002 г.). «Комплекс, содержащий PBX2, способствует активации протоонкогена HOX11». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 294 (1): 23–34. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00426-6. PMID 12054735.
Окада Ю., Нагай Р., Сато Т., Мацуура Е., Минами Т., Морита И., Дои Т. (июнь 2003 г.). «Гомеодоменные белки MEIS1 и PBX регулируют клон-специфичную транскрипцию гена фактора 4 тромбоцитов». Кровь. 101 (12): 4748–56. Дои:10.1182 / кровь-2002-02-0380. PMID 12609849.
Longobardi E, Blasi F (октябрь 2003 г.). «Сверхэкспрессия PREP-1 в клетках тератокарциномы F9 приводит к функционально значимому увеличению PBX-2, предотвращая его деградацию». Журнал биологической химии. 278 (40): 39235–41. Дои:10.1074 / jbc.M304704200. PMID 12871956.
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (декабрь 2003 г.). «Анализ области класса III главного комплекса гистосовместимости с плотным геном и его сравнение с мышью». Геномные исследования. 13 (12): 2621–36. Дои:10.1101 / гр.1736803. ЧВК 403804. PMID 14656967.
Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.