BACH1 - BACH1

BACH1
Белок BACH1 PDB 2ihc.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыBACH1, BACH-1, BTBD24, домен BTB и гомолог 1 с ЧПУ
Внешние идентификаторыOMIM: 602751 MGI: 894680 ГомолоГен: 916 Генные карты: BACH1
Расположение гена (человек)
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека)[1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение BACH1
Геномное расположение BACH1
Группа21q21.3Начните29,194,071 бп[1]
Конец29,630,751 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE BACH1 210818 s в формате fs.png

PBB GE BACH1 204194 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001011545
NM_001186
NM_206866

NM_007520

RefSeq (белок)

NP_001177
NP_996749

NP_031546

Расположение (UCSC)Chr 21: 29.19 - 29.63 МбChr 16: 87,7 - 87,73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок-регулятор транскрипции BACH1 это белок что у людей кодируется BACH1 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует фактор транскрипции, который принадлежит к типу основной области cap'n'collar. лейциновая молния факторное семейство (CNC-bZip). Кодируемый белок содержит широкие комплексные домены, tramtrack, bric-a-brac / poxvirus и цинковые пальцы (BTB / POZ) домены, что нетипично для членов семейства CNC-bZip. Эти BTB / POZ домены облегчают белок-белковые взаимодействия и образование гомо- и / или гетероолигомеров. С-конец белка представляет собой лейциновую молнию bzip_maf семья. Когда этот белок образует гетеродимер с MafK, он действует как репрессор элемента распознавания Maf (MARE), и транскрипция репрессируется. Для этого гена было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов. Некоторые экзоны этого гена перекрываются с некоторыми экзонами гена C21orf41, который транскрибируется в противоположной ориентации по отношению к этому гену, но, по-видимому, не кодирует белок.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000156273 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025612 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Блуин Дж. Л., Дюрио Саил Дж., Гиппони М., Россье С., Паппасавас М. П., Антонаракис С. Е. (март 1998 г.). «Выделение гена регулятора транскрипции BACH1 человека, который отображается на хромосоме 21q22.1». Генетика человека. 102 (3): 282–8. Дои:10.1007 / s004390050692. PMID  9544839. S2CID  9494442.
  6. ^ Охира М., Секи Н., Нагасе Т., Исикава К., Номура Н., Охара О. (январь 1998 г.). «Характеристика человеческого гомолога (BACH1) гена Bach1 мыши, кодирующего фактор транскрипции лейциновой молнии BTB, и его картирование на хромосоме 21q22.1». Геномика. 47 (2): 300–6. Дои:10.1006 / geno.1997.5080. PMID  9479503.
  7. ^ а б «Ген Entrez: BACH1 BTB и гомология CNC 1, основной фактор транскрипции лейциновой молнии 1».

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.